Amyloid-beta precursor protein
物种未注明
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白拷贝数一致 | 链 A； UniProt 672–713 链 AA； UniProt 672–713 链 B； UniProt 672–713 链 BB； UniProt 672–713 链 C； UniProt 672–713 链 CC； UniProt 672–713 链 D； UniProt 672–713 链 DD； UniProt 672–713 链 E； UniProt 672–713 链 EE； UniProt 672–713 链 F； UniProt 672–713 链 FF； UniProt 672–713 | 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 无其他共同聚合物 | ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE | 分辨率 3.00 Å |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 9JAZ | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11EN Structure of Rapidly twisting Amyloid-beta 40 fibril , RT-Ab40(2_1) 提交 2026-02-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
672–711（40 aa）
链 B
672–711（40 aa）
链 C
672–711（40 aa）
链 D
672–711（40 aa）
链 E
672–711（40 aa）
链 F
672–711（40 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.50 Å |
| 11EO Structure of Rapidly twisting Amyloid-beta 40 fibril , RT-Ab40(C2) 提交 2026-02-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
672–711（40 aa）
链 B
672–711（40 aa）
链 C
672–711（40 aa）
链 D
672–711（40 aa）
链 E
672–711（40 aa）
链 F
672–711（40 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.73 Å |
| 11EP Structure of Rapidly twisting Amyloid-beta 40 fibril , RT-Ab40(C1) 提交 2026-02-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
672–711（40 aa）
链 B
672–711（40 aa）
链 C
672–711（40 aa）
链 D
672–711（40 aa）
链 E
672–711（40 aa）
链 F
672–711（40 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.75 Å |
| 12GB High Resolution Structure of Monomorphic AB1-40 Fibrils 提交 2026-04-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 20 PDB 声明：20-meric |
链 A
672–711（40 aa）
链 B
672–711（40 aa）
链 C
672–711（40 aa）
链 D
672–711（40 aa）
链 E
672–711（40 aa）
链 F
672–711（40 aa）
链 G
672–711（40 aa）
链 H
672–711（40 aa）
链 I
672–711（40 aa）
链 J
672–711（40 aa）
链 K
672–711（40 aa）
链 L
672–711（40 aa）
链 M
672–711（40 aa）
链 N
672–711（40 aa）
链 O
672–711（40 aa）
链 P
672–711（40 aa）
链 Q
672–711（40 aa）
链 R
672–711（40 aa）
链 S
672–711（40 aa）
链 T
672–711（40 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLID-STATE NMR
NMR测量条件
pH 7.4；277 K；离子强度（mmCIF原始值）20；压力 1
NMR样品组成
350 uM [U-13C; U-15N] Amyloid-beta 1-40 fibrils, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
|
分辨率未提供 |
| 1AAP X-RAY CRYSTAL STRUCTURE OF THE PROTEASE INHIBITOR DOMAIN OF ALZHEIMER'S AMYLOID BETA-PROTEIN PRECURSOR 提交 1990-09-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
287–344（58 aa）
片段：INHIBITOR DOMAIN
链 B
287–344（58 aa）
片段：INHIBITOR DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.50 Å |
| 1AMB SOLUTION STRUCTURE OF RESIDUES 1-28 OF THE AMYLOID BETA-PEPTIDE 提交 1994-10-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
672–699（28 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率未提供 |
| 1AMC SOLUTION STRUCTURE OF RESIDUES 1-28 OF THE AMYLOID BETA-PEPTIDE 提交 1994-11-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
672–699（28 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率未提供 |
| 1AML THE ALZHEIMER`S DISEASE AMYLOID A4 PEPTIDE (RESIDUES 1-40) 提交 1995-02-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
672–711（40 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率未提供 |
| 1BA4 THE SOLUTION STRUCTURE OF AMYLOID BETA-PEPTIDE (1-40) IN A WATER-MICELLE ENVIRONMENT. IS THE MEMBRANE-SPANNING DOMAIN WHERE WE THINK IT IS? NMR, 10 STRUCTURES 提交 1998-04-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
672–711（40 aa）
片段：ABETA
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 5.1；298 K
|
分辨率未提供 |
| 1BA6 SOLUTION STRUCTURE OF THE METHIONINE-OXIDIZED AMYLOID BETA-PEPTIDE (1-40). DOES OXIDATION AFFECT CONFORMATIONAL SWITCHING? NMR, 10 STRUCTURES 提交 1998-04-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
672–711（40 aa）
片段：ABETA
|
突变：INS(MO) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 5.3；298 K
|
分辨率未提供 |
| 1BJB SOLUTION NMR STRUCTURE OF AMYLOID BETA[E16], RESIDUES 1-28, 14 STRUCTURES 提交 1998-06-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
672–699（28 aa）
片段：ABETA [F16], RESIDUES 1-28
|
突变：K16E | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 5.6；296 K；压力 1
NMR样品组成
SDS MICELLES (100MM)/D2O, H2O
|
分辨率未提供 |
| 1BJC SOLUTION NMR STRUCTURE OF AMYLOID BETA[F16], RESIDUES 1-28, 15 STRUCTURES 提交 1998-06-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
672–699（28 aa）
片段：ABETA [F16], RESIDUES 1-28
|
突变：K16F | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 5.8；296 K；压力 1
NMR样品组成
SDS MICELLES (100MM)/D2O, H2O
|
分辨率未提供 |
| 1BRC RELOCATING A NEGATIVE CHARGE IN THE BINDING POCKET OF TRYPSIN 提交 1992-12-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 I
287–342（56 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.50 Å |
| 1CA0 BOVINE CHYMOTRYPSIN COMPLEXED TO APPI 提交 1997-01-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 D
289–342（54 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4.5；pH 4.5
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.323 |
| 1CA0 BOVINE CHYMOTRYPSIN COMPLEXED TO APPI 提交 1997-01-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 I
289–342（54 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 4.5；pH 4.5
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.323 |
| 1HZ3 ALZHEIMER'S DISEASE AMYLOID-BETA PEPTIDE (RESIDUES 10-35) 提交 2001-01-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
681–706（26 aa）
片段：RESIDUES 10-35
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 5.6；283 K；离子强度（mmCIF原始值）<1mM；压力 ambient
NMR样品组成
300uM A-Beta(10-35); 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
300uM A-Beta(1-40) U-15N; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
300 uM A-Beta(10-35) 2H-Val12, -Leu17, -Val18, -Phe19, -Ile32 and -Leu34; 15N-Phe19, -Val24, -Gly25 and -Gly29; 13C-Val24; 13C-Ala21 Beta Methyl; 13C-Ala30 Beta Methyl; 13C-Met35 Delta Methyl | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
300 uM A-Beta(10-35) 2H-Val12, -Leu17, -Phe19, -Val24, -Ile31 and -Leu34; 15N-Val 18, -Phe20, -Gly25, -Gly29 and -Gly33; 13C-Val24; 13C-Ala21 Beta Methyl; 13C-Ala30 Beta Methyl; 13C-Met35 Delta Methyl | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 1IYT Solution structure of the Alzheimer's disease amyloid beta-peptide (1-42) 提交 2002-09-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
672–713（42 aa）
片段：beta-peptide
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
300 K；压力 ambient
NMR样品组成
2mM amyloid beta-peptide (TFA pretreated); 20% H2O, 80% hexafluoroisopropanol-d2 | 20% H2O, 80% hexafluoroisopropanol-d2 (v/v)
NMR样品组成
2.5mM amyloid beta-peptide (TFA pretreated); 20% D2O, 80% hexafluoroisopropanol-d2 | 20% D2O, 80% hexafluoroisopropanol-d2 (v/v)
|
分辨率未提供 |
| 1MWP N-TERMINAL DOMAIN OF THE AMYLOID PRECURSOR PROTEIN 提交 1999-03-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
28–123（96 aa）
片段：HEPARIN BINDING DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5；pH 7.5
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.242 |
| 1OWT Structure of the Alzheimer's disease amyloid precursor protein copper binding domain 提交 2003-03-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
124–189（66 aa）
片段：Copper binding domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.9；303 K；离子强度（mmCIF原始值）0.3；压力 1
NMR样品组成
0.5mM CuBD U-15N,13C; 20mM phosphate buffer | 90% H2O, 10% D20
|
分辨率未提供 |
| 1QCM AMYLOID BETA PEPTIDE (25-35), NMR, 20 STRUCTURES 提交 1996-07-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–706（11 aa）
片段：RESIDUES 25 - 35
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率未提供 |
| 1QWP NMR analysis of 25-35 fragment of beta amyloid peptide 提交 2003-09-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–706（11 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 4.5；300 K；压力 ambient
NMR样品组成
2mM abeta(25-35) peptide | hexafluoroisopropanol/water mixture 80/20 v:v
|
分辨率未提供 |
| 1QXC NMR structure of the fragment 25-35 of beta amyloid peptide in 20/80 v:v hexafluoroisopropanol/water mixture 提交 2003-09-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–706（11 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 4.5；300 K；压力 ambient
NMR样品组成
2mM abeta(25-35) peptide | hexafluoroisopropanol/water 20/80 v:v mixture
|
分辨率未提供 |
| 1QYT Solution structure of fragment (25-35) of beta amyloid peptide in SDS micellar solution 提交 2003-09-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
696–706（11 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 4.15；300 K；压力 ambient
NMR样品组成
2mM abeta(25-35) peptide | 100mM SDS solution
|
分辨率未提供 |
| 1TAW BOVINE TRYPSIN COMPLEXED TO APPI 提交 1996-12-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 B
287–344（58 aa）
片段：;RESIDUES 289 - 342 OF ALZHEIMER'S AMYLOID BETA-PROTEIN PRECURSOR
;
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6.5；pH 6.5
|
分辨率 1.80 Å |
| 1TKN Solution structure of CAPPD*, an independently folded extracellular domain of human Amyloid-beta Precursor Protein 提交 2004-06-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
460–569（110 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.4；300 K；离子强度（mmCIF原始值）250 mM NaCl, 300 mM guanidinium chloride；压力 1
NMR样品组成
0.85 mM U-15N CAPPD*, 50mM sodium phosphate, 250 mM NaCl, 300 mM guanidinium chloride | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
0.85 mM U-15N,13C CAPPD*, 50mM sodium phosphate, 250 mM NaCl, 300 mM guanidinium chloride | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
0.8 mM 10% 13C CAPPD*, 50mM sodium phosphate, 250 mM NaCl, 300 mM guanidinium chloride | 95% H2O/5% D2O
|
分辨率未提供 |
| 1X11 X11 PTB DOMAIN 提交 1997-07-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 C
754–766（13 aa）
链 D
754–766（13 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5；pH 7.5
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.304 |
| 1X11 X11 PTB DOMAIN 提交 1997-07-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 C
754–766（13 aa）
链 D
754–766（13 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5；pH 7.5
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.304 |
| 1X11 X11 PTB DOMAIN 提交 1997-07-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 C
754–766（13 aa）
链 D
754–766（13 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5；pH 7.5
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.304 |
| 1Z0Q Aqueous Solution Structure of the Alzheimer's Disease Abeta Peptide (1-42) 提交 2005-03-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
672–713（42 aa）
片段：Beta-peptide
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
300 K；压力 ambient
NMR样品组成
2mM beta peptide (TFA pretreated); 70% H2O, 30% hexafluoroisopropanol-d2 | 70% H2O, 30% hexafluoroisopropanol-d2
|
分辨率未提供 |
| 1ZE7 Zinc-binding domain of Alzheimer's disease amyloid beta-peptide in water solution at pH 6.5 提交 2005-04-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
672–687（16 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.5；278 K；离子强度（mmCIF原始值）0.1；压力 ambient
NMR样品组成
2.8mM in 50mM sodium phosphate buffer | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 1ZE9 Zinc-binding domain of Alzheimer's disease amyloid beta-peptide complexed with a zinc (II) cation 提交 2005-04-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
672–687（16 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ZN ZINC ION × 1 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.5；278 K；离子强度（mmCIF原始值）0.1；压力 ambient
NMR样品组成
