8vpq

The structure of LSD1-CoREST-HDAC1 in complex with KBTBD4IPR310delinsTTYML

Method: ELECTRON MICROSCOPY D_max: 144.2 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Isoform 2 of Kelch repeat and BTB domain-containing protein 4

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–534 链 B； UniProt 1–534	未记录	Histone deacetylase 1 × 1 （Q13547） REST corepressor 1 × 1 （Q9UKL0） ZN ZINC ION × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8VPQ	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2EQX Solution structure of the BACK domain of Kelch repeat and BTB domain-containing protein 4 提交 2007-03-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 142–239（98 aa）片段：BACK domain	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）120mM；压力 ambient NMR样品组成 1.15mM 13C-15N PROTEIN; 20mM d-Tris-HCl (pH7.0); 100mM NaCl; 1mM d-DTT; 0.02% NaN3; 90% H2O, 10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
8VOJ The Cryo-EM structure of LSD1-CoREST-HDAC1 in complex with KBTBD4 enhanced by UM171 and IP6 提交 2024-01-15	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–534（534 aa）链 B 1–534（534 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 A1ACV (1r,4r)-N~1~-[(7P)-2-benzyl-7-(2-methyl-2H-tetrazol-5-yl)-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl]cyclohexane-1,4-diamine × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.77 Å
8VRT The structure of LSD1-CoREST-HDAC1 in complex with KBTBD4R313PRR mutant 提交 2024-01-22	构建体不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 17–534（518 aa）链 B 17–534（518 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.42 Å
9DTG The cryo-EM structure of apo KBTBD4 提交 2024-09-30	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–534（534 aa）链 B 1–534（534 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.83 Å
9DTQ The structure of HDAC2-CoREST in complex with KBTBD4R313PRR mutant 提交 2024-10-01	构建体不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 17–534（518 aa）链 E 17–534（518 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.87 Å
9GGL Cryo-EM structure of KBTBD4 WT-HDAC2 2:1 complex mediated by molecular glue UM171 提交 2024-08-13	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 17–534（518 aa）链 C 17–534（518 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 A1ACV (1r,4r)-N~1~-[(7P)-2-benzyl-7-(2-methyl-2H-tetrazol-5-yl)-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl]cyclohexane-1,4-diamine × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.13 Å
9GGM Cryo-EM structure of KBTBD4 P313PRR mutant-HDAC2 2:2 complex 提交 2024-08-13	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 17–534（518 aa）链 C 17–534（518 aa）	突变：Indel mutation R313PRR 突变：Indel mutation R313PRR	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.71 Å
9GGN Cryo-EM structure of KBTBD4 WT-HDAC2 2:2 complex mediated by molecular glue UM171 提交 2024-08-13	构建体不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 17–534（518 aa）链 C 17–534（518 aa）	未记录	A1ACV (1r,4r)-N~1~-[(7P)-2-benzyl-7-(2-methyl-2H-tetrazol-5-yl)-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl]cyclohexane-1,4-diamine × 2 ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
9I2C Cryo-EM structure of KBTBD4 WT-HDAC2-CoREST1 2:1:1 complex mediated by molecular glue UM171 提交 2025-01-20	构建体不同配体/离子不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 17–534（518 aa）链 C 17–534（518 aa）	未记录	A1ACV (1r,4r)-N~1~-[(7P)-2-benzyl-7-(2-methyl-2H-tetrazol-5-yl)-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl]cyclohexane-1,4-diamine × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å

共 9 个其他 PDB 条目、9 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	KBTB4_HUMAN
Isoform	Q9NVX7-2
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–536； UniProt 1–534 作者链 B； PDB构建体 1–536； UniProt 1–534

Histone deacetylase 1

Homo sapiens

UniProt Q13547

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 1–482	未记录	Isoform 2 of Kelch repeat and BTB domain-containing protein 4 × 2 （Q9NVX7） REST corepressor 1 × 1 （Q9UKL0） ZN ZINC ION × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 8VPQ	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
4BKX The structure of HDAC1 in complex with the dimeric ELM2-SANT domain of MTA1 from the NuRD complex 提交 2013-04-30	配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–482（482 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 ACT ACETATE ION × 2 K POTASSIUM ION × 4 SO4 SULFATE ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；0.1M NA HEPES PH7.5, 2M AMMONIUM SULPHATE, 5% PEG400	分辨率 3.00 Å R-free 0.261
5ICN HDAC1:MTA1 in complex with inositol-6-phosphate and a novel peptide inhibitor based on histone H4 提交 2016-02-23	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 B 1–376（376 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 2 K POTASSIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.1M NA HEPES PH7.5, 2M AMMONIUM SULPHATE, 5% PEG400	分辨率 3.30 Å R-free 0.299
6Z2J The structure of the dimeric HDAC1/MIDEAS/DNTTIP1 MiDAC deacetylase complex 提交 2020-05-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 C 1–482（482 aa）链 E 1–482（482 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 2 K POTASSIUM ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Blot time 3 sec, blot force 10.	分辨率 4.00 Å
6Z2K The structure of the tetrameric HDAC1/MIDEAS/DNTTIP1 MiDAC deacetylase complex 提交 2020-05-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 C 1–482（482 aa）链 E 1–482（482 aa）链 I 1–482（482 aa）链 K 1–482（482 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4 K POTASSIUM ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Blot time 3 sec, blot force 10.	分辨率 4.50 Å
7AO8 Structure of the MTA1/HDAC1/MBD2 NURD deacetylase complex 提交 2020-10-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 B 1–482（482 aa）链 E 1–482（482 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 2 K POTASSIUM ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Blot for 3 seconds, blot force 10	分辨率 4.50 Å
7AO9 Structure of the core MTA1/HDAC1/MBD2 NURD deacetylase complex 提交 2020-10-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 B 1–482（482 aa）链 E 1–482（482 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 2 K POTASSIUM ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Blot for 3 seconds, blot force 10	分辨率 6.10 Å
7AOA Structure of the extended MTA1/HDAC1/MBD2/RBBP4 NURD deacetylase complex 提交 2020-10-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 B 1–482（482 aa）链 E 1–482（482 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 2 K POTASSIUM ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Blot for 3 seconds, blot force 10	分辨率 19.40 Å
7SME p107 pocket domain complexed with HDAC1 peptide 提交 2021-10-25	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 413–422（10 aa）片段：UNP residues 413-422	未记录	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；100 mM MES, pH 6.5, 4% PEG400, 1.6 M ammonium sulfate	分辨率 2.64 Å R-free 0.277
8VOJ The Cryo-EM structure of LSD1-CoREST-HDAC1 in complex with KBTBD4 enhanced by UM171 and IP6 提交 2024-01-15	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–482（482 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 A1ACV (1r,4r)-N~1~-[(7P)-2-benzyl-7-(2-methyl-2H-tetrazol-5-yl)-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl]cyclohexane-1,4-diamine × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.77 Å
8VRT The structure of LSD1-CoREST-HDAC1 in complex with KBTBD4R313PRR mutant 提交 2024-01-22	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–482（482 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.42 Å
9R4I An auto inhibitory loop in the MiDAC histone deacetylase complex 提交 2025-05-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–482（482 aa）链 D 1–482（482 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 2 K POTASSIUM ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；10 mM HEPES, 25 mM KCl, 1 micromolar Inositol Hexaphosphate cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.92 Å

共 11 个其他 PDB 条目、11 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	HDAC1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–482； UniProt 1–482

