8rlu

TCR in complex with HLA-E*01:03 bound to HBV envelope 371-379 S3N peptide

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 5	Beta-2-microglobulin × 1 （P61769） Large envelope protein × 1 （Q67953） T cell receptor alpha variable 12-2,T cell receptor alpha chain MC.7.G5 × 1 （A0A075B6T6,P0DTU3） T cell receptor beta variable 6-5,T cell receptor beta chain MC.7.G5 × 1 （A0A0K0K1A5,P0DTU4） water × 5	与蛋白数一致
2	信息不足	异源复合物	蛋白 5	Beta-2-microglobulin × 1 （P61769） Large envelope protein × 1 （Q67953） T cell receptor alpha variable 12-2,T cell receptor alpha chain MC.7.G5 × 1 （A0A075B6T6,P0DTU3） T cell receptor beta variable 6-5,T cell receptor beta chain MC.7.G5 × 1 （A0A0K0K1A5,P0DTU4） water × 5	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	HLAE_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–276； UniProt 22–297 作者链 F； PDB构建体 1–276； UniProt 22–297

Beta-2-microglobulin

Homo sapiens

UniProt P61769

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 5	HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E × 1 （P13747） Large envelope protein × 1 （Q67953） T cell receptor alpha variable 12-2,T cell receptor alpha chain MC.7.G5 × 1 （A0A075B6T6,P0DTU3） T cell receptor beta variable 6-5,T cell receptor beta chain MC.7.G5 × 1 （A0A0K0K1A5,P0DTU4） water × 5	与蛋白数一致
2	信息不足	异源复合物	蛋白 5	HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E × 1 （P13747） Large envelope protein × 1 （Q67953） T cell receptor alpha variable 12-2,T cell receptor alpha chain MC.7.G5 × 1 （A0A075B6T6,P0DTU3） T cell receptor beta variable 6-5,T cell receptor beta chain MC.7.G5 × 1 （A0A0K0K1A5,P0DTU4） water × 5	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	B2MG_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 2–100； UniProt 21–119 作者链 G； PDB构建体 2–100； UniProt 21–119

Large envelope protein

物种未注明

UniProt Q67953

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 5	HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E × 1 （P13747） Beta-2-microglobulin × 1 （P61769） T cell receptor alpha variable 12-2,T cell receptor alpha chain MC.7.G5 × 1 （A0A075B6T6,P0DTU3） T cell receptor beta variable 6-5,T cell receptor beta chain MC.7.G5 × 1 （A0A0K0K1A5,P0DTU4） water × 5	与蛋白数一致
2	信息不足	异源复合物	蛋白 5	HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E × 1 （P13747） Beta-2-microglobulin × 1 （P61769） T cell receptor alpha variable 12-2,T cell receptor alpha chain MC.7.G5 × 1 （A0A075B6T6,P0DTU3） T cell receptor beta variable 6-5,T cell receptor beta chain MC.7.G5 × 1 （A0A0K0K1A5,P0DTU4） water × 5	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q67953_HBV
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–9； UniProt 427–435 作者链 H； PDB构建体 1–9； UniProt 427–435

T cell receptor alpha variable 12-2,T cell receptor alpha chain MC.7.G5

Homo sapiens

UniProt A0A075B6T6

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 5	HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E × 1 （P13747） Beta-2-microglobulin × 1 （P61769） Large envelope protein × 1 （Q67953） T cell receptor beta variable 6-5,T cell receptor beta chain MC.7.G5 × 1 （A0A0K0K1A5,P0DTU4） water × 5	与蛋白数一致
2	信息不足	异源复合物	蛋白 5	HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E × 1 （P13747） Beta-2-microglobulin × 1 （P61769） Large envelope protein × 1 （Q67953） T cell receptor beta variable 6-5,T cell receptor beta chain MC.7.G5 × 1 （A0A0K0K1A5,P0DTU4） water × 5	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TVAL2_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 3–92； UniProt 23–112 作者链 I； PDB构建体 3–92； UniProt 23–112

T cell receptor alpha variable 12-2,T cell receptor alpha chain MC.7.G5

Homo sapiens

UniProt P0DTU3

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 5	HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E × 1 （P13747） Beta-2-microglobulin × 1 （P61769） Large envelope protein × 1 （Q67953） T cell receptor beta variable 6-5,T cell receptor beta chain MC.7.G5 × 1 （A0A0K0K1A5,P0DTU4） water × 5	与蛋白数一致
2	信息不足	异源复合物	蛋白 5	HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E × 1 （P13747） Beta-2-microglobulin × 1 （P61769） Large envelope protein × 1 （Q67953） T cell receptor beta variable 6-5,T cell receptor beta chain MC.7.G5 × 1 （A0A0K0K1A5,P0DTU4） water × 5	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TRAR2_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 111–199； UniProt 132–220 作者链 I； PDB构建体 111–199； UniProt 132–220

