9d4u

Core particle assembly intermediate Capless 13S purified from Saccharomyces cerevisiae

Method: ELECTRON MICROSCOPY
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Proteasome subunit alpha type-1

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P21243

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 11 Proteasome subunit alpha type-2 × 1 (P23639) Proteasome subunit alpha type-3 × 1 (P23638) Proteasome subunit alpha type-4 × 1 (P40303) Proteasome subunit alpha type-5 × 1 (P32379) Proteasome subunit alpha type-6 × 1 (P40302) Probable proteasome subunit alpha type-7 × 1 (P21242) Proteasome subunit beta type-2 × 1 (P25043) Proteasome subunit beta type-3 × 1 (P25451) Proteasome subunit beta type-4 × 1 (P22141) Proteasome maturation factor UMP1 × 1 (P38293) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 PSA1_YEAST
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–252; UniProt 1–252

Proteasome subunit alpha type-2

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P23639

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 11 Proteasome subunit alpha type-1 × 1 (P21243) Proteasome subunit alpha type-3 × 1 (P23638) Proteasome subunit alpha type-4 × 1 (P40303) Proteasome subunit alpha type-5 × 1 (P32379) Proteasome subunit alpha type-6 × 1 (P40302) Probable proteasome subunit alpha type-7 × 1 (P21242) Proteasome subunit beta type-2 × 1 (P25043) Proteasome subunit beta type-3 × 1 (P25451) Proteasome subunit beta type-4 × 1 (P22141) Proteasome maturation factor UMP1 × 1 (P38293) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 PSA2_YEAST
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–250; UniProt 1–250

Proteasome subunit alpha type-3

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P23638

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 11 Proteasome subunit alpha type-1 × 1 (P21243) Proteasome subunit alpha type-2 × 1 (P23639) Proteasome subunit alpha type-4 × 1 (P40303) Proteasome subunit alpha type-5 × 1 (P32379) Proteasome subunit alpha type-6 × 1 (P40302) Probable proteasome subunit alpha type-7 × 1 (P21242) Proteasome subunit beta type-2 × 1 (P25043) Proteasome subunit beta type-3 × 1 (P25451) Proteasome subunit beta type-4 × 1 (P22141) Proteasome maturation factor UMP1 × 1 (P38293) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 PSA3_YEAST
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 1–258; UniProt 1–258

Proteasome subunit alpha type-4

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P40303

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 11 Proteasome subunit alpha type-1 × 1 (P21243) Proteasome subunit alpha type-2 × 1 (P23639) Proteasome subunit alpha type-3 × 1 (P23638) Proteasome subunit alpha type-5 × 1 (P32379) Proteasome subunit alpha type-6 × 1 (P40302) Probable proteasome subunit alpha type-7 × 1 (P21242) Proteasome subunit beta type-2 × 1 (P25043) Proteasome subunit beta type-3 × 1 (P25451) Proteasome subunit beta type-4 × 1 (P22141) Proteasome maturation factor UMP1 × 1 (P38293) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 PSA4_YEAST
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 D; PDB构建体 1–254; UniProt 1–254

Proteasome subunit alpha type-5

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P32379

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 11 Proteasome subunit alpha type-1 × 1 (P21243) Proteasome subunit alpha type-2 × 1 (P23639) Proteasome subunit alpha type-3 × 1 (P23638) Proteasome subunit alpha type-4 × 1 (P40303) Proteasome subunit alpha type-6 × 1 (P40302) Probable proteasome subunit alpha type-7 × 1 (P21242) Proteasome subunit beta type-2 × 1 (P25043) Proteasome subunit beta type-3 × 1 (P25451) Proteasome subunit beta type-4 × 1 (P22141) Proteasome maturation factor UMP1 × 1 (P38293) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 PSA5_YEAST
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 E; PDB构建体 1–260; UniProt 1–260

Proteasome subunit alpha type-6

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P40302

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 11 Proteasome subunit alpha type-1 × 1 (P21243) Proteasome subunit alpha type-2 × 1 (P23639) Proteasome subunit alpha type-3 × 1 (P23638) Proteasome subunit alpha type-4 × 1 (P40303) Proteasome subunit alpha type-5 × 1 (P32379) Probable proteasome subunit alpha type-7 × 1 (P21242) Proteasome subunit beta type-2 × 1 (P25043) Proteasome subunit beta type-3 × 1 (P25451) Proteasome subunit beta type-4 × 1 (P22141) Proteasome maturation factor UMP1 × 1 (P38293) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 PSA6_YEAST
Isoform —
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 F; PDB构建体 1–234; UniProt 1–234

Probable proteasome subunit alpha type-7

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P21242

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 11 Proteasome subunit alpha type-1 × 1 (P21243) Proteasome subunit alpha type-2 × 1 (P23639) Proteasome subunit alpha type-3 × 1 (P23638) Proteasome subunit alpha type-4 × 1 (P40303) Proteasome subunit alpha type-5 × 1 (P32379) Proteasome subunit alpha type-6 × 1 (P40302) Proteasome subunit beta type-2 × 1 (P25043) Proteasome subunit beta type-3 × 1 (P25451) Proteasome subunit beta type-4 × 1 (P22141) Proteasome maturation factor UMP1 × 1 (P38293) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PSA7_YEAST
Isoform —
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 G; PDB构建体 1–288; UniProt 1–288

Proteasome subunit beta type-2

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P25043

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 11 Proteasome subunit alpha type-1 × 1 (P21243) Proteasome subunit alpha type-2 × 1 (P23639) Proteasome subunit alpha type-3 × 1 (P23638) Proteasome subunit alpha type-4 × 1 (P40303) Proteasome subunit alpha type-5 × 1 (P32379) Proteasome subunit alpha type-6 × 1 (P40302) Probable proteasome subunit alpha type-7 × 1 (P21242) Proteasome subunit beta type-3 × 1 (P25451) Proteasome subunit beta type-4 × 1 (P22141) Proteasome maturation factor UMP1 × 1 (P38293) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 PSB2_YEAST
Isoform —
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 I; PDB构建体 1–261; UniProt 1–261

Proteasome subunit beta type-3

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P25451

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 11 Proteasome subunit alpha type-1 × 1 (P21243) Proteasome subunit alpha type-2 × 1 (P23639) Proteasome subunit alpha type-3 × 1 (P23638) Proteasome subunit alpha type-4 × 1 (P40303) Proteasome subunit alpha type-5 × 1 (P32379) Proteasome subunit alpha type-6 × 1 (P40302) Probable proteasome subunit alpha type-7 × 1 (P21242) Proteasome subunit beta type-2 × 1 (P25043) Proteasome subunit beta type-4 × 1 (P22141) Proteasome maturation factor UMP1 × 1 (P38293) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PSB3_YEAST
Isoform —
PDB实体 9
链与序列区间 作者链 J; PDB构建体 1–205; UniProt 1–205

Proteasome subunit beta type-4

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P22141

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 11 Proteasome subunit alpha type-1 × 1 (P21243) Proteasome subunit alpha type-2 × 1 (P23639) Proteasome subunit alpha type-3 × 1 (P23638) Proteasome subunit alpha type-4 × 1 (P40303) Proteasome subunit alpha type-5 × 1 (P32379) Proteasome subunit alpha type-6 × 1 (P40302) Probable proteasome subunit alpha type-7 × 1 (P21242) Proteasome subunit beta type-2 × 1 (P25043) Proteasome subunit beta type-3 × 1 (P25451) Proteasome maturation factor UMP1 × 1 (P38293) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PSB4_YEAST
Isoform —
PDB实体 10
链与序列区间 作者链 K; PDB构建体 1–198; UniProt 1–198

Proteasome maturation factor UMP1

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P38293

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 11 Proteasome subunit alpha type-1 × 1 (P21243) Proteasome subunit alpha type-2 × 1 (P23639) Proteasome subunit alpha type-3 × 1 (P23638) Proteasome subunit alpha type-4 × 1 (P40303) Proteasome subunit alpha type-5 × 1 (P32379) Proteasome subunit alpha type-6 × 1 (P40302) Probable proteasome subunit alpha type-7 × 1 (P21242) Proteasome subunit beta type-2 × 1 (P25043) Proteasome subunit beta type-3 × 1 (P25451) Proteasome subunit beta type-4 × 1 (P22141) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 UMP1_YEAST
Isoform —
PDB实体 11
链与序列区间 作者链 P; PDB构建体 1–148; UniProt 1–148

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id9d4u
沉积日期 deposition_date2024-08-13
结构标题 titleCore particle assembly intermediate Capless 13S purified from Saccharomyces cerevisiae
关键词 keywordsProteasome, Cryo-EM, Assembly, assembly chaperone, Blm10, PA200, Blm10-13S, Pba1, CP, HYDROLASE; HYDROLASE
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9d4u__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9d4u__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

9d4u__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)44.14 Å
Rg(电子密度)43.54 Å
总 Rg43.95 Å
原子数35217
残基数2273
排除体积314230 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 9d4u__assembly_1__model_1 11-meric (11) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (11)

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7. 引用文献 (1)