9bcx

Cryo-EM structure of the S. cerevisiae ORC-Cdc6-Mcm2-7-DNA complex with a fully closed Mcm2-Mcm5 DNA entry gate

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 185.6 Å Quality: GOOD

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

DNA replication licensing factor MCM2

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P29469

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 14 DNA 2 PDB 声明:16-meric(16) 与全部聚合物数一致 链 2; UniProt 1–868 未记录 DNA replication licensing factor MCM3 × 1 (A0A8H8ULI2) DNA replication licensing factor MCM5 × 1 (A0A6A5PUY8) DNA replication licensing factor MCM4 × 1 (A0A8H4BU27) DNA replication licensing factor MCM6 × 1 (P53091) DNA replication licensing factor MCM7 × 1 (P38132) Origin recognition complex subunit 1 × 1 (P54784) Origin recognition complex subunit 2 × 1 (P32833) Origin recognition complex subunit 3 × 1 (P54790) Origin recognition complex subunit 4 × 1 (P54791) Origin recognition complex subunit 5 × 1 (P50874) Origin recognition complex subunit 6 × 1 (P38826) Cell division control protein 6 × 1 (P09119) TAH11 isoform 1 × 1 (A0A8H4C095) DNA (39-MER) × 1 DNA (39-MER) × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 6.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 51 个其他 PDB 条目、51 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 MCM2_YEAST
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 2; PDB构建体 1–868; UniProt 1–868

DNA replication licensing factor MCM3

Saccharomyces cerevisiae

UniProt A0A8H8ULI2

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 14 DNA 2 PDB 声明:16-meric(16) 与全部聚合物数一致 链 3; UniProt 1–971 未记录 DNA replication licensing factor MCM2 × 1 (P29469) DNA replication licensing factor MCM5 × 1 (A0A6A5PUY8) DNA replication licensing factor MCM4 × 1 (A0A8H4BU27) DNA replication licensing factor MCM6 × 1 (P53091) DNA replication licensing factor MCM7 × 1 (P38132) Origin recognition complex subunit 1 × 1 (P54784) Origin recognition complex subunit 2 × 1 (P32833) Origin recognition complex subunit 3 × 1 (P54790) Origin recognition complex subunit 4 × 1 (P54791) Origin recognition complex subunit 5 × 1 (P50874) Origin recognition complex subunit 6 × 1 (P38826) Cell division control protein 6 × 1 (P09119) TAH11 isoform 1 × 1 (A0A8H4C095) DNA (39-MER) × 1 DNA (39-MER) × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 6.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

数据库中没有找到同一 UniProt 蛋白的其他 PDB 条目。

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A8H8ULI2_YEASX
Isoform
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 3; PDB构建体 1–971; UniProt 1–971

DNA replication licensing factor MCM5

Saccharomyces cerevisiae

UniProt A0A6A5PUY8

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 14 DNA 2 PDB 声明:16-meric(16) 与全部聚合物数一致 链 5; UniProt 1–775 未记录 DNA replication licensing factor MCM2 × 1 (P29469) DNA replication licensing factor MCM3 × 1 (A0A8H8ULI2) DNA replication licensing factor MCM4 × 1 (A0A8H4BU27) DNA replication licensing factor MCM6 × 1 (P53091) DNA replication licensing factor MCM7 × 1 (P38132) Origin recognition complex subunit 1 × 1 (P54784) Origin recognition complex subunit 2 × 1 (P32833) Origin recognition complex subunit 3 × 1 (P54790) Origin recognition complex subunit 4 × 1 (P54791) Origin recognition complex subunit 5 × 1 (P50874) Origin recognition complex subunit 6 × 1 (P38826) Cell division control protein 6 × 1 (P09119) TAH11 isoform 1 × 1 (A0A8H4C095) DNA (39-MER) × 1 DNA (39-MER) × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 6.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 4 个其他 PDB 条目、4 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A6A5PUY8_YEASX
Isoform
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 5; PDB构建体 1–775; UniProt 1–775

DNA replication licensing factor MCM4

Saccharomyces cerevisiae

UniProt A0A8H4BU27

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 14 DNA 2 PDB 声明:16-meric(16) 与全部聚合物数一致 链 4; UniProt 1–933 未记录 DNA replication licensing factor MCM2 × 1 (P29469) DNA replication licensing factor MCM3 × 1 (A0A8H8ULI2) DNA replication licensing factor MCM5 × 1 (A0A6A5PUY8) DNA replication licensing factor MCM6 × 1 (P53091) DNA replication licensing factor MCM7 × 1 (P38132) Origin recognition complex subunit 1 × 1 (P54784) Origin recognition complex subunit 2 × 1 (P32833) Origin recognition complex subunit 3 × 1 (P54790) Origin recognition complex subunit 4 × 1 (P54791) Origin recognition complex subunit 5 × 1 (P50874) Origin recognition complex subunit 6 × 1 (P38826) Cell division control protein 6 × 1 (P09119) TAH11 isoform 1 × 1 (A0A8H4C095) DNA (39-MER) × 1 DNA (39-MER) × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 6.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

