9imn

Cryo-EM structure of a TEF30-associated intermediate PSII core dimer complex, type I, from Chlamydomonas reinhardtii

Method: ELECTRON MICROSCOPY

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Photosystem II protein D1

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 34	Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （P37255） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P10898） Photosystem II D2 protein × 2 （P06007） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P48268） Cytochrome b559 subunit beta × 2 （Q08363） PDZ domain-containing protein × 2 （A0A2K3E6S5） Photosystem II reaction center protein H × 2 （P22666） Photosystem II reaction center protein I × 2 （P59763） Photosystem II reaction center protein K × 2 （P18263） Photosystem II reaction center protein L × 2 （P32974） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P92277） Photosystem II reaction center protein T × 2 （P37256） Photosystem II reaction center protein Psb30 × 2 （P50370） Photosystem II reaction center W protein, chloroplastic × 2 （Q9SPI9） Chloroplast photosystem II subunit X × 2 （A8I846） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （P92276） FE (II) ION × 2 CHLOROPHYLL A × 70 PHEOPHYTIN A × 4 BETA-CAROTENE × 20 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 10 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 14 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 2 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 6 DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 2 BICARBONATE ION × 2 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 2 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBA_CHLRE
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–327； UniProt 10–336 作者链 a； PDB构建体 1–327； UniProt 10–336

Photosystem II CP47 reaction center protein

物种未注明

UniProt P37255

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 34	Photosystem II protein D1 × 2 （P07753） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P10898） Photosystem II D2 protein × 2 （P06007） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P48268） Cytochrome b559 subunit beta × 2 （Q08363） PDZ domain-containing protein × 2 （A0A2K3E6S5） Photosystem II reaction center protein H × 2 （P22666） Photosystem II reaction center protein I × 2 （P59763） Photosystem II reaction center protein K × 2 （P18263） Photosystem II reaction center protein L × 2 （P32974） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P92277） Photosystem II reaction center protein T × 2 （P37256） Photosystem II reaction center protein Psb30 × 2 （P50370） Photosystem II reaction center W protein, chloroplastic × 2 （Q9SPI9） Chloroplast photosystem II subunit X × 2 （A8I846） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （P92276） FE (II) ION × 2 CHLOROPHYLL A × 70 PHEOPHYTIN A × 4 BETA-CAROTENE × 20 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 10 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 14 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 2 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 6 DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 2 BICARBONATE ION × 2 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 2 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBB_CHLRE
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–480； UniProt 2–481 作者链 b； PDB构建体 1–480； UniProt 2–481

Photosystem II CP43 reaction center protein

物种未注明

UniProt P10898

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 34	Photosystem II protein D1 × 2 （P07753） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （P37255） Photosystem II D2 protein × 2 （P06007） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P48268） Cytochrome b559 subunit beta × 2 （Q08363） PDZ domain-containing protein × 2 （A0A2K3E6S5） Photosystem II reaction center protein H × 2 （P22666） Photosystem II reaction center protein I × 2 （P59763） Photosystem II reaction center protein K × 2 （P18263） Photosystem II reaction center protein L × 2 （P32974） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P92277） Photosystem II reaction center protein T × 2 （P37256） Photosystem II reaction center protein Psb30 × 2 （P50370） Photosystem II reaction center W protein, chloroplastic × 2 （Q9SPI9） Chloroplast photosystem II subunit X × 2 （A8I846） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （P92276） FE (II) ION × 2 CHLOROPHYLL A × 70 PHEOPHYTIN A × 4 BETA-CAROTENE × 20 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 10 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 14 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 2 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 6 DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 2 BICARBONATE ION × 2 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 2 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBC_CHLRE
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–450； UniProt 12–461 作者链 c； PDB构建体 1–450； UniProt 12–461

Photosystem II D2 protein

物种未注明

UniProt P06007

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 34	Photosystem II protein D1 × 2 （P07753） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （P37255） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P10898） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P48268） Cytochrome b559 subunit beta × 2 （Q08363） PDZ domain-containing protein × 2 （A0A2K3E6S5） Photosystem II reaction center protein H × 2 （P22666） Photosystem II reaction center protein I × 2 （P59763） Photosystem II reaction center protein K × 2 （P18263） Photosystem II reaction center protein L × 2 （P32974） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P92277） Photosystem II reaction center protein T × 2 （P37256） Photosystem II reaction center protein Psb30 × 2 （P50370） Photosystem II reaction center W protein, chloroplastic × 2 （Q9SPI9） Chloroplast photosystem II subunit X × 2 （A8I846） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （P92276） FE (II) ION × 2 CHLOROPHYLL A × 70 PHEOPHYTIN A × 4 BETA-CAROTENE × 20 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 10 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 14 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 2 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 6 DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 2 BICARBONATE ION × 2 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 2 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBD_CHLRE
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–351； UniProt 2–352 作者链 d； PDB构建体 1–351； UniProt 2–352

Cytochrome b559 subunit alpha

物种未注明

UniProt P48268

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 34	Photosystem II protein D1 × 2 （P07753） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （P37255） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P10898） Photosystem II D2 protein × 2 （P06007） Cytochrome b559 subunit beta × 2 （Q08363） PDZ domain-containing protein × 2 （A0A2K3E6S5） Photosystem II reaction center protein H × 2 （P22666） Photosystem II reaction center protein I × 2 （P59763） Photosystem II reaction center protein K × 2 （P18263） Photosystem II reaction center protein L × 2 （P32974） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P92277） Photosystem II reaction center protein T × 2 （P37256） Photosystem II reaction center protein Psb30 × 2 （P50370） Photosystem II reaction center W protein, chloroplastic × 2 （Q9SPI9） Chloroplast photosystem II subunit X × 2 （A8I846） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （P92276） FE (II) ION × 2 CHLOROPHYLL A × 70 PHEOPHYTIN A × 4 BETA-CAROTENE × 20 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 10 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 14 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 2 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 6 DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 2 BICARBONATE ION × 2 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 2 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBE_CHLRE
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–75； UniProt 8–82 作者链 e； PDB构建体 1–75； UniProt 8–82

Cytochrome b559 subunit beta

物种未注明

UniProt Q08363

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 34	Photosystem II protein D1 × 2 （P07753） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （P37255） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P10898） Photosystem II D2 protein × 2 （P06007） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P48268） PDZ domain-containing protein × 2 （A0A2K3E6S5） Photosystem II reaction center protein H × 2 （P22666） Photosystem II reaction center protein I × 2 （P59763） Photosystem II reaction center protein K × 2 （P18263） Photosystem II reaction center protein L × 2 （P32974） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P92277） Photosystem II reaction center protein T × 2 （P37256） Photosystem II reaction center protein Psb30 × 2 （P50370） Photosystem II reaction center W protein, chloroplastic × 2 （Q9SPI9） Chloroplast photosystem II subunit X × 2 （A8I846） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （P92276） FE (II) ION × 2 CHLOROPHYLL A × 70 PHEOPHYTIN A × 4 BETA-CAROTENE × 20 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 10 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 14 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 2 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 6 DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 2 BICARBONATE ION × 2 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 2 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBF_CHLRE
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–31； UniProt 14–44 作者链 f； PDB构建体 1–31； UniProt 14–44

PDZ domain-containing protein

Chlamydomonas reinhardtii

UniProt A0A2K3E6S5

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 34	Photosystem II protein D1 × 2 （P07753） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （P37255） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P10898） Photosystem II D2 protein × 2 （P06007） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P48268） Cytochrome b559 subunit beta × 2 （Q08363） Photosystem II reaction center protein H × 2 （P22666） Photosystem II reaction center protein I × 2 （P59763） Photosystem II reaction center protein K × 2 （P18263） Photosystem II reaction center protein L × 2 （P32974） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P92277） Photosystem II reaction center protein T × 2 （P37256） Photosystem II reaction center protein Psb30 × 2 （P50370） Photosystem II reaction center W protein, chloroplastic × 2 （Q9SPI9） Chloroplast photosystem II subunit X × 2 （A8I846） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （P92276） FE (II) ION × 2 CHLOROPHYLL A × 70 PHEOPHYTIN A × 4 BETA-CAROTENE × 20 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 10 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 14 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 2 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 6 DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 2 BICARBONATE ION × 2 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 2 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A2K3E6S5_CHLRE
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–240； UniProt 86–325 作者链 g； PDB构建体 1–240； UniProt 86–325

Photosystem II reaction center protein H

物种未注明

UniProt P22666

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 34	Photosystem II protein D1 × 2 （P07753） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （P37255） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P10898） Photosystem II D2 protein × 2 （P06007） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P48268） Cytochrome b559 subunit beta × 2 （Q08363） PDZ domain-containing protein × 2 （A0A2K3E6S5） Photosystem II reaction center protein I × 2 （P59763） Photosystem II reaction center protein K × 2 （P18263） Photosystem II reaction center protein L × 2 （P32974） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P92277） Photosystem II reaction center protein T × 2 （P37256） Photosystem II reaction center protein Psb30 × 2 （P50370） Photosystem II reaction center W protein, chloroplastic × 2 （Q9SPI9） Chloroplast photosystem II subunit X × 2 （A8I846） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （P92276） FE (II) ION × 2 CHLOROPHYLL A × 70 PHEOPHYTIN A × 4 BETA-CAROTENE × 20 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 10 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 14 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 2 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 6 DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 2 BICARBONATE ION × 2 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 2 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PSBH_CHLRE
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 1–69； UniProt 17–85 作者链 h； PDB构建体 1–69； UniProt 17–85

Photosystem II reaction center protein I

物种未注明

UniProt P59763

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 34	Photosystem II protein D1 × 2 （P07753） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （P37255） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P10898） Photosystem II D2 protein × 2 （P06007） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P48268） Cytochrome b559 subunit beta × 2 （Q08363） PDZ domain-containing protein × 2 （A0A2K3E6S5） Photosystem II reaction center protein H × 2 （P22666） Photosystem II reaction center protein K × 2 （P18263） Photosystem II reaction center protein L × 2 （P32974） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P92277） Photosystem II reaction center protein T × 2 （P37256） Photosystem II reaction center protein Psb30 × 2 （P50370） Photosystem II reaction center W protein, chloroplastic × 2 （Q9SPI9） Chloroplast photosystem II subunit X × 2 （A8I846） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （P92276） FE (II) ION × 2 CHLOROPHYLL A × 70 PHEOPHYTIN A × 4 BETA-CAROTENE × 20 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 10 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 14 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 2 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 6 DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 2 BICARBONATE ION × 2 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 2 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PSBI_CHLRE
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 1–34； UniProt 1–34 作者链 i； PDB构建体 1–34； UniProt 1–34

Photosystem II reaction center protein K

物种未注明

UniProt P18263

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 34	Photosystem II protein D1 × 2 （P07753） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （P37255） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P10898） Photosystem II D2 protein × 2 （P06007） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P48268） Cytochrome b559 subunit beta × 2 （Q08363） PDZ domain-containing protein × 2 （A0A2K3E6S5） Photosystem II reaction center protein H × 2 （P22666） Photosystem II reaction center protein I × 2 （P59763） Photosystem II reaction center protein L × 2 （P32974） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P92277） Photosystem II reaction center protein T × 2 （P37256） Photosystem II reaction center protein Psb30 × 2 （P50370） Photosystem II reaction center W protein, chloroplastic × 2 （Q9SPI9） Chloroplast photosystem II subunit X × 2 （A8I846） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （P92276） FE (II) ION × 2 CHLOROPHYLL A × 70 PHEOPHYTIN A × 4 BETA-CAROTENE × 20 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 10 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 14 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 2 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 6 DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 2 BICARBONATE ION × 2 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 2 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PSBK_CHLRE
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 K； PDB构建体 1–37； UniProt 10–46 作者链 k； PDB构建体 1–37； UniProt 10–46

Photosystem II reaction center protein L

物种未注明

UniProt P32974

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 34	Photosystem II protein D1 × 2 （P07753） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （P37255） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P10898） Photosystem II D2 protein × 2 （P06007） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P48268） Cytochrome b559 subunit beta × 2 （Q08363） PDZ domain-containing protein × 2 （A0A2K3E6S5） Photosystem II reaction center protein H × 2 （P22666） Photosystem II reaction center protein I × 2 （P59763） Photosystem II reaction center protein K × 2 （P18263） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P92277） Photosystem II reaction center protein T × 2 （P37256） Photosystem II reaction center protein Psb30 × 2 （P50370） Photosystem II reaction center W protein, chloroplastic × 2 （Q9SPI9） Chloroplast photosystem II subunit X × 2 （A8I846） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （P92276） FE (II) ION × 2 CHLOROPHYLL A × 70 PHEOPHYTIN A × 4 BETA-CAROTENE × 20 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 10 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 14 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 2 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 6 DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 2 BICARBONATE ION × 2 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 2 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBL_CHLRE
Isoform	—
PDB实体	11
链与序列区间	作者链 L； PDB构建体 1–38； UniProt 1–38 作者链 l； PDB构建体 1–38； UniProt 1–38

Photosystem II reaction center protein M

物种未注明

UniProt P92277

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 34	Photosystem II protein D1 × 2 （P07753） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （P37255） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P10898） Photosystem II D2 protein × 2 （P06007） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P48268） Cytochrome b559 subunit beta × 2 （Q08363） PDZ domain-containing protein × 2 （A0A2K3E6S5） Photosystem II reaction center protein H × 2 （P22666） Photosystem II reaction center protein I × 2 （P59763） Photosystem II reaction center protein K × 2 （P18263） Photosystem II reaction center protein L × 2 （P32974） Photosystem II reaction center protein T × 2 （P37256） Photosystem II reaction center protein Psb30 × 2 （P50370） Photosystem II reaction center W protein, chloroplastic × 2 （Q9SPI9） Chloroplast photosystem II subunit X × 2 （A8I846） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （P92276） FE (II) ION × 2 CHLOROPHYLL A × 70 PHEOPHYTIN A × 4 BETA-CAROTENE × 20 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 10 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 14 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 2 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 6 DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 2 BICARBONATE ION × 2 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 2 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBM_CHLRE
Isoform	—
PDB实体	12
链与序列区间	作者链 M； PDB构建体 1–27； UniProt 4–30 作者链 m； PDB构建体 1–27； UniProt 4–30

Photosystem II reaction center protein T

物种未注明

UniProt P37256

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 34	Photosystem II protein D1 × 2 （P07753） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （P37255） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P10898） Photosystem II D2 protein × 2 （P06007） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P48268） Cytochrome b559 subunit beta × 2 （Q08363） PDZ domain-containing protein × 2 （A0A2K3E6S5） Photosystem II reaction center protein H × 2 （P22666） Photosystem II reaction center protein I × 2 （P59763） Photosystem II reaction center protein K × 2 （P18263） Photosystem II reaction center protein L × 2 （P32974） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P92277） Photosystem II reaction center protein Psb30 × 2 （P50370） Photosystem II reaction center W protein, chloroplastic × 2 （Q9SPI9） Chloroplast photosystem II subunit X × 2 （A8I846） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （P92276） FE (II) ION × 2 CHLOROPHYLL A × 70 PHEOPHYTIN A × 4 BETA-CAROTENE × 20 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 10 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 14 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 2 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 6 DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 2 BICARBONATE ION × 2 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 2 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBT_CHLRE
Isoform	—
PDB实体	13
链与序列区间	作者链 T； PDB构建体 1–31； UniProt 1–31 作者链 t； PDB构建体 1–31； UniProt 1–31

Photosystem II reaction center protein Psb30

物种未注明

UniProt P50370

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 34	Photosystem II protein D1 × 2 （P07753） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （P37255） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P10898） Photosystem II D2 protein × 2 （P06007） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P48268） Cytochrome b559 subunit beta × 2 （Q08363） PDZ domain-containing protein × 2 （A0A2K3E6S5） Photosystem II reaction center protein H × 2 （P22666） Photosystem II reaction center protein I × 2 （P59763） Photosystem II reaction center protein K × 2 （P18263） Photosystem II reaction center protein L × 2 （P32974） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P92277） Photosystem II reaction center protein T × 2 （P37256） Photosystem II reaction center W protein, chloroplastic × 2 （Q9SPI9） Chloroplast photosystem II subunit X × 2 （A8I846） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （P92276） FE (II) ION × 2 CHLOROPHYLL A × 70 PHEOPHYTIN A × 4 BETA-CAROTENE × 20 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 10 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 14 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 2 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 6 DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 2 BICARBONATE ION × 2 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 2 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSB30_CHLRE
Isoform	—
PDB实体	14
链与序列区间	作者链 V； PDB构建体 1–31； UniProt 3–33 作者链 v； PDB构建体 1–31； UniProt 3–33

Photosystem II reaction center W protein, chloroplastic

物种未注明

UniProt Q9SPI9

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 34	Photosystem II protein D1 × 2 （P07753） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （P37255） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P10898） Photosystem II D2 protein × 2 （P06007） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P48268） Cytochrome b559 subunit beta × 2 （Q08363） PDZ domain-containing protein × 2 （A0A2K3E6S5） Photosystem II reaction center protein H × 2 （P22666） Photosystem II reaction center protein I × 2 （P59763） Photosystem II reaction center protein K × 2 （P18263） Photosystem II reaction center protein L × 2 （P32974） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P92277） Photosystem II reaction center protein T × 2 （P37256） Photosystem II reaction center protein Psb30 × 2 （P50370） Chloroplast photosystem II subunit X × 2 （A8I846） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （P92276） FE (II) ION × 2 CHLOROPHYLL A × 70 PHEOPHYTIN A × 4 BETA-CAROTENE × 20 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 10 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 14 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 2 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 6 DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 2 BICARBONATE ION × 2 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 2 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBW_CHLRE
Isoform	—
PDB实体	15
链与序列区间	作者链 W； PDB构建体 1–19； UniProt 79–97 作者链 w； PDB构建体 1–19； UniProt 79–97

Chloroplast photosystem II subunit X

物种未注明

UniProt A8I846

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 34	Photosystem II protein D1 × 2 （P07753） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （P37255） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P10898） Photosystem II D2 protein × 2 （P06007） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P48268） Cytochrome b559 subunit beta × 2 （Q08363） PDZ domain-containing protein × 2 （A0A2K3E6S5） Photosystem II reaction center protein H × 2 （P22666） Photosystem II reaction center protein I × 2 （P59763） Photosystem II reaction center protein K × 2 （P18263） Photosystem II reaction center protein L × 2 （P32974） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P92277） Photosystem II reaction center protein T × 2 （P37256） Photosystem II reaction center protein Psb30 × 2 （P50370） Photosystem II reaction center W protein, chloroplastic × 2 （Q9SPI9） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （P92276） FE (II) ION × 2 CHLOROPHYLL A × 70 PHEOPHYTIN A × 4 BETA-CAROTENE × 20 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 10 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 14 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 2 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 6 DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 2 BICARBONATE ION × 2 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 2 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A8I846_CHLRE
Isoform	—
PDB实体	16
链与序列区间	作者链 X； PDB构建体 1–32； UniProt 64–95 作者链 x； PDB构建体 1–32； UniProt 64–95

Photosystem II reaction center protein Z

物种未注明

UniProt P92276

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 34	Photosystem II protein D1 × 2 （P07753） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （P37255） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P10898） Photosystem II D2 protein × 2 （P06007） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P48268） Cytochrome b559 subunit beta × 2 （Q08363） PDZ domain-containing protein × 2 （A0A2K3E6S5） Photosystem II reaction center protein H × 2 （P22666） Photosystem II reaction center protein I × 2 （P59763） Photosystem II reaction center protein K × 2 （P18263） Photosystem II reaction center protein L × 2 （P32974） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P92277） Photosystem II reaction center protein T × 2 （P37256） Photosystem II reaction center protein Psb30 × 2 （P50370） Photosystem II reaction center W protein, chloroplastic × 2 （Q9SPI9） Chloroplast photosystem II subunit X × 2 （A8I846） FE (II) ION × 2 CHLOROPHYLL A × 70 PHEOPHYTIN A × 4 BETA-CAROTENE × 20 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 10 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 14 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 2 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 6 DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 2 BICARBONATE ION × 2 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; × 2 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBZ_CHLRE
Isoform	—
PDB实体	17
链与序列区间	作者链 Z； PDB构建体 1–61； UniProt 1–61 作者链 z； PDB构建体 1–61； UniProt 1–61

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9imn
沉积日期 deposition_date	2024-07-03
结构标题 title	Cryo-EM structure of a TEF30-associated intermediate PSII core dimer complex, type I, from Chlamydomonas reinhardtii
关键词 keywords	photosystem II, PSII repair, PSII assembly, PSII intermediate, TEF30, PHOTOSYNTHESIS; PHOTOSYNTHESIS
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9imn__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9imn__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

9imn__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	55.33 Å
Rg（电子密度）	54.48 Å
总 Rg	54.75 Å
原子数	42392
残基数	4462
排除体积	787540 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`9imn__assembly_1__model_1`	34-meric （34）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (29)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Photosystem II protein D1
分子量 formula_weight	36263.3 kDa
EC 编号 ec_number	1.10.3.9
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,a
原子数 atom_count	42392

NSSLWARFCEWITSTENRLYIGWFGVIMIPCLLTATSVFIIAFIAAPPVDIDGIREPVSGSLLYGNNIITGAVIPTSNAIGLHFYPIWEAASLDEWLYNGGPYQLIVCHFLLGVYCYMGREWELSFRLGMRPWIAVAYSAPVAAASAVFLVYPIGQGSFSDGMPLGISGTFNFMIVFQAEHNILMHPFHMLGVAGVFGGSLFSAMHGSLVTSSLIRETTENESANEGYRFGQEEETYNIVAAHGYFGRLIFQYASFNNSRSLHFFLAAWPVIGIWFTALGLSTMAFNLNGFNFNQSVVDSQGRVLNTWADIINRANLGMEVMHERNA

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Photosystem II CP47 reaction center protein
分子量 formula_weight	52938.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,b

GLPWYRVHTVVINDPGRLISVHLMHTALVSGWAGSMALFEISVFDPSDPVLNPMWRQGMFVLPFMTRLGITQSWGGWTISGETATNPGIWSYEGVAAAHIILSGALFLASVWHWTYWDLELFRDPRTGKTALDLPKIFGIHLFLSGLLCFGFGAFHVTGVFGPGIWVSDPYGLTGRVQPVAPSWGADGFDPYNPGGIASHHIAAGILGVLAGLFHLCVRPSIRLYFGLSMGSIETVLSSSIAAVFWAAFVVAGTMWYGSAATPIELFGPTRYQWDQGFFQQEIQKRVQASLAEGASLSDAWSRIPEKLAFYDYIGNNPAKGGLFRTGAMNSGDGIAVGWLGHASFKDQEGRELFVRRMPTFFETFPVLLLDKDGIVRADVPFRKAESKYSIEQVGVSVTFYGGELDGLTFTDPATVKKYARKAQLGEIFEFDRSTLQSDGVFRSSPRGWFTFGHVCFALLFFFGHIWHGARTIFRDVFAG

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Photosystem II CP43 reaction center protein
分子量 formula_weight	49473.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,c

GGRDQETTGFAWWSGNARLINLSGKLLGAHVAHAGLIVFWAGAMNLFEVSHFVPEKPMYEQGLILLPHIATLGYGVGPGGEIIDTFPYFVSGVLHLISSAVLGFGGVYHSLIGPETLEESYPFFGYVWKDKNKMTNILGYHLIMLGLGAWLLVWKAMYFGGVYDTWAPGGGDVRVITNPTTNAAVIFGYLVKSPFGGDGWICSVDNMEDIIGGHIWIGTLEILGGIWHIYTTPWPWARRAFVWSGEAYLSYSLGAIGVMGFIACCMSWFNNTAYPSEFYGPTGPEASQSQAFTFLVRDQRLGANVASAQGPTGLGKYLMRSPTGEIIFGGETMRFWDFRGPWLEPLRGPNGLDLNKLKNDIQPWQERRAAEYMTHAPLGSLNSVGGVATEINAVNFVSPRSWLACSHFCLGFFFFIGHLWHAGRARAAAAGFEKGIDRFDEPVLSMRPLD

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Photosystem II D2 protein
分子量 formula_weight	39342.8 kDa
EC 编号 ec_number	1.10.3.9
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D,d

TIAIGTYQEKRTWFDDADDWLRQDRFVFVGWSGLLLFPCAYFALGGWLTGTTFVTSWYTHGLATSYLEGCNFLTAAVSTPANSMAHSLLFVWGPEAQGDFTRWCQLGGLWAFVALHGAFGLIGFMLRQFEIARSVNLRPYNAIAFSAPIAVFVSVFLIYPLGQSGWFFAPSFGVAAIFRFILFFQGFHNWTLNPFHMMGVAGVLGAALLCAIHGATVENTLFEDGDGANTFRAFNPTQAEETYSMVTANRFWSQIFGVAFSNKRWLHFFMLLVPVTGLWMSAIGVVGLALNLRAYDFVSQEIRAAEDPEFETFYTKNILLNEGIRAWMAAQDQPHERLVFPEEVLPRGNAL

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Cytochrome b559 subunit alpha
分子量 formula_weight	8598.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,e

RPFSDILTSIRYWVIHSITVPALFIAGWLFVSTGLAYDVFGTPRPNEYFTEDRQEAPLITDRFNALEQVKKLSGN

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Cytochrome b559 subunit beta
分子量 formula_weight	3535.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F,f

IFTVRWLAIHGIAVPTIFFLGAITAMQFIQR

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	PDZ domain-containing protein
分子量 formula_weight	27116.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G,g

ARGNDGGAYIIEVNPKAGNIDARVQPGDKIVEISASFGSEVWKAENFGQIMYAIRTRSGTVYMKLKKNYGDLSALEEEGLDAAEKQWKKERAGGNYGAGTKEIQARNYVQRKENERKRREMFDDALAKFKENDIQGALVEFENIIAMEPRNFVGDNFSRNTPIYKVTQYNIACCYSMLDQVEEAIKSLDAAMLSGFDNYDQIRRDKNLSKARANPKFQAVLDKYDEPVVNWNAVKATFGA

来源 Source

来源生物 organism	Chlamydomonas reinhardtii
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	3055
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	Photosystem II reaction center protein H
分子量 formula_weight	7522.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H,h

FQEPGLVTPLGTLLRPLNSEAGKVLPGWGTTVLMAVFILLFAAFLLIILEIYNSSLILDDVSMSWETLA

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	Photosystem II reaction center protein I
分子量 formula_weight	3902.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I,i

MLTLKIFVYTVVTFFVCLFIFGFLSNDPARNPGK

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	Photosystem II reaction center protein K
分子量 formula_weight	4148.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K,k

KLPEAYAPFAPIVDVLPVIPVFFILLAFVWQAAVSFR

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	Photosystem II reaction center protein L
分子量 formula_weight	4431.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L,l

MARPNPNKQVVELNRTSLYWGLLLIFVLAVLFSSYIFN

实体 12 Entity 12 polymer

描述 description	Photosystem II reaction center protein M
分子量 formula_weight	2971.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	M,m

NIYGLTATALFIIIPTSFLLILYVKTA

实体 13 Entity 13 polymer

描述 description	Photosystem II reaction center protein T
分子量 formula_weight	3639.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	T,t

MEALVYTFLLVGTLGIIFFSIFFRDPPRMIK

实体 14 Entity 14 polymer

描述 description	Photosystem II reaction center protein Psb30
分子量 formula_weight	3087.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	V,v

IELALTLVSLVLVVSAGPLVVVLLSARGGNL

实体 15 Entity 15 polymer

描述 description	Photosystem II reaction center W protein, chloroplastic
分子量 formula_weight	2192.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	W,w

PVLGWVLLGVFGTMWAIWF

实体 16 Entity 16 polymer

描述 description	Chloroplast photosystem II subunit X
分子量 formula_weight	3056.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	X,x

AVTPSLKNFLGSLIAGATVLGGIALAITAVSK

实体 17 Entity 17 polymer

描述 description	Photosystem II reaction center protein Z
分子量 formula_weight	6466.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Z,z

MTSILQVALLALIFVSFALVVGVPVVFATPNGWTDNKGAVFSGLSLWLLLVFVVGILNSFV

实体 18 Entity 18 non-polymer

描述 description	FE (II) ION
分子量 formula_weight	55.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 19 Entity 19 non-polymer

描述 description	CHLOROPHYLL A
分子量 formula_weight	893.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	70

实体 20 Entity 20 non-polymer

描述 description	PHEOPHYTIN A
分子量 formula_weight	871.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 21 Entity 21 non-polymer

描述 description	BETA-CAROTENE
分子量 formula_weight	536.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	20

实体 22 Entity 22 non-polymer

描述 description	1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE
分子量 formula_weight	787.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	10

实体 23 Entity 23 non-polymer

描述 description	1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE
分子量 formula_weight	723.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	14

实体 24 Entity 24 non-polymer

描述 description	1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL
分子量 formula_weight	795.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 25 Entity 25 non-polymer

描述 description	DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG)
分子量 formula_weight	949.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

实体 26 Entity 26 non-polymer

描述 description	DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE
分子量 formula_weight	510.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 27 Entity 27 non-polymer

描述 description	BICARBONATE ION
分子量 formula_weight	61.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 28 Entity 28 non-polymer

描述 description	;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ;
分子量 formula_weight	749.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 29 Entity 29 non-polymer

描述 description	PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE
分子量 formula_weight	616.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.97 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	61267

Cryo-EM structure of a TEF30-associated intermediate PSII core dimer complex, type I, from Chlamydomonas reinhardtii

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Photosystem II protein D1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem II CP47 reaction center protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem II CP43 reaction center protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem II D2 protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Cytochrome b559 subunit alpha

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Cytochrome b559 subunit beta

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

PDZ domain-containing protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem II reaction center protein H

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem II reaction center protein I

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem II reaction center protein K

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体