T cell receptor beta variable 6-5,T cell receptor beta chain MC.7.G5

Homo sapiens

UniProt A0A0K0K1A5

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 5	HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E × 1 （P13747） Beta-2-microglobulin × 1 （P61769） Large envelope protein × 1 （Q67953） T cell receptor alpha variable 12-2,T cell receptor alpha chain MC.7.G5 × 1 （A0A075B6T6,P0DTU3） water × 5	与蛋白数一致
2	信息不足	异源复合物	蛋白 5	HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E × 1 （P13747） Beta-2-microglobulin × 1 （P61769） Large envelope protein × 1 （Q67953） T cell receptor alpha variable 12-2,T cell receptor alpha chain MC.7.G5 × 1 （A0A075B6T6,P0DTU3） water × 5	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TVB65_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 2–94； UniProt 20–112 作者链 J； PDB构建体 2–94； UniProt 20–112

T cell receptor beta variable 6-5,T cell receptor beta chain MC.7.G5

Homo sapiens

UniProt P0DTU4

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 5	HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E × 1 （P13747） Beta-2-microglobulin × 1 （P61769） Large envelope protein × 1 （Q67953） T cell receptor alpha variable 12-2,T cell receptor alpha chain MC.7.G5 × 1 （A0A075B6T6,P0DTU3） water × 5	与蛋白数一致
2	信息不足	异源复合物	蛋白 5	HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E × 1 （P13747） Beta-2-microglobulin × 1 （P61769） Large envelope protein × 1 （Q67953） T cell receptor alpha variable 12-2,T cell receptor alpha chain MC.7.G5 × 1 （A0A075B6T6,P0DTU3） water × 5	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TRBR2_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 104–243； UniProt 127–266 作者链 J； PDB构建体 104–243； UniProt 127–266

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	8rlu
沉积日期 deposition_date	2024-01-03
结构标题 title	TCR in complex with HLA-E*01:03 bound to HBV envelope 371-379 S3N peptide
关键词 keywords	TCR-MHC, TCR, HLA-E, HBV, affinity matured, pHLA, IMMUNE SYSTEM; IMMUNE SYSTEM
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

8rlu__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

8rlu__assembly_2__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

8rlu__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	36.46 Å
Rg（电子密度）	36.80 Å
总 Rg	36.93 Å
原子数	12383
残基数	791
排除体积	111260 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`8rlu__assembly_1__model_1`	pentameric （5）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`8rlu__assembly_2__model_1`	pentameric （5）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E
分子量 formula_weight	31824.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,F
原子数 atom_count	25369

GSHSLKYFHTSVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDNDAASPRMVPRAPWMEQEGSEYWDRETRSARDTAQIFRVNLRTLRGYYNQSEAGSHTLQWMHGCELGPDGRFLRGYEQFAYDGKDYLTLNEDLRSWTAVDTAAQISEQKSNDASEAEHQRAYLEDTCVEWLHKYLEKGKETLLHLEPPKTHVTHHPISDHEATLRCWALGFYPAEITLTWQQDGEGHTQDTELVETRPAGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLPEPVTLRWKP

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Beta-2-microglobulin
分子量 formula_weight	11879.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,G

MIQRTPKIQVYSRHPAENGKSNFLNCYVSGFHPSDIEVDLLKNGERIEKVEHSDLSFSKDWSFYLLYYTEFTPTEKDEYACRVNHVTLSQPKIVKWDRDM

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Large envelope protein
分子量 formula_weight	1039.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,H

ILNPFLPLL

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	T cell receptor alpha variable 12-2,T cell receptor alpha chain MC.7.G5
分子量 formula_weight	21944.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D,I

MAKEVEQNSGPLSVPEGAIASLNCTYSDRGSVSFFWYRQYSGKSPELIMSIYLNGLKEDGRFTAQLNKASQYVSLLIRDSQPSDSATYLCAVGNHNTGNMLTFGGGTRLMVKPHIQNPDPAVYQLRDSKSSDKSVCLFTDFDSQTNVSQSKDSDVYITDKCVLDMRSMDFKSNSAVAWSNKSDFACANAFNNSIIPEDT

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	T cell receptor beta variable 6-5,T cell receptor beta chain MC.7.G5
分子量 formula_weight	27436.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,J

MNAGVTQTPKFQVLKTGQSMTLQCAQDMNYEYMSWYRQDPGMGLRLIHYSVSAGLTDQGEVPNGYNVSRSTTEDFPLRLLSAAPSQTSVYFCASHRNRLTEAFFGQGTRLTVVEDLKNVFPPEVAVFEPSEAEISHTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKEVHSGVCTDPQPLKEQPALNDSRYALSSRLRVSATFWQDPRNHFRCQVQFYGLSENDEWTQDRAKPVTQIVSAEAWGRAD

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 6 Entity 6 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	237

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晶胞边长 a length_a	81.417 Å
晶胞边长 b length_b	147.845 Å
晶胞边长 c length_c	91.908 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	99.03 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.350 Å
最低分辨率 resolution_low	65.510 Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	0.2083
R_free r_free	0.2609

TCR in complex with HLA-E*01:03 bound to HBV envelope 371-379 S3N peptide

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Beta-2-microglobulin

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Large envelope protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

T cell receptor alpha variable 12-2,T cell receptor alpha chain MC.7.G5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

T cell receptor alpha variable 12-2,T cell receptor alpha chain MC.7.G5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

T cell receptor beta variable 6-5,T cell receptor beta chain MC.7.G5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

T cell receptor beta variable 6-5,T cell receptor beta chain MC.7.G5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

8rlu__assembly_2__model_1

8rlu__assembly_2__model_1 | I(q)

8rlu__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source