9b1e

Cryo-EM structure of native SWR1 bound to nucleosome (composite structure)

Method: ELECTRON MICROSCOPY

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Vacuolar protein sorting-associated protein 72

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 19 DNA 2	Helicase SWR1 × 1 Actin-like protein ARP6 × 1 （Q12509） Vacuolar protein sorting-associated protein 71 × 1 （Q03433） RuvB-like protein 1 × 3 RuvB-like protein 2 × 3 （Q12464） SWR1-complex protein 3 × 1 （P31376） Histone H2A × 2 （A0A6A5Q1K4） Histone H2B × 2 （A0A6A5PZQ7） Histone H3 × 2 （P02299） Histone H4 × 2 （A0A0B4KFZ9） DNA (214-MER) × 1 DNA (214-MER) × 1 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MAGNESIUM ION × 8 ZINC ION × 2	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	VPS72_YEAST
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–795； UniProt 1–795

Actin-like protein ARP6

物种未注明

UniProt Q12509

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 19 DNA 2	Helicase SWR1 × 1 Vacuolar protein sorting-associated protein 72 × 1 （Q03388） Vacuolar protein sorting-associated protein 71 × 1 （Q03433） RuvB-like protein 1 × 3 RuvB-like protein 2 × 3 （Q12464） SWR1-complex protein 3 × 1 （P31376） Histone H2A × 2 （A0A6A5Q1K4） Histone H2B × 2 （A0A6A5PZQ7） Histone H3 × 2 （P02299） Histone H4 × 2 （A0A0B4KFZ9） DNA (214-MER) × 1 DNA (214-MER) × 1 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MAGNESIUM ION × 8 ZINC ION × 2	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	ARP6_YEAST
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–438； UniProt 1–438

Vacuolar protein sorting-associated protein 71

物种未注明

UniProt Q03433

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 19 DNA 2	Helicase SWR1 × 1 Vacuolar protein sorting-associated protein 72 × 1 （Q03388） Actin-like protein ARP6 × 1 （Q12509） RuvB-like protein 1 × 3 RuvB-like protein 2 × 3 （Q12464） SWR1-complex protein 3 × 1 （P31376） Histone H2A × 2 （A0A6A5Q1K4） Histone H2B × 2 （A0A6A5PZQ7） Histone H3 × 2 （P02299） Histone H4 × 2 （A0A0B4KFZ9） DNA (214-MER) × 1 DNA (214-MER) × 1 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MAGNESIUM ION × 8 ZINC ION × 2	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	VPS71_YEAST
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–280； UniProt 1–280

RuvB-like protein 2

物种未注明

UniProt Q12464

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 19 DNA 2	Helicase SWR1 × 1 Vacuolar protein sorting-associated protein 72 × 1 （Q03388） Actin-like protein ARP6 × 1 （Q12509） Vacuolar protein sorting-associated protein 71 × 1 （Q03433） RuvB-like protein 1 × 3 SWR1-complex protein 3 × 1 （P31376） Histone H2A × 2 （A0A6A5Q1K4） Histone H2B × 2 （A0A6A5PZQ7） Histone H3 × 2 （P02299） Histone H4 × 2 （A0A0B4KFZ9） DNA (214-MER) × 1 DNA (214-MER) × 1 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MAGNESIUM ION × 8 ZINC ION × 2	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RUVB2_YEAST
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–471； UniProt 1–471 作者链 H； PDB构建体 1–471； UniProt 1–471 作者链 J； PDB构建体 1–471； UniProt 1–471

SWR1-complex protein 3

物种未注明

UniProt P31376

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 19 DNA 2	Helicase SWR1 × 1 Vacuolar protein sorting-associated protein 72 × 1 （Q03388） Actin-like protein ARP6 × 1 （Q12509） Vacuolar protein sorting-associated protein 71 × 1 （Q03433） RuvB-like protein 1 × 3 RuvB-like protein 2 × 3 （Q12464） Histone H2A × 2 （A0A6A5Q1K4） Histone H2B × 2 （A0A6A5PZQ7） Histone H3 × 2 （P02299） Histone H4 × 2 （A0A0B4KFZ9） DNA (214-MER) × 1 DNA (214-MER) × 1 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MAGNESIUM ION × 8 ZINC ION × 2	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	SWC3_YEAST
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 K； PDB构建体 1–625； UniProt 1–625