REST corepressor 1

Homo sapiens

UniProt Q9UKL0

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 D； UniProt 1–485	未记录	Isoform 2 of Kelch repeat and BTB domain-containing protein 4 × 2 （Q9NVX7） Histone deacetylase 1 × 1 （Q13547） ZN ZINC ION × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 8VPQ	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2IW5 Structural Basis for CoREST-Dependent Demethylation of Nucleosomes by the Human LSD1 Histone Demethylase 提交 2006-06-26	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 286–482（197 aa）片段：FRAGMENT OF SANT1, LINKER REGION AND SANT2 DOMAIN, RESIDUES 286-482	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 CL CHLORIDE ION × 3 GOL GLYCEROL × 2 NH4 AMMONIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, 20 DEGREES. DROP: 0.8 MICRO-LITERS OF PROTEIN (10 MG/ML IN 25 MM HEPES, PH 7.4, 200 MM SODIUM CHLORIDE, 1 MM PMSF, 5 MM DTT) PLUS 0.8 MICRO-LITERS OF CRYSTALLIZATION SOLUTION (0.8 M LITHIUM SULFATE, 0.8 M AMMONIUM SULFATE, 0.4 M SODIUM CHLORIDE, 0.1 M SODIUM CITRATE, PH 5.6, 10 MM DTT). RESERVOIR: 1 ML OF CRYSTALLIZATION SOLUTION. CRYSTALS APPEARED WITHIN 12 HOURS AND GREW TO THEIR FINAL SIZE WITHIN 10 DAYS. CRYO-PROTECTION SOLUTION: RESERVOIR SOLUTION PLUS 23 PERCENT (V/V) GLYCEROL.	分辨率 2.57 Å R-free 0.212
2UXN Structural Basis of Histone Demethylation by LSD1 Revealed by Suicide Inactivation 提交 2007-03-28	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 286–482（197 aa）片段：FRAGMENT OF SANT1, LINKER REGION AND SANT2 DOMAIN, RESIDUES 286-482	未记录	FDA DIHYDROFLAVINE-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 GOL GLYCEROL × 1 CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.6；PROTEIN: 25 MM HEPES, PH 7.4, 200 MM SODIUM CHLORIDE, 1 MM PMSF, AND 5 MM DTT RESERVOIR: 0.8 M LITHIUM SULFATE, 0.8 M AMMONIUM SULFATE, 0.4 M SODIUM CHLORIDE, 0.1 M SODIUM CITRATE, PH 5.6, AND 10 MM DTT	分辨率 2.72 Å R-free 0.272
2UXX Human LSD1 Histone Demethylase-CoREST in complex with an FAD- tranylcypromine adduct 提交 2007-03-30	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 286–482（197 aa）片段：FRAGMENT OF SANT1, LINKER REGION AND SANT2 DOMAIN, RESIDUES 308-482	未记录	FAJ FAD-trans-2-Phenylcyclopropylamine Adduct × 1 GOL GLYCEROL × 2 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；293 K；VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, 20 DEGREES. DROP: 0.8 MICRO-LITERS OF PROTEIN (10 MG/ML IN 25 MM HEPES, PH 7.4, 200 MM SODIUM CHLORIDE, 1 MM PMSF, 5 MM DTT) PLUS 0.8 MICRO-LITERS OF CRYSTALLIZATION SOLUTION (0.8 M LITHIUM SULFATE, 0.8 M AMMONIUM SULFATE, 0.4 M SODIUM CHLORIDE, 0.1 M SODIUM CITRATE, PH 5.6, 10 MM DTT). RESERVOIR: 1 ML OF CRYSTALLIZATION SOLUTION. CRYSTALS APPEARED WITHIN 12 HOURS AND GREW TO THEIR FINAL SIZE WITHIN 10 DAYS. CRYO-PROTECTION SOLUTION: RESERVOIR SOLUTION PLUS 23 PERCENT (V/V) GLYCEROL.	分辨率 2.74 Å R-free 0.260
2V1D Structural basis of LSD1-CoREST selectivity in histone H3 recognition 提交 2007-05-23	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 305–482（178 aa）片段：305-482	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.10 Å R-free 0.239
2X0L Crystal structure of a neuro-specific splicing variant of human histone lysine demethylase LSD1. 提交 2009-12-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 308–440（133 aa）	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.00 Å R-free 0.252
2XAF Crystal structure of LSD1-CoREST in complex with para-bromo-(+)-cis-2- phenylcyclopropyl-1-amine 提交 2010-03-31	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–482（482 aa）	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 TCF 3-(4-BROMOPHENYL)PROPANAMIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 SODIUM/POTASSIUM TARTRATE, ADA BUFFER PH 6.5	分辨率 3.25 Å R-free 0.229
2XAG Crystal structure of LSD1-CoREST in complex with para-bromo-(-)-trans- 2-phenylcyclopropyl-1-amine 提交 2010-03-31	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–482（482 aa）	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 TCF 3-(4-BROMOPHENYL)PROPANAMIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 SODIUM-POTASSIUM TARTRATE, ADA BUFFER PH 6.5	分辨率 3.10 Å R-free 0.245
2XAH Crystal structure of LSD1-CoREST in complex with (+)-trans-2- phenylcyclopropyl-1-amine 提交 2010-03-31	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–482（482 aa）	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 3PL 3-PHENYLPROPANAL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 SODIUM-POTASSIUM TARTRATE, ADA BUFFER PH 6.5	分辨率 3.10 Å R-free 0.228
2XAJ Crystal structure of LSD1-CoREST in complex with (-)-trans-2- phenylcyclopropyl-1-amine 提交 2010-03-31	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–482（482 aa）	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 TCA PHENYLETHYLENECARBOXYLIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 SODIUM-POTASSIUM TARTRATE, ADA BUFFER PH 6.5	分辨率 3.30 Å R-free 0.227
2XAQ Crystal structure of LSD1-CoREST in complex with a tranylcypromine derivative (MC2584, 13b) 提交 2010-03-31	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–482（482 aa）	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 M84 3-{4-[(PHENYLCARBONYL)AMINO]PHENYL}PROPANOIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 SODIUM-POTASSIUM TARTRATE, ADA BUFFER PH 6.5	分辨率 3.20 Å R-free 0.264
2XAS Crystal structure of LSD1-CoREST in complex with a tranylcypromine derivative (MC2580, 14e) 提交 2010-03-31	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–482（482 aa）	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 M80 3-[4-({N-[(BENZYLOXY)CARBONYL]-L-PHENYLALANYL}AMINO)PHENYL]PROPANOIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 SODIUM-POTASSIUM TARTRATE, ADA BUFFER PH 6.5	分辨率 3.20 Å R-free 0.220
2Y48 Crystal structure of LSD1-CoREST in complex with a N-terminal SNAIL peptide 提交 2011-01-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 305–482（178 aa）片段：RESIDUES 305-482	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 1.2 M SODIUM/POTASSIUM TARTRATE, 100 MM ADA BUFFER PH 6.5	分辨率 3.00 Å R-free 0.246
3ZMS LSD1-CoREST in complex with INSM1 peptide 提交 2013-02-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–482（482 aa）	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；pH 6.5	分辨率 2.96 Å R-free 0.227
3ZMT LSD1-CoREST in complex with PRSFLV peptide 提交 2013-02-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–482（482 aa）	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；pH 6.5	分辨率 3.10 Å R-free 0.230
3ZMU LSD1-CoREST in complex with PKSFLV peptide 提交 2013-02-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–482（482 aa）	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；pH 6.5	分辨率 3.20 Å R-free 0.226
3ZMV LSD1-CoREST in complex with PLSFLV peptide 提交 2013-02-12	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–482（482 aa）	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；pH 6.5	分辨率 3.00 Å R-free 0.258
3ZMZ LSD1-CoREST in complex with PRSFAV peptide 提交 2013-02-13	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–482（482 aa）	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；pH 6.5	分辨率 3.00 Å R-free 0.227
3ZN0 LSD1-CoREST in complex with PRSFAA peptide 提交 2013-02-13	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–482（482 aa）	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；pH 6.5	分辨率 2.80 Å R-free 0.244
3ZN1 LSD1-CoREST in complex with PRLYLV peptide 提交 2013-02-13	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–482（482 aa）	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；pH 6.5	分辨率 3.10 Å R-free 0.230
4BAY Phosphomimetic mutant of LSD1-8a splicing variant in complex with CoREST 提交 2012-09-17	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 308–440（133 aa）片段：RESIDUES 308-440	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；20DEG BY HANGING-DROP VAPOR DIFFUSION METHOD BY MIXING EQUAL VOLUMES OF PROTEIN SAMPLES WITH RESERVOIR SOLUTIONS CONTAINING 1.2 M SODIUM/POTASSIUM TARTRATE AND 100 MM N-(2-ACETAMIDO)IMINODIACETIC ACID, PH 6.5	分辨率 3.10 Å R-free 0.226
4UV8 LSD1(KDM1A)-CoREST in complex with 1-Benzyl-Tranylcypromine 提交 2014-08-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–482（482 aa）	未记录	D69 [[(2R,3S,4S)-5-[(4aS,10aS)-4a-[(1S)-3-azanylidene-1,4-diphenyl-butyl]-7,8-dimethyl-2,4-bis(oxidanylidene)-5,10a-dihydro-1H-benzo[g]pteridin-10-yl]-2,3,4-tris(oxidanyl)pentoxy]-oxidanyl-phosphoryl] [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl hydrogen phosphate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；pH 6.5	分辨率 2.80 Å R-free 0.237
4UV9 LSD1(KDM1A)-CoREST in complex with 1-Ethyl-Tranylcypromine 提交 2014-08-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–482（482 aa）	未记录	D70 [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]methyl (2R,3S,4S)-2,3,4-trihydroxy-5-[(4aS,10aS)-4a-[(1S,3E)-3-imino-1-phenylpentyl]-7,8-dimethyl-2,4-dioxo-1,3,4,4a,5,10a-hexahydrobenzo[g]pteridin-10(2H)-yl]pentyl dihydrogen diphosphate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；PH 6.5	分辨率 3.00 Å R-free 0.246
4UVA LSD1(KDM1A)-CoREST in complex with 1-Methyl-Tranylcypromine (1R,2S) 提交 2014-08-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–482（482 aa）	未记录	D73 [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]methyl (2R,3S,4S)-2,3,4-trihydroxy-5-[(4aS)-4a-[(1S,3E)-3-imino-1-phenylbutyl]-7,8-dimethyl-2,4-dioxo-3,4,4a,5-tetrahydrobenzo[g]pteridin-10(2H)-yl]pentyl dihydrogen diphosphate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；PH 6.5	分辨率 2.90 Å R-free 0.232
4UVB LSD1(KDM1A)-CoREST in complex with 1-Methyl-Tranylcypromine (1S,2R) 提交 2014-08-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–482（482 aa）	未记录	D51 [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]methyl (2R,3S,4S)-5-[(1R,3S,3aS,7aS)-1-amino-1,10,11-trimethyl-4,6-dioxo-3-phenyl-2,3,5,6,7,7a-hexahydro-1H-benzo[g]pyrrolo[2,1-e]pteridin-8(4H)-yl]-2,3,4-trihydroxypentyl dihydrogen diphosphate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；pH 6.5	分辨率 2.80 Å R-free 0.236
4UVC LSD1(KDM1A)-CoREST in complex with 1-Phenyl-Tranylcypromine 提交 2014-08-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–482（482 aa）	未记录	D52 [[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] [(2R,3S,4S)-5-[5-[(1S)-1-azanyl-1,3-diphenyl-propyl]-7,8-dimethyl-2,4-bis(oxidanylidene)-4aH-benzo[g]pteridin-10-yl]-2,3,4-tris(oxidanyl)pentyl] hydrogen phosphate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；pH 6.5	分辨率 3.10 Å R-free 0.241
4UXN LSD1(KDM1A)-CoREST in complex with Z-Pro derivative of MC2580 提交 2014-08-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–482（482 aa）	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 M8A benzyl (2R)-2-{[4-(3-oxopropyl)phenyl]carbamoyl}pyrrolidine-1-carboxylate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；PH 6.5	分辨率 2.85 Å R-free 0.215
4XBF Structure of LSD1:CoREST in complex with ssRNA 提交 2014-12-16	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：dodecameric	链 B 308–440（133 aa）片段：UNP residues 308-440	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 4 SO4 SULFATE ION × 20 GOL GLYCEROL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；290 K；The LSD1-CoREST complex 10-12 mg/ml concentration (in 25 mM HEPES-Na, pH 7.4, 100 mM NaCl, 5 mM DTT, 1 mM PMSF) was mixed (1:1) with the reservoir solution [0.60 M Li2SO4, 0.63 M (NH4)2SO4, 0.25 M NaCl, 100 mM Na-citrate, pH 5.6, 10 mM DTT]	分辨率 2.80 Å R-free 0.227
5H6Q Crystal structure of LSD1-CoREST in complex with peptide 11 提交 2016-11-14	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 308–440（133 aa）片段：UNP RESIDUES 308-440	未记录	GOL GLYCEROL × 4 FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M N-(2-Acetamido) iminodiacetic acid, 1.23 M potassium sodium tartrate tetrahydrate.	分辨率 2.53 Å R-free 0.247
5H6R Crystal structure of LSD1-CoREST in complex with peptide 13 提交 2016-11-14	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 308–440（133 aa）片段：UNP RESIDUES 308-440	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；0.1 M N-(2-Acetamido) iminodiacetic acid (pH 5.5), 1.23 M potassium sodium tartrate tetrahydrate	分辨率 2.60 Å R-free 0.231
5L3B Human LSD1/CoREST: LSD1 D556G mutation 提交 2016-04-06	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–482（482 aa）	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；Tartrate 1-1.4 M, ADA 100 mM pH 6.5	分辨率 3.30 Å R-free 0.208
5L3C Human LSD1/CoREST: LSD1 E379K mutation 提交 2016-04-06	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–482（482 aa）	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；Tartrate 1-1.4 M, ADA 100 mM pH 6.5	分辨率 3.31 Å R-free 0.223
5L3D Human LSD1/CoREST: LSD1 Y761H mutation 提交 2016-04-06	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–482（482 aa）	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；298 K；Tartrate 1-1.4 M, ADA 100 mM pH 5.6	分辨率 2.60 Å R-free 0.219
5L3E LSD1-CoREST1 in complex with quinazoline-derivative reversible inhibitor 提交 2016-04-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 305–482（178 aa）	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 E11 N~4~-(1-benzylpiperidin-4-yl)-N~2~-[3-(dimethylamino)propyl]-6,7-dimethoxyquinazoline-2,4-diamine × 5 NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.3 M Na/K Tartrate, 100 mM ADA	分辨率 2.80 Å R-free 0.224
5L3F LSD1-CoREST1 in complex with polymyxin B 提交 2016-04-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 305–482（178 aa）	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.3 M Na/K Tartrate 100 mM ADA	分辨率 3.50 Å R-free 0.210
5L3G LSD1-CoREST1 in complex with polymyxin E (colistin) 提交 2016-04-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 305–482（178 aa）	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 NA SODIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.3 M Na/K Tartrate 100 mM ADA	分辨率 3.10 Å R-free 0.197
5LBQ LSD1-CoREST1 in complex with quinazoline-derivative reversible inhibitor 提交 2016-06-16	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 305–482（178 aa）	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 767 N2-(3-(dimethylamino)propyl)-6,7-dimethoxy-N4,N4-dimethylquinazoline-2,4-diamine × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；100 mM ADA pH 6.5 1.2 M Na/Ka Tartrate	分辨率 3.30 Å R-free 0.250
5LGN Thieno[3,2-b]pyrrole-5-carboxamides as Novel Reversible Inhibitors of Histone Lysine Demethylase KDM1A/LSD1: Compound 19 提交 2016-07-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 308–440（133 aa）	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 6W0 ~{N}-[3-(methoxymethyl)phenyl]-4-methyl-thieno[3,2-b]pyrrole-5-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.6；297 K；Sodium Tartrate 1.2 M as precipitant in Sodium Citrate buffer pH 5.6	分辨率 3.20 Å R-free 0.220
5LGT Thieno[3,2-b]pyrrole-5-carboxamides as Novel Reversible Inhibitors of Histone Lysine Demethylase KDM1A/LSD1: Compound 15 提交 2016-07-08	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 305–482（178 aa）	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 6W3 4-methyl-~{N}-[2-[[4-(1-methylpiperidin-4-yl)oxyphenoxy]methyl]phenyl]thieno[3,2-b]pyrrole-5-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；293 K；Hanging-drop vapor diffusion method at 20 C by mixing equal volumes of 100 microM LSD1-CoREST solution in 5% (w/v) glycerol, 25 mm potassium phosphate, pH 7.2, with reservoir solutions containing 1.2 M sodium/potassium tartrate and 100 mmN-(2-acetamido)-2-iminodiacetic acid, pH 6.5.	分辨率 3.00 Å R-free 0.230
5LGU Thieno[3,2-b]pyrrole-5-carboxamides as Novel Reversible Inhibitors of Histone Lysine Demethylase KDM1A/LSD1: Compound 34 提交 2016-07-08	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 305–482（178 aa）	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 6W1 4-methyl-~{N}-[2-[[4-[[(3~{R})-pyrrolidin-3-yl]methoxy]phenoxy]methyl]phenyl]thieno[3,2-b]pyrrole-5-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；293 K；The hanging-drop vapor diffusion method at 20 C by mixing equal volumes of 100 microM LSD1-CoREST solution in 5% (w/v) glycerol, 25 mm potassium phosphate, pH 7.2, with reservoir solutions containing 1.2 M sodium/potassium tartrate and 100 mmN-(2-acetamido)-2-iminodiacetic acid, pH 6.5.	分辨率 3.20 Å R-free 0.206
5LHG Structure of the KDM1A/CoREST complex with the inhibitor 4-methyl-N-[4-[[4-(1-methylpiperidin-4-yl)oxyphenoxy]methyl]phenyl]thieno[3,2-b]pyrrole-5-carboxamide 提交 2016-07-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–482（482 aa）	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 GOL GLYCEROL × 4 6X3 4-methyl-N-[4-[[4-[(1-methyl-4-piperidyl)oxy]phenoxy]methyl]phenyl]thieno[3,2-b]pyrrole-5-carboxamide × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；1.1-1.2 M Na/K tartrate 0.1 M ADA pH 6.0	分辨率 3.34 Å R-free 0.192
5LHH Structure of the KDM1A/CoREST complex with the inhibitor 4-ethyl-N-[3-(methoxymethyl)-2-[[4-[[(3R)-pyrrolidin-3-yl]methoxy]phenoxy]methyl]phenyl]thieno[3,2-b]pyrrole-5-carboxamide 提交 2016-07-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–482（482 aa）	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 GOL GLYCEROL × 6 6X0 4-ethyl-~{N}-[3-(methoxymethyl)-2-[[4-[[(3~{R})-pyrrolidin-3-yl]methoxy]phenoxy]methyl]phenyl]thieno[3,2-b]pyrrole-5-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；1.1-1.2 M Na/K tartrate 0.1 M ADA pH 6.0	分辨率 3.05 Å R-free 0.186
5LHI Structure of the KDM1A/CoREST complex with the inhibitor N-[3-(ethoxymethyl)-2-[[4-[[(3R)-pyrrolidin-3-yl]methoxy]phenoxy]methyl]phenyl]-4-methylthieno[3,2-b]pyrrole-5-carboxamide 提交 2016-07-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–482（482 aa）	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 6X5 ~{N}-[3-(ethoxymethyl)-2-[[4-[[(3~{R})-pyrrolidin-3-yl]methoxy]phenoxy]methyl]phenyl]-4-methyl-thieno[3,2-b]pyrrole-5-carboxamide × 1 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；1.1-1.2 M Na/K tartrate 0.1 M ADA pH 6.0	分辨率 3.40 Å R-free 0.225
5X60 Crystal structure of LSD1-CoREST in complex with peptide 9 提交 2017-02-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 311–443（133 aa）片段：UNP RESIDUES 311-443	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 GOL GLYCEROL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M N-(2-acetamido)iminodiacetic acid, 1.23 M potassium sodium tartrate tetrahydrate.	分辨率 2.69 Å R-free 0.236
5YJB LSD1-CoREST in complex with 4-[5-(piperidin-4-ylmethoxy)-2-(p-tolyl)pyridin-3-yl]benzonitrile 提交 2017-10-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 311–443（133 aa）片段：UNP residues 311-443	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 8WC 4-[2-(4-methylphenyl)-5-(piperidin-4-ylmethoxy)pyridin-3-yl]benzenecarbonitrile × 1 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M N-(2-ACETAMIDO)IMINODIACETIC ACID (PH 5.5), 1.23M POTASSIUM SODIUM TARTRATE TETRAHYDRATE	分辨率 2.96 Å R-free 0.219
6K3E LSD1/Co-Rest structure with an inhibitor 提交 2019-05-17	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 311–443（133 aa）	未记录	CW0 piperidin-4-ylmethyl 4-fluoranyl-4-[[[(1~{R},2~{S})-2-phenylcyclopropyl]amino]methyl]piperidine-1-carboxylate × 1 DTT 2,3-DIHYDROXY-1,4-DITHIOBUTANE × 1 ACT ACETATE ION × 2 MLA MALONIC ACID × 3 GOL GLYCEROL × 4 D3U 2-PCPA derivative × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 12 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；36% Tacsimate	分辨率 2.87 Å R-free 0.223
6KGK LSD1-CoREST-S2101 five-membered ring adduct model 提交 2019-07-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 311–443（133 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 3 DJ0 3-[3,5-bis(fluoranyl)-2-phenylmethoxy-phenyl]propanal × 1 FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M N-(carbamoylmethyl)iminodiacetic acid (pH 5.5), 1.23 M potassium sodium tartrate	分辨率 2.70 Å R-free 0.206
6KGL LSD1-CoREST-S2101 N5 adduct model 提交 2019-07-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 311–443（133 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 3 DJ0 3-[3,5-bis(fluoranyl)-2-phenylmethoxy-phenyl]propanal × 1 FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M N-(carbamoylmethyl)iminodiacetic acid (pH 5.5), 1.28 M potassium sodium tartrate	分辨率 2.70 Å R-free 0.205
6KGM LSD1-CoREST-S2116 five-membered ring adduct model 提交 2019-07-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 311–443（133 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 5 DJ0 3-[3,5-bis(fluoranyl)-2-phenylmethoxy-phenyl]propanal × 1 FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M N-(carbamoylmethyl)iminodiacetic acid (pH 5.5), 1.28 M potassium sodium tartrate	分辨率 2.62 Å R-free 0.195
6KGN LSD1-CoREST-S2116 N5 adduct model 提交 2019-07-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 311–443（133 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 5 DJ0 3-[3,5-bis(fluoranyl)-2-phenylmethoxy-phenyl]propanal × 1 FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M N-(carbamoylmethyl)iminodiacetic acid (pH 5.5), 1.28 M potassium sodium tartrate	分辨率 2.62 Å R-free 0.194
6S35 LSD1/CoREST1 complex with macrocyclic peptide inhibitor 提交 2019-06-24	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 308–485（178 aa）	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；295 K；Crystallization: hanging drop, 2 uL total, 1:1 protein-to-reservoir. Protein: 11 mg/mL in 50 mM HEPES, 200 mM NaCl, 2 mM DTT, pH 7.5. Reservoir: 100 mM sodium citrate/citric acid, 1.1 M sodium tartrate, pH 5.5. Soaking: 100 mM sodium citrate/citric acid, 1.5 M sodium tartrate, 10% glycerol, 1 mM ligand, pH 5.5.	分辨率 3.10 Å R-free 0.213
6TE1 Structure of the KDM1A/CoREST complex with the inhibitor 2-[3-{4-chloro-3-[(4-chlorophenyl)ethynyl]phenyl}-1-(3-morpholin-4-ylpropyl)-1,4,6,7-tetrahydro-5H-pyrazolo[4,3-c]pyridin-5-yl]-2-oxoethanol 提交 2019-11-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–482（482 aa）	未记录	N4K 5-[4-cyclobutyl-1-[2-(4-piperidin-4-yloxyphenoxy)ethyl]imidazol-2-yl]-4-methyl-thieno[3,2-b]pyrrole × 2 FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 GOL GLYCEROL × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；1.1-1.2 M NA/K TARTRATE 0.1 M ADA	分辨率 3.11 Å R-free 0.192
6TUY Human LSD1/CoREST bound to the quinazoline inhibitor MC4106 提交 2020-01-08	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–485（485 aa）	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 NY8 ~{N}2-[3-(dimethylamino)propyl]-6,7-dimethoxy-~{N}4-[1-(naphthalen-2-ylmethyl)piperidin-4-yl]quinazoline-2,4-diamine × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 1 CL CHLORIDE ION × 5 GOL GLYCEROL × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；293 K；20 degrees C in 100 mM N-(2- acetamido)iminodiacetic acid (pH 6.5) and 1.2 M Na-K tartrate	分辨率 2.60 Å R-free 0.223
6VYP Crystal structure of the LSD1/CoREST histone demethylase bound to its nucleosome substrate 提交 2020-02-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 L 289–443（155 aa）链 N 289–443（155 aa）	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 7.5；277 K；25 mM HEPES pH7.5, 75 mM triammonium citrate, 10% PEG2000-MME, Modified Microbatch under oil	分辨率 4.99 Å R-free 0.277
6VYP Crystal structure of the LSD1/CoREST histone demethylase bound to its nucleosome substrate 提交 2020-02-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric	链 l 289–443（155 aa）链 n 289–443（155 aa）	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 7.5；277 K；25 mM HEPES pH7.5, 75 mM triammonium citrate, 10% PEG2000-MME, Modified Microbatch under oil	分辨率 4.99 Å R-free 0.277
6W4K Crystal structure of Lysine Specific Demethylase 1 (LSD1) with CC-90011 提交 2020-03-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 312–443（132 aa）	未记录	V0Y 4-[2-(4-aminopiperidin-1-yl)-5-(3-fluoro-4-methoxyphenyl)-1-methyl-6-oxo-1,6-dihydropyrimidin-4-yl]-2-fluorobenzonitrile × 1 FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；1.3M Na Tartrate	分辨率 2.93 Å R-free 0.235
6WC6 Crystal structure of a truncated LSD1:CoREST in the presence of an LSD1-NT peptide 提交 2020-03-29	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 308–440（133 aa）	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；298 K；The LSD1-CoREST complex 10mg/ml concentration (in 25 mM HEPES-Na, pH 7.4, 100 mM NaCl, 1 mM TCEP) was mixed (1:1) with the reservoir solution [0.60 M Li2SO4, 0.63 M (NH4)2SO4, 0.25 M NaCl, 100 mM Na-citrate, pH 5.6, 5 mM TCEP]. When get crystals, soak the crystals within 5mM LSD1-NT peptide.	分辨率 3.10 Å R-free 0.236
7CDC Crystal structure of LSD1-CoREST in complex with PRSFLVRRP peptide 提交 2020-06-19	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 311–443（133 aa）	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M N-(carbamoylmethyl)iminodiacetic acid, 1.23 M potassium sodium tartrate tetrahydrate	分辨率 2.64 Å R-free 0.231
7CDD Crystal structure of LSD1-CoREST in complex with PRSFLVRR peptide 提交 2020-06-19	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 311–443（133 aa）	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M N-(carbamoylmethyl)iminodiacetic acid, 1.23 M potassium sodium tartrate tetrahydrate	分辨率 2.76 Å R-free 0.227
7CDE Crystal structure of LSD1-CoREST in complex with PRSFLVRKR peptide 提交 2020-06-19	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 311–443（133 aa）	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 GOL GLYCEROL × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M N-(carbamoylmethyl)iminodiacetic acid, 1.23 M potassium sodium tartrate tetrahydrate	分辨率 2.68 Å R-free 0.233
7CDF Crystal structure of LSD1-CoREST in complex with PRSFLVRRK peptide 提交 2020-06-19	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 311–443（133 aa）	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 GOL GLYCEROL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M N-(carbamoylmethyl)iminodiacetic acid, 1.23 M potassium sodium tartrate tetrahydrate	分辨率 2.68 Å R-free 0.241
7CDG Crystal structure of LSD1-CoREST in complex with PRSFLVRRR peptide 提交 2020-06-19	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 311–443（133 aa）	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 GOL GLYCEROL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M N-(carbamoylmethyl)iminodiacetic acid, 1.23 M potassium sodium tartrate tetrahydrate	分辨率 2.80 Å R-free 0.242
7ZRY Structure of the 2a splicing variant of the full-length human LSD1 bound to CoREST (delta305) 提交 2022-05-06	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 305–482（178 aa）	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；1.0-1.3 M Na/K Tartrate, 0.1 M ADA pH 6.5	分辨率 2.70 Å R-free 0.241
8BOP LSD1-CoREST in complex with AW4, long soaking 提交 2022-11-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 308–443（136 aa）	未记录	SV9 [[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] [(2~{R},3~{S},4~{S})-5-[7,8-dimethyl-2,4-bis(oxidanylidene)-5-[3-[4-(3-phenylphenyl)phenyl]propanoyl]-1~{H}-benzo[g]pteridin-10-yl]-2,3,4-tris(oxidanyl)pentyl] hydrogen phosphate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2 Na/K Tartrate, 100 mM ADA pH 6.5	分辨率 2.74 Å R-free 0.262
8BOX LSD1-CoREST in complex with AW4 and SNAG peptide 提交 2022-11-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 308–443（136 aa）	未记录	SV9 [[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] [(2~{R},3~{S},4~{S})-5-[7,8-dimethyl-2,4-bis(oxidanylidene)-5-[3-[4-(3-phenylphenyl)phenyl]propanoyl]-1~{H}-benzo[g]pteridin-10-yl]-2,3,4-tris(oxidanyl)pentyl] hydrogen phosphate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2 Na/K Tartrate, 100 mM ADA pH 6.5	分辨率 2.82 Å R-free 0.229
8F2Z LSD1-CoREST in complex with AW2, short soaking 提交 2022-11-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 308–443（136 aa）	未记录	XB3 [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methyl (2R,3S,4S)-5-[(1R,3S,3aS,13R)-3-([1,1'-biphenyl]-4-yl)-1-hydroxy-10,11-dimethyl-4,6-dioxo-2,3,5,6-tetrahydro-1H-benzo[g]pyrrolo[2,1-e]pteridin-8(4H)-yl]-2,3,4-trihydroxypentyl dihydrogen diphosphate (non-preferred name) × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2 M Na/K Tartrate, 100 mM ADA pH 6.5	分辨率 3.00 Å R-free 0.246
8F30 LSD1-CoREST in complex with AW2, long soaking 提交 2022-11-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 308–443（136 aa）	未记录	XB6 [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methyl (2R,3S,4S)-5-{5-[3-([1,1'-biphenyl]-4-yl)propanoyl]-7,8-dimethyl-2,4-dioxo-1,3,4,5-tetrahydrobenzo[g]pteridin-10(2H)-yl}-2,3,4-trihydroxypentyl dihydrogen diphosphate (non-preferred name) × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2 Na/K Tartrate, 100 mM ADA pH 6.5	分辨率 3.10 Å R-free 0.223
8F59 LSD1-CoREST in complex with AW2 and SNAG peptide 提交 2022-11-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 308–443（136 aa）	未记录	XB6 [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methyl (2R,3S,4S)-5-{5-[3-([1,1'-biphenyl]-4-yl)propanoyl]-7,8-dimethyl-2,4-dioxo-1,3,4,5-tetrahydrobenzo[g]pteridin-10(2H)-yl}-2,3,4-trihydroxypentyl dihydrogen diphosphate (non-preferred name) × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2 Na/K Tartrate, 100 mM ADA pH 6.5	分辨率 2.80 Å R-free 0.234
8F6S LSD1-CoREST in complex with T105 提交 2022-11-17	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 308–443（136 aa）	未记录	XHT [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methyl (2S,3R,4S)-2,3,4-trihydroxy-5-[(1R,3R,3aS,13R)-1-hydroxy-10,11-dimethyl-3-{3-[(5-methyl-1,3,4-thiadiazol-2-yl)carbamoyl]phenyl}-4,6-dioxo-2,3,5,6-tetrahydro-1H-benzo[g]pyrrolo[2,1-e]pteridin-8(4H)-yl]pentyl dihydrogen diphosphate (non-preferred name) × 1 XHX 3-[(1R,2S)-2-(cyclobutylamino)cyclopropyl]-N-(5-methyl-1,3,4-thiadiazol-2-yl)benzamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2 Na/K Tartrate, 100 mM ADA pH 6.5	分辨率 2.91 Å R-free 0.244
8FDV LSD1-CoREST in complex N-formyl FAD and SNAG peptide 提交 2022-12-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 308–443（136 aa）	未记录	HUF [[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] [(2R,3S,4S)-5-[5-methanoyl-7,8-dimethyl-2,4-bis(oxidanylidene)-1H-benzo[g]pteridin-10-yl]-2,3,4-tris(oxidanyl)pentyl] hydrogen phosphate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2 Na/K Tartrate, 100 mM ADA pH 6.5	分辨率 2.95 Å R-free 0.252
8FJ4 LSD1-CoREST in complex with T108, short soaking 提交 2022-12-19	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 308–443（136 aa）	未记录	XZU 3-[(1R,2S)-2-(cyclobutylamino)cyclopropyl]-N-phenylbenzamide × 3 XZQ [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methyl (2R,3S,4S)-2,3,4-trihydroxy-5-[(1R,3R,3aS,13R)-1-hydroxy-10,11-dimethyl-4,6-dioxo-3-[3-(phenylcarbamoyl)phenyl]-2,3,5,6-tetrahydro-1H-benzo[g]pyrrolo[2,1-e]pteridin-8(4H)-yl]pentyl dihydrogen diphosphate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2 Na/K Tartrate, 100 mM ADA pH 6.5	分辨率 2.76 Å R-free 0.248
8FJ7 LSD1-CoREST in complex with T108 and SNAG peptide 提交 2022-12-19	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 308–443（136 aa）	未记录	Y0Z [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methyl (2R,3S,4S)-5-[7,8-dimethyl-2,4-dioxo-5-{3-[3-(phenylcarbamoyl)phenyl]propanoyl}-1,3,4,5-tetrahydrobenzo[g]pteridin-10(2H)-yl]-2,3,4-trihydroxypentyl dihydrogen diphosphate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2 Na/K Tartrate, 100 mM ADA pH 6.5	分辨率 2.80 Å R-free 0.243
8FQJ LSD1-CoREST in complex with T14, short soaking 提交 2023-01-06	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 308–443（136 aa）	未记录	Y66 [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methyl (2S,3R,4R)-2,3,4-trihydroxy-5-[(1R,3S,3aS,13R)-1-hydroxy-10,11-dimethyl-3-{4-[(5-methyl-1,3,4-thiadiazol-2-yl)carbamoyl]phenyl}-4,6-dioxo-2,3,5,6-tetrahydro-1H-benzo[g]pyrrolo[2,1-e]pteridin-8(4H)-yl]pentyl dihydrogen diphosphate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2 Na/K Tartrate, 100 mM ADA pH 6.5	分辨率 2.90 Å R-free 0.246
8FRI LSD1-CoREST in complex with AW4, short soaking 提交 2023-01-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 308–443（136 aa）	未记录	Y9K [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methyl (2R,3S,4S)-2,3,4-trihydroxy-5-[(1R,3S,3aS,13R)-1-hydroxy-10,11-dimethyl-4,6-dioxo-3-([1~1~,2~1~:2~3~,3~1~-terphenyl]-1~4~-yl)-2,3,5,6-tetrahydro-1H-benzo[g]pyrrolo[2,1-e]pteridin-8(4H)-yl]pentyl dihydrogen diphosphate (non-preferred name) × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2 M Sodium/Potassium Tartrate, 100 mM ADA pH 6.5	分辨率 2.80 Å R-free 0.241
8FRQ LSD1-CoREST in complex with T14, long soaking 提交 2023-01-08	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 308–443（136 aa）	未记录	XF6 [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methyl (2R,3S,4S)-5-[(4aS)-7,8-dimethyl-5-(3-{4-[(5-methyl-1,3,4-thiadiazol-2-yl)carbamoyl]phenyl}propanoyl)-2,4-dioxo-3,4,4a,5-tetrahydrobenzo[g]pteridin-10(2H)-yl]-2,3,4-trihydroxypentyl dihydrogen diphosphate (non-preferred name) × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2 Na/K Tartrate, 100 mM ADA pH 6.5	分辨率 2.89 Å R-free 0.241
8FRV LSD1-CoREST in complex with T17, short soaking 提交 2023-01-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 308–443（136 aa）	未记录	YAF [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methyl (2R,3S,4S)-5-[(1R,3S,3aS,13R)-3-[3-(dimethylcarbamoyl)phenyl]-1-hydroxy-10,11-dimethyl-4,6-dioxo-2,3,5,6-tetrahydro-1H-benzo[g]pyrrolo[2,1-e]pteridin-8(4H)-yl]-2,3,4-trihydroxypentyl dihydrogen diphosphate (non-preferred name) × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；1.2 Sodium/Potassium Tartrate, 100 mM ADA pH 6.5	分辨率 2.72 Å R-free 0.248
8FSK LSD1-CoREST in complex with T18, short soaking 提交 2023-01-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 308–443（136 aa）	未记录	YAO [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methyl (2R,3S,4S)-5-[(1R,3S,3aS,13R)-3-(3-benzamidophenyl)-1-hydroxy-10,11-dimethyl-4,6-dioxo-2,3,5,6-tetrahydro-1H-benzo[g]pyrrolo[2,1-e]pteridin-8(4H)-yl]-2,3,4-trihydroxypentyl dihydrogen diphosphate (non-preferred name) × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2 Sodium/Potassium Tartrate, 100 mM ADA pH 6.5	分辨率 3.13 Å R-free 0.223
8GJ6 LSD1-CoREST in complex with T16 提交 2023-03-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 308–443（136 aa）	未记录	ZSI [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methyl (2R,3S,4S)-2,3,4-trihydroxy-5-[(1R,3S,3aS,13R)-1-hydroxy-10,11-dimethyl-3-[3-(methylcarbamoyl)phenyl]-4,6-dioxo-2,3,5,6-tetrahydro-1H-benzo[g]pyrrolo[2,1-e]pteridin-8(4H)-yl]pentyl dihydrogen diphosphate (non-preferred name) × 1 K POTASSIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2 Sodium/Potassium Tartrate, 100 mM ADA pH 6.5	分辨率 2.77 Å R-free 0.251
8JF5 Crystal structure of Lysine Specific Demethylase 1 (LSD1) with TAS1440 提交 2023-05-17	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 311–443（133 aa）	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 GOL GLYCEROL × 2 UEU 4-[5-[(3~{R})-3-azanylpyrrolidin-1-yl]carbonyl-2-[2-fluoranyl-4-(2-methyl-2-oxidanyl-propyl)phenyl]phenyl]-2-fluoranyl-benzenecarbonitrile × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；293 K；100mM ADA pH6.5, 1.22M Na/K Tartrate	分辨率 3.20 Å R-free 0.230
8Q1G LSD1-CoREST bound to Acetylated K14 of Histone H3 提交 2023-07-31	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 305–482（178 aa）	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；Sodium Tartrate 1.2M, ADA 0.1M,	分辨率 2.60 Å R-free 0.255
8Q1H LSD1 Y391K-CoREST bound to Histone H3 N-terminal tail 提交 2023-07-31	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 305–482（178 aa）	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；Sodium Tartrate 1.2 M, ADA 0.1M	分辨率 2.90 Å R-free 0.254
8Q1J LSD1 Y391K-CoREST bound to Acetylated K14 of Histone H3 提交 2023-07-31	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 305–482（178 aa）	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；Sodium Tartate 1.2 M, ADA 0.1M	分辨率 2.87 Å R-free 0.272
8UL6 LSD1-CoREST in complex with T16, long soaking 提交 2023-10-16	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 308–443（136 aa）	未记录	ZSI [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methyl (2R,3S,4S)-2,3,4-trihydroxy-5-[(1R,3S,3aS,13R)-1-hydroxy-10,11-dimethyl-3-[3-(methylcarbamoyl)phenyl]-4,6-dioxo-2,3,5,6-tetrahydro-1H-benzo[g]pyrrolo[2,1-e]pteridin-8(4H)-yl]pentyl dihydrogen diphosphate (non-preferred name) × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2 Sodium Potassium Tartrate, 100 mM ADA pH 6.5	分辨率 2.74 Å R-free 0.241
8UL8 LSD1-CoREST in complex with T15, short soaking 提交 2023-10-16	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 308–443（136 aa）	未记录	XRK methyl 3-{(1R,3S,3aS,13R)-8-[(2S,3S,4R)-5-{[(S)-{[(S)-{[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methoxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}-2,3,4-trihydroxypentyl]-1-hydroxy-10,11-dimethyl-4,6-dioxo-2,3,4,5,6,8-hexahydro-1H-benzo[g]pyrrolo[2,1-e]pteridin-3-yl}benzoate (non-preferred name) × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.2 Na/K Tartrate, 100 mM ADA pH 6.5	分辨率 2.82 Å R-free 0.247
8ULB LSD1-CoREST in complex with T17, long soaking 提交 2023-10-16	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 308–443（136 aa）	未记录	YAF [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methyl (2R,3S,4S)-5-[(1R,3S,3aS,13R)-3-[3-(dimethylcarbamoyl)phenyl]-1-hydroxy-10,11-dimethyl-4,6-dioxo-2,3,5,6-tetrahydro-1H-benzo[g]pyrrolo[2,1-e]pteridin-8(4H)-yl]-2,3,4-trihydroxypentyl dihydrogen diphosphate (non-preferred name) × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.2 M Sodium Potassium Tartrate, 100 mM ADA pH 6.5	分辨率 3.41 Å R-free 0.216
8ULC LSD1-CoREST in complex with T15, long soaking 提交 2023-10-16	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 308–443（136 aa）	未记录	XRK methyl 3-{(1R,3S,3aS,13R)-8-[(2S,3S,4R)-5-{[(S)-{[(S)-{[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methoxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}-2,3,4-trihydroxypentyl]-1-hydroxy-10,11-dimethyl-4,6-dioxo-2,3,4,5,6,8-hexahydro-1H-benzo[g]pyrrolo[2,1-e]pteridin-3-yl}benzoate (non-preferred name) × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.2 M Sodium Potassium Tartrate, 100 mM ADA pH 6.5	分辨率 2.82 Å R-free 0.255
8ULZ LSD1-CoREST in complex with T18 and SNAG peptide 提交 2023-10-17	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 308–443（136 aa）	未记录	YAO [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methyl (2R,3S,4S)-5-[(1R,3S,3aS,13R)-3-(3-benzamidophenyl)-1-hydroxy-10,11-dimethyl-4,6-dioxo-2,3,5,6-tetrahydro-1H-benzo[g]pyrrolo[2,1-e]pteridin-8(4H)-yl]-2,3,4-trihydroxypentyl dihydrogen diphosphate (non-preferred name) × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.2 Sodium Potassium Tartrate, 100 mM ADA pH 6.5	分辨率 3.32 Å R-free 0.231
8UMQ LSD1-CoREST in complex with T18, long soaking 提交 2023-10-18	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 308–443（136 aa）	未记录	YAO [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methyl (2R,3S,4S)-5-[(1R,3S,3aS,13R)-3-(3-benzamidophenyl)-1-hydroxy-10,11-dimethyl-4,6-dioxo-2,3,5,6-tetrahydro-1H-benzo[g]pyrrolo[2,1-e]pteridin-8(4H)-yl]-2,3,4-trihydroxypentyl dihydrogen diphosphate (non-preferred name) × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.2 Sodium Potassium Tartrate, 100 mM ADA pH 6.5	分辨率 3.26 Å R-free 0.209
8UNI LSD1-CoREST with N-formyl-FAD in complex with H3K4M histone tail 提交 2023-10-19	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 308–443（136 aa）	未记录	HUF [[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] [(2R,3S,4S)-5-[5-methanoyl-7,8-dimethyl-2,4-bis(oxidanylidene)-1H-benzo[g]pteridin-10-yl]-2,3,4-tris(oxidanyl)pentyl] hydrogen phosphate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.2 M Sodium Potassium Tartrate, 100 mM ADA pH 6.5	分辨率 3.40 Å R-free 0.252
8UOM LSD1-CoREST with N-formyl-FAD in complex with H3dimeK4 histone tail 提交 2023-10-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 308–443（136 aa）	未记录	HUF [[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] [(2R,3S,4S)-5-[5-methanoyl-7,8-dimethyl-2,4-bis(oxidanylidene)-1H-benzo[g]pteridin-10-yl]-2,3,4-tris(oxidanyl)pentyl] hydrogen phosphate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.2 Na/K Tartrate, 100 mM ADA pH 6.5	分辨率 3.20 Å R-free 0.240
8VOJ The Cryo-EM structure of LSD1-CoREST-HDAC1 in complex with KBTBD4 enhanced by UM171 and IP6 提交 2024-01-15	构建体不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 86–485（400 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 A1ACV (1r,4r)-N~1~-[(7P)-2-benzyl-7-(2-methyl-2H-tetrazol-5-yl)-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl]cyclohexane-1,4-diamine × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.77 Å
8VRT The structure of LSD1-CoREST-HDAC1 in complex with KBTBD4R313PRR mutant 提交 2024-01-22	构建体不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 86–485（400 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.42 Å
8YM7 Crystal structure of Lysine Specific Demethylase 1 (LSD1) with JH-45 提交 2024-03-08	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 310–443（134 aa）	未记录	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 A1LZJ 4-[5-(4-azanylpiperidin-1-yl)-8-(4-methylphenyl)pyrido[3,4-b]pyrazin-7-yl]-2-fluoranyl-benzenecarbonitrile × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M Sodium acetate pH 4.6 1.2 M Sodium malonate	分辨率 2.83 Å R-free 0.248
9DBP Crystal structure of the LSD1/CoREST histone demethylase in complex with the cofactor FAD and the inhibitor GSK690 提交 2024-08-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 312–442（131 aa）	突变：K315A,K381A,V425A,R428A	FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 GOL GLYCEROL × 2 A1A5U 4-[2-(4-methylphenyl)-5-{[(3R)-pyrrolidin-3-yl]methoxy}pyridin-3-yl]benzonitrile × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；100 mM ADA, 1.2 - 1.6M N/K and 3% w/v D-(+)-Glucose monohydrate	分辨率 2.66 Å R-free 0.250
9DTQ The structure of HDAC2-CoREST in complex with KBTBD4R313PRR mutant 提交 2024-10-01	构建体不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 86–485（400 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.87 Å
9DWU CoREST complex bound to U2AF2 提交 2024-10-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 311–379（69 aa）片段：UNP residues 311-379	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.14 Å
9EL7 LSD1-CoREST in complex with T105 enantiomer (1R,2S) 提交 2024-12-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 308–443（136 aa）	未记录	A1BI4 [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methyl (2S,3S,4R)-5-[(4aS)-7,8-dimethyl-4a-[(1R)-1-{3-[(5-methyl-1,3,4-thiadiazol-2-yl)carbamoyl]phenyl}-3-oxopropyl]-2,4-dioxo-3,4,4a,5-tetrahydrobenzo[g]pteridin-10(2H)-yl]-2,3,4-trihydroxypentyl dihydrogen diphosphate (non-preferred name) × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；300 K；1.2 Na/K Tartrate, 100 mM ADA pH 6.5	分辨率 2.87 Å R-free 0.242
9EL8 LSD1-CoREST in complex with T105 1S2R enantiomer 提交 2024-12-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 308–443（136 aa）	未记录	XHT [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methyl (2S,3R,4S)-2,3,4-trihydroxy-5-[(1R,3R,3aS,13R)-1-hydroxy-10,11-dimethyl-3-{3-[(5-methyl-1,3,4-thiadiazol-2-yl)carbamoyl]phenyl}-4,6-dioxo-2,3,5,6-tetrahydro-1H-benzo[g]pyrrolo[2,1-e]pteridin-8(4H)-yl]pentyl dihydrogen diphosphate (non-preferred name) × 1 XHX 3-[(1R,2S)-2-(cyclobutylamino)cyclopropyl]-N-(5-methyl-1,3,4-thiadiazol-2-yl)benzamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；300 K；1.2 Na/K Tartrate, 100 mM ADA pH 6.5	分辨率 2.91 Å R-free 0.244
9ELA LSD1-CoREST in complex with T108, long soaking 提交 2024-12-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 308–443（136 aa）	未记录	XZQ [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methyl (2R,3S,4S)-2,3,4-trihydroxy-5-[(1R,3R,3aS,13R)-1-hydroxy-10,11-dimethyl-4,6-dioxo-3-[3-(phenylcarbamoyl)phenyl]-2,3,5,6-tetrahydro-1H-benzo[g]pyrrolo[2,1-e]pteridin-8(4H)-yl]pentyl dihydrogen diphosphate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；300 K；1.2 Na/K Tartrate, 100 mM ADA pH 6.5	分辨率 2.85 Å R-free 0.243
9F0A N5 Adduct of LSD1-CoREST in complex with MC4455 提交 2024-04-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 305–482（178 aa）	未记录	A1H8N [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{S})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] [(2~{S},3~{S},4~{R})-5-[5-[3-[4-[[4-[[(2~{S})-3-(3,4-dihydro-1~{H}-isoquinolin-2-yl)-2-oxidanyl-propyl]carbamoyl]pyridin-2-yl]amino]phenyl]propanoyl]-7,8-dimethyl-2,4-bis(oxidanylidene)-4~{a}~{H}-benzo[g]pteridin-10-yl]-2,3,4-tris(oxidanyl)pentyl] hydrogen phosphate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；1.2 M Sodium Tartrate, 0.1 M ADA, pH 6.5	分辨率 3.36 Å R-free 0.234
9FWG LSD1/CoREST bound to bomedemstat 提交 2024-06-30	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–485（485 aa）	未记录	A1IG2 Bomedemstat FAD adduct × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；293 K；100 mM N-(2-Acetamido)iminodiacetic acid (ADA) pH 6.5, 1.2 M Na/K Tartrate. Crystals were soaked in a solution containing 1 mM bomedemstat for 2 hours at 20 degress	分辨率 3.20 Å R-free 0.227
9I2C Cryo-EM structure of KBTBD4 WT-HDAC2-CoREST1 2:1:1 complex mediated by molecular glue UM171 提交 2025-01-20	构建体不同配体/离子不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 86–248（163 aa）	未记录	A1ACV (1r,4r)-N~1~-[(7P)-2-benzyl-7-(2-methyl-2H-tetrazol-5-yl)-9H-pyrimido[4,5-b]indol-4-yl]cyclohexane-1,4-diamine × 1 ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å

共 100 个其他 PDB 条目、101 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RCOR1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–485； UniProt 1–485

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	8vpq
沉积日期 deposition_date	2024-01-16
结构标题 title	The structure of LSD1-CoREST-HDAC1 in complex with KBTBD4IPR310delinsTTYML
关键词 keywords	protein degradation, E3 ligase, Neo-substrate, cancer mutation, LIGASE; LIGASE
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	43.02 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	42.82 Å
零角强度 I(0) i0	446075000.00
分子量 molecular_weight	171990.0 kDa
排除体积 excluded_volume	214450 Å³
包络体积 envelope_volume	298260 Å³
水化壳体积 shell_volume	58556 Å³
包络直径 envelope_diameter	154.1 Å
壳层 Rg shell_rg	47.20 Å
包络 Rg envelope_rg	42.42 Å
形状 Rg shape_rg	42.84 Å
总 Rg total_rg	42.96 Å
总原子数 total_atoms	12090
残基数 n_residues	1509
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	144.2 Å
Rg (实空间) rg_real	43.05 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.37 Å
I(0) (实空间) i0_real	4.4610e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	8.1780e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	43.02 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	446100000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8894
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	46.8 Å
偏度 Skewness skewness	0.295
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.495
角度范围 angular_range	— – 0.1850 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	63270000.0000
实空间数据点数 n_real_points	38
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.899; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.986; Smooth: 0.876

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Isoform 2 of Kelch repeat and BTB domain-containing protein 4
分子量 formula_weight	60214.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	12090

MKGGNADSWQREKLASMESPEEPGASMDENYFVNYTFKDRSHSGRVAQGIMKLCLEEELFADVTISVEGREFQLHRLVLSAQSCFFRSMFTSNLKEAHNRVIVLQDVSESVFQLLVDYIYHGTVKLRAEELQEIYEVSDMYQLTSLFEECSRFLARTVQVGNCLQVMWLADRHSDPELYTAAKHCAKTHLAQLQNTEEFLHLPHRLLTDIISDGVPCSQNPTEAIEAWINFNKEEREAFAESLRTSLKEIGENVHIYLIGKESSRTHSLAVSLHCAEDDSISVSGQNSLCHQITAACKHGGDLYVVGGSTTYMLRMWKCNNATVDWEWCAPLPRDRLQHTLVSVPGKDAIYSLGGKTLQDTLSNAVIYYRVGDNVWTETTQLEVAVSGAAGANLNGIIYLLGGEENDLDFFTKPSRLIQCFDTETDKCHVKPYVLPFAGRMHAAVHKDLVFIVAEGDSLVCYNPLLDSFTRLCLPEAWSSAPSLWKIASCNGSIYVFRDRYKKGDANTYKLDPATSAVTVTRGIKVLLTNLQFVLA

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Histone deacetylase 1
分子量 formula_weight	55178.9 kDa
EC 编号 ec_number	3.5.1.98,3.5.1.-
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

MAQTQGTRRKVCYYYDGDVGNYYYGQGHPMKPHRIRMTHNLLLNYGLYRKMEIYRPHKANAEEMTKYHSDDYIKFLRSIRPDNMSEYSKQMQRFNVGEDCPVFDGLFEFCQLSTGGSVASAVKLNKQQTDIAVNWAGGLHHAKKSEASGFCYVNDIVLAILELLKYHQRVLYIDIDIHHGDGVEEAFYTTDRVMTVSFHKYGEYFPGTGDLRDIGAGKGKYYAVNYPLRDGIDDESYEAIFKPVMSKVMEMFQPSAVVLQCGSDSLSGDRLGCFNLTIKGHAKCVEFVKSFNLPMLMLGGGGYTIRNVARCWTYETAVALDTEIPNELPYNDYFEYFGPDFKLHISPSNMTNQNTNEYLEKIKQRLFENLRMLPHAPGVQMQAIPEDAIPEESGDEDEDDPDKRISICSSDKRIACEEEFSDSEEEGEGGRKNSSNFKKAKRVKTEDEKEKDPEEKKEVTEEEKTKEEKPEAKGVKEEVKLA

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	REST corepressor 1
分子量 formula_weight	53401.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

MPAMVEKGPEVSGKRRGRNNAAASASAAAASAAASAACASPAATAASGAAASSASAAAASAAAAPNNGQNKSLAAAAPNGNSSSNSWEEGSSGSSSDEEHGGGGMRVGPQYQAVVPDFDPAKLARRSQERDNLGMLVWSPNQNLSEAKLDEYIAIAKEKHGYNMEQALGMLFWHKHNIEKSLADLPNFTPFPDEWTVEDKVLFEQAFSFHGKTFHRIQQMLPDKSIASLVKFYYSWKKTRTKTSVMDRHARKQKREREESEDELEEANGNNPIDIEVDQNKESKKEVPPTETVPQVKKEKHSTQAKNRAKRKPPKGMFLSQEDVEAVSANATAATTVLRQLDMELVSVKRQIQNIKQTNSALKEKLDGGIEPYRLPEVIQKCNARWTTEEQLLAVQAIRKYGRDFQAISDVIGNKSVVQVKNFFVNYRRRFNIDEVLQEWEAEHGKEETNGPSNQKPVKSPDNSIKMPEEEDEAPVLDVRYASAS

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE
分子量 formula_weight	660.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.30 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	825583

fit	/app/data/saxs_computation/vp/8vpq/8vpq.fit
pddf	/app/data/pr_computation/vp/8vpq/8vpq.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/vp/8vpq/8vpq.dat

The structure of LSD1-CoREST-HDAC1 in complex with KBTBD4IPR310delinsTTYML

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Isoform 2 of Kelch repeat and BTB domain-containing protein 4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Histone deacetylase 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

REST corepressor 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)