数据库中没有找到同一 UniProt 蛋白的其他 PDB 条目。

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A8H4BU27_YEASX
Isoform
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 4; PDB构建体 1–933; UniProt 1–933

DNA replication licensing factor MCM6

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P53091

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 14 DNA 2 PDB 声明:16-meric(16) 与全部聚合物数一致 链 6; UniProt 1–1017 未记录 DNA replication licensing factor MCM2 × 1 (P29469) DNA replication licensing factor MCM3 × 1 (A0A8H8ULI2) DNA replication licensing factor MCM5 × 1 (A0A6A5PUY8) DNA replication licensing factor MCM4 × 1 (A0A8H4BU27) DNA replication licensing factor MCM7 × 1 (P38132) Origin recognition complex subunit 1 × 1 (P54784) Origin recognition complex subunit 2 × 1 (P32833) Origin recognition complex subunit 3 × 1 (P54790) Origin recognition complex subunit 4 × 1 (P54791) Origin recognition complex subunit 5 × 1 (P50874) Origin recognition complex subunit 6 × 1 (P38826) Cell division control protein 6 × 1 (P09119) TAH11 isoform 1 × 1 (A0A8H4C095) DNA (39-MER) × 1 DNA (39-MER) × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 6.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 58 个其他 PDB 条目、58 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 MCM6_YEAST
Isoform
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 6; PDB构建体 1–1017; UniProt 1–1017

DNA replication licensing factor MCM7

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P38132

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 14 DNA 2 PDB 声明:16-meric(16) 与全部聚合物数一致 链 7; UniProt 1–845 未记录 DNA replication licensing factor MCM2 × 1 (P29469) DNA replication licensing factor MCM3 × 1 (A0A8H8ULI2) DNA replication licensing factor MCM5 × 1 (A0A6A5PUY8) DNA replication licensing factor MCM4 × 1 (A0A8H4BU27) DNA replication licensing factor MCM6 × 1 (P53091) Origin recognition complex subunit 1 × 1 (P54784) Origin recognition complex subunit 2 × 1 (P32833) Origin recognition complex subunit 3 × 1 (P54790) Origin recognition complex subunit 4 × 1 (P54791) Origin recognition complex subunit 5 × 1 (P50874) Origin recognition complex subunit 6 × 1 (P38826) Cell division control protein 6 × 1 (P09119) TAH11 isoform 1 × 1 (A0A8H4C095) DNA (39-MER) × 1 DNA (39-MER) × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 6.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 55 个其他 PDB 条目、55 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 MCM7_YEAST
Isoform
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 7; PDB构建体 1–845; UniProt 1–845

Origin recognition complex subunit 1

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P54784

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 14 DNA 2 PDB 声明:16-meric(16) 与全部聚合物数一致 链 B; UniProt 1–914 未记录 DNA replication licensing factor MCM2 × 1 (P29469) DNA replication licensing factor MCM3 × 1 (A0A8H8ULI2) DNA replication licensing factor MCM5 × 1 (A0A6A5PUY8) DNA replication licensing factor MCM4 × 1 (A0A8H4BU27) DNA replication licensing factor MCM6 × 1 (P53091) DNA replication licensing factor MCM7 × 1 (P38132) Origin recognition complex subunit 2 × 1 (P32833) Origin recognition complex subunit 3 × 1 (P54790) Origin recognition complex subunit 4 × 1 (P54791) Origin recognition complex subunit 5 × 1 (P50874) Origin recognition complex subunit 6 × 1 (P38826) Cell division control protein 6 × 1 (P09119) TAH11 isoform 1 × 1 (A0A8H4C095) DNA (39-MER) × 1 DNA (39-MER) × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 6.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 25 个其他 PDB 条目、27 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ORC1_YEAST
Isoform
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–914; UniProt 1–914

Origin recognition complex subunit 2

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P32833

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 14 DNA 2 PDB 声明:16-meric(16) 与全部聚合物数一致 链 C; UniProt 1–620 未记录 DNA replication licensing factor MCM2 × 1 (P29469) DNA replication licensing factor MCM3 × 1 (A0A8H8ULI2) DNA replication licensing factor MCM5 × 1 (A0A6A5PUY8) DNA replication licensing factor MCM4 × 1 (A0A8H4BU27) DNA replication licensing factor MCM6 × 1 (P53091) DNA replication licensing factor MCM7 × 1 (P38132) Origin recognition complex subunit 1 × 1 (P54784) Origin recognition complex subunit 3 × 1 (P54790) Origin recognition complex subunit 4 × 1 (P54791) Origin recognition complex subunit 5 × 1 (P50874) Origin recognition complex subunit 6 × 1 (P38826) Cell division control protein 6 × 1 (P09119) TAH11 isoform 1 × 1 (A0A8H4C095) DNA (39-MER) × 1 DNA (39-MER) × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 6.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 19 个其他 PDB 条目、19 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ORC2_YEAST
Isoform
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 1–620; UniProt 1–620