Histone H2A

Saccharomyces cerevisiae

UniProt A0A6A5Q1K4

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 19 DNA 2	Helicase SWR1 × 1 Vacuolar protein sorting-associated protein 72 × 1 （Q03388） Actin-like protein ARP6 × 1 （Q12509） Vacuolar protein sorting-associated protein 71 × 1 （Q03433） RuvB-like protein 1 × 3 RuvB-like protein 2 × 3 （Q12464） SWR1-complex protein 3 × 1 （P31376） Histone H2B × 2 （A0A6A5PZQ7） Histone H3 × 2 （P02299） Histone H4 × 2 （A0A0B4KFZ9） DNA (214-MER) × 1 DNA (214-MER) × 1 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MAGNESIUM ION × 8 ZINC ION × 2	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A6A5Q1K4_YEASX
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 Q； PDB构建体 1–132； UniProt 1–132 作者链 S； PDB构建体 1–132； UniProt 1–132

Histone H2B

Saccharomyces cerevisiae

UniProt A0A6A5PZQ7

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 19 DNA 2	Helicase SWR1 × 1 Vacuolar protein sorting-associated protein 72 × 1 （Q03388） Actin-like protein ARP6 × 1 （Q12509） Vacuolar protein sorting-associated protein 71 × 1 （Q03433） RuvB-like protein 1 × 3 RuvB-like protein 2 × 3 （Q12464） SWR1-complex protein 3 × 1 （P31376） Histone H2A × 2 （A0A6A5Q1K4） Histone H3 × 2 （P02299） Histone H4 × 2 （A0A0B4KFZ9） DNA (214-MER) × 1 DNA (214-MER) × 1 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MAGNESIUM ION × 8 ZINC ION × 2	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A6A5PZQ7_YEASX
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 R； PDB构建体 1–131； UniProt 1–131 作者链 T； PDB构建体 1–131； UniProt 1–131

Histone H3

Drosophila melanogaster

UniProt P02299

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 19 DNA 2	Helicase SWR1 × 1 Vacuolar protein sorting-associated protein 72 × 1 （Q03388） Actin-like protein ARP6 × 1 （Q12509） Vacuolar protein sorting-associated protein 71 × 1 （Q03433） RuvB-like protein 1 × 3 RuvB-like protein 2 × 3 （Q12464） SWR1-complex protein 3 × 1 （P31376） Histone H2A × 2 （A0A6A5Q1K4） Histone H2B × 2 （A0A6A5PZQ7） Histone H4 × 2 （A0A0B4KFZ9） DNA (214-MER) × 1 DNA (214-MER) × 1 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MAGNESIUM ION × 8 ZINC ION × 2	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	H3_DROME
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 U； PDB构建体 1–136； UniProt 1–136 作者链 W； PDB构建体 1–136； UniProt 1–136

Histone H4

Drosophila melanogaster

UniProt A0A0B4KFZ9

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 19 DNA 2	Helicase SWR1 × 1 Vacuolar protein sorting-associated protein 72 × 1 （Q03388） Actin-like protein ARP6 × 1 （Q12509） Vacuolar protein sorting-associated protein 71 × 1 （Q03433） RuvB-like protein 1 × 3 RuvB-like protein 2 × 3 （Q12464） SWR1-complex protein 3 × 1 （P31376） Histone H2A × 2 （A0A6A5Q1K4） Histone H2B × 2 （A0A6A5PZQ7） Histone H3 × 2 （P02299） DNA (214-MER) × 1 DNA (214-MER) × 1 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MAGNESIUM ION × 8 ZINC ION × 2	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A0B4KFZ9_DROME
Isoform	—
PDB实体	11
链与序列区间	作者链 V； PDB构建体 1–103； UniProt 1–103 作者链 X； PDB构建体 1–103； UniProt 1–103

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9b1e
沉积日期 deposition_date	2024-03-13
结构标题 title	Cryo-EM structure of native SWR1 bound to nucleosome (composite structure)
关键词 keywords	Chromatin Remodeler, Snf2 family ATPase, histone exchange, H2A.Z, GENE REGULATION; GENE REGULATION
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9b1e__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9b1e__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

9b1e__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	66.91 Å
Rg（电子密度）	65.66 Å
总 Rg	65.93 Å
原子数	49842
残基数	5695
排除体积	867280 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`9b1e__assembly_1__model_1`	21-meric （21）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (17)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Helicase SWR1
分子量 formula_weight	178058.2 kDa
EC 编号 ec_number	3.6.4.12
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	49842

MTTSRKSHAKDKKAGGEQDLADLKFRYDLLTNELFHLREFVSLVDYDPTHFNDSESFQKFLRETHLSLEERGEKFTDDVAKKGTNGDLTRRRRNLRTSTVVSSETTNEKKGDIELKLESIAPLVRNKCEELKYKLSDHSNRKSIVPQKRPIQHLKKREAAKSLKFKSERKENPLPLHEHIAEERYDHIAKVEEPSEAFTIKCPSDDSSFENTSEHYSDNFYFTTSSEEEDIKKKRGRKKKKPRIKLVVHPPKQTITNPLHVVKPGYESLHEYIASFKSLEDDLTLEEYNKYIDEQRRLLSRLKKGIENGALKYDKETDSLQPITSKEIKTIITYKPDPISYFYKQQDLQIHTDHLINQGIHMSKLFRSSTKARIARAKKVSQMIEQHFKHVAGAEERKAKEEERHKKSLARFAVQAVKKRWNMAEKAYRILRKDEEEQLKRIEGKQHLSKMLEKSTQLLEAQLNQVNDDGRSSTPSSDSNDVLSESDDDMDDELSTSSDEDEEVDADVGLENSPASTEATPTDESLNLIQLKEKYGHFNGSSTVYDSRNKDEKFPTLDKHESSSSESSVMTGEESSIYSSSENESQNENDRESDDKTPSVGLSALFGKGEESDGDLDLDDSEDFTVNSSSVEGEELEKDQVDNSAATFERAGDFVHTQNENRDDIKDVEEDAETKVQEEQLSVVDVPVPSLLRGNLRTYQKQGLNWLASLYNNHTNGILADEMGLGKTIQTISLLAYLACEKENWGPHLIVVPTSVLLNWEMEFKRFAPGFKVLTYYGSPQQRKEKRKGWNKPDAFHVCIVSYQLVVQDQHSFKRKRWQYMVLDEAHNIKNFRSTRWQALLNFNTQRRLLLTGTPLQNNLAELWSLLYFLMPQTVIDGKKVSGFADLDAFQQWFGRPVDKIIETGQNFGQDKETKKTVAKLHQVLRPYLLRRLKADVEKQMPAKYEHIVYCKLSKRQRFLYDDFMSRAQTKATLASGNFMSIVNCLMQLRKVCNHPNLFEVRPILTSFVLEHCVASDYKDVERTLLKLFKKNNQVNRVDLDFLNLVFTLNDKDLTSYHAEEISKLTCVKNFVEEVNKLRETNKQLQEEFGEASFLNFQDANQYFKYSNKQKLEGTVDMLNFLKMVNKLRCDRRPIFGKNLIDLLTKDRRVKYDKSSIIDNELIKPLQTRVLDNRKIIDTFAVLTPSAVSLDMRKLALGLNDDSSVGENTRLKVMQNCFEVSNPLHQLQTKLTIAFPDKSLLQYDCGKLQKLAILLQQLKDNGHRALIFTQMTKVLDVLEQFLNYHGYLYMRLDGATKIEDRQILTERFNTDSRITVFILSSRSGGLGINLTGADTVIFYDSDWNPAMDKQCQDRCHRIGQTRDVHIYRFVSEHTIESNILKKANQKRQLDNVVIQEGDFTTDYFSKLSVRDLLGSELPENASGGDKPLIADADVAAKDPRQLERLLAQAEDEDDVKAANLAMREVEIDNDDFDESTEKKAANEEEENHAELDEYEGTAHVDEYMIRFIANGYYYGSGGSGDYKDHDGDYKDHDIDYKDDDDKGS

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Vacuolar protein sorting-associated protein 72
分子量 formula_weight	90709.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MSDEGADKSLDTNTEFIIQTRSRRSNAGNKLQKLLEQELRDIESTKRQISSYKNGNDDEEDEIGLLFQEDEDDEDFEMMAKDDDDEGEEKEDETQSIRKEPSQASSEQAADDLMFSSSESEDSSNENDEDAEEKEIRRQELLSRKKRNKRLQKGPVVIKKQKPKPKSGEAIPRSHHTHEQLNAETLLLNTRRTSKRSSVMENTMKVYEKLSKAEKKRKIIQERIRKHKEQESQHMLTQEERLRIAKETEKLNILSLDKFKEQEVWKKENRLALQKRQKQKFQPNETILQFLSTAWLMTPAMELEDRKYWQEQLNKRDKKKKKYPRKPKKNLNLGKQDASDDKKRESEESIKNDGDVNSLGENSSSVHNQKRIEETSTNDTVEGESSPDAAVSRVNSDELKPTALPDVTLDAIANKQSTVDEAPNSQPQKNIITNEQKITNVGEPIQNLHNEEIKDEMVSALESRENTFENSSPAAQVVSQRDNSATPTPSNSTGTEDTILISPDTDIKGEPEPCLKTEGIENLSHNVPQETKSNTDVSFLKQVTFTDHPQVAIIDTEESPSKKDTANVDESSAENSLSTQTYEGPEQLTSRNFVTLYDFPNAPPNLKDFNTNLFGDRWSYTNGLSATQRPQDMKTVFHSILPSPPQSSVPSPTVDISLDLSALANFPSFGEYDKKIVHQINTEINKDLEIKIKTQPPTGVFLANGIRKKCLITNKECQYFDPRTGVPYSDVEAYKIIQRIQDPISKEEGRSDIKRDETTNEDSDDQVRFKWFGFKNGGIYLDLSQRPAKGVPEGF

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Actin-like protein ARP6
分子量 formula_weight	50100.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

METPPIVIDNGSYEIKFGPSTNKKPFRALNALAKDKFGTSYLSNHIKNIKDISSITFRRPHELGQLTLWELESCIWDYCLFNPSEFDGFDLKEGKGHHLVASESCMTLPELSKHADQVIFEEYEFDSLFKSPVAVFVPFTKSYKGEMRTISGKDEDIDIVRGNSDSTNSTSSESKNAQDSGSDYHDFQLVIDSGFNCTWIIPVLKGIPYYKAVKKLDIGGRFLTGLLKETLSFRHYNMMDETILVNNIKEQCLFVSPVSYFDSFKTKDKHALEYVLPDFQTSFLGYVRNPRKENVPLPEDAQIITLTDELFTIPETFFHPEISQITKPGIVEAILESLSMLPEIVRPLMVGNIVCTGGNFNLPNFAQRLAAELQRQLPTDWTCHVSVPEGDCALFGWEVMSQFAKTDSYRKARVTREEYYEHGPDWCTKHRFGYQNWI

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Vacuolar protein sorting-associated protein 71
分子量 formula_weight	32073.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