2.8mM in 50mM sodium phosphate buffer | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 1ZJD Crystal Structure of the Catalytic Domain of Coagulation Factor XI in Complex with Kunitz Protease Inhibitor Domain of Protease Nexin II 提交 2005-04-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
289–345（57 aa）
片段：Inhibitory Domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；283 K；Sodium Formate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 283K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.255 |
| 21FB Structure of minor species of Abeta fibrils from AppNL-FPsen1P117L mice 提交 2025-12-10 | 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric |
链 A
672–713（42 aa）
链 B
672–713（42 aa）
链 C
672–713（42 aa）
链 D
672–713（42 aa）
链 E
672–713（42 aa）
链 F
672–713（42 aa）
链 G
672–713（42 aa）
链 H
672–713（42 aa）
链 I
672–713（42 aa）
链 J
672–713（42 aa）
链 K
672–713（42 aa）
链 L
672–713（42 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 2BEG 3D Structure of Alzheimer's Abeta(1-42) fibrils 提交 2005-10-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 A
672–713（42 aa）
片段：Beta-amyloid protein 42
链 B
672–713（42 aa）
片段：Beta-amyloid protein 42
链 C
672–713（42 aa）
片段：Beta-amyloid protein 42
链 D
672–713（42 aa）
片段：Beta-amyloid protein 42
链 E
672–713（42 aa）
片段：Beta-amyloid protein 42
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率未提供 |
| 2BP4 Zinc-binding domain of Alzheimer's disease amyloid beta-peptide in TFE-water (80-20) solution 提交 2005-04-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
672–687（16 aa）
片段：;16-MER FRAGMENT BETWEEN THE BETA AND ALPHA SECRETASES CLEAVAGE SITES OF ALZHEIMER'S DISEASE AMYLOID A4 PROTEIN, RESIDUES 672-687
;
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 3；298 K；压力 1.0
NMR样品组成
80 % TFE-D2OH / 20 % H2O
|
分辨率未提供 |
| 2FJZ Structure of the Alzheimer's Amyloid Precursor Protein (APP) copper binding domain (residues 133 to 189) in 'small unit cell' form, metal-free 提交 2006-01-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
133–189（57 aa）
片段：Residues 133 to 189
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；295 K；28 - 32 % (w/v) PEG 10000, 0.1 M HEPES pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.61 Å R-free 0.209 |
| 2FK1 Structure of the Alzheimer's Amyloid Precursor Protein (APP) Copper Binding Domain in 'small unit cell' form, Cu(II)-bound 提交 2006-01-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
133–189（57 aa）
片段：Residues 133 to 189
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；295 K；0.1 M HEPES pH 8.0, 28 - 32 % (w/v) PEG 10000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.232 |
| 2FK2 Structure of the Alzheimer's Amyloid Precursor Protein (APP) Copper Binding Domain in 'small unit cell' form, Cu(I)-bound 提交 2006-01-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
133–189（57 aa）
片段：Residues 133 to 189
|
未记录 | CU1 COPPER (I) ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；295 K；0.1 M HEPES pH 8.0, 28 - 32 % (w/v) PEG 10000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.249 |
| 2FK3 Structure of the Alzheimer's Amyloid Precursor Protein (APP) Copper Binding Domain in 'large unit cell' form 提交 2006-01-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
133–189（57 aa）
片段：Residues 133 to 189
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；295 K；0.1 M MES pH 5.4 - 5.6, 0.4 M NaCOOH, 10 - 15 % (w/v) PEG 4000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.248 |
| 2FK3 Structure of the Alzheimer's Amyloid Precursor Protein (APP) Copper Binding Domain in 'large unit cell' form 提交 2006-01-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
133–189（57 aa）
片段：Residues 133 to 189
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；295 K；0.1 M MES pH 5.4 - 5.6, 0.4 M NaCOOH, 10 - 15 % (w/v) PEG 4000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.248 |
| 2FK3 Structure of the Alzheimer's Amyloid Precursor Protein (APP) Copper Binding Domain in 'large unit cell' form 提交 2006-01-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 C
133–189（57 aa）
片段：Residues 133 to 189
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；295 K；0.1 M MES pH 5.4 - 5.6, 0.4 M NaCOOH, 10 - 15 % (w/v) PEG 4000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.248 |
| 2FK3 Structure of the Alzheimer's Amyloid Precursor Protein (APP) Copper Binding Domain in 'large unit cell' form 提交 2006-01-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 D
133–189（57 aa）
片段：Residues 133 to 189
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；295 K；0.1 M MES pH 5.4 - 5.6, 0.4 M NaCOOH, 10 - 15 % (w/v) PEG 4000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.248 |
| 2FK3 Structure of the Alzheimer's Amyloid Precursor Protein (APP) Copper Binding Domain in 'large unit cell' form 提交 2006-01-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 E
133–189（57 aa）
片段：Residues 133 to 189
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；295 K；0.1 M MES pH 5.4 - 5.6, 0.4 M NaCOOH, 10 - 15 % (w/v) PEG 4000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.248 |
| 2FK3 Structure of the Alzheimer's Amyloid Precursor Protein (APP) Copper Binding Domain in 'large unit cell' form 提交 2006-01-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 F
133–189（57 aa）
片段：Residues 133 to 189
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；295 K；0.1 M MES pH 5.4 - 5.6, 0.4 M NaCOOH, 10 - 15 % (w/v) PEG 4000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.248 |
| 2FK3 Structure of the Alzheimer's Amyloid Precursor Protein (APP) Copper Binding Domain in 'large unit cell' form 提交 2006-01-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 7 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 G
133–189（57 aa）
片段：Residues 133 to 189
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；295 K；0.1 M MES pH 5.4 - 5.6, 0.4 M NaCOOH, 10 - 15 % (w/v) PEG 4000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.248 |
| 2FK3 Structure of the Alzheimer's Amyloid Precursor Protein (APP) Copper Binding Domain in 'large unit cell' form 提交 2006-01-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 8 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 H
133–189（57 aa）
片段：Residues 133 to 189
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；295 K；0.1 M MES pH 5.4 - 5.6, 0.4 M NaCOOH, 10 - 15 % (w/v) PEG 4000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.248 |
| 2FKL Structure of the Alzheimer's Amyloid Precursor Protein (APP) Copper Binding Domain (Residues 126- 189 of APP) 提交 2006-01-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
124–189（66 aa）
片段：Residues 124 to 189
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.05；295 K；1.5 M (NH4)H2PO4, pH 4.05, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.263 |
| 2FKL Structure of the Alzheimer's Amyloid Precursor Protein (APP) Copper Binding Domain (Residues 126- 189 of APP) 提交 2006-01-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
124–189（66 aa）
片段：Residues 124 to 189
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.05；295 K；1.5 M (NH4)H2PO4, pH 4.05, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.263 |
| 2FMA Structure of the Alzheimer's Amyloid Precursor Protein (APP) Copper Binding Domain in 'small unit cell' form, atomic resolution 提交 2006-01-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
133–189（57 aa）
片段：Copper Binding Domain(residues 133-189)
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；295 K；0.1M HEPES pH 8.0, 28-32% (w/v) PEG 10000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 0.85 Å R-free 0.150 |
| 2LFM A partially folded structure of amyloid-beta(1 40) in an aqueous environment 提交 2011-07-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
672–711（40 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7.3；15 K；离子强度（mmCIF原始值）0.07；压力 ambient
NMR样品组成
20 mM potassium phosphate, 50 mM sodium chloride, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2LLM Structure of amyloid precursor protein's transmembrane domain 提交 2011-11-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
686–726（41 aa）
片段：UNP residues 686-726
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 4.6；318 K；离子强度（mmCIF原始值）20；压力 ambient
NMR样品组成
0.3-1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] APPjmtm, 21-70 mM [U-100% 2H] DPC, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
0.3-1 mM [U-100% 15N] APPjmtm, 21-70 mM DPC, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2LMN Structural Model for a 40-Residue Beta-Amyloid Fibril with Two-Fold Symmetry, Positive Stagger 提交 2011-12-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric |
链 A
672–711（40 aa）
链 B
672–711（40 aa）
链 C
672–711（40 aa）
链 D
672–711（40 aa）
链 E
672–711（40 aa）
链 F
672–711（40 aa）
链 G
672–711（40 aa）
链 H
672–711（40 aa）
链 I
672–711（40 aa）
链 J
672–711（40 aa）
链 K
672–711（40 aa）
链 L
672–711（40 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLID-STATE NMR
NMR测量条件
pH 7.4；300 K；离子强度（mmCIF原始值）10；压力 ambient
NMR样品组成
selective 13C and 15N beta-amyloid, 10 mM phosphate buffer | 10 mM phosphate buffer
|
分辨率未提供 |
| 2LMO Structural Model for a 40-Residue Beta-Amyloid Fibril with Two-Fold Symmetry, Negative Stagger 提交 2011-12-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric |
链 A
672–711（40 aa）
链 B
672–711（40 aa）
链 C
672–711（40 aa）
链 D
672–711（40 aa）
链 E
672–711（40 aa）
链 F
672–711（40 aa）
链 G
672–711（40 aa）
链 H
672–711（40 aa）
链 I
672–711（40 aa）
链 J
672–711（40 aa）
链 K
672–711（40 aa）
链 L
672–711（40 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLID-STATE NMR
NMR测量条件
pH 7.4；300 K；离子强度（mmCIF原始值）10；压力 ambient
NMR样品组成
selective 13C and 15N beta-amyloid, 10 mM phosphate buffer | 10 mM phosphate buffer
|
分辨率未提供 |
| 2LMP Structural Model for a 40-residue Beta-Amyloid Fibril with Three-Fold Symmetry, Positive Stagger 提交 2011-12-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric |
链 A
672–711（40 aa）
链 B
672–711（40 aa）
链 C
672–711（40 aa）
链 D
672–711（40 aa）
链 E
672–711（40 aa）
链 F
672–711（40 aa）
链 G
672–711（40 aa）
链 H
672–711（40 aa）
链 I
672–711（40 aa）
链 J
672–711（40 aa）
链 K
672–711（40 aa）
链 L
672–711（40 aa）
链 M
672–711（40 aa）
链 N
672–711（40 aa）
链 O
672–711（40 aa）
链 P
672–711（40 aa）
链 Q
672–711（40 aa）
链 R
672–711（40 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLID-STATE NMR
NMR测量条件
pH 7.4；300 K；离子强度（mmCIF原始值）10；压力 ambient
NMR样品组成
selective 13C and 15N beta-amyloid, 10 mM phosphate buffer | 10 mM phosphate buffer
|
分辨率未提供 |
| 2LMQ Structural Model for a 40-residue Beta-Amyloid Fibril with Three-Fold Symmetry, Negative Stagger 提交 2011-12-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric |
链 A
672–711（40 aa）
链 B
672–711（40 aa）
链 C
672–711（40 aa）
链 D
672–711（40 aa）
链 E
672–711（40 aa）
链 F
672–711（40 aa）
链 G
672–711（40 aa）
链 H
672–711（40 aa）
链 I
672–711（40 aa）
链 J
672–711（40 aa）
链 K
672–711（40 aa）
链 L
672–711（40 aa）
链 M
672–711（40 aa）
链 N
672–711（40 aa）
链 O
672–711（40 aa）
链 P
672–711（40 aa）
链 Q
672–711（40 aa）
链 R
672–711（40 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLID-STATE NMR
NMR测量条件
pH 7.4；300 K；离子强度（mmCIF原始值）10；压力 ambient
NMR样品组成
selective 13C and 15N beta-amyloid, 10 mM phosphate buffer | 10 mM phosphate buffer
|
分辨率未提供 |
| 2LNQ 40-residue D23N beta amyloid fibril 提交 2012-01-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 A
672–711（40 aa）
链 B
672–711（40 aa）
链 C
672–711（40 aa）
链 D
672–711（40 aa）
链 E
672–711（40 aa）
链 F
672–711（40 aa）
链 G
672–711（40 aa）
链 H
672–711（40 aa）
|
突变：D23N 突变：D23N 突变：D23N 突变：D23N 突变：D23N 突变：D23N 突变：D23N 突变：D23N | 未记录非水小分子 |
SOLID-STATE NMR
NMR测量条件
pH 7.4；279 K；压力 ambient
NMR样品组成
25 uM [U-13C] protein, H2O | H2O
|
分辨率未提供 |
| 2LOH Dimeric structure of transmembrane domain of amyloid precursor protein in micellar environment 提交 2012-01-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
686–726（41 aa）
片段：UNP residues 686-726
链 B
686–726（41 aa）
片段：UNP residues 686-726
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.2；318 K；离子强度（mmCIF原始值）20；压力 ambient
NMR样品组成
0.9 mM [U-100% 15N] APPjmtm, 36 mM DPC, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
0.75 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] APPjmtm, 0.75 mM APPjmtm, 60 mM [U-98% 2H] DPC, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2LP1 The solution NMR structure of the transmembrane C-terminal domain of the amyloid precursor protein (C99) 提交 2012-01-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
671–770（100 aa）
片段：UNP residues 683-728
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.5；318 K；压力 ambient
NMR样品组成
10 % lyso myristoyl phosphatidylglycerol, 10 % [U-2H] D2O, 100 mM imidazole, 250 uM [U-100% 15N] APP_C99, 1 mM EDTA, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2LZ3 Solution NMR structure of transmembrane domain of amyloid precursor protein WT 提交 2012-09-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
699–726（28 aa）
链 B
699–726（28 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7.2；313 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 ambient
NMR样品组成
0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] peptide, sodium phosphate, 10% D2O | 10% D2O
NMR样品组成
0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] peptide, sodium phosphate, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
0.5 mM [U-99% 15N] peptide, sodium phosphate, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2LZ4 Solution NMR structure of transmembrane domain of amyloid precursor protein V44M 提交 2012-09-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
699–726（28 aa）
链 B
699–726（28 aa）
|
突变：V21M 突变：V21M | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7.2；313 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 ambient
NMR样品组成
0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] peptide, sodium chloride, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] peptide, sodium phosphate, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
0.5 mM [U-99% 15N] peptide, sodium chloride, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2M4J 40-residue beta-amyloid fibril derived from Alzheimer's disease brain 提交 2013-02-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric |
链 A
672–711（40 aa）
片段：UNP residues 672-711
链 B
672–711（40 aa）
片段：UNP residues 672-711
链 C
672–711（40 aa）
片段：UNP residues 672-711
链 D
672–711（40 aa）
片段：UNP residues 672-711
链 E
672–711（40 aa）
片段：UNP residues 672-711
链 F
672–711（40 aa）
片段：UNP residues 672-711
链 G
672–711（40 aa）
片段：UNP residues 672-711
链 H
672–711（40 aa）
片段：UNP residues 672-711
链 I
672–711（40 aa）
片段：UNP residues 672-711
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLID-STATE NMR
NMR测量条件
pH 7.4；288 K；离子强度（mmCIF原始值）10；压力 ambient
NMR样品组成
1-2 mg selectively and uniformly labeled samples beta-amyloid peptide | none
|
分辨率未提供 |
| 2M9R 3D NMR structure of a complex between the amyloid beta peptide (1-40) and the polyphenol epsilon-viniferin glucoside 提交 2013-06-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
672–711（40 aa）
片段：UNP residues 672-711
|
未记录 | 23Y (2S,3S)-3-(3,5-dihydroxyphenyl)-2-(4-hydroxyphenyl)-4-[(E)-2-(4-hydroxyphenyl)ethenyl]-2,3-dihydro-1-benzofuran-6-yl beta-D-glucopyranoside × 2 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
300 K；压力 ambient
NMR样品组成
1 mM amyloid peptide, 100% DMSO-d6 | 100% DMSO-d6
|
分辨率未提供 |
| 2M9S 3D NMR structure of a complex between the amyloid beta peptide (1-40) and the polyphenol epsilon-viniferin glucoside 提交 2013-06-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
672–711（40 aa）
片段：UNP residues 672-711
|
未记录 | 23Y (2S,3S)-3-(3,5-dihydroxyphenyl)-2-(4-hydroxyphenyl)-4-[(E)-2-(4-hydroxyphenyl)ethenyl]-2,3-dihydro-1-benzofuran-6-yl beta-D-glucopyranoside × 2 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
300 K；压力 ambient
NMR样品组成
1 mM amyloid peptide, 100% DMSO-d6 | 100% DMSO-d6
|
分辨率未提供 |
| 2MGT Zinc induced dimer of the metal binding domain 1-16 of human amyloid beta-peptide with Alzheimer's disease pathogenic English mutation H6R 提交 2013-11-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
672–687（16 aa）
片段：metal binding domain, UNP residues 672-687
链 B
672–687（16 aa）
片段：metal binding domain, UNP residues 672-687
|
突变：H6R 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：H6R 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ZN ZINC ION × 1 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.8；274 K；压力 ambient
NMR测量条件
278 K；压力 ambient
NMR样品组成
2 mM protein_1-1, 20 mM [U-99% 2H] bis-Tris-2, 40 uM d4 (100%) TSP-3, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
2 mM protein_1-4, 20 mM [U-99% 2H] bis-Tris-5, 40 uM d4 (100%) TSP-6, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
2 mM protein_1-7, 1 mM zinc cloride-8, 20 mM [U-99% 2H] bis-Tris-9, 40 uM d4 (100%) TSP-10, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
2 mM protein_1-11, 1 mM zinc cloride-12, 20 mM [U-99% 2H] bis-Tris-13, 40 uM d4 (100%) TSP-14, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2MJ1 NMR structure of the soluble A beta 17-34 peptide 提交 2013-12-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
688–705（18 aa）
片段：UNP RESIDUES 688-705
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7；278 K；离子强度（mmCIF原始值）0.12；压力 ambient
NMR样品组成
50 mM sodium phosphate-1, 0.2 uM sodium azide-2, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2MPZ Atomic model of the Abeta D23N "Iowa" mutant using solid-state NMR, EM and Rosetta modeling 提交 2014-06-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric |
链 A
686–711（26 aa）
链 B
686–711（26 aa）
链 C
686–711（26 aa）
链 D
686–711（26 aa）
链 E
686–711（26 aa）
链 F
686–711（26 aa）
链 G
686–711（26 aa）
链 H
686–711（26 aa）
链 I
686–711（26 aa）
链 J
686–711（26 aa）
链 K
686–711（26 aa）
链 L
686–711（26 aa）
链 M
686–711（26 aa）
链 N
686–711（26 aa）
链 O
686–711（26 aa）
链 P
686–711（26 aa）
链 Q
686–711（26 aa）
链 R
686–711（26 aa）
链 S
686–711（26 aa）
链 T
686–711（26 aa）
链 U
686–711（26 aa）
链 V
686–711（26 aa）
链 W
686–711（26 aa）
链 X
686–711（26 aa）
链 Y
686–711（26 aa）
链 Z
686–711（26 aa）
链 a
686–711（26 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLID-STATE NMR
NMR测量条件
pH 7.4；298 K；离子强度（mmCIF原始值）10；压力 ambient
NMR样品组成
25 uM [U-99% 13C; U-99% 15N] Abeta D23N, solid
|
分辨率未提供 |
| 2MVX Atomic-resolution 3D structure of amyloid-beta fibrils: the Osaka mutation 提交 2014-10-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
672–711（40 aa）
片段：UNP residues 672-711
链 B
672–711（40 aa）
片段：UNP residues 672-711
链 C
672–711（40 aa）
片段：UNP residues 672-711
链 D
672–711（40 aa）
片段：UNP residues 672-711
链 E
672–711（40 aa）
片段：UNP residues 672-711
链 F
672–711（40 aa）
片段：UNP residues 672-711
链 G
672–711（40 aa）
片段：UNP residues 672-711
链 H
672–711（40 aa）
片段：UNP residues 672-711
链 I
672–711（40 aa）
片段：UNP residues 672-711
链 J
672–711（40 aa）
片段：UNP residues 672-711
|
突变：E22Delta 突变：E22Delta 突变：E22Delta 突变：E22Delta 突变：E22Delta 突变：E22Delta 突变：E22Delta 突变：E22Delta 突变：E22Delta 突变：E22Delta | 未记录非水小分子 |
SOLID-STATE NMR
NMR测量条件
pH 7；283 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 ambient
NMR样品组成
15 mg/mL [U-100% 13C; U-100% 15N] amyloid beta, 100% H2O | 100% H2O
NMR样品组成
15 mg/mL [U-100% 13C] amyloid beta, 100% H2O | 100% H2O
NMR样品组成
15 mg/mL [U-100% 13C]/[U-100% 15N] amyloid beta, 100% H2O | 100% H2O
NMR样品组成
15 mg/mL [U-100% 2-13C-glucose; U-100% 15N] amyloid beta, 100% H2O | 100% H2O
NMR样品组成
15 mg/mL [U-100% 13C; U-100% 15N]/natural abundance amyloid beta, 100% H2O | 100% H2O
|
分辨率未提供 |
| 2MXU 42-Residue Beta Amyloid Fibril 提交 2015-01-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric |
链 A
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
链 B
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
链 C
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
链 D
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
链 E
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
链 F
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
链 G
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
链 H
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
链 I
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
链 J
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
链 K
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
链 L
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLID-STATE NMR
NMR测量条件
pH 7.4；283 K；压力 ambient
NMR样品组成
50 uM [U-100% 13C; U-100% 15N] AB42, 10 mM sodium phosphate, 100% H2O | 100% H2O
|
分辨率未提供 |
| 2NAO Atomic resolution structure of a disease-relevant Abeta(1-42) amyloid fibril 提交 2016-01-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
672–713（42 aa）
链 B
672–713（42 aa）
链 C
672–713（42 aa）
链 D
672–713（42 aa）
链 E
672–713（42 aa）
链 F
672–713（42 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7.4；277 K；压力 ambient
NMR样品组成
100 mM sodium chloride, 100 mM sodium phosphate, 100 uM zinc chloride, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2OTK Structure of Alzheimer Ab peptide in complex with an engineered binding protein 提交 2007-02-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 C
672–711（40 aa）
片段：residues 672-711
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7.2；298 K；离子强度（mmCIF原始值）20 mM sodium phophate；压力 ambient
NMR测量条件
pH 7.2；298 K；离子强度（mmCIF原始值）20 mM sodium phosphate；压力 ambient
NMR样品组成
400 uM [U-100% 13C; U-100% 15N] Abeta peptide, 400 uM ZAb3 dimers, 20 mM Na-phosphate buffer, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
400 uM Abeta peptide, 400 uM [U-100% 13C; U-100% 15N] ZAb3 dimers, 20 mM Na-phosphate buffer, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2R0W PFA2 FAB complexed with Abeta1-8 提交 2007-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 Q
672–679（8 aa）
片段：octapeptide
|
未记录 | NA SODIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 5.3；295 K；25% PEG-MME 5000, 0.1 M OAc, pH 5.3, VAPOR DIFFUSION, temperature 295K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.277 |
| 2WK3 Crystal structure of human insulin-degrading enzyme in complex with amyloid-beta (1-42) 提交 2009-06-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 D
672–713（42 aa）
片段：BETA-AMYLOID PROTEIN 42, RESIDUES 672-713
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.59 Å R-free 0.232 |
| 2WK3 Crystal structure of human insulin-degrading enzyme in complex with amyloid-beta (1-42) 提交 2009-06-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 C
672–713（42 aa）
片段：BETA-AMYLOID PROTEIN 42, RESIDUES 672-713
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.59 Å R-free 0.232 |
| 2Y29 Structure of segment KLVFFA from the amyloid-beta peptide (Ab, residues 16-21), alternate polymorph III 提交 2010-12-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
687–692（6 aa）
片段：SEGMENT KLVFFA, RESIDUES 687-692
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 8.5；AB16-21 FORM III CRYSTALS WERE OBTAINED AFTER THE SEGMENT WAS DISSOLVED IN WATER AT 5 MG/ML AND MIXED WITH 0.2M AMMONIUM ACETATE, 0.1 M TRIS BUFFER PH 8.5 AND 30% ISOPROPANOL.
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.260 |
| 2Y2A Structure of segment KLVFFA from the amyloid-beta peptide (Ab, residues 16-21), alternate polymorph I 提交 2010-12-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
687–692（6 aa）
片段：SEGMENT KLVFFA, RESIDUES 687-692
|
未记录 | ACT ACETATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.5；AB16-21 FORM I CRYSTALS WERE OBTAINED AFTER THE SEGMENT WAS DISSOLVED IN WATER AT 5 MG/ML AND MIXED WITH 0.2 M AMMONIUM ACETATE, 0.1 M BIS-TRIS PH 5.5, 45 % V/V MPD
|
分辨率 1.91 Å R-free 0.248 |
| 2Y3J Structure of segment AIIGLM from the amyloid-beta peptide (Ab, residues 30-35) 提交 2010-12-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
701–706（6 aa）
片段：RESIDUES 701-706
链 B
701–706（6 aa）
片段：RESIDUES 701-706
链 C
701–706（6 aa）
片段：RESIDUES 701-706
链 D
701–706（6 aa）
片段：RESIDUES 701-706
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7；AB3035 WAS DISSOLVED IN WATER AT 1MG/ML AND MIXED WITH 2 M SODIUM CHLORIDE, pH 7
|
分辨率 1.99 Å R-free 0.267 |
| 2Y3J Structure of segment AIIGLM from the amyloid-beta peptide (Ab, residues 30-35) 提交 2010-12-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 E
701–706（6 aa）
片段：RESIDUES 701-706
链 F
701–706（6 aa）
片段：RESIDUES 701-706
链 G
701–706（6 aa）
片段：RESIDUES 701-706
链 H
701–706（6 aa）
片段：RESIDUES 701-706
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7；AB3035 WAS DISSOLVED IN WATER AT 1MG/ML AND MIXED WITH 2 M SODIUM CHLORIDE, pH 7
|
分辨率 1.99 Å R-free 0.267 |
| 2Y3K Structure of segment MVGGVVIA from the amyloid-beta peptide (Ab, residues 35-42), alternate polymorph 1 提交 2010-12-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
706–713（8 aa）
片段：RESIDUES 706-713
链 B
706–713（8 aa）
片段：RESIDUES 706-713
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.6；AB3542 CRYSTALS (FIRST DISSOLVED IN WATER) WERE FOUND IN 1.5-YEAR-OLD TRAYS SET AT 0.5 MG/ML IN 1.26 M NA PHOSPHATE MONOBASIC MONOHYDRATE, 0.14 M K PHOSPHATE DIBASIC, PH 5.6 (CRYSTAL FORM I)
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.231 |
| 2Y3K Structure of segment MVGGVVIA from the amyloid-beta peptide (Ab, residues 35-42), alternate polymorph 1 提交 2010-12-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 C
706–713（8 aa）
片段：RESIDUES 706-713
链 D
706–713（8 aa）
片段：RESIDUES 706-713
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.6；AB3542 CRYSTALS (FIRST DISSOLVED IN WATER) WERE FOUND IN 1.5-YEAR-OLD TRAYS SET AT 0.5 MG/ML IN 1.26 M NA PHOSPHATE MONOBASIC MONOHYDRATE, 0.14 M K PHOSPHATE DIBASIC, PH 5.6 (CRYSTAL FORM I)
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.231 |
| 2Y3K Structure of segment MVGGVVIA from the amyloid-beta peptide (Ab, residues 35-42), alternate polymorph 1 提交 2010-12-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 E
706–713（8 aa）
片段：RESIDUES 706-713
链 F
706–713（8 aa）
片段：RESIDUES 706-713
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.6；AB3542 CRYSTALS (FIRST DISSOLVED IN WATER) WERE FOUND IN 1.5-YEAR-OLD TRAYS SET AT 0.5 MG/ML IN 1.26 M NA PHOSPHATE MONOBASIC MONOHYDRATE, 0.14 M K PHOSPHATE DIBASIC, PH 5.6 (CRYSTAL FORM I)
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.231 |
| 2Y3K Structure of segment MVGGVVIA from the amyloid-beta peptide (Ab, residues 35-42), alternate polymorph 1 提交 2010-12-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 G
706–713（8 aa）
片段：RESIDUES 706-713
链 H
706–713（8 aa）
片段：RESIDUES 706-713
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.6；AB3542 CRYSTALS (FIRST DISSOLVED IN WATER) WERE FOUND IN 1.5-YEAR-OLD TRAYS SET AT 0.5 MG/ML IN 1.26 M NA PHOSPHATE MONOBASIC MONOHYDRATE, 0.14 M K PHOSPHATE DIBASIC, PH 5.6 (CRYSTAL FORM I)
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.231 |
| 2Y3L Structure of segment MVGGVVIA from the amyloid-beta peptide (Ab, residues 35-42), alternate polymorph 2 提交 2010-12-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
706–713（8 aa）
片段：RESIDUES 706-713
链 B
706–713（8 aa）
片段：RESIDUES 706-713
链 C
706–713（8 aa）
片段：RESIDUES 706-713
链 G
706–713（8 aa）
片段：RESIDUES 706-713
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5；AB3542 CRYSTALS (FIRST DISSOLVED IN WATER) WERE FOUND IN 1.5-YEAR-OLD TRAYS SET AT 0.5 MG/ML IN 0.1 M HEPES PH 7.5, 0.5 M MG FORMATE (CRYSTAL FORM II)
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.247 |
| 3AYU Crystal structure of MMP-2 active site mutant in complex with APP-drived decapeptide inhibitor 提交 2011-05-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
586–595（10 aa）
片段：UNP residues 586-595
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.00 Å R-free 0.205 |
| 3DXC Crystal structure of the intracellular domain of human APP in complex with Fe65-PTB2 提交 2008-07-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
739–770（32 aa）
片段：APP intracellular domain, UNP residues 739-770
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 4.6；293 K；3.2 M NaCl,0.1 M sodium acetate , pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.238 |
| 3DXC Crystal structure of the intracellular domain of human APP in complex with Fe65-PTB2 提交 2008-07-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 D
739–770（32 aa）
片段：APP intracellular domain, UNP residues 739-770
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 4.6；293 K；3.2 M NaCl,0.1 M sodium acetate , pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.238 |
| 3DXD Crystal structure of the intracellular domain of human APP (T668E mutant) in complex with Fe65-PTB2 提交 2008-07-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
739–770（32 aa）
片段：APP intracellular domain, UNP residues 739-770
|
突变：T668E | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 4.6；293 K；3.2 M NaCl, 0.1 M sodium acetate , pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.247 |
| 3DXD Crystal structure of the intracellular domain of human APP (T668E mutant) in complex with Fe65-PTB2 提交 2008-07-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 D
739–770（32 aa）
片段：APP intracellular domain, UNP residues 739-770
|
突变：T668E | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 4.6；293 K；3.2 M NaCl, 0.1 M sodium acetate , pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.247 |
| 3DXE Crystal structure of the intracellular domain of human APP (T668A mutant) in complex with Fe65-PTB2 提交 2008-07-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
739–770（32 aa）
片段：APP intracellular domain, UNP residues 739-770
|
突变：T668A | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 4.6；293 K；3.2 M NaCl, 0.1 M sodium acetate , pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.241 |
| 3DXE Crystal structure of the intracellular domain of human APP (T668A mutant) in complex with Fe65-PTB2 提交 2008-07-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 D
739–770（32 aa）
片段：APP intracellular domain, UNP residues 739-770
|
突变：T668A | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 4.6；293 K；3.2 M NaCl, 0.1 M sodium acetate , pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.241 |
| 3GCI Crystal Structure of the Complex Formed Between a New Isoform of Phospholipase A2 with C-terminal Amyloid Beta Heptapeptide at 2 A Resolution 提交 2009-02-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 P
707–713（7 aa）
片段：UNP residues 707-713
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；290 K；10mM Sodium phosphate, pH 6.0, 1mM CaCl2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
|
分辨率 2.04 Å R-free 0.221 |
| 3IFL X-ray structure of amyloid beta peptide:antibody (Abeta1-7:12A11) complex 提交 2009-07-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 P
672–678（7 aa）
片段：residues 672-678
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；295 K；Protein: 15 mg/ml, 10 mM Hepes, pH 7.5, 75 mM NaCl. Protein:peptide molar ratio: 1:1.1. Reservoir: 32% PEG400, 0.1M Tris pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.206 |
| 3IFN X-ray structure of amyloid beta peptide:antibody (Abeta1-40:12A11) complex 提交 2009-07-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 P
672–711（40 aa）
片段：residues 672-711
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；Protein: 5.3 mg/ml, 10 mM Hepes, pH 7.5, 75 mM NaCl. Protein:peptide molar ratio: 1:4.5. Reservoir: 0.2M NaCl, 25% Peg 4K, 0.1M Hepes pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.212 |
| 3IFO X-ray structure of amyloid beta peptide:antibody (Abeta1-7:10D5) complex 提交 2009-07-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 P
672–678（7 aa）
片段：residues 672-678
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；Protein: 15 mg/ml, 10 mM Hepes pH 7.5, 75 mM NaCl. Protein:peptide molar ratio: 1:2. Reservoir: 30% PEG4K, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.218 |
| 3IFO X-ray structure of amyloid beta peptide:antibody (Abeta1-7:10D5) complex 提交 2009-07-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 Q
672–678（7 aa）
片段：residues 672-678
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；Protein: 15 mg/ml, 10 mM Hepes pH 7.5, 75 mM NaCl. Protein:peptide molar ratio: 1:2. Reservoir: 30% PEG4K, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.218 |
| 3IFP X-ray structure of amyloid beta peptide:antibody (Abeta1-7:12B4) complex 提交 2009-07-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 P
672–678（7 aa）
片段：residues 672-678
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；Protein: 4.1 mg/ml, 10 mM Hepes pH 7.5, 75 mM NaCl. Protein:peptide molar ratio: 1:1.8. Reservoir: 30%PEG8K, 0.1M Hepes pH 7.0, 0.2M (NH4)2SO4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.95 Å R-free 0.269 |
| 3IFP X-ray structure of amyloid beta peptide:antibody (Abeta1-7:12B4) complex 提交 2009-07-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 Q
672–678（7 aa）
片段：residues 672-678
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；Protein: 4.1 mg/ml, 10 mM Hepes pH 7.5, 75 mM NaCl. Protein:peptide molar ratio: 1:1.8. Reservoir: 30%PEG8K, 0.1M Hepes pH 7.0, 0.2M (NH4)2SO4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.95 Å R-free 0.269 |
| 3IFP X-ray structure of amyloid beta peptide:antibody (Abeta1-7:12B4) complex 提交 2009-07-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 R
672–678（7 aa）
片段：residues 672-678
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；Protein: 4.1 mg/ml, 10 mM Hepes pH 7.5, 75 mM NaCl. Protein:peptide molar ratio: 1:1.8. Reservoir: 30%PEG8K, 0.1M Hepes pH 7.0, 0.2M (NH4)2SO4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.95 Å R-free 0.269 |
| 3IFP X-ray structure of amyloid beta peptide:antibody (Abeta1-7:12B4) complex 提交 2009-07-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 S
672–678（7 aa）
片段：residues 672-678
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；Protein: 4.1 mg/ml, 10 mM Hepes pH 7.5, 75 mM NaCl. Protein:peptide molar ratio: 1:1.8. Reservoir: 30%PEG8K, 0.1M Hepes pH 7.0, 0.2M (NH4)2SO4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.95 Å R-free 0.269 |
| 3JTI Crystal structure of the complex formed between Phospholipase A2 with beta-amyloid fragment, Lys-Gly-Ala-Ile-Ile-Gly-Leu-Met at 1.8 A resolution 提交 2009-09-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
699–706（8 aa）
片段：UNP residues 699-706
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；290 K；10MM SODIUM PHOSPHATE, 1mM CACL2, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.210 |
| 3KTM Structure of the Heparin-induced E1-Dimer of the Amyloid Precursor Protein (APP) 提交 2009-11-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
18–190（173 aa）
片段：UNP residues 18-190
链 C
18–190（173 aa）
片段：UNP residues 18-190
|
未记录 | BU4 (3R)-butane-1,3-diol × 2 SO4 SULFATE ION × 1 ACT ACETATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.250 |
| 3KTM Structure of the Heparin-induced E1-Dimer of the Amyloid Precursor Protein (APP) 提交 2009-11-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 10 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 F
18–190（173 aa）
片段：UNP residues 18-190
|
未记录 | BU4 (3R)-butane-1,3-diol × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.250 |
| 3KTM Structure of the Heparin-induced E1-Dimer of the Amyloid Precursor Protein (APP) 提交 2009-11-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 11 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 G
18–190（173 aa）
片段：UNP residues 18-190
|
未记录 | BU4 (3R)-butane-1,3-diol × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.250 |
| 3KTM Structure of the Heparin-induced E1-Dimer of the Amyloid Precursor Protein (APP) 提交 2009-11-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 12 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 H
18–190（173 aa）
片段：UNP residues 18-190
|
未记录 | BU4 (3R)-butane-1,3-diol × 1 SO4 SULFATE ION × 1 ACT ACETATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.250 |
| 3KTM Structure of the Heparin-induced E1-Dimer of the Amyloid Precursor Protein (APP) 提交 2009-11-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
18–190（173 aa）
片段：UNP residues 18-190
链 D
18–190（173 aa）
片段：UNP residues 18-190
|
未记录 | BU4 (3R)-butane-1,3-diol × 2 SO4 SULFATE ION × 2 ACT ACETATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.250 |
| 3KTM Structure of the Heparin-induced E1-Dimer of the Amyloid Precursor Protein (APP) 提交 2009-11-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 F
18–190（173 aa）
片段：UNP residues 18-190
链 H
18–190（173 aa）
片段：UNP residues 18-190
|
未记录 | BU4 (3R)-butane-1,3-diol × 2 SO4 SULFATE ION × 1 ACT ACETATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.250 |
| 3KTM Structure of the Heparin-induced E1-Dimer of the Amyloid Precursor Protein (APP) 提交 2009-11-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 E
18–190（173 aa）
片段：UNP residues 18-190
链 G
18–190（173 aa）
片段：UNP residues 18-190
|
未记录 | BU4 (3R)-butane-1,3-diol × 2 SO4 SULFATE ION × 1 ACT ACETATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.250 |
| 3KTM Structure of the Heparin-induced E1-Dimer of the Amyloid Precursor Protein (APP) 提交 2009-11-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
18–190（173 aa）
片段：UNP residues 18-190
|
未记录 | BU4 (3R)-butane-1,3-diol × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.250 |
| 3KTM Structure of the Heparin-induced E1-Dimer of the Amyloid Precursor Protein (APP) 提交 2009-11-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
18–190（173 aa）
片段：UNP residues 18-190
|
未记录 | BU4 (3R)-butane-1,3-diol × 1 SO4 SULFATE ION × 1 ACT ACETATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.250 |
| 3KTM Structure of the Heparin-induced E1-Dimer of the Amyloid Precursor Protein (APP) 提交 2009-11-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 7 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 C
18–190（173 aa）
片段：UNP residues 18-190
|
未记录 | BU4 (3R)-butane-1,3-diol × 1 SO4 SULFATE ION × 1 ACT ACETATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.250 |
| 3KTM Structure of the Heparin-induced E1-Dimer of the Amyloid Precursor Protein (APP) 提交 2009-11-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 8 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 D
18–190（173 aa）
片段：UNP residues 18-190
|
未记录 | BU4 (3R)-butane-1,3-diol × 1 SO4 SULFATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.250 |
| 3KTM Structure of the Heparin-induced E1-Dimer of the Amyloid Precursor Protein (APP) 提交 2009-11-25 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 9 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 E
18–190（173 aa）
片段：UNP residues 18-190
|
未记录 | BU4 (3R)-butane-1,3-diol × 1 SO4 SULFATE ION × 1 ACT ACETATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.250 |
| 3L33 Human mesotrypsin complexed with amyloid precursor protein inhibitor(APPI) 提交 2009-12-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 E
290–341（52 aa）
片段：UNP residues 290-341
|
未记录 | FMT FORMIC ACID × 9 CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；4M sodium formate solution, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 2.48 Å R-free 0.256 |
| 3L33 Human mesotrypsin complexed with amyloid precursor protein inhibitor(APPI) 提交 2009-12-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 F
290–341（52 aa）
片段：UNP residues 290-341
|
未记录 | FMT FORMIC ACID × 6 CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；4M sodium formate solution, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 2.48 Å R-free 0.256 |
| 3L33 Human mesotrypsin complexed with amyloid precursor protein inhibitor(APPI) 提交 2009-12-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 G
290–341（52 aa）
片段：UNP residues 290-341
|
未记录 | FMT FORMIC ACID × 3 CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；4M sodium formate solution, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 2.48 Å R-free 0.256 |
| 3L33 Human mesotrypsin complexed with amyloid precursor protein inhibitor(APPI) 提交 2009-12-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 H
290–341（52 aa）
片段：UNP residues 290-341
|
未记录 | FMT FORMIC ACID × 1 CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；4M sodium formate solution, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 2.48 Å R-free 0.256 |
| 3L81 Crystal structure of adaptor protein complex 4 (AP-4) mu4 subunit C-terminal domain, in complex with a sorting peptide from the amyloid precursor protein (APP) 提交 2009-12-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
761–767（7 aa）
片段：C-terminus, residues 761-767
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；10% PEG 3350, 10mM magnesium chloride, 0.1M HEPES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；15% PEG 6000, 3% trimethylamine N-oxide dihydrate, 0.1M HEPES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.252 |
| 3MOQ Amyloid beta(18-41) peptide fusion with new antigen receptor variable domain from sharks 提交 2010-04-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
689–712（24 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；20% PEG 6000, 0.2M AMMONIUM CHLORIDE, 0.1M MES, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.249 |
| 3MOQ Amyloid beta(18-41) peptide fusion with new antigen receptor variable domain from sharks 提交 2010-04-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
689–712（24 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；20% PEG 6000, 0.2M AMMONIUM CHLORIDE, 0.1M MES, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.249 |
| 3MOQ Amyloid beta(18-41) peptide fusion with new antigen receptor variable domain from sharks 提交 2010-04-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 C
689–712（24 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；20% PEG 6000, 0.2M AMMONIUM CHLORIDE, 0.1M MES, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.249 |
| 3MOQ Amyloid beta(18-41) peptide fusion with new antigen receptor variable domain from sharks 提交 2010-04-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 D
689–712（24 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；20% PEG 6000, 0.2M AMMONIUM CHLORIDE, 0.1M MES, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.249 |
| 3MOQ Amyloid beta(18-41) peptide fusion with new antigen receptor variable domain from sharks 提交 2010-04-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 5 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
689–712（24 aa）
链 B
689–712（24 aa）
链 C
689–712（24 aa）
链 D
689–712（24 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；20% PEG 6000, 0.2M AMMONIUM CHLORIDE, 0.1M MES, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.249 |
| 3NYJ Crystal Structure Analysis of APP E2 domain 提交 2010-07-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
365–567（203 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | OS OSMIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 5.6；298 K；20% PEG 4000, 20% isopropanol, 0.1M Na Citrate, pH 5.6, vapor diffusion, temperature 298K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.380 |
| 3OVJ Structure of an amyloid forming peptide KLVFFA from amyloid beta in complex with orange G 提交 2010-09-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
687–692（6 aa）
片段：KLVFFA (UNP residues 687-692)
链 B
687–692（6 aa）
片段：KLVFFA (UNP residues 687-692)
链 C
687–692（6 aa）
片段：KLVFFA (UNP residues 687-692)
链 D
687–692（6 aa）
片段：KLVFFA (UNP residues 687-692)
|
未记录 | ORA 7-hydroxy-8-[(E)-phenyldiazenyl]naphthalene-1,3-disulfonic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；reservoir contained 30% w/v Polyethylene glycol 1,500, 20% v/v Glycerol, vapor diffusion, hanging drop, temperature 291K
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；reservoir contained 10% w/v Polyethylene glycol 1,500, 30% v/v Glycerol, vapor diffusion, hanging drop, temperature 291K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.220 |
| 3OW9 Structure of an amyloid forming peptide KLVFFA from amyloid beta, alternate polymorph II 提交 2010-09-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric |
链 A
687–692（6 aa）
片段：KLVFFA (UNP residues 687-692)
链 B
687–692（6 aa）
片段：KLVFFA (UNP residues 687-692)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；reservoir contained 30% (v/v) Jeffamine M-600, 0.1M Mes pH 6.5 ; 0.05M CsCl, 1mM FDDNP, vapor diffusion, hanging drop, temperature 291K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.258 |
| 3PZZ Structure of an amyloid forming peptide GAIIGL (29-34) from amyloid beta 提交 2010-12-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric |
链 A
700–705（6 aa）
片段：GAIIGL hexapeptide segment (UNP residues 700-705)
链 B
700–705（6 aa）
片段：GAIIGL hexapeptide segment (UNP residues 700-705)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；reservoir contained 14.4% PEG 8000, 0.08 M Na Cacodylate pH 6.5, 0.16 M Calcium Acetate, 20% v/v Glycerol, vapor diffusion, hanging drop, temperature 291K
|
分辨率 1.29 Å R-free 0.196 |
| 3Q2X Structure of an amyloid forming peptide NKGAII (residues 27-32) from amyloid beta 提交 2010-12-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
698–703（6 aa）
片段：NKGAII hexapeptide segment (UNP residues 698-703)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；reservoir contained 2.4M Sodium Malonate, 15% v/v Glycerol, vapor diffusion, hanging drop, temperature 291K
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.259 |
| 3SV1 Crystal structure of APP peptide bound rat Mint2 PARM 提交 2011-07-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 D
754–767（14 aa）
片段：C-terminal peptide, residues 754-767
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1M HEPES, 36% PEG200, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.301 |
| 3SV1 Crystal structure of APP peptide bound rat Mint2 PARM 提交 2011-07-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 E
754–767（14 aa）
片段：C-terminal peptide, residues 754-767
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1M HEPES, 36% PEG200, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.301 |
| 3SV1 Crystal structure of APP peptide bound rat Mint2 PARM 提交 2011-07-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 F
754–767（14 aa）
片段：C-terminal peptide, residues 754-767
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1M HEPES, 36% PEG200, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.301 |
| 3U0T Fab-antibody complex 提交 2011-09-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 E
701–711（11 aa）
片段：UNP residues 701-711
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.50 Å R-free 0.268 |
| 3U0T Fab-antibody complex 提交 2011-09-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 F
701–711（11 aa）
片段：UNP residues 701-711
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.50 Å R-free 0.268 |
| 3UMH X-ray structure of the E2 domain of the human amyloid precursor protein (APP) in complex with cadmium 提交 2011-11-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
370–575（206 aa）
片段：HUMAN AMYLOID PRECURSOR PROTEIN E2 DOMAIN
|
未记录 | ACT ACETATE ION × 2 CD CADMIUM ION × 9 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.4；293 K；0.1 mM HEPES, 1 M sodium acetate, 10 mM MgCl2, 50 mM CdSO4, pH 6.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.240 |
| 3UMI X-ray structure of the E2 domain of the human amyloid precursor protein (APP) in complex with zinc 提交 2011-11-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
370–575（206 aa）
片段：HUMAN AMYLOID PRECURSOR PROTEIN E2 DOMAIN
|
未记录 | ACT ACETATE ION × 1 ZN ZINC ION × 1 CD CADMIUM ION × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.4；293 K；0.1 mM HEPES, 1 M sodium acetate, 10 mM MgCl2, 50 mM CdSO4, pH 6.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.245 |
| 3UMK X-ray structure of the E2 domain of the human amyloid precursor protein (APP) in complex with copper 提交 2011-11-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
370–575（206 aa）
片段：HUMAN AMYLOID PRECURSOR PROTEIN E2 DOMAIN
|
未记录 | ACT ACETATE ION × 1 CU COPPER (II) ION × 2 CD CADMIUM ION × 7 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.4；293 K；0.1 mM HEPES, 1 M sodium acetate, 10 mM MgCl2, 50 mM CdSO4, pH 6.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.239 |
| 4HIX Crystal structure of a humanised 3D6 Fab bound to amyloid beta peptide 提交 2012-10-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
672–699（28 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；sodium formate, PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.220 |
| 4JFN Crystal structure of the N-terminal, growth factor-like domain of the amyloid precursor protein bound to copper 提交 2013-02-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
23–185（163 aa）
片段：growth factor-like domain (GFLD), UNP residues 23-185
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；6% (w/v) PEG 3350, 0.1 M Hepes, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.230 |
| 4M1C Crystal Structure Analysis of Fab-Bound Human Insulin Degrading Enzyme (IDE) in Complex with Amyloid-Beta (1-40) 提交 2013-08-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 G
672–711（40 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291.15 K；0.1M Sodium cacodylate, pH6.5, 0.2M MgCl2, 10% PEG-3000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291.15K
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.270 |
| 4M1C Crystal Structure Analysis of Fab-Bound Human Insulin Degrading Enzyme (IDE) in Complex with Amyloid-Beta (1-40) 提交 2013-08-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 H
672–711（40 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291.15 K；0.1M Sodium cacodylate, pH6.5, 0.2M MgCl2, 10% PEG-3000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291.15K
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.270 |
| 4MDR Crystal structure of adaptor protein complex 4 (AP-4) mu4 subunit C-terminal domain D190A mutant, in complex with a sorting peptide from the amyloid precursor protein (APP) 提交 2013-08-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
758–767（10 aa）
片段：C-terminus, residues 761-767
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；15% PEG 6000, 3% trimethylamine N-oxide dihydrate, 0.1M HEPES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295.0K
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.260 |
| 4MVI Crystal structure of an engineered lipocalin (Anticalin US7) in complex with the Alzheimer amyloid peptide Abeta(1-40) 提交 2013-09-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
672–711（40 aa）
片段：UNP residues 672-711
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.25；293 K；30 % (w/v) PEG 4000, 100 mM sodium acetate, pH 5.25, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.212 |
| 4MVK Crystal structure of an engineered lipocalin (Anticalin US7) in complex with the Alzheimer amyloid peptide fragment VFFAED 提交 2013-09-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
689–694（6 aa）
片段：UNP residues 689-694
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；27 % (w/v) PEG 8000, 100 mM MES, pH 6.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.186 |
| 4MVL Crystal structure of an engineered lipocalin (Anticalin H1GA) in complex with the Alzheimer amyloid peptide Abeta1-40 提交 2013-09-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 E
672–711（40 aa）
片段：UNP residues 672-711
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；24 % (w/v) PEG 3350, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.279 |
| 4MVL Crystal structure of an engineered lipocalin (Anticalin H1GA) in complex with the Alzheimer amyloid peptide Abeta1-40 提交 2013-09-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 F
672–711（40 aa）
片段：UNP residues 672-711
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；24 % (w/v) PEG 3350, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.279 |
| 4MVL Crystal structure of an engineered lipocalin (Anticalin H1GA) in complex with the Alzheimer amyloid peptide Abeta1-40 提交 2013-09-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 G
672–711（40 aa）
片段：UNP residues 672-711
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；24 % (w/v) PEG 3350, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.279 |
| 4MVL Crystal structure of an engineered lipocalin (Anticalin H1GA) in complex with the Alzheimer amyloid peptide Abeta1-40 提交 2013-09-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 H
672–711（40 aa）
片段：UNP residues 672-711
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；24 % (w/v) PEG 3350, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.279 |
| 4NGE Crystal Structure of Human Presequence Protease in Complex with Amyloid-beta (1-40) 提交 2013-11-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 B
672–711（40 aa）
片段：UNP residues 572-711
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 ACT ACETATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291.15 K；15.2% w/v PEG8000, 15 mM TCEP, 80 mM sodium cacodylate, pH 6.5, 160 mM calcium acetate, 20% v/v glycerol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291.15K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.232 |
| 4NGE Crystal Structure of Human Presequence Protease in Complex with Amyloid-beta (1-40) 提交 2013-11-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 E
672–711（40 aa）
片段：UNP residues 572-711
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291.15 K；15.2% w/v PEG8000, 15 mM TCEP, 80 mM sodium cacodylate, pH 6.5, 160 mM calcium acetate, 20% v/v glycerol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291.15K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.232 |
| 4OJF Humanised 3D6 Fab complexed to amyloid beta 1-8 提交 2014-01-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
672–679（8 aa）
片段：UNP residues 672-679
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.1M HEPES, 25%(w/v) PEG 6000, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.215 |
| 4ONF Fab fragment of 3D6 in complex with amyloid beta 1-7 提交 2014-01-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 P
672–678（7 aa）
片段：unp residues 672-678
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；295 K；30% Peg400, 0.1 M Tris, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.203 |
| 4ONG Fab fragment of 3D6 in complex with amyloid beta 1-40 提交 2014-01-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 P
672–711（40 aa）
片段：unp residues 672-711
|
未记录 | ZN ZINC ION × 27 IMD IMIDAZOLE × 3 CL CHLORIDE ION × 11 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；2.5 M NaCl, 0.1 Imidazole pH 8.0, 0.2 ZnAc2., VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.227 |
| 4PQD The longer crystal structure of the grow factor like domain from Beta amypoid precusor protein (APP22-126) 提交 2014-03-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
22–126（105 aa）
片段：the N-terminal GFLD doamin of APP, UNP residues 22-126
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；288 K；60% v/v TacsimateTM pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288K
|
分辨率 1.33 Å R-free 0.186 |
| 4PWQ HIGH-RESOLUTION CRYSTAL STRUCTURE OF THE E1-DOMAIN of THE AMYLOID PRECURSOR PROTEIN 提交 2014-03-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
18–190（173 aa）
片段：E1 domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；283 K；0.1M Na-citrate, 20% PEG4000, 11% 2-propanole, 10mM sarcosine, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 283K
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.185 |
| 4PWQ HIGH-RESOLUTION CRYSTAL STRUCTURE OF THE E1-DOMAIN of THE AMYLOID PRECURSOR PROTEIN 提交 2014-03-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 B
18–190（173 aa）
片段：E1 domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；283 K；0.1M Na-citrate, 20% PEG4000, 11% 2-propanole, 10mM sarcosine, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 283K
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.185 |
| 4XXD Crystal Structure of mid-region amyloid beta capture by solanezumab 提交 2015-01-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 C
683–699（17 aa）
片段：UNP residues 683-699
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；292 K；PEG 3350, sodium citrate
|
分辨率 2.41 Å R-free 0.290 |
| 4XXD Crystal Structure of mid-region amyloid beta capture by solanezumab 提交 2015-01-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 F
683–699（17 aa）
片段：UNP residues 683-699
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；292 K；PEG 3350, sodium citrate
|
分辨率 2.41 Å R-free 0.290 |
| 5AM8 Crystal structure of the Angiotensin-1 converting enzyme N-domain in complex with amyloid-beta 4-10 提交 2015-03-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 R
675–681（7 aa）
片段：FRAGMENT 4-10, UNP RESIDUES 675-681
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 8.5；0.06 M DIVALENT CATIONS, 0.1 M TRIS/BICINE PH 8.5, 30 % PEG550MME/PEG20000
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.224 |
| 5AM8 Crystal structure of the Angiotensin-1 converting enzyme N-domain in complex with amyloid-beta 4-10 提交 2015-03-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 P
675–681（7 aa）
片段：FRAGMENT 4-10, UNP RESIDUES 675-681
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4 P6G HEXAETHYLENE GLYCOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 8.5；0.06 M DIVALENT CATIONS, 0.1 M TRIS/BICINE PH 8.5, 30 % PEG550MME/PEG20000
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.224 |
| 5AM8 Crystal structure of the Angiotensin-1 converting enzyme N-domain in complex with amyloid-beta 4-10 提交 2015-03-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 S
675–681（7 aa）
片段：FRAGMENT 4-10, UNP RESIDUES 675-681
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 5 P6G HEXAETHYLENE GLYCOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 8.5；0.06 M DIVALENT CATIONS, 0.1 M TRIS/BICINE PH 8.5, 30 % PEG550MME/PEG20000
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.224 |
| 5AM8 Crystal structure of the Angiotensin-1 converting enzyme N-domain in complex with amyloid-beta 4-10 提交 2015-03-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 Q
675–681（7 aa）
片段：FRAGMENT 4-10, UNP RESIDUES 675-681
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 5 P6G HEXAETHYLENE GLYCOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 8.5；0.06 M DIVALENT CATIONS, 0.1 M TRIS/BICINE PH 8.5, 30 % PEG550MME/PEG20000
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.224 |
| 5AMB Crystal structure of the Angiotensin-1 converting enzyme N-domain in complex with amyloid-beta 35-42 提交 2015-03-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 P
706–713（8 aa）
片段：UNP RESIDUES 706-713
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 P6G HEXAETHYLENE GLYCOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 8.5；0.06 M DIVALENT CATIONS, 0.1 M TRIS/ BICINE PH 8.5, 30 % PEG550MME/PEG20000
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.181 |
| 5AMB Crystal structure of the Angiotensin-1 converting enzyme N-domain in complex with amyloid-beta 35-42 提交 2015-03-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 Q
706–713（8 aa）
片段：UNP RESIDUES 706-713
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 P6G HEXAETHYLENE GLYCOL × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 8.5；0.06 M DIVALENT CATIONS, 0.1 M TRIS/ BICINE PH 8.5, 30 % PEG550MME/PEG20000
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.181 |
| 5BUO A receptor molecule 提交 2015-06-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
351–691（341 aa）
片段：UNP Residues 351-691
链 B
351–691（341 aa）
片段：UNP Residues 351-691
|
未记录 | ZN ZINC ION × 6 CA CALCIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 3 ACT ACETATE ION × 1 SCN THIOCYANATE ION × 3 SO4 SULFATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG3350, ammonium acetate, bis-tris, zinc, thiocyanate
|
分辨率 2.31 Å R-free 0.241 |
| 5C67 Human Mesotrypsin in complex with amyloid precursor protein inhibitor variant APPI-M17G/I18F/F34V 提交 2015-06-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 E
294–346（53 aa）
|
突变：M15G, I16F, F32V | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；0.1 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris pH 7.5, and 20% PEG-1000
|
分辨率 1.83 Å R-free 0.267 |
| 5C67 Human Mesotrypsin in complex with amyloid precursor protein inhibitor variant APPI-M17G/I18F/F34V 提交 2015-06-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 C
294–346（53 aa）
|
突变：M15G, I16F, F32V | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；0.1 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris pH 7.5, and 20% PEG-1000
|
分辨率 1.83 Å R-free 0.267 |
| 5CSZ CRYSTAL STRUCTURE OF GANTENERUMAB FAB FRAGMENT IN COMPLEX WITH ABETA 1-11 提交 2015-07-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 D
672–682（11 aa）
片段：UNP residues 672-682
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 SO4 SULFATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；25 % PEG 3350, 0.1M Bis-Tris 6.5, 0.2 M ammonium sulfate
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.230 |
| 5CSZ CRYSTAL STRUCTURE OF GANTENERUMAB FAB FRAGMENT IN COMPLEX WITH ABETA 1-11 提交 2015-07-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 E
672–682（11 aa）
片段：UNP residues 672-682
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 SO4 SULFATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；25 % PEG 3350, 0.1M Bis-Tris 6.5, 0.2 M ammonium sulfate
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.230 |
| 5HOX X-ray crystallographic structure of an A-beta 17_36 beta-hairpin. Synchrotron data set. (LVFFAEDCGSNKCAII(SAR)LMV). 提交 2016-01-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
687–707（21 aa）
片段：UNP residues 687-707
链 B
687–707（21 aa）
片段：UNP residues 687-707
链 C
687–707（21 aa）
片段：UNP residues 687-707
|
突变：V24C, G29C, G33Sar 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V24C, G29C, G33Sar 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V24C, G29C, G33Sar 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.1；296 K；0.1 M HEPES Buffer, 29% (v/v) Jeffamine M-600
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.250 |
| 5HOX X-ray crystallographic structure of an A-beta 17_36 beta-hairpin. Synchrotron data set. (LVFFAEDCGSNKCAII(SAR)LMV). 提交 2016-01-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
687–707（21 aa）
片段：UNP residues 687-707
链 B
687–707（21 aa）
片段：UNP residues 687-707
链 C
687–707（21 aa）
片段：UNP residues 687-707
|
突变：V24C, G29C, G33Sar 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V24C, G29C, G33Sar 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V24C, G29C, G33Sar 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.1；296 K；0.1 M HEPES Buffer, 29% (v/v) Jeffamine M-600
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.250 |
| 5HOX X-ray crystallographic structure of an A-beta 17_36 beta-hairpin. Synchrotron data set. (LVFFAEDCGSNKCAII(SAR)LMV). 提交 2016-01-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 D
687–707（21 aa）
片段：UNP residues 687-707
链 E
687–707（21 aa）
片段：UNP residues 687-707
链 F
687–707（21 aa）
片段：UNP residues 687-707
|
突变：V24C, G29C, G33Sar 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V24C, G29C, G33Sar 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V24C, G29C, G33Sar 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | JEF O-(O-(2-AMINOPROPYL)-O'-(2-METHOXYETHYL)POLYPROPYLENE GLYCOL 500) × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.1；296 K；0.1 M HEPES Buffer, 29% (v/v) Jeffamine M-600
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.250 |
| 5HOX X-ray crystallographic structure of an A-beta 17_36 beta-hairpin. Synchrotron data set. (LVFFAEDCGSNKCAII(SAR)LMV). 提交 2016-01-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 D
687–707（21 aa）
片段：UNP residues 687-707
链 E
687–707（21 aa）
片段：UNP residues 687-707
链 F
687–707（21 aa）
片段：UNP residues 687-707
|
突变：V24C, G29C, G33Sar 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V24C, G29C, G33Sar 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V24C, G29C, G33Sar 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | JEF O-(O-(2-AMINOPROPYL)-O'-(2-METHOXYETHYL)POLYPROPYLENE GLYCOL 500) × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.1；296 K；0.1 M HEPES Buffer, 29% (v/v) Jeffamine M-600
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.250 |
| 5HOX X-ray crystallographic structure of an A-beta 17_36 beta-hairpin. Synchrotron data set. (LVFFAEDCGSNKCAII(SAR)LMV). 提交 2016-01-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric |
链 A
687–707（21 aa）
片段：UNP residues 687-707
链 B
687–707（21 aa）
片段：UNP residues 687-707
链 C
687–707（21 aa）
片段：UNP residues 687-707
链 D
687–707（21 aa）
片段：UNP residues 687-707
链 E
687–707（21 aa）
片段：UNP residues 687-707
链 F
687–707（21 aa）
片段：UNP residues 687-707
|
突变：V24C, G29C, G33Sar 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V24C, G29C, G33Sar 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V24C, G29C, G33Sar 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V24C, G29C, G33Sar 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V24C, G29C, G33Sar 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V24C, G29C, G33Sar 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | JEF O-(O-(2-AMINOPROPYL)-O'-(2-METHOXYETHYL)POLYPROPYLENE GLYCOL 500) × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.1；296 K；0.1 M HEPES Buffer, 29% (v/v) Jeffamine M-600
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.250 |
| 5HOY X-ray crystallographic structure of an A-beta 17_36 beta-hairpin. X-ray diffractometer data set. (LVFFAEDCGSNKCAII(SAR)LMV). 提交 2016-01-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric |
链 A
687–707（21 aa）
片段：UNP residues 687-707
链 B
687–707（21 aa）
片段：UNP residues 687-707
链 C
687–707（21 aa）
片段：UNP residues 687-707
链 D
687–707（21 aa）
片段：UNP residues 687-707
链 E
687–707（21 aa）
片段：UNP residues 687-707
链 F
687–707（21 aa）
片段：UNP residues 687-707
|
突变：V24C, G29C, G33SAR 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V24C, G29C, G33SAR 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V24C, G29C, G33SAR 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V24C, G29C, G33SAR 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V24C, G29C, G33SAR 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V24C, G29C, G33SAR 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | JEF O-(O-(2-AMINOPROPYL)-O'-(2-METHOXYETHYL)POLYPROPYLENE GLYCOL 500) × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；296 K；0.1 M HEPES Buffer, 27% (v/v) Jeffamine M-600
|
分辨率 2.29 Å R-free 0.276 |
| 5HOY X-ray crystallographic structure of an A-beta 17_36 beta-hairpin. X-ray diffractometer data set. (LVFFAEDCGSNKCAII(SAR)LMV). 提交 2016-01-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
687–707（21 aa）
片段：UNP residues 687-707
链 B
687–707（21 aa）
片段：UNP residues 687-707
链 C
687–707（21 aa）
片段：UNP residues 687-707
|
突变：V24C, G29C, G33SAR 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V24C, G29C, G33SAR 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V24C, G29C, G33SAR 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；296 K；0.1 M HEPES Buffer, 27% (v/v) Jeffamine M-600
|
分辨率 2.29 Å R-free 0.276 |
| 5HOY X-ray crystallographic structure of an A-beta 17_36 beta-hairpin. X-ray diffractometer data set. (LVFFAEDCGSNKCAII(SAR)LMV). 提交 2016-01-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
687–707（21 aa）
片段：UNP residues 687-707
链 B
687–707（21 aa）
片段：UNP residues 687-707
链 C
687–707（21 aa）
片段：UNP residues 687-707
|
突变：V24C, G29C, G33SAR 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V24C, G29C, G33SAR 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V24C, G29C, G33SAR 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；296 K；0.1 M HEPES Buffer, 27% (v/v) Jeffamine M-600
|
分辨率 2.29 Å R-free 0.276 |
| 5HOY X-ray crystallographic structure of an A-beta 17_36 beta-hairpin. X-ray diffractometer data set. (LVFFAEDCGSNKCAII(SAR)LMV). 提交 2016-01-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 D
687–707（21 aa）
片段：UNP residues 687-707
链 E
687–707（21 aa）
片段：UNP residues 687-707
链 F
687–707（21 aa）
片段：UNP residues 687-707
|
突变：V24C, G29C, G33SAR 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V24C, G29C, G33SAR 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V24C, G29C, G33SAR 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | JEF O-(O-(2-AMINOPROPYL)-O'-(2-METHOXYETHYL)POLYPROPYLENE GLYCOL 500) × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；296 K；0.1 M HEPES Buffer, 27% (v/v) Jeffamine M-600
|
分辨率 2.29 Å R-free 0.276 |
| 5HOY X-ray crystallographic structure of an A-beta 17_36 beta-hairpin. X-ray diffractometer data set. (LVFFAEDCGSNKCAII(SAR)LMV). 提交 2016-01-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 D
687–707（21 aa）
片段：UNP residues 687-707
链 E
687–707（21 aa）
片段：UNP residues 687-707
链 F
687–707（21 aa）
片段：UNP residues 687-707
|
突变：V24C, G29C, G33SAR 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V24C, G29C, G33SAR 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V24C, G29C, G33SAR 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | JEF O-(O-(2-AMINOPROPYL)-O'-(2-METHOXYETHYL)POLYPROPYLENE GLYCOL 500) × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；296 K；0.1 M HEPES Buffer, 27% (v/v) Jeffamine M-600
|
分辨率 2.29 Å R-free 0.276 |
| 5KK3 Atomic Resolution Structure of Monomorphic AB42 Amyloid Fibrils 提交 2016-06-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric |
链 A
672–713（42 aa）
片段：residues 672-713
链 B
672–713（42 aa）
片段：residues 672-713
链 C
672–713（42 aa）
片段：residues 672-713
链 D
672–713（42 aa）
片段：residues 672-713
链 E
672–713（42 aa）
片段：residues 672-713
链 F
672–713（42 aa）
片段：residues 672-713
链 G
672–713（42 aa）
片段：residues 672-713
链 H
672–713（42 aa）
片段：residues 672-713
链 I
672–713（42 aa）
片段：residues 672-713
链 J
672–713（42 aa）
片段：residues 672-713
链 K
672–713（42 aa）
片段：residues 672-713
链 L
672–713（42 aa）
片段：residues 672-713
链 M
672–713（42 aa）
片段：residues 672-713
链 N
672–713（42 aa）
片段：residues 672-713
链 O
672–713（42 aa）
片段：residues 672-713
链 P
672–713（42 aa）
片段：residues 672-713
链 Q
672–713（42 aa）
片段：residues 672-713
链 R
672–713（42 aa）
片段：residues 672-713
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLID-STATE NMR
NMR测量条件
pH 8；277 K；离子强度（mmCIF原始值）1；压力 1
NMR样品组成
1 mg/uL [U-100% 13C; U-100% 15N] AB42-M01-42, 20 mM sodium phosphate, 0.2 mM EDTA, 0.02 % sodium azide, 100% H2O | 100% H2O
NMR样品组成
1 mg/uL [U-30% 13C; U-30% 15N] AB42-M01-42, 20 mM sodium phosphate, 0.2 mM EDTA, 0.02 % sodium azide, 100% H2O | 100% H2O
NMR样品组成
1 mg/uL [1,6-13C-glucose, U-100% 15N] AB42-M01-42, 20 mM sodium phosphate, 0.2 mM EDTA, 0.02 % sodium azide, 100% H2O | 100% H2O
NMR样品组成
1 mg/uL [2-13C-glycerol, U-100% 15N] AB42-M01-42, 20 mM sodium phosphate, 0.2 mM EDTA, 0.02 % sodium azide, 100% H2O | 100% H2O
|
分辨率未提供 |
| 5MYO Structure of Pyroglutamate-Abeta-specific Fab c#6 in complex with human Abeta-pE3-12-PEGb 提交 2017-01-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 E
674–683（10 aa）
片段：UNP residues 674-683
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；286 K；25.5% w/v PEG 4000
15% glycerol
170 mM ammonium sulfate
|
分辨率 1.59 Å R-free 0.215 |
| 5NX1 Combinatorial Engineering of Proteolytically Resistant APPI Variants that Selectively Inhibit Human Kallikrein 6 for Cancer Therapy 提交 2017-05-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 B
289–301（13 aa）
片段：UNP residues 289-301
链 C
289–346（58 aa）
片段：UNP residues 289-346
链 D
302–346（45 aa）
片段：UNP residues 302-346
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；0.2M Ammonium Sulfate, 0.1M Bis-Tris pH 5.5, 25% Polyethylene Glycol 3350
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.226 |
| 5NX3 Combinatorial Engineering of Proteolytically Resistant APPI Variants that Selectively Inhibit Human Kallikrein 6 for Cancer Therapy 提交 2017-05-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 B
289–301（13 aa）
片段：Inhibitor domain, UNP Residues 294-346
链 C
289–346（58 aa）
片段：Inhibitor domain, UNP Residues 289-346
链 D
306–346（41 aa）
片段：Inhibitor domain, UNP Residues 306-346
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M tri-Na Citrate pH 5.6, 20% 2-propanol , 20% Polyethylene Glycol 4000
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.226 |
| 5OQV Near-atomic resolution fibril structure of complete amyloid-beta(1-42) by cryo-EM 提交 2017-08-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric |
链 A
672–713（42 aa）
链 B
672–713（42 aa）
链 C
672–713（42 aa）
链 D
672–713（42 aa）
链 E
672–713（42 aa）
链 F
672–713（42 aa）
链 G
672–713（42 aa）
链 H
672–713（42 aa）
链 I
672–713（42 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 2；in water
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；2.5 microL sample was applied to the grid, blotted for 2.5 s before plunging.
|
分辨率 4.00 Å |
| 5TXD Structure of amyloid-beta derived peptide - NKGAIF 提交 2016-11-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 Z
698–703（6 aa）
片段：unp residues 698-703
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；298 K；reservoir contained 20% PEG 3350, 0.2M Potassium Phosphate dibasic
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.191 |
| 5VZY Crystal structure of crenezumab Fab in complex with Abeta 提交 2017-05-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
682–696（15 aa）
片段：UNP residues 682-696
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M magnesium chloride hexahydrate, 0.1 M Tris hydrochloride pH 8.5, 30% w/v polyethylene glycol 4000
|
分辨率 2.32 Å R-free 0.249 |
| 5W3P ANTIBODY C706 IN COMPLEX WTH BETA-AMYLOID PEPTIDE 1-16 提交 2017-06-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 P
671–688（18 aa）
片段：RESIDUES 1-16
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 4 GOL GLYCEROL × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；293 K；2.0 M AMMONIUM SULFATE, 0.1 M SODIUM ACETATE, PH 4.5
|
分辨率 1.92 Å R-free 0.236 |
| 6GFI Structure of Human Mesotrypsin in complex with APPI variant T11V/M17R/I18F/F34V 提交 2018-04-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 E
294–346（53 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M Sodium Chloride, 0.1M Bis-Tris pH 6.8 , 1.42M Ammonium Sulfate
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.301 |
| 6GFI Structure of Human Mesotrypsin in complex with APPI variant T11V/M17R/I18F/F34V 提交 2018-04-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 C
294–346（53 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M Sodium Chloride, 0.1M Bis-Tris pH 6.8 , 1.42M Ammonium Sulfate
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.301 |
| 6IYC Recognition of the Amyloid Precursor Protein by Human gamma-secretase 提交 2018-12-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 E
688–770（83 aa）
片段：C83
|
突变：V8C | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 PC1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 2 CLR CHOLESTEROL × 3 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.60 Å |
| 6NB9 Amyloid-Beta (20-34) with L-isoaspartate 23 提交 2018-12-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
691–705（15 aa）
片段：residues 20-34
|
突变：L-isoaspartate 23 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 |
ELECTRON CRYSTALLOGRAPHY
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
X-ray结晶条件
BATCH；pH 7.6；310 K；0.05M Tris-HCl, 0.15M NaCl, 1% DMSO
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.246 |
| 6O4J Amyloid Beta KLVFFAENVGS 16-26 D23N Iowa mutation 提交 2019-02-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric |
链 A
687–697（11 aa）
片段：UNP residues 687-697
链 B
687–697（11 aa）
片段：UNP residues 687-697
|
突变：D23N 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：D23N 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 |
ELECTRON CRYSTALLOGRAPHY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
X-ray结晶条件
UNSPECIFIED
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.283 |
| 6OC9 S8 phosphorylated beta amyloid 40 fibrils 提交 2019-03-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
653–692（40 aa）
片段：residues 616-655
链 B
653–692（40 aa）
片段：residues 616-655
链 C
653–692（40 aa）
片段：residues 616-655
链 D
653–692（40 aa）
片段：residues 616-655
链 E
653–692（40 aa）
片段：residues 616-655
链 F
653–692（40 aa）
片段：residues 616-655
链 G
653–692（40 aa）
片段：residues 616-655
链 H
653–692（40 aa）
片段：residues 616-655
链 I
653–692（40 aa）
片段：residues 616-655
链 J
653–692（40 aa）
片段：residues 616-655
|
未记录 | 2PO PHOSPHONATE × 10 |
SOLID-STATE NMR
NMR测量条件
pH 7.4；280 K；离子强度（mmCIF原始值）10；压力 1
NMR样品组成
50 uM 13C, 15N-uniformly labeled E3, G9, V18, F20, D23, S26, K28 beta amyloid peptide, 50 uM 13C, 15N-uniformly labeled A2, F4, D7, Y10, V24, G25 beta amyloid peptide, 50 uM 13C, 15N-uniformly labeled Q15, F19, A21, I31, L34, V36, G37 beta amyloid peptide, 50 uM 13C, 15N-uniformly labeled V12, E22, G29, A30, M35 beta amyloid peptide, 50 uM 13C, 15N-uniformly labeled E11, L17, N27, I32, G33, G38, V39 beta amyloid peptide, 50 uM 13C, 15N-uniformly labeled F19, L34 beta amyloid peptide, 50 uM 13C, 15N-uniformly labeled E3, F4, V24, G25, S26 beta amyloid peptide, 50 uM 13C, 15N-uniformly labeled V12, F20, E22 beta amyloid peptide, 50 uM 13C, 15N-uniformly labeled I31, G33, V39 beta amyloid peptide, water | water
NMR样品组成
50 uM 2H labeled L17, 2H-CD3 beta amyloid peptide, 50 uM 2H labeled F19, 2H-ring-D5 beta amyloid peptide, 50 2H labeled uM L34, 2H-CD3 beta amyloid peptide, 50 uM 2H labeled M35, 2H-CD3 beta amyloid peptide, 50 uM 2H labeled V36, 2H-CD3 beta amyloid peptide, water | water
NMR样品组成
50 uM 13C selective labeled A2-CH3, V12-CO beta amyloid peptide, 50 uM 13C selective labeled V18-CO, A21-CH3 beta amyloid peptide, 50 uM 13C selective labeled V24-CO, A30-CH3 beta amyloid peptide, 50 uM 13C selective labeled G33-CO, V39-Ca beta amyloid peptide, 50 uM 13C selective labeled V36-Ca, G38-CO beta amyloid peptide, 50 uM 13C selective labeled G9-CO beta amyloid peptide, water | water
|
分辨率未提供 |
| 6RHY Structure of pore-forming amyloid-beta tetramers 提交 2019-04-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 A
672–713（42 aa）
链 B
672–713（42 aa）
链 C
672–713（42 aa）
链 D
672–713（42 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 8.5；310.15 K；压力 1
NMR测量条件
pH 9.5；310.15 K；压力 1
NMR样品组成
1 mM [U-15N] Amyloid-beta A4 protein, 10 mM [U-2H] TRIS-d11, 28.5 mM [U-2H] DPC-d38, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1 mM [U-13C; U-15N; U-2H] Amyloid-beta A4 protein, 10 mM [U-2H] TRIS-d11, 28.5 mM [U-2H] DPC-d38, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1 mM [U-2H,13C,15N]-Ile-[13CH3]d1, Ala-[13CH3], Leu/Val-[13CH3]proR Amyloid-beta A4 protein, 10 mM [U-2H] TRIS-d11, 28.5 mM [U-2H] DPC-d38, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1 mM [U-2H,15N]-Ile-[13CH3]d1, Ala-[13CH3], Leu/Val-[13CH3]proR Amyloid-beta A4 protein, 10 mM [U-2H] TRIS-d11, 28.5 mM [U-2H] DPC-d38, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 6SHS Abeta fibril (Morphology I) 提交 2019-08-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric |
链 A
616–655（40 aa）
链 B
616–655（40 aa）
链 C
616–655（40 aa）
链 D
616–655（40 aa）
链 E
616–655（40 aa）
链 F
616–655（40 aa）
链 G
616–655（40 aa）
链 H
616–655（40 aa）
链 I
616–655（40 aa）
链 J
616–655（40 aa）
链 K
616–655（40 aa）
链 L
616–655（40 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.40 Å |
| 6SZF Solution structure of the amyloid beta-peptide (1-42) 提交 2019-10-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
672–713（42 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 5.4；300 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 ambient
NMR样品组成
0.5 mM Amyloid beta-peptide (1-42), 50% H2O/50% HFIP | 50% H2O/50% HFIP
|
分辨率未提供 |
| 6TI5 A New Structural Model of Abeta(1-40) Fibrils 提交 2019-11-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric |
链 A
616–655（40 aa）
链 B
616–655（40 aa）
链 C
616–655（40 aa）
链 D
616–655（40 aa）
链 E
616–655（40 aa）
链 F
616–655（40 aa）
链 G
616–655（40 aa）
链 H
616–655（40 aa）
链 I
616–655（40 aa）
链 J
616–655（40 aa）
链 K
616–655（40 aa）
链 L
616–655（40 aa）
链 M
616–655（40 aa）
链 N
616–655（40 aa）
链 O
616–655（40 aa）
链 P
616–655（40 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLID-STATE NMR
NMR测量条件
pH 8.5；283 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 1
NMR样品组成
100 uM [U-100% 13C; U-100% 15N] Amyloid beta peptide 1-40, 50 mM ammonium acetate, H2O | H2O
|
分辨率未提供 |
| 6TI6 Mixing Abeta(1-40) and Abeta(1-42) peptides generates unique amyloid fibrils 提交 2019-11-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric |
链 A
616–655（40 aa）
链 B
598–639（42 aa）
链 C
616–655（40 aa）
链 D
598–639（42 aa）
链 E
616–655（40 aa）
链 F
598–639（42 aa）
链 G
616–655（40 aa）
链 H
598–639（42 aa）
链 I
616–655（40 aa）
链 J
598–639（42 aa）
链 K
616–655（40 aa）
链 L
598–639（42 aa）
链 M
616–655（40 aa）
链 N
598–639（42 aa）
链 O
616–655（40 aa）
链 P
598–639（42 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLID-STATE NMR
NMR测量条件
pH 8.5；283 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 1
NMR样品组成
50 uM [U-100% 13C; U-100% 15N] Amyloid-beta peptide 1-40, 50 uM Amyloid-beta peptide 1-42, 50 mM ammonium acetate, H2O | H2O
NMR样品组成
70 uM [U-100% 13C; U-100% 15N] Amyloid-beta peptide 1-40, 30 uM Amyloid-beta peptide 1-42, 50 mM ammonium acetate, H2O | H2O
NMR样品组成
50 uM Amyloid-beta peptide 1-40, 50 uM [U-100% 13C; U-100% 15N] Amyloid-beta peptide 1-42, 50 mM ammonium acetate, H2O | H2O
NMR样品组成
50 uM [U-100% 13C] Amyloid-beta peptide 1-40, 50 uM [U-100% 15N] Amyloid-beta peptide 1-42, 50 mM ammonium acetate, H2O | H2O
|
分辨率未提供 |
| 6TI7 Mixing Abeta(1-40) and Abeta(1-42) peptides generates unique amyloid fibrils 提交 2019-11-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric |
链 A
616–655（40 aa）
链 B
598–639（42 aa）
链 C
616–655（40 aa）
链 D
598–639（42 aa）
链 E
616–655（40 aa）
链 F
598–639（42 aa）
链 G
616–655（40 aa）
链 H
598–639（42 aa）
链 I
598–639（42 aa）
链 J
616–655（40 aa）
链 K
598–639（42 aa）
链 L
616–655（40 aa）
链 M
598–639（42 aa）
链 N
616–655（40 aa）
链 O
598–639（42 aa）
链 P
616–655（40 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLID-STATE NMR
NMR测量条件
pH 8.5；283 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 1
NMR样品组成
50 uM [U-100% 13C; U-100% 15N] Amyloid-beta peptide 1-40, 50 uM Amyloid-beta peptide 1-42, 50 mM ammonium acetate, H2O | H2O
NMR样品组成
70 uM [U-100% 13C; U-100% 15N] Amyloid-beta peptide 1-40, 30 uM Amyloid-beta peptide 1-42, 50 mM ammonium acetate, H2O | H2O
NMR样品组成
50 uM Amyloid-beta peptide 1-40, 50 uM [U-100% 13C; U-100% 15N] Amyloid-beta peptide 1-42, 50 mM ammonium acetate, H2O | H2O
NMR样品组成
50 uM [U-100% 13C] Amyloid-beta peptide 1-40, 50 uM [U-100% 15N] Amyloid-beta peptide 1-42, 50 mM ammonium acetate, H2O | H2O
|
分辨率未提供 |
| 6W0O Amyloid-beta(1-40) fibril derived from Alzheimer's disease cortical tissue 提交 2020-03-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 1
653–692（40 aa）
片段：UNP residues 653-692
链 2
653–692（40 aa）
片段：UNP residues 653-692
链 3
653–692（40 aa）
片段：UNP residues 653-692
链 4
653–692（40 aa）
片段：UNP residues 653-692
链 5
653–692（40 aa）
片段：UNP residues 653-692
链 6
653–692（40 aa）
片段：UNP residues 653-692
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
实验方法未声明
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；10 mM phosphate buffer with 0.01% NaN3 to avoid microbial contamination. Buffers were filtered to avoid contamination.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；The grids were preblotted for 10 seconds and blotted for 6 seconds before plunging.
NMR测量条件
pH 7.4；297 K；离子强度（mmCIF原始值）10；压力 1
NMR样品组成
100 uM U-15N,13C amyloid-beta(1-40), phosphate buffer | phosphate buffer
|
分辨率 2.77 Å |
| 6WXM X-ray crystallographic structure of a beta-hairpin peptide derived from amyloid beta 16-36 提交 2020-05-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 A
685–706（22 aa）
链 B
685–706（22 aa）
链 C
685–706（22 aa）
链 D
685–706（22 aa）
链 E
685–706（22 aa）
链 F
685–706（22 aa）
链 G
685–706（22 aa）
链 H
685–706（22 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | HEZ HEXANE-1,6-DIOL × 7 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；296.15 K；0.1 M sodium acetate (pH 5.0), 0.1 M CoCl2, 1.1 M 1,6-hexanediol
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.218 |
| 6WXM X-ray crystallographic structure of a beta-hairpin peptide derived from amyloid beta 16-36 提交 2020-05-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 I
685–706（22 aa）
链 J
685–706（22 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | HEZ HEXANE-1,6-DIOL × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；296.15 K；0.1 M sodium acetate (pH 5.0), 0.1 M CoCl2, 1.1 M 1,6-hexanediol
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.218 |
| 6WXM X-ray crystallographic structure of a beta-hairpin peptide derived from amyloid beta 16-36 提交 2020-05-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric |
链 I
685–706（22 aa）
链 J
685–706（22 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | HEZ HEXANE-1,6-DIOL × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；296.15 K；0.1 M sodium acetate (pH 5.0), 0.1 M CoCl2, 1.1 M 1,6-hexanediol
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.218 |
| 6WXM X-ray crystallographic structure of a beta-hairpin peptide derived from amyloid beta 16-36 提交 2020-05-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 K
685–706（22 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；296.15 K；0.1 M sodium acetate (pH 5.0), 0.1 M CoCl2, 1.1 M 1,6-hexanediol
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.218 |
| 6XOV CryoEM structure of human presequence protease in partial closed state 1 提交 2020-07-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 B
653–692（40 aa）
片段：UNP residues 653-692
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.7；20 mM Tris, pH 7.7, 150 mM NaCl, 10mM KCl, 20 mM EDTA and 1 mM 2-mercaptoethanol
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 6YHF Solution NMR Structure of APP TMD 提交 2020-03-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
697–726（30 aa）
片段：Amyloid precursor protein transmembrane domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 ambient
NMR样品组成
500 uM APP WT, 80% TFE-d2, 20% H2O | 80% TFE-d2, 20% H2O
|
分辨率未提供 |
| 6YHI Solution NMR Structure of APP G38L mutant TMD 提交 2020-03-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
697–726（30 aa）
片段：Amyloid precursor protein transmembrane domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 ambient
NMR样品组成
500 uM APP G38L, 80% TFE-d2, 20% H2O | 80% TFE-d2, 20% H2O
|
分辨率未提供 |
| 6YHO Solution NMR Structure of APP G38P mutant TM 提交 2020-03-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
697–726（30 aa）
片段：Amyloid precursor protein transmembrane domain
|
突变：G38P | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 ambient
NMR样品组成
500 uM APP G38P, 80% TFE-d2, 20% H2O | 80% TFE-d2, 20% H2O
|
分辨率未提供 |
| 6YHP Solution NMR Structure of APP V44M mutant TMD 提交 2020-03-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
697–726（30 aa）
片段：Amyloid precursor protein transmembrane domain
|
突变：V44M | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 ambient
NMR样品组成
500 uM APP V44M, 80% TFE-d2, 20% H2O | 80% TFE-d2, 20% H2O
|
分辨率未提供 |
| 6YHX Solution NMR Structure of APP I45T mutant TMD 提交 2020-03-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
697–726（30 aa）
片段：Amyloid precursor protein transmembrane domain
|
突变：I45T | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 ambient
NMR样品组成
500 uM APP I45T, 80% TFE-d2, 20% H2O | 80% TFE-d2, 20% H2O
|
分辨率未提供 |
| 7B3J Dynamic complex between all-D-enantiomeric peptide D3 with wild-type amyloid precursor protein 672-726 fragment (amyloid beta 1-55) 提交 2020-12-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
579–633（55 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.9；303 K；离子强度（mmCIF原始值）20；压力 1
NMR样品组成
0.2 mM [U-13C; U-15N] APP672-726, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.2 mM [U-13C; U-15N] APP672-726, 0.2 mM D3cys(MTSL), 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.2 mM [U-13C; U-15N] APP672-726, 0.2 mM (MTSL)cysD3, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 7B3K Dynamic complex between all-D-enantiomeric peptide D3 with L723P mutant of amyloid precursor protein (APP) 672-726 fragment (amyloid beta 1-55) 提交 2020-12-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
579–633（55 aa）
|
突变：V52P | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.9；303 K；离子强度（mmCIF原始值）20；压力 1
NMR样品组成
0.2 mM [U-13C; U-15N] APP_L723P_672-726, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.2 mM [U-13C; U-15N] APP_L723P_672-726, 0.2 mM D3cys(MTSL), 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 7JXN Beta hairpin derived from Abeta17-36 with an F20Cha mutation 提交 2020-08-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
686–706（21 aa）
链 D
686–706（21 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CL CHLORIDE ION × 2 NA SODIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；297.15 K；Bis-Tris buffer, ammonium acetate, and methyl-2,4-pentanediol
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.301 |
| 7JXN Beta hairpin derived from Abeta17-36 with an F20Cha mutation 提交 2020-08-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 B
686–706（21 aa）
链 C
686–706（21 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；297.15 K；Bis-Tris buffer, ammonium acetate, and methyl-2,4-pentanediol
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.301 |
| 7JXO Triangular trimer of beta-hairpins derived from Abeta17-36 with an F20Cha mutation 提交 2020-08-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric |
链 A
686–706（21 aa）
链 B
686–706（21 aa）
链 C
686–706（21 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；297.15 K；Tris buffer, MgCl2, and 1,6-hexanediol
|
分辨率 2.81 Å R-free 0.320 |
| 7O1Q Amyