8y9z

Structure of the SecA-SecY complex with the substrate HmBRI-3TM

Method: ELECTRON MICROSCOPY
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Protein translocase subunit SecA

Bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168

UniProt P28366

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 5 Protein translocase subunit SecY × 1 (A4IJK8) Protein translocase subunit SecE × 1 (A4IJH4) Nanobody × 1 Bacteriorhodopsin-I × 1 (Q5UXY6) MAGNESIUM ION × 1 BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SECA_BACSU
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–778; UniProt 1–778

Protein translocase subunit SecY

Geobacillus thermodenitrificans NG80-2

UniProt A4IJK8

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 5 Protein translocase subunit SecA × 1 (P28366) Protein translocase subunit SecE × 1 (A4IJH4) Nanobody × 1 Bacteriorhodopsin-I × 1 (Q5UXY6) MAGNESIUM ION × 1 BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A4IJK8_GEOTN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 Y; PDB构建体 1–430; UniProt 1–430

Protein translocase subunit SecE

Geobacillus thermodenitrificans NG80-2

UniProt A4IJH4

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 5 Protein translocase subunit SecA × 1 (P28366) Protein translocase subunit SecY × 1 (A4IJK8) Nanobody × 1 Bacteriorhodopsin-I × 1 (Q5UXY6) MAGNESIUM ION × 1 BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A4IJH4_GEOTN
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 E; PDB构建体 1–60; UniProt 1–60

Bacteriorhodopsin-I

Haloarcula marismortui ATCC 43049

UniProt Q5UXY6

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 5 Protein translocase subunit SecA × 1 (P28366) Protein translocase subunit SecY × 1 (A4IJK8) Protein translocase subunit SecE × 1 (A4IJH4) Nanobody × 1 MAGNESIUM ION × 1 BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 BACR1_HALMA
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–99; UniProt 1–99

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id8y9z
沉积日期 deposition_date2024-02-07
结构标题 titleStructure of the SecA-SecY complex with the substrate HmBRI-3TM
关键词 keywordsProtein translocation, Membrane protein insertion, Protein chaperone, PROTEIN TRANSPORT; PROTEIN TRANSPORT
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

8y9z__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

8y9z__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

8y9z__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)40.67 Å
Rg(电子密度)40.10 Å
总 Rg40.43 Å
原子数11061
残基数1388
排除体积198550 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 8y9z__assembly_1__model_1 pentameric (5) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

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7. 引用文献 (1)