Origin recognition complex subunit 3

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P54790

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 14 DNA 2 PDB 声明:16-meric(16) 与全部聚合物数一致 链 D; UniProt 1–616 未记录 DNA replication licensing factor MCM2 × 1 (P29469) DNA replication licensing factor MCM3 × 1 (A0A8H8ULI2) DNA replication licensing factor MCM5 × 1 (A0A6A5PUY8) DNA replication licensing factor MCM4 × 1 (A0A8H4BU27) DNA replication licensing factor MCM6 × 1 (P53091) DNA replication licensing factor MCM7 × 1 (P38132) Origin recognition complex subunit 1 × 1 (P54784) Origin recognition complex subunit 2 × 1 (P32833) Origin recognition complex subunit 4 × 1 (P54791) Origin recognition complex subunit 5 × 1 (P50874) Origin recognition complex subunit 6 × 1 (P38826) Cell division control protein 6 × 1 (P09119) TAH11 isoform 1 × 1 (A0A8H4C095) DNA (39-MER) × 1 DNA (39-MER) × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 6.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 19 个其他 PDB 条目、19 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ORC3_YEAST
Isoform
PDB实体 9
链与序列区间 作者链 D; PDB构建体 1–616; UniProt 1–616

Origin recognition complex subunit 4

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P54791

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 14 DNA 2 PDB 声明:16-meric(16) 与全部聚合物数一致 链 E; UniProt 1–529 未记录 DNA replication licensing factor MCM2 × 1 (P29469) DNA replication licensing factor MCM3 × 1 (A0A8H8ULI2) DNA replication licensing factor MCM5 × 1 (A0A6A5PUY8) DNA replication licensing factor MCM4 × 1 (A0A8H4BU27) DNA replication licensing factor MCM6 × 1 (P53091) DNA replication licensing factor MCM7 × 1 (P38132) Origin recognition complex subunit 1 × 1 (P54784) Origin recognition complex subunit 2 × 1 (P32833) Origin recognition complex subunit 3 × 1 (P54790) Origin recognition complex subunit 5 × 1 (P50874) Origin recognition complex subunit 6 × 1 (P38826) Cell division control protein 6 × 1 (P09119) TAH11 isoform 1 × 1 (A0A8H4C095) DNA (39-MER) × 1 DNA (39-MER) × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 6.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 19 个其他 PDB 条目、19 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ORC4_YEAST
Isoform
PDB实体 10
链与序列区间 作者链 E; PDB构建体 1–529; UniProt 1–529

Origin recognition complex subunit 5

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P50874

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 14 DNA 2 PDB 声明:16-meric(16) 与全部聚合物数一致 链 F; UniProt 1–479 未记录 DNA replication licensing factor MCM2 × 1 (P29469) DNA replication licensing factor MCM3 × 1 (A0A8H8ULI2) DNA replication licensing factor MCM5 × 1 (A0A6A5PUY8) DNA replication licensing factor MCM4 × 1 (A0A8H4BU27) DNA replication licensing factor MCM6 × 1 (P53091) DNA replication licensing factor MCM7 × 1 (P38132) Origin recognition complex subunit 1 × 1 (P54784) Origin recognition complex subunit 2 × 1 (P32833) Origin recognition complex subunit 3 × 1 (P54790) Origin recognition complex subunit 4 × 1 (P54791) Origin recognition complex subunit 6 × 1 (P38826) Cell division control protein 6 × 1 (P09119) TAH11 isoform 1 × 1 (A0A8H4C095) DNA (39-MER) × 1 DNA (39-MER) × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 6.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 19 个其他 PDB 条目、19 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ORC5_YEAST
Isoform
PDB实体 11
链与序列区间 作者链 F; PDB构建体 1–479; UniProt 1–479

Origin recognition complex subunit 6

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P38826

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 14 DNA 2 PDB 声明:16-meric(16) 与全部聚合物数一致 链 G; UniProt 1–435 未记录 DNA replication licensing factor MCM2 × 1 (P29469) DNA replication licensing factor MCM3 × 1 (A0A8H8ULI2) DNA replication licensing factor MCM5 × 1 (A0A6A5PUY8) DNA replication licensing factor MCM4 × 1 (A0A8H4BU27) DNA replication licensing factor MCM6 × 1 (P53091) DNA replication licensing factor MCM7 × 1 (P38132) Origin recognition complex subunit 1 × 1 (P54784) Origin recognition complex subunit 2 × 1 (P32833) Origin recognition complex subunit 3 × 1 (P54790) Origin recognition complex subunit 4 × 1 (P54791) Origin recognition complex subunit 5 × 1 (P50874) Cell division control protein 6 × 1 (P09119) TAH11 isoform 1 × 1 (A0A8H4C095) DNA (39-MER) × 1 DNA (39-MER) × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 6.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 18 个其他 PDB 条目、18 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ORC6_YEAST
Isoform
PDB实体 12
链与序列区间 作者链 G; PDB构建体 1–435; UniProt 1–435

Cell division control protein 6

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P09119

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 14 DNA 2 PDB 声明:16-meric(16) 与全部聚合物数一致 链 I; UniProt 1–513 未记录 DNA replication licensing factor MCM2 × 1 (P29469) DNA replication licensing factor MCM3 × 1 (A0A8H8ULI2) DNA replication licensing factor MCM5 × 1 (A0A6A5PUY8) DNA replication licensing factor MCM4 × 1 (A0A8H4BU27) DNA replication licensing factor MCM6 × 1 (P53091) DNA replication licensing factor MCM7 × 1 (P38132) Origin recognition complex subunit 1 × 1 (P54784) Origin recognition complex subunit 2 × 1 (P32833) Origin recognition complex subunit 3 × 1 (P54790) Origin recognition complex subunit 4 × 1 (P54791) Origin recognition complex subunit 5 × 1 (P50874) Origin recognition complex subunit 6 × 1 (P38826) TAH11 isoform 1 × 1 (A0A8H4C095) DNA (39-MER) × 1 DNA (39-MER) × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 6.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 9 个其他 PDB 条目、9 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CDC6_YEAST
Isoform
PDB实体 13
链与序列区间 作者链 I; PDB构建体 1–513; UniProt 1–513

TAH11 isoform 1

Saccharomyces cerevisiae

UniProt A0A8H4C095

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 14 DNA 2 PDB 声明:16-meric(16) 与全部聚合物数一致 链 8; UniProt 1–604 未记录 DNA replication licensing factor MCM2 × 1 (P29469) DNA replication licensing factor MCM3 × 1 (A0A8H8ULI2) DNA replication licensing factor MCM5 × 1 (A0A6A5PUY8) DNA replication licensing factor MCM4 × 1 (A0A8H4BU27) DNA replication licensing factor MCM6 × 1 (P53091) DNA replication licensing factor MCM7 × 1 (P38132) Origin recognition complex subunit 1 × 1 (P54784) Origin recognition complex subunit 2 × 1 (P32833) Origin recognition complex subunit 3 × 1 (P54790) Origin recognition complex subunit 4 × 1 (P54791) Origin recognition complex subunit 5 × 1 (P50874) Origin recognition complex subunit 6 × 1 (P38826) Cell division control protein 6 × 1 (P09119) DNA (39-MER) × 1 DNA (39-MER) × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 6.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

数据库中没有找到同一 UniProt 蛋白的其他 PDB 条目。

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A8H4C095_YEASX
Isoform
PDB实体 14
链与序列区间 作者链 8; PDB构建体 1–604; UniProt 1–604

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 9bcx

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 9bcx
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id9bcx
沉积日期 deposition_date2024-04-10
结构标题 titleCryo-EM structure of the S. cerevisiae ORC-Cdc6-Mcm2-7-DNA complex with a fully closed Mcm2-Mcm5 DNA entry gate
关键词 keywordsDNA replication, Cryo-EM, OCCM-deltaC6, REPLICATION-DNA complex, DNA BINDING PROTEIN; DNA BINDING PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier65.50
回转半径 Rg (电子) rg_electron65.29
零角强度 I(0) i09418050000.00
分子量 molecular_weight818750.0 kDa
排除体积 excluded_volume1023500 ų
包络体积 envelope_volume1673000 ų
水化壳体积 shell_volume200720 ų
包络直径 envelope_diameter213.4
壳层 Rg shell_rg74.61
包络 Rg envelope_rg63.92
形状 Rg shape_rg65.32
总 Rg total_rg65.33
总原子数 total_atoms57494
残基数 n_residues7165
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax185.6
Rg (实空间) rg_real65.13
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.83
I(0) (实空间) i0_real9.4170e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.7170e+08
Rg (倒空间) rg_reciprocal65.77
I(0) (倒空间) i0_reciprocal9428000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8399
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary77.3
偏度 Skewness skewness0.214
峰度 Kurtosis kurtosis-0.477
角度范围 angular_range— – 0.1200 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0001
最高正则化参数 α highest_alpha2104000000.0000
实空间数据点数 n_real_points25
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.982; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.965; Smooth: 0.002

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (18)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)