9h1d

Crystal structure of Angiotensin-1 converting enzyme C-domain in complex with dual ACE/NEP inhibitor AD015

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 81.6 Å Quality: REASONABLE

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Angiotensin-converting enzyme

Homo sapiens

UniProt P12821

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 单体 蛋白 × 1 其他聚合物 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 642–1238 突变:E64G, N90Q, N155Q, N337Q, N586Q ;alpha-D-mannopyranose-(1-3)-alpha-D-mannopyranose-(1-6)-[alpha-D-mannopyranose-(1-3)]beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-[alpha-L-fucopyranose-(1-6)]2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; × 1 A1IRR (2~{S},5~{R})-5-(4-methylphenyl)-1-[2-[[(2~{S})-3-phenyl-2-sulfanyl-propanoyl]amino]ethanoyl]pyrrolidine-2-carboxylic acid × 1 IMD IMIDAZOLE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ZN ZINC ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4;289 K;0.1 M MIB pH 4.0, 5% glycerol, 15.5% PEG 3350 分辨率 1.80 Å R-free 0.206

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 89 个其他 PDB 条目、150 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ACE_HUMAN
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–597; UniProt 642–1238

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 9h1d

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 9h1d
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id9h1d
沉积日期 deposition_date2024-10-09
最后修订 last_revision2025-04-16
结构标题 titleCrystal structure of Angiotensin-1 converting enzyme C-domain in complex with dual ACE/NEP inhibitor AD015
关键词 keywordsAngiotensin-1 converting enzyme, Dual inhibitor, NEP, Metalloprotease, HYDROLASE; HYDROLASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier25.35
回转半径 Rg (电子) rg_electron24.02
零角强度 I(0) i078261900.00
分子量 molecular_weight69797.0 kDa
排除体积 excluded_volume87247 ų
包络体积 envelope_volume101920 ų
水化壳体积 shell_volume33986 ų
包络直径 envelope_diameter83.6
壳层 Rg shell_rg32.60
包络 Rg envelope_rg24.19
形状 Rg shape_rg24.00
总 Rg total_rg24.96
总原子数 total_atoms9621
残基数 n_residues586
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax81.6
Rg (实空间) rg_real25.21
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.37
I(0) (实空间) i0_real7.8260e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error8.2400e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal25.25
I(0) (倒空间) i0_reciprocal78260000.0000
解质量估计 total_estimate0.7115
解质量评级 solution_quality REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary32.4
偏度 Skewness skewness0.197
峰度 Kurtosis kurtosis-0.343
角度范围 angular_range— – 0.3150 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0001
最高正则化参数 α highest_alpha20670000.0000
实空间数据点数 n_real_points64
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.842; Stabil: 1.000; Sysdev: 0.242; Positv: 1.000; Valcen: 0.997; Smooth: 0.996

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (9)

8. 引用文献 (2)

9. 文件与曲线 (10)