9b85

Cryo-EM structure of human dynactin complex bound to Chlamydia effector Dre1

Method: ELECTRON MICROSCOPY

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Alpha-centractin

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 19	Actin, cytoplasmic 1 × 1 （P60709） Actin-related protein 10 × 1 （Q9NZ32） Dynactin subunit 4 × 1 （Q9UJW0） Dynactin subunit 5 × 1 （Q9BTE1） Dynactin subunit 6 × 1 （O00399） F-actin-capping protein subunit alpha-1 × 1 （P52907） F-actin-capping protein subunit beta × 1 （P47756） Dynactin subunit 2 × 4 （Q13561） ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 ZINC ION × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ACTZ_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–376； UniProt 1–376 作者链 B； PDB构建体 1–376； UniProt 1–376 作者链 C； PDB构建体 1–376； UniProt 1–376 作者链 D； PDB构建体 1–376； UniProt 1–376 作者链 E； PDB构建体 1–376； UniProt 1–376 作者链 F； PDB构建体 1–376； UniProt 1–376 作者链 G； PDB构建体 1–376； UniProt 1–376 作者链 I； PDB构建体 1–376； UniProt 1–376

Actin, cytoplasmic 1

物种未注明

UniProt P60709

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 19	Alpha-centractin × 8 （P61163） Actin-related protein 10 × 1 （Q9NZ32） Dynactin subunit 4 × 1 （Q9UJW0） Dynactin subunit 5 × 1 （Q9BTE1） Dynactin subunit 6 × 1 （O00399） F-actin-capping protein subunit alpha-1 × 1 （P52907） F-actin-capping protein subunit beta × 1 （P47756） Dynactin subunit 2 × 4 （Q13561） ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 ZINC ION × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	ACTB_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 1–375； UniProt 1–375

Actin-related protein 10

物种未注明

UniProt Q9NZ32

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 19	Alpha-centractin × 8 （P61163） Actin, cytoplasmic 1 × 1 （P60709） Dynactin subunit 4 × 1 （Q9UJW0） Dynactin subunit 5 × 1 （Q9BTE1） Dynactin subunit 6 × 1 （O00399） F-actin-capping protein subunit alpha-1 × 1 （P52907） F-actin-capping protein subunit beta × 1 （P47756） Dynactin subunit 2 × 4 （Q13561） ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 ZINC ION × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	ARP10_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 J； PDB构建体 1–417； UniProt 1–417

Dynactin subunit 4

物种未注明

UniProt Q9UJW0

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 19	Alpha-centractin × 8 （P61163） Actin, cytoplasmic 1 × 1 （P60709） Actin-related protein 10 × 1 （Q9NZ32） Dynactin subunit 5 × 1 （Q9BTE1） Dynactin subunit 6 × 1 （O00399） F-actin-capping protein subunit alpha-1 × 1 （P52907） F-actin-capping protein subunit beta × 1 （P47756） Dynactin subunit 2 × 4 （Q13561） ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 ZINC ION × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	DCTN4_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 K； PDB构建体 1–460； UniProt 1–460

Dynactin subunit 5

物种未注明

UniProt Q9BTE1

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 19	Alpha-centractin × 8 （P61163） Actin, cytoplasmic 1 × 1 （P60709） Actin-related protein 10 × 1 （Q9NZ32） Dynactin subunit 4 × 1 （Q9UJW0） Dynactin subunit 6 × 1 （O00399） F-actin-capping protein subunit alpha-1 × 1 （P52907） F-actin-capping protein subunit beta × 1 （P47756） Dynactin subunit 2 × 4 （Q13561） ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 ZINC ION × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	DCTN5_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 L； PDB构建体 1–182； UniProt 1–182

Dynactin subunit 6

物种未注明

UniProt O00399

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 19	Alpha-centractin × 8 （P61163） Actin, cytoplasmic 1 × 1 （P60709） Actin-related protein 10 × 1 （Q9NZ32） Dynactin subunit 4 × 1 （Q9UJW0） Dynactin subunit 5 × 1 （Q9BTE1） F-actin-capping protein subunit alpha-1 × 1 （P52907） F-actin-capping protein subunit beta × 1 （P47756） Dynactin subunit 2 × 4 （Q13561） ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 ZINC ION × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	DCTN6_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 M； PDB构建体 1–190； UniProt 1–190

F-actin-capping protein subunit alpha-1

物种未注明

UniProt P52907

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 19	Alpha-centractin × 8 （P61163） Actin, cytoplasmic 1 × 1 （P60709） Actin-related protein 10 × 1 （Q9NZ32） Dynactin subunit 4 × 1 （Q9UJW0） Dynactin subunit 5 × 1 （Q9BTE1） Dynactin subunit 6 × 1 （O00399） F-actin-capping protein subunit beta × 1 （P47756） Dynactin subunit 2 × 4 （Q13561） ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 ZINC ION × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	CAZA1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 N； PDB构建体 1–286； UniProt 1–286

F-actin-capping protein subunit beta

物种未注明

UniProt P47756

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 19	Alpha-centractin × 8 （P61163） Actin, cytoplasmic 1 × 1 （P60709） Actin-related protein 10 × 1 （Q9NZ32） Dynactin subunit 4 × 1 （Q9UJW0） Dynactin subunit 5 × 1 （Q9BTE1） Dynactin subunit 6 × 1 （O00399） F-actin-capping protein subunit alpha-1 × 1 （P52907） Dynactin subunit 2 × 4 （Q13561） ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 ZINC ION × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	CAPZB_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 O； PDB构建体 1–272； UniProt 1–272

Dynactin subunit 2

物种未注明

UniProt Q13561

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 19	Alpha-centractin × 8 （P61163） Actin, cytoplasmic 1 × 1 （P60709） Actin-related protein 10 × 1 （Q9NZ32） Dynactin subunit 4 × 1 （Q9UJW0） Dynactin subunit 5 × 1 （Q9BTE1） Dynactin subunit 6 × 1 （O00399） F-actin-capping protein subunit alpha-1 × 1 （P52907） F-actin-capping protein subunit beta × 1 （P47756） ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 ZINC ION × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	DCTN2_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 P； PDB构建体 1–401； UniProt 1–401 作者链 Q； PDB构建体 1–401； UniProt 1–401 作者链 p； PDB构建体 1–401； UniProt 1–401 作者链 q； PDB构建体 1–401； UniProt 1–401

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9b85
沉积日期 deposition_date	2024-03-28
最后修订 last_revision	2025-04-16
结构标题 title	Cryo-EM structure of human dynactin complex bound to Chlamydia effector Dre1
关键词 keywords	Human dynactin, Chlamydia effector, host-pathogen interaction, MOTOR PROTEIN; MOTOR PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9b85__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9b85__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

9b85__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	0.00 Å
Rg（电子密度）	107.30 Å
总 Rg	107.00 Å
原子数	82296
残基数	5159
排除体积	735140 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`9b85__assembly_1__model_1`	19-meric （19）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (12)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Alpha-centractin
分子量 formula_weight	42670.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	8

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D,E,F,G,I
原子数 atom_count	82296

MESYDVIANQPVVIDNGSGVIKAGFAGDQIPKYCFPNYVGRPKHVRVMAGALEGDIFIGPKAEEHRGLLSIRYPMEHGIVKDWNDMERIWQYVYSKDQLQTFSEEHPVLLTEAPLNPRKNRERAAEVFFETFNVPALFISMQAVLSLYATGRTTGVVLDSGDGVTHAVPIYEGFAMPHSIMRIDIAGRDVSRFLRLYLRKEGYDFHSSSEFEIVKAIKERACYLSINPQKDETLETEKAQYYLPDGSTIEIGPSRFRAPELLFRPDLIGEESEGIHEVLVFAIQKSDMDLRRTLFSNIVLSGGSTLFKGFGDRLLSEVKKLAPKDVKIRISAPQERLYSTWIGGSILASLDTFKKMWVSKKEYEEDGARSIHRKTF

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Actin, cytoplasmic 1
分子量 formula_weight	41782.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H

MDDDIAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Actin-related protein 10
分子量 formula_weight	46360.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J

MPLYEGLGSGGEKTAVVIDLGEAFTKCGFAGETGPRCIIPSVIKRAGMPKPVRVVQYNINTEELYSYLKEFIHILYFRHLLVNPRDRRVVIIESVLCPSHFRETLTRVLFKYFEVPSVLLAPSHLMALLTLGINSAMVLDCGYRESLVLPIYEGIPVLNCWGALPLGGKALHKELETQLLEQCTVDTSVAKEQSLPSVMGSVPEGVLEDIKARTCFVSDLKRGLKIQAAKFNIDGNNERPSPPPNVDYPLDGEKILHILGSIRDSVVEILFEQDNEEQSVATLILDSLIQCPIDTRKQLAENLVVIGGTSMLPGFLHRLLAEIRYLVEKPKYKKALGTKTFRIHTPPAKANCVAWLGGAIFGALQDILGSRSVSKEYYNQTGRIPDWCSLNNPPLEMMFDVGKTQPPLMKRAFSTEK

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Dynactin subunit 4
分子量 formula_weight	52409.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K

MASLLQSDRVLYLVQGEKKVRAPLSQLYFCRYCSELRSLECVSHEVDSHYCPSCLENMPSAEAKLKKNRCANCFDCPGCMHTLSTRATSISTQLPDDPAKTTMKKAYYLACGFCRWTSRDVGMADKSVASGGWQEPENPHTQRMNKLIEYYQQLAQKEKVERDRKKLARRRNYMPLAFSDKYGLGTRLQRPRAGASISTLAGLSLKEGEDQKEIKIEPAQAVDEVEPLPEDYYTRPVNLTEVTTLQQRLLQPDFQPVCASQLYPRHKHLLIKRSLRCRKCEHNLSKPEFNPTSIKFKIQLVAVNYIPEVRIMSIPNLRYMKESQVLLTLTNPVENLTHVTLFECEEGDPDDINSTAKVVVPPKELVLAGKDAAAEYDELAEPQDFQDDPDIIAFRKANKVGIFIKVTPQREEGEVTVCFKMKHDFKNLAAPIRPIEESDQGTEVIWLTQHVELSLGPLLP

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Dynactin subunit 5
分子量 formula_weight	20150.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L

MELGELLYNKSEYIETASGNKVSRQSVLCGSQNIVLNGKTIVMNDCIIRGDLANVRVGRHCVVKSRSVIRPPFKKFSKGVAFFPLHIGDHVFIEEDCVVNAAQIGSYVHVGKNCVIGRRCVLKDCCKILDNTVLPPETVVPPFTVFSGCPGLFSGELPECTQELMIDVTKSYYQKFLPLTQV

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Dynactin subunit 6
分子量 formula_weight	20769.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	M

MAEKTQKSVKIAPGAVVCVESEIRGDVTIGPRTVIHPKARIIAEAGPIVIGEGNLIEEQALIINAYPDNITPDTEDPEPKPMIIGTNNVFEVGCYSQAMKMGDNNVIESKAYVGRNVILTSGCIIGACCNLNTFEVIPENTVIYGADCLRRVQTERPQPQTLQLDFLMKILPNYHHLKKTMKGSSTPVKN

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	F-actin-capping protein subunit alpha-1
分子量 formula_weight	32964.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	N

MADFDDRVSDEEKVRIAAKFITHAPPGEFNEVFNDVRLLLNNDNLLREGAAHAFAQYNMDQFTPVKIEGYEDQVLITEHGDLGNSRFLDPRNKISFKFDHLRKEASDPQPEEADGGLKSWRESCDSALRAYVKDHYSNGFCTVYAKTIDGQQTIIACIESHQFQPKNFWNGRWRSEWKFTITPPTAQVVGVLKIQVHYYEDGNVQLVSHKDVQDSLTVSNEAQTAKEFIKIIENAENEYQTAISENYQTMSDTTFKALRRQLPVTRTKIDWNKILSYKIGKEMQNA

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	F-actin-capping protein subunit beta
分子量 formula_weight	30669.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	O

MSDQQLDCALDLMRRLPPQQIEKNLSDLIDLVPSLCEDLLSSVDQPLKIARDKVVGKDYLLCDYNRDGDSYRSPWSNKYDPPLEDGAMPSARLRKLEVEANNAFDQYRDLYFEGGVSSVYLWDLDHGFAGVILIKKAGDGSKKIKGCWDSIHVVEVQEKSSGRTAHYKLTSTVMLWLQTNKSGSGTMNLGGSLTRQMEKDETVSDCSPHIANIGRLVEDMENKIRSTLNEIYFGKTKDIVNGLRSVQTFADKSKQEALKNDLVEALKRKQQC

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	Dynactin subunit 2
分子量 formula_weight	44285.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	P,Q,p,q

MADPKYADLPGIARNEPDVYETSDLPEDDQAEFDAEELTSTSVEHIIVNPNAAYDKFKDKRVGTKGLDFSDRIGKTKRTGYESGEYEMLGEGLGVKETPQQKYQRLLHEVQELTTEVEKIKTTVKESATEEKLTPVLLAKQLAALKQQLVASHLEKLLGPDAAINLTDPDGALAKRLLLQLEATKNSKGGSGGKTTGTPPDSSLVTYELHSRPEQDKFSQAAKVAELEKRLTELETAVRCDQDAQNPLSAGLQGACLMETVELLQAKVSALDLAVLDQVEARLQSVLGKVNEIAKHKASVEDADTQSKVHQLYETIQRWSPIASTLPELVQRLVTIKQLHEQAMQFGQLLTHLDTTQQMIANSLKDNTTLLTQVQTTMRENLATVEGNFASIDERMKKLGK

实体 10 Entity 10 non-polymer

描述 description	ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	427.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	8

实体 11 Entity 11 non-polymer

描述 description	PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER
分子量 formula_weight	506.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 12 Entity 12 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

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分辨率 resolution	3.47 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	50376

Cryo-EM structure of human dynactin complex bound to Chlamydia effector Dre1

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Alpha-centractin

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Actin, cytoplasmic 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Actin-related protein 10

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Dynactin subunit 4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Dynactin subunit 5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Dynactin subunit 6

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

F-actin-capping protein subunit alpha-1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

F-actin-capping protein subunit beta

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Dynactin subunit 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

9b85__assembly_1__model_1

9b85__assembly_1__model_1 | I(q)

9b85__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment