Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C
Homo sapiens
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 其他组合 异源复合物 蛋白 × 2 其他聚合物 5 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白拷贝数一致 | 链 A; UniProt 1–2201 | 未记录 | Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1 × 1 (P54289) ;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; × 1 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 ;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; × 1 CA CALCIUM ION × 2 9Z9 (3beta,14beta,17beta,25R)-3-[4-methoxy-3-(methoxymethyl)butoxy]spirost-5-en × 1 WB9 4-[(2-bromanyl-4,5-dimethoxy-phenyl)methyl]-4-[2-[2-[(1~{R},2~{S},5~{R})-6,6-dimethyl-2-bicyclo[3.1.1]heptanyl]ethoxy]ethyl]morpholin-4-ium × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 | ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE | 分辨率 3.20 Å |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 8WEA | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1T0J Crystal structure of a complex between voltage-gated calcium channel beta2a subunit and a peptide of the alpha1c subunit 提交 2004-04-09 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 C
428–445(18 aa)
片段:Residues 428-443
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;277 K;Tris-Cl, PEG 4000, NaCl, pH 8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.242 |
| 1T0J Crystal structure of a complex between voltage-gated calcium channel beta2a subunit and a peptide of the alpha1c subunit 提交 2004-04-09 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 C
428–445(18 aa)
片段:Residues 428-443
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;277 K;Tris-Cl, PEG 4000, NaCl, pH 8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.242 |
| 2LQC NMR solution structure of a Ca2+-Calmodulin with a binding motif (NSCaTE) peptide from the N-terminal cytoplasmic domain of the L-type Voltage-Cated Calcium Channel alpha1C subunit 提交 2012-02-29 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
47–68(22 aa)
片段:UNP residues 47-68
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7;298 K;离子强度(mmCIF原始值)100;压力 ambient
NMR样品组成
1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] calmodulin, 2 mM NSCaTE peptide, 55 M H2O, 5 M [U-99% 2H] D2O, 10 mM DTT, 20 mM TRIS, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] NSCaTE peptide, 0.5 mM calmodulin, 55 M H2O, 5 M [U-99% 2H] D2O, 10 mM DTT, 20 mM TRIS, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] calmodulin, 2 mM NSCaTE peptide, 7.5 mg Pf1 phage, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 3G43 Crystal structure of the calmodulin-bound Cav1.2 C-terminal regulatory domain dimer 提交 2009-02-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 E
1609–1682(74 aa)
片段:C-terminal fragment: UNP residues 1609-1682
链 F
1609–1682(74 aa)
片段:C-terminal fragment: UNP residues 1609-1682
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 14 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;298 K;20% PEG 6000, 1.0 M LiCl, 3% w/v MPD, 100 mM MES, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.269 |
| 3OXQ Crystal Structure of Ca2+/CaM-CaV1.2 pre-IQ/IQ domain complex 提交 2010-09-21 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 E
1609–1685(77 aa)
片段:preIQ/IQ domain (unp residues 1609-1685)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 7 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;293 K;0.2 M Li2SO4,
24.5% PEG3350,
0.1 M Bis-Tris pH5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.55 Å R-free 0.288 |
| 3OXQ Crystal Structure of Ca2+/CaM-CaV1.2 pre-IQ/IQ domain complex 提交 2010-09-21 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 F
1609–1685(77 aa)
片段:preIQ/IQ domain (unp residues 1609-1685)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 7 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;293 K;0.2 M Li2SO4,
24.5% PEG3350,
0.1 M Bis-Tris pH5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.55 Å R-free 0.288 |
| 5V2P CaV beta2a subunit: CaV1.2 AID-CAP complex 提交 2017-03-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
427–445(19 aa)
片段:AID-CAP (UNP residues 427-445)
|
突变:K427C, Q428S, Q429P, E432C | NI NICKEL (II) ION × 1 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 2 8VY 1,3-bis(bromomethyl)benzene × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.3;277 K;34-37% PEG400, 0.1 M magnesium chloride, 0.1 M MES, pH 6.3
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.230 |
| 5V2Q CaV beta2a subunit: CaV1.2 AID-CEN complex 提交 2017-03-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
427–445(19 aa)
片段:AID-CEN (UNP residues 427-445)
|
突变:K427A, Q428S, Q429P, K435C, D439C | CL CHLORIDE ION × 1 8VY 1,3-bis(bromomethyl)benzene × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;277 K;1.5-1.7 M ammonium sulfate, 5 mM BME, 0.1 M HEPES, pH 7.0
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.196 |
| 6C0A Actinin-1 EF-Hand bound to the Cav1.2 IQ Motif 提交 2017-12-28 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
1587–1609(23 aa)
片段:IQ Motif (UNP residues 1587-1609)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7.5;303 K;离子强度(mmCIF原始值)0;压力 1
NMR样品组成
300 uM [U-99% 15N] Actinin-1 EF hand, 300 uM IQ Motif, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
300 uM [U-99% 15N] Cav1.2 IQ Motif, 300 uM Actinin-1 EF 3,3, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
300 uM [U-99% 13C; U-99% 15N] Actinin-1 EF 3,4, 300 uM Cav1.2 IQ Motif, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
12 mg/mL Pf1 phage, 300 uM [U-99% 15N] Actinin-1 EF 3,4, 300 uM Cav1.2 IQ Motif, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
12 mg/mL Pf1 phage, 300 uM [U-99% 15N] Cav1.2 IQ Motif, 300 uM Actinin-1 EF 3,4, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 6DAD 1.65 Angstrom crystal structure of the N97I Ca/CaM:CaV1.2 IQ domain complex 提交 2018-05-01 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 C
1611–1644(34 aa)
片段:UNP residues 1611-1644
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;2.1 M sodium malonate, 0.1 M HEPES, pH 7.5
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.208 |
| 6DAD 1.65 Angstrom crystal structure of the N97I Ca/CaM:CaV1.2 IQ domain complex 提交 2018-05-01 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 D
1611–1644(34 aa)
片段:UNP residues 1611-1644
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;2.1 M sodium malonate, 0.1 M HEPES, pH 7.5
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.208 |
| 6DAE 2.0 Angstrom crystal structure of the D95V Ca/CaM:CaV1.2 IQ domain complex 提交 2018-05-01 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 C
1611–1644(34 aa)
片段:UNP residues 1611-1644
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 10.3;277 K;1 M lithium chloride, 30% PEG6000, 0.1M Bicine, pH 10.3
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.226 |
| 6DAE 2.0 Angstrom crystal structure of the D95V Ca/CaM:CaV1.2 IQ domain complex 提交 2018-05-01 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 D
1611–1644(34 aa)
片段:UNP residues 1611-1644
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 10.3;277 K;1 M lithium chloride, 30% PEG6000, 0.1M Bicine, pH 10.3
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.226 |
| 6DAF 2.4 Angstrom crystal structure of the F141L Ca/CaM:CaV1.2 IQ domain complex 提交 2018-05-01 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 C
1611–1644(34 aa)
片段:UNP residues 1611-1644
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;0.5 M potassium nitrate, 20% PEG3350
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.243 |
| 6DAF 2.4 Angstrom crystal structure of the F141L Ca/CaM:CaV1.2 IQ domain complex 提交 2018-05-01 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 D
1611–1644(34 aa)
片段:UNP residues 1611-1644
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;0.5 M potassium nitrate, 20% PEG3350
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.243 |
| 6U39 2.4 Angstrom crystal structure of the D129G Ca-CaM:CaV1.2 IQ domain complex 提交 2019-08-21 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
1611–1644(34 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;ammonium sulfate
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.283 |
| 6U39 2.4 Angstrom crystal structure of the D129G Ca-CaM:CaV1.2 IQ domain complex 提交 2019-08-21 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 10 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 T
1611–1644(34 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;ammonium sulfate
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.283 |
| 6U39 2.4 Angstrom crystal structure of the D129G Ca-CaM:CaV1.2 IQ domain complex 提交 2019-08-21 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 D
1611–1644(34 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;ammonium sulfate
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.283 |
| 6U39 2.4 Angstrom crystal structure of the D129G Ca-CaM:CaV1.2 IQ domain complex 提交 2019-08-21 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 F
1611–1644(34 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;ammonium sulfate
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.283 |
| 6U39 2.4 Angstrom crystal structure of the D129G Ca-CaM:CaV1.2 IQ domain complex 提交 2019-08-21 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 H
1611–1644(34 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;ammonium sulfate
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.283 |
| 6U39 2.4 Angstrom crystal structure of the D129G Ca-CaM:CaV1.2 IQ domain complex 提交 2019-08-21 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 J
1611–1644(34 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;ammonium sulfate
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.283 |
| 6U39 2.4 Angstrom crystal structure of the D129G Ca-CaM:CaV1.2 IQ domain complex 提交 2019-08-21 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 L
1611–1644(34 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;ammonium sulfate
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.283 |
| 6U39 2.4 Angstrom crystal structure of the D129G Ca-CaM:CaV1.2 IQ domain complex 提交 2019-08-21 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 N
1611–1644(34 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;ammonium sulfate
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.283 |
| 6U39 2.4 Angstrom crystal structure of the D129G Ca-CaM:CaV1.2 IQ domain complex 提交 2019-08-21 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 8 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 P
1611–1644(34 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;ammonium sulfate
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.283 |
| 6U39 2.4 Angstrom crystal structure of the D129G Ca-CaM:CaV1.2 IQ domain complex 提交 2019-08-21 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 9 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 R
1611–1644(34 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;ammonium sulfate
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.283 |
| 6U3A 1.65 Angstrom crystal structure of the N97S Ca-CaM:CaV1.2 IQ domain complex 提交 2019-08-21 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 C
1611–1644(34 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 3 NA SODIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;277 K;DL-malic acid
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.209 |
| 6U3A 1.65 Angstrom crystal structure of the N97S Ca-CaM:CaV1.2 IQ domain complex 提交 2019-08-21 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 D
1611–1644(34 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;277 K;DL-malic acid
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.209 |
| 6U3B 1.7 Angstrom crystal structure of the Q135P Ca-CaM:CaV1.2 IQ domain complex 提交 2019-08-21 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
1611–1644(34 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 5 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;PEG 550 MME, sodium acetate
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.200 |
| 6U3D 1.75 Angstrom crystal structure of the N53I Ca-CaM:CaV1.2 IQ domain complex 提交 2019-08-21 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 C
1611–1644(34 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;PEG 3350, citric acid
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.201 |
| 6U3D 1.75 Angstrom crystal structure of the N53I Ca-CaM:CaV1.2 IQ domain complex 提交 2019-08-21 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 D
1611–1644(34 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;PEG 3350, citric acid
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.201 |
| 7L8V NMR Structure of half-calcified calmodulin mutant (CaMEF12) bound to the IQ-motif of CaV1.2 提交 2021-01-01 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 C
1662–1682(21 aa)
片段:IQ-motif residues 1662-1682
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7.4;303 K;离子强度(mmCIF原始值)0.1;压力 1
NMR样品组成
0.5 mM [U-95% 15N] calmodulin, 0.75 mM IQ-motif, 10 mM TRIS, 2 mM CALCIUM ION, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.5 mM [U-13C; U-15N] calmodulin, 0.75 mM IQ-motif, 10 mM TRIS, 2 mM CALCIUM ION, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 8EOI Structure of a human EMC:human Cav1.2 channel complex in GDN detergent 提交 2022-10-03 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 11 PDB 声明:undecameric |
链 K
109–1658(1550 aa)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 9Z9 (3beta,14beta,17beta,25R)-3-[4-methoxy-3-(methoxymethyl)butoxy]spirost-5-en × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 8FD7 Structure of the human L-type voltage-gated calcium channel Cav1.2 complexed with gabapentin 提交 2022-12-02 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 K
1–1648(1648 aa)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 GBN [1-(AMINOMETHYL)CYCLOHEXYL]ACETIC ACID × 1 CA CALCIUM ION × 3 NA SODIUM ION × 1 WO9 (2R)-3-{[(R)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-2-(dodecanoyloxy)propyl heptadecanoate × 1 YSW (2S)-3-{[(R)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-2-(dodecanoyloxy)propyl dodecanoate × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 8FHS Human L-type voltage-gated calcium channel Cav1.2 in the presence of amiodarone and sofosbuvir at 3.3 Angstrom resolution 提交 2022-12-15 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
1–2221(2221 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 BBI (2-butyl-1-benzofuran-3-yl){4-[2-(diethylamino)ethoxy]-3,5-diiodophenyl}methanone × 1 WG6 Sofosbuvir × 1 3PE 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 2 CLR CHOLESTEROL × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 8WE6 Human L-type voltage-gated calcium channel Cav1.2 at 2.9 Angstrom resolution 提交 2023-09-17 | 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
1–2201(2201 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 3PE 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 1 CLR CHOLESTEROL × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 PT5 [(2R)-1-octadecanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phospho ryl]oxy-propan-2-yl] (8Z)-icosa-5,8,11,14-tetraenoate × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 8WE7 Human L-type voltage-gated calcium channel Cav1.2 in the presence of calciseptine at 3.2 Angstrom resolution 提交 2023-09-17 | 聚集状态不同 配体/离子不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
1–2201(2201 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 CLR CHOLESTEROL × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 8WE8 Human L-type voltage-gated calcium channel Cav1.2 in the presence of calciseptine, amlodipine and pinaverium at 2.9 Angstrom resolution 提交 2023-09-17 | 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
1–2201(2201 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 CLR CHOLESTEROL × 5 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 PT5 [(2R)-1-octadecanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phospho ryl]oxy-propan-2-yl] (8Z)-icosa-5,8,11,14-tetraenoate × 1 3PE 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 1 6UB amlodipine × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 8WE9 Human L-type voltage-gated calcium channel Cav1.2 (Class I) in the presence of pinaverium at 3.0 Angstrom resolution 提交 2023-09-17 | 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
1–2201(2201 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 3PE 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 PT5 [(2R)-1-octadecanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phospho ryl]oxy-propan-2-yl] (8Z)-icosa-5,8,11,14-tetraenoate × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 9ZZ4 NMR structure of CaBP1 bound to the IQ motif of Cav1.2 提交 2026-01-06 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
1587–1609(23 aa)
片段:IQ Motif (UNP residues 1587-1609)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7.5;300 K;离子强度(mmCIF原始值)10;压力 1
NMR样品组成
0.5 mM [U-100% 15N] CaBP1 C-Lobe, 0.75 mM CaV1.2 IQ motif, 1 mM Ca2+, 10 mM [U-100% 2H] Tris, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.6 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] CaBP1 C-Lobe, 0.9 mM CaV1.2 IQ motif, 1 mM Ca2+, 10 mM [U-100% 2H] Tris, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供 |
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查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | CAC1C_HUMAN |
| Isoform | Q13936-4 |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A; PDB构建体 1–2201; UniProt 1–2201 |