9eug

Cryo-EM structure of Staphylococcus aureus bacteriophage phi812 baseplate in the pre-contraction state - core, wedge module, and proximal tail proteins

Method: ELECTRON MICROSCOPY
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

NlpC/P60 domain-containing protein

物种未注明

UniProt A0A0U1UXW0

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 135 GP-PDE domain-containing protein × 5 (A0A0U1WFD7) Baseplate component × 20 (A0A0U1WF63) Peptidase C51 domain-containing protein × 5 (A0A0U1X189) Baseplate component × 10 (A0A0U1UXD6) TmpF × 10 (A0A0U1WGD3) Baseplate wedge subunit × 10 (A0A0U1UXD7) Putative baseplate component × 10 (A0A0U1X2L4) Major tail sheath protein × 30 (A0A0U1WZ79) Capsid protein × 30 (A1YTP2) 待复核

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 A0A0U1UXW0_9CAUD
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–295; UniProt 1–295

GP-PDE domain-containing protein

物种未注明

UniProt A0A0U1WFD7

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 135 NlpC/P60 domain-containing protein × 5 (A0A0U1UXW0) Baseplate component × 20 (A0A0U1WF63) Peptidase C51 domain-containing protein × 5 (A0A0U1X189) Baseplate component × 10 (A0A0U1UXD6) TmpF × 10 (A0A0U1WGD3) Baseplate wedge subunit × 10 (A0A0U1UXD7) Putative baseplate component × 10 (A0A0U1X2L4) Major tail sheath protein × 30 (A0A0U1WZ79) Capsid protein × 30 (A1YTP2) 待复核

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 A0A0U1WFD7_9CAUD
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–848; UniProt 1–848

Baseplate component

物种未注明

UniProt A0A0U1WF63

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 135 NlpC/P60 domain-containing protein × 5 (A0A0U1UXW0) GP-PDE domain-containing protein × 5 (A0A0U1WFD7) Peptidase C51 domain-containing protein × 5 (A0A0U1X189) Baseplate component × 10 (A0A0U1UXD6) TmpF × 10 (A0A0U1WGD3) Baseplate wedge subunit × 10 (A0A0U1UXD7) Putative baseplate component × 10 (A0A0U1X2L4) Major tail sheath protein × 30 (A0A0U1WZ79) Capsid protein × 30 (A1YTP2) 待复核

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 A0A0U1WF63_9CAUD
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 1–348; UniProt 1–348 作者链 D; PDB构建体 1–348; UniProt 1–348 作者链 I; PDB构建体 1–348; UniProt 1–348 作者链 K; PDB构建体 1–348; UniProt 1–348

Peptidase C51 domain-containing protein

物种未注明

UniProt A0A0U1X189

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 135 NlpC/P60 domain-containing protein × 5 (A0A0U1UXW0) GP-PDE domain-containing protein × 5 (A0A0U1WFD7) Baseplate component × 20 (A0A0U1WF63) Baseplate component × 10 (A0A0U1UXD6) TmpF × 10 (A0A0U1WGD3) Baseplate wedge subunit × 10 (A0A0U1UXD7) Putative baseplate component × 10 (A0A0U1X2L4) Major tail sheath protein × 30 (A0A0U1WZ79) Capsid protein × 30 (A1YTP2) 待复核

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 A0A0U1X189_9CAUD
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 E; PDB构建体 1–808; UniProt 1–808

Baseplate component

物种未注明

UniProt A0A0U1UXD6

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 135 NlpC/P60 domain-containing protein × 5 (A0A0U1UXW0) GP-PDE domain-containing protein × 5 (A0A0U1WFD7) Baseplate component × 20 (A0A0U1WF63) Peptidase C51 domain-containing protein × 5 (A0A0U1X189) TmpF × 10 (A0A0U1WGD3) Baseplate wedge subunit × 10 (A0A0U1UXD7) Putative baseplate component × 10 (A0A0U1X2L4) Major tail sheath protein × 30 (A0A0U1WZ79) Capsid protein × 30 (A1YTP2) 待复核

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 A0A0U1UXD6_9CAUD
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 F; PDB构建体 1–174; UniProt 1–174 作者链 G; PDB构建体 1–174; UniProt 1–174

TmpF

物种未注明

UniProt A0A0U1WGD3

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 135 NlpC/P60 domain-containing protein × 5 (A0A0U1UXW0) GP-PDE domain-containing protein × 5 (A0A0U1WFD7) Baseplate component × 20 (A0A0U1WF63) Peptidase C51 domain-containing protein × 5 (A0A0U1X189) Baseplate component × 10 (A0A0U1UXD6) Baseplate wedge subunit × 10 (A0A0U1UXD7) Putative baseplate component × 10 (A0A0U1X2L4) Major tail sheath protein × 30 (A0A0U1WZ79) Capsid protein × 30 (A1YTP2) 待复核

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 A0A0U1WGD3_9CAUD
Isoform —
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 H; PDB构建体 1–1019; UniProt 1–1019 作者链 J; PDB构建体 1–1019; UniProt 1–1019

Baseplate wedge subunit

物种未注明

UniProt A0A0U1UXD7

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 135 NlpC/P60 domain-containing protein × 5 (A0A0U1UXW0) GP-PDE domain-containing protein × 5 (A0A0U1WFD7) Baseplate component × 20 (A0A0U1WF63) Peptidase C51 domain-containing protein × 5 (A0A0U1X189) Baseplate component × 10 (A0A0U1UXD6) TmpF × 10 (A0A0U1WGD3) Putative baseplate component × 10 (A0A0U1X2L4) Major tail sheath protein × 30 (A0A0U1WZ79) Capsid protein × 30 (A1YTP2) 待复核

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 A0A0U1UXD7_9CAUD
Isoform —
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 L; PDB构建体 1–234; UniProt 1–234 作者链 O; PDB构建体 1–234; UniProt 1–234

Putative baseplate component

物种未注明

UniProt A0A0U1X2L4

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 135 NlpC/P60 domain-containing protein × 5 (A0A0U1UXW0) GP-PDE domain-containing protein × 5 (A0A0U1WFD7) Baseplate component × 20 (A0A0U1WF63) Peptidase C51 domain-containing protein × 5 (A0A0U1X189) Baseplate component × 10 (A0A0U1UXD6) TmpF × 10 (A0A0U1WGD3) Baseplate wedge subunit × 10 (A0A0U1UXD7) Major tail sheath protein × 30 (A0A0U1WZ79) Capsid protein × 30 (A1YTP2) 待复核

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 A0A0U1X2L4_9CAUD
Isoform —
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 M; PDB构建体 1–263; UniProt 1–263 作者链 N; PDB构建体 1–263; UniProt 1–263

Major tail sheath protein

物种未注明

UniProt A0A0U1WZ79

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 135 NlpC/P60 domain-containing protein × 5 (A0A0U1UXW0) GP-PDE domain-containing protein × 5 (A0A0U1WFD7) Baseplate component × 20 (A0A0U1WF63) Peptidase C51 domain-containing protein × 5 (A0A0U1X189) Baseplate component × 10 (A0A0U1UXD6) TmpF × 10 (A0A0U1WGD3) Baseplate wedge subunit × 10 (A0A0U1UXD7) Putative baseplate component × 10 (A0A0U1X2L4) Capsid protein × 30 (A1YTP2) 待复核

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 A0A0U1WZ79_9CAUD
Isoform —
PDB实体 9
链与序列区间 作者链 P; PDB构建体 1–587; UniProt 1–587 作者链 Q; PDB构建体 1–587; UniProt 1–587 作者链 T; PDB构建体 1–587; UniProt 1–587 作者链 U; PDB构建体 1–587; UniProt 1–587 作者链 X; PDB构建体 1–587; UniProt 1–587 作者链 Y; PDB构建体 1–587; UniProt 1–587

Capsid protein

物种未注明

UniProt A1YTP2

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 135 NlpC/P60 domain-containing protein × 5 (A0A0U1UXW0) GP-PDE domain-containing protein × 5 (A0A0U1WFD7) Baseplate component × 20 (A0A0U1WF63) Peptidase C51 domain-containing protein × 5 (A0A0U1X189) Baseplate component × 10 (A0A0U1UXD6) TmpF × 10 (A0A0U1WGD3) Baseplate wedge subunit × 10 (A0A0U1UXD7) Putative baseplate component × 10 (A0A0U1X2L4) Major tail sheath protein × 30 (A0A0U1WZ79) 待复核

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 A1YTP2_9CAUD
Isoform —
PDB实体 10
链与序列区间 作者链 R; PDB构建体 1–142; UniProt 1–142 作者链 S; PDB构建体 1–142; UniProt 1–142 作者链 V; PDB构建体 1–142; UniProt 1–142 作者链 W; PDB构建体 1–142; UniProt 1–142 作者链 Z; PDB构建体 1–142; UniProt 1–142 作者链 a; PDB构建体 1–142; UniProt 1–142

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id9eug
沉积日期 deposition_date2024-03-27
结构标题 titleCryo-EM structure of Staphylococcus aureus bacteriophage phi812 baseplate in the pre-contraction state - core, wedge module, and proximal tail proteins
关键词 keywordsbacteriophage, phage, contractile, phi812, baseplate, VIRUS; VIRUS
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9eug__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9eug__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 109 1010 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

9eug__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)93.12 Å
Rg(电子密度)92.51 Å
总 Rg92.62 Å
原子数187569
残基数23700
排除体积3330500 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 9eug__assembly_1__model_1 81-meric (81) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (10)

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7. 引用文献 (1)