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8vc3

Voltage gated potassium ion channel Kv1.2 in complex with DTx

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 107.8 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Kunitz-type serine protease inhibitor homolog alpha-dendrotoxin

物种未注明

UniProt P00980

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 2–59 未记录 Potassium voltage-gated channel subfamily A member 2 × 4 （P63142） K POTASSIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8VC3 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1DTX CRYSTAL STRUCTURE OF ALPHA-DENDROTOXIN FROM THE GREEN MAMBA VENOM AND ITS COMPARISON WITH THE STRUCTURE OF BOVINE PANCREATIC TRYPSIN INHIBITOR 提交 1991-04-29 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–59（58 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SO4 SULFATE ION × 5 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.20 Å

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 VKTHA_DENAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 2–59； UniProt 2–59

Potassium voltage-gated channel subfamily A member 2

Rattus norvegicus

UniProt P63142

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白拷贝数一致 链 B； UniProt 1–499 链 C； UniProt 1–499 链 D； UniProt 1–499 链 E； UniProt 1–499 未记录 Kunitz-type serine protease inhibitor homolog alpha-dendrotoxin × 1 （P00980） K POTASSIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8VC3 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1DSX KV1.2 T1 DOMAIN, RESIDUES 33-119, T46V MUTANT 提交 2000-01-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 33–119（87 aa） 片段：N-TERMINAL ASSEMBLY DOMAIN, RESIDUES 33-119
链 B 33–119（87 aa） 片段：N-TERMINAL ASSEMBLY DOMAIN, RESIDUES 33-119
链 C 33–119（87 aa） 片段：N-TERMINAL ASSEMBLY DOMAIN, RESIDUES 33-119
链 D 33–119（87 aa） 片段：N-TERMINAL ASSEMBLY DOMAIN, RESIDUES 33-119
突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5；22% PEG 1500, 5 % ISOPROPANOL, 200 MM NA ACETATE, 12 MM SRCL2, 50 MM TRIS, PH 8.5, pH 8.50
分辨率 1.60 Å R-free 0.279
1DSX KV1.2 T1 DOMAIN, RESIDUES 33-119, T46V MUTANT 提交 2000-01-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 33–119（87 aa） 片段：N-TERMINAL ASSEMBLY DOMAIN, RESIDUES 33-119
链 F 33–119（87 aa） 片段：N-TERMINAL ASSEMBLY DOMAIN, RESIDUES 33-119
链 G 33–119（87 aa） 片段：N-TERMINAL ASSEMBLY DOMAIN, RESIDUES 33-119
链 H 33–119（87 aa） 片段：N-TERMINAL ASSEMBLY DOMAIN, RESIDUES 33-119
突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5；22% PEG 1500, 5 % ISOPROPANOL, 200 MM NA ACETATE, 12 MM SRCL2, 50 MM TRIS, PH 8.5, pH 8.50
分辨率 1.60 Å R-free 0.279
1QDV N-TERMINAL DOMAIN, VOLTAGE-GATED POTASSIUM CHANNEL KV1.2 RESIDUES 33-131 提交 1999-07-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 33–131（99 aa） 片段：N-TERMINAL DOMAIN, RESIDUES 33-131
链 B 33–131（99 aa） 片段：N-TERMINAL DOMAIN, RESIDUES 33-131
链 C 33–131（99 aa） 片段：N-TERMINAL DOMAIN, RESIDUES 33-131
链 D 33–131（99 aa） 片段：N-TERMINAL DOMAIN, RESIDUES 33-131
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；19% PEG 4000, 100 MM NH4 ACETATE, 21% METHANOL, MES PH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 1.60 Å R-free 0.278
1QDW N-TERMINAL DOMAIN, VOLTAGE-GATED POTASSIUM CHANNEL KV1.2 RESIDUES 33-119 提交 1999-07-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 33–119（87 aa） 片段：N-TERMINAL DOMAIN KV1.2, RESIDUES 33-119 (CORE)
链 B 33–119（87 aa） 片段：N-TERMINAL DOMAIN KV1.2, RESIDUES 33-119 (CORE)
链 C 33–119（87 aa） 片段：N-TERMINAL DOMAIN KV1.2, RESIDUES 33-119 (CORE)
链 D 33–119（87 aa） 片段：N-TERMINAL DOMAIN KV1.2, RESIDUES 33-119 (CORE)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；9% PEG 1500, 5% N-PROPANOL, 120 MM GDHCL 50 MM MES PH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.10 Å R-free 0.266
1QDW N-TERMINAL DOMAIN, VOLTAGE-GATED POTASSIUM CHANNEL KV1.2 RESIDUES 33-119 提交 1999-07-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 33–119（87 aa） 片段：N-TERMINAL DOMAIN KV1.2, RESIDUES 33-119 (CORE)
链 F 33–119（87 aa） 片段：N-TERMINAL DOMAIN KV1.2, RESIDUES 33-119 (CORE)
链 G 33–119（87 aa） 片段：N-TERMINAL DOMAIN KV1.2, RESIDUES 33-119 (CORE)
链 H 33–119（87 aa） 片段：N-TERMINAL DOMAIN KV1.2, RESIDUES 33-119 (CORE)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；9% PEG 1500, 5% N-PROPANOL, 120 MM GDHCL 50 MM MES PH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.10 Å R-free 0.266
2A79 Mammalian Shaker Kv1.2 potassium channel- beta subunit complex 提交 2005-07-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 B 1–499（499 aa）
未记录 NAP NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 4 K POTASSIUM ION × 24 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；peg 400, potassium chloride, tris buffer, EDTA, DTT, TCEP, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.90 Å R-free 0.252
3LNM F233W mutant of the Kv2.1 paddle-Kv1.2 chimera channel 提交 2010-02-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 D 1–266（266 aa）
链 D 303–499（197 aa）
突变：C31S, C32S, N207Q, F233W, C431S, C478S 突变：C31S, C32S, N207Q, F233W, C431S, C478S NAP NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 4 PGW (1R)-2-{[(S)-{[(2S)-2,3-dihydroxypropyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(hexadecanoyloxy)methyl]ethyl (9Z)-octadec-9-enoate × 4 K POTASSIUM ION × 20 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；25-28% PEG 400, 50mM Tris-HCl, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.90 Å R-free 0.247
3LNM F233W mutant of the Kv2.1 paddle-Kv1.2 chimera channel 提交 2010-02-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 1–266（266 aa）
链 B 303–499（197 aa）
突变：C31S, C32S, N207Q, F233W, C431S, C478S 突变：C31S, C32S, N207Q, F233W, C431S, C478S NAP NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 4 PGW (1R)-2-{[(S)-{[(2S)-2,3-dihydroxypropyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(hexadecanoyloxy)methyl]ethyl (9Z)-octadec-9-enoate × 48 K POTASSIUM ION × 20 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；25-28% PEG 400, 50mM Tris-HCl, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.90 Å R-free 0.247
3LUT A Structural Model for the Full-length Shaker Potassium Channel Kv1.2 提交 2010-02-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 1–499（499 aa）
突变：N207Q NAP NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 4 K POTASSIUM ION × 24 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.90 Å R-free 0.221
4JTA Crystal structure of Kv1.2-2.1 paddle chimera channel in complex with Charybdotoxin 提交 2013-03-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 1–266（266 aa）
链 B 304–499（196 aa）
未记录 NAP NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 4 K POTASSIUM ION × 12 PGW (1R)-2-{[(S)-{[(2S)-2,3-dihydroxypropyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(hexadecanoyloxy)methyl]ethyl (9Z)-octadec-9-enoate × 64 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.9；293 K；PEG 400, POTASSIUM CHLORIDE, TRIS , pH 8.9, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 2.50 Å R-free 0.236
4JTA Crystal structure of Kv1.2-2.1 paddle chimera channel in complex with Charybdotoxin 提交 2013-03-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 Q 1–266（266 aa）
链 Q 304–499（196 aa）
未记录 NAP NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 4 K POTASSIUM ION × 12 PGW (1R)-2-{[(S)-{[(2S)-2,3-dihydroxypropyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(hexadecanoyloxy)methyl]ethyl (9Z)-octadec-9-enoate × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.9；293 K；PEG 400, POTASSIUM CHLORIDE, TRIS , pH 8.9, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 2.50 Å R-free 0.236
4JTC Crystal structure of Kv1.2-2.1 paddle chimera channel in complex with Charybdotoxin in Cs+ 提交 2013-03-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 1–266（266 aa）
链 B 304–499（196 aa）
未记录 NAP NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 4 CS CESIUM ION × 16 PGW (1R)-2-{[(S)-{[(2S)-2,3-dihydroxypropyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(hexadecanoyloxy)methyl]ethyl (9Z)-octadec-9-enoate × 64 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.9；293 K；PEG 400, Cesium CHLORIDE, TRIS BUFFER, pH 8.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.56 Å R-free 0.262
4JTC Crystal structure of Kv1.2-2.1 paddle chimera channel in complex with Charybdotoxin in Cs+ 提交 2013-03-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 H 1–266（266 aa）
链 H 304–499（196 aa）
未记录 NAP NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 4 CS CESIUM ION × 16 PGW (1R)-2-{[(S)-{[(2S)-2,3-dihydroxypropyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(hexadecanoyloxy)methyl]ethyl (9Z)-octadec-9-enoate × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.9；293 K；PEG 400, Cesium CHLORIDE, TRIS BUFFER, pH 8.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.56 Å R-free 0.262
4JTD Crystal structure of Kv1.2-2.1 paddle chimera channel in complex with Lys27Met mutant of Charybdotoxin 提交 2013-03-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 1–266（266 aa）
链 B 304–499（196 aa）
未记录 NAP NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 4 K POTASSIUM ION × 16 PGW (1R)-2-{[(S)-{[(2S)-2,3-dihydroxypropyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(hexadecanoyloxy)methyl]ethyl (9Z)-octadec-9-enoate × 64 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.9；293 K；PEG 400, POTASSIUM CHLORIDE, TRIS , pH 8.9, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 2.54 Å R-free 0.235
4JTD Crystal structure of Kv1.2-2.1 paddle chimera channel in complex with Lys27Met mutant of Charybdotoxin 提交 2013-03-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric
链 H 1–266（266 aa）
链 H 304–499（196 aa）
未记录 NAP NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 4 K POTASSIUM ION × 16 PGW (1R)-2-{[(S)-{[(2S)-2,3-dihydroxypropyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(hexadecanoyloxy)methyl]ethyl (9Z)-octadec-9-enoate × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.9；293 K；PEG 400, POTASSIUM CHLORIDE, TRIS , pH 8.9, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 2.54 Å R-free 0.235
5WIE Crystal structure of a Kv1.2-2.1 chimera K+ channel V406W mutant in an inactivated state 提交 2017-07-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 1–42（42 aa）
突变：V406W NAP NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 4 PGW (1R)-2-{[(S)-{[(2S)-2,3-dihydroxypropyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(hexadecanoyloxy)methyl]ethyl (9Z)-octadec-9-enoate × 20 K POTASSIUM ION × 16 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；293 K；50 mM Tris-Cl pH 8.3, 29-31% PEG400
分辨率 3.30 Å R-free 0.243
5WIE Crystal structure of a Kv1.2-2.1 chimera K+ channel V406W mutant in an inactivated state 提交 2017-07-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 H 1–42（42 aa）
突变：V406W NAP NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 4 PGW (1R)-2-{[(S)-{[(2S)-2,3-dihydroxypropyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(hexadecanoyloxy)methyl]ethyl (9Z)-octadec-9-enoate × 4 K POTASSIUM ION × 16 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；293 K；50 mM Tris-Cl pH 8.3, 29-31% PEG400
分辨率 3.30 Å R-free 0.243
6EBK The voltage-activated Kv1.2-2.1 paddle chimera channel in lipid nanodiscs 提交 2018-08-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 1–266（266 aa）
链 B 303–499（197 aa）
链 D 1–266（266 aa）
链 D 303–499（197 aa）
链 F 1–266（266 aa）
链 F 303–499（197 aa）
链 H 1–266（266 aa）
链 H 303–499（197 aa）
未记录 NAP NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；A 3 microliter sample was applied to a plasma-cleaned grid and blotted for 10 seconds.
分辨率 3.30 Å
6EBL The voltage-activated Kv1.2-2.1 paddle chimera channel in lipid nanodiscs, cytosolic domain 提交 2018-08-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 1–266（266 aa）
链 B 303–499（197 aa）
链 D 1–266（266 aa）
链 D 303–499（197 aa）
链 F 1–266（266 aa）
链 F 303–499（197 aa）
链 H 1–266（266 aa）
链 H 303–499（197 aa）
未记录 NAP NADP NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE PHOSPHATE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；A 3 microliter sample was applied to a plasma-cleaned grid and blotted for 10 seconds.
分辨率 3.00 Å
6EBM The voltage-activated Kv1.2-2.1 paddle chimera channel in lipid nanodiscs, transmembrane domain of subunit alpha 提交 2018-08-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–266（266 aa）
链 B 303–499（197 aa）
链 D 1–266（266 aa）
链 D 303–499（197 aa）
链 F 1–266（266 aa）
链 F 303–499（197 aa）
链 H 1–266（266 aa）
链 H 303–499（197 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；A 3 microliter sample was applied to a plasma-cleaned grid and blotted for 10 seconds.
分辨率 4.00 Å
8VC4 Voltage gated potassium ion channel Kv1.2 in Sodium 提交 2023-12-13 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–499（499 aa）
链 B 1–499（499 aa）
链 C 1–499（499 aa）
链 D 1–499（499 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.17 Å
8VC6 Voltage gated potassium ion channel Kv1.2 in Potassium 提交 2023-12-13 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–499（499 aa）
链 B 1–499（499 aa）
链 C 1–499（499 aa）
链 D 1–499（499 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.17 Å
8VCH Voltage gated potassium ion channel Kv1.2 W366F, C-type inactivated 提交 2023-12-14 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–499（499 aa）
链 B 1–499（499 aa）
链 C 1–499（499 aa）
链 D 1–499（499 aa）
突变：W366F 突变：W366F 突变：W366F 突变：W366F K POTASSIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.55 Å

共 16 个其他 PDB 条目、23 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 KCNA2_RAT
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B； PDB构建体 38–536； UniProt 1–499 作者链 C； PDB构建体 38–536； UniProt 1–499 作者链 D； PDB构建体 38–536； UniProt 1–499 作者链 E； PDB构建体 38–536； UniProt 1–499

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 8vc3

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 8vc3
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id8vc3
沉积日期 deposition_date2023-12-13
结构标题 titleVoltage gated potassium ion channel Kv1.2 in complex with DTx
关键词 keywordsIon Channel, Toxin bound, Blocker, MEMBRANE PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier33.93 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron32.96 Å
零角强度 I(0) i0173060000.00
分子量 molecular_weight116030.0 kDa
排除体积 excluded_volume149480 ų
包络体积 envelope_volume192620 ų
水化壳体积 shell_volume47875 ų
包络直径 envelope_diameter113.0 Å
壳层 Rg shell_rg40.34 Å
包络 Rg envelope_rg33.26 Å
形状 Rg shape_rg33.06 Å
总 Rg total_rg33.24 Å
总原子数 total_atoms8219
残基数 n_residues1087
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax107.8 Å
Rg (实空间) rg_real33.79 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.88 Å
I(0) (实空间) i0_real1.7310e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error2.7690e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal33.88 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal173100000.0000
解质量估计 total_estimate0.8864
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary45.9 Å
偏度 Skewness skewness0.169
峰度 Kurtosis kurtosis-0.320
角度范围 angular_range— – 0.2350 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha20770000.0000
实空间数据点数 n_real_points48
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.859; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.995; Smooth: 0.947
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)