MKALVEEIDKKTYNPDIYFTSLDPQARRYTSKKINKQGTISTSRPVKRINYSLADLEARLYTSRSEGDGNSISRQDDRNSKNSHSFEERYTQQEILQSDRRFMELNTENFSDLPNVPTLLSDLTGVPRDRIESTTKPISQTSDGLSALMGGSSFVKEHSKYGHGWVLKPETLREIQLSYKSTKLPKPKRKNTNRIVALKKVLSSKRNLHSFLDSALLNLMDKNVIYHNVYNKRYFKVLPLITTCSICGGYDSISSCVNCGNKICSVSCFKLHNETRCRNR

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	RuvB-like protein 1
分子量 formula_weight	91413.2 kDa
EC 编号 ec_number	3.6.4.12
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,G,I

MVAISEVKENPGVNSSNSGAVTRTAAHTHIKGLGLDESGVAKRVEGGFVGQIEAREACGVIVDLIKAKKMSGRAILLAGGPSTGKTALALAISQELGPKVPFCPLVGSELYSVEVKKTETLMENFRRAIGLRIKETKEVYEGEVTELTPEDAENPLGGYGKTISHVIVGLKSAKGTKTLRLDPTIYESIQREKVSIGDVIYIEANTGAVKRVGRSDAYATEFDLETEEYVPLPKGEVHKKKEIVQDVTLHDLDVANARPQGGQDVISMMGQLLKPKKTEITEKLRQEVNKVVAKYIDQGVAELIPGVLFIDEVNMLDIEIFTYLNKALESNIAPVVVLASNRGMTTVRGTEDVISPHGVPPDLIDRLLIVRTLPYDKDEIRTIIERRATVERLQVESSALDLLATMGTETSLRYALQLLAPCGILAQTSNRKEIVVNDVNEAKLLFLDAKRSTKILETSANYLSGGGASMKIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTN

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	RuvB-like protein 2
分子量 formula_weight	51673.5 kDa
EC 编号 ec_number	3.6.4.12
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F,H,J

MSIQTSDPNETSDLKSLSLIAAHSHITGLGLDENLQPRPTSEGMVGQLQARRAAGVILKMVQNGTIAGRAVLVAGPPSTGKTALAMGVSQSLGKDVPFTAIAGSEIFSLELSKTEALTQAFRKSIGIKIKEETELIEGEVVEIQIDRSITGGHKQGKLTIKTTDMETIYELGNKMIDGLTKEKVLAGDVISIDKASGKITKLGRSFARSRDYDAMGADTRFVQCPEGELQKRKTVVHTVSLHEIDVINSRTQGFLALFTGDTGEIRSEVRDQINTKVAEWKEEGKAEIVPGVLFIDEVHMLDIECFSFINRALEDEFAPIVMMATNRGVSKTRGTNYKSPHGLPLDLLDRSIIITTKSYNEQEIKTILSIRAQEEEVELSSDALDLLTKTGVETSLRYSSNLISVAQQIAMKRKNNTVEVEDVKRAYLLFLDSARSVKYVQENESQYIDDQGNVQISIAKSADPDAMDTTE

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	SWR1-complex protein 3
分子量 formula_weight	72648.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K

MPAVLRTRSKESSIEQKPASRTRTRSRRGKRGRDDDDDDDDEESDDAYDEVGNDYDEYASRAKLATNRPFEIVAGLPASVELPNYNSSLTHPQSIKNSGVLYDSLVSSRRTWVQGEMFELYWRRPKKIVSESTPAATESPTSGTIPLIRDKMQKMCDCVMSGGPHTFKVRLFILKNDKIEQKWQDEQELKKKEKELKRKNDAEAKRLRMEERKRQQMQKKIAKEQKLQLQKENKAKQKLEQEALKLKRKEEMKKLKEQNKNKQGSPSSSMHDPRMIMNLNLMAQEDPKLNTLMETVAKGLANNSQLEEFKKFIEIAKKRSLEENPVNKRPSVTTTRPAPPSKAKDVAEDHRLNSITLVKSSKTAATEPEPKKADDENAEKQQSKEAKTTAESTQVDVKKEEEDVKEKGVKSEDTQKKEDNQVVPKRKRRKNAIKEDKDMQLTAFQQKYVQGAEIILEYLEFTHSRYYLPKKSVVEFLEDTDEIIISWIVIHNSKEIEKFKTKKIKAKLKADQKLNKEDAKPGSDVEKEVSFNPLFEADCPTPLYTPMTMKLSGIHKRFNQIIRNSVSPMEEVVKEMEKILQIGTRLSGYNLWYQLDGYDDEALSESLRFELNEWEHAMRSRRHKR

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	Histone H2A
分子量 formula_weight	14013.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Q,S

MSGGKGGKAGSAAKASQSRSAKAGLTFPVGRVHRLLRRGNYAQRIGSGAPVYLTAVLEYLAAEILELAGNAARDNKKTRIIPRHLQLAIRNDDELNKLLGNVTIAQGGVLPNIHQNLLPKKSAKATKASQEL

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
通用名 common_name	;brewer's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4932
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	Histone H2B
分子量 formula_weight	14280.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	R,T

MSAKAEKKPASKAPAEKKPAAKKTSTSTDGKKRSKARKETYSSYIYKVLKQTHPDTGISQKSMSILNSFVNDIFERIATEASKLAAYNKKSTISAREIQTAVRLILPGELAKHAVSEGTRAVTKYSSSTQA

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
通用名 common_name	;brewer's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4932
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	Histone H3
分子量 formula_weight	15421.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	U,W

MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPATGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSSAVMALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA

来源 Source

来源生物 organism	Drosophila melanogaster
通用名 common_name	fruit fly
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	7227
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	Histone H4
分子量 formula_weight	11408.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	V,X

MTGRGKGGKGLGKGGAKRHRKVLRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAKRKTVTAMDVVYALKRQGRTLYGFGG

来源 Source

来源生物 organism	Drosophila melanogaster
通用名 common_name	fruit fly
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	7227
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21

实体 12 Entity 12 polymer

描述 description	DNA (214-MER)
分子量 formula_weight	65672.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	Y

ATCGCATCGATCTTCACACCGAGTTCATCCCTTATGTGATGGACCCTATACGCGGCCGCCCTGGAGAATCCCGGTGCCGAGGCCGCTCAATTGGTCGTAGCAAGCTCTAGCACCGCTTAAACGCACGTACGCGCTGTCCCCCGCGTTTTAACCGCCAAGGGGATTACTCCCTAGTCTCCAGGCACGTGTCAGATATATACATCCTGTGCATGAT

实体 13 Entity 13 polymer

描述 description	DNA (214-MER)
分子量 formula_weight	66478.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	Z

ATCATGCACAGGATGTATATATCTGACACGTGCCTGGAGACTAGGGAGTAATCCCCTTGGCGGTTAAAACGCGGGGGACAGCGCGTACGTGCGTTTAAGCGGTGCTAGAGCTTGCTACGACCAATTGAGCGGCCTCGGCACCGGGATTCTCCAGGGCGGCCGCGTATAGGGTCCATCACATAAGGGATGAACTCGGTGTGAAGATCGATGCGAT

实体 14 Entity 14 non-polymer

描述 description	ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	427.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	8

实体 15 Entity 15 non-polymer

描述 description	BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION
分子量 formula_weight	66.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 16 Entity 16 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	8

实体 17 Entity 17 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	triclinic

分辨率 resolution	4.40 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	16524

Cryo-EM structure of native SWR1 bound to nucleosome (composite structure)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Vacuolar protein sorting-associated protein 72

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Actin-like protein ARP6

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Vacuolar protein sorting-associated protein 71

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

RuvB-like protein 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

SWR1-complex protein 3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Histone H2A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Histone H2B

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Histone H3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Histone H4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

9b1e__assembly_1__model_1

9b1e__assembly_1__model_1 | I(q)

9b1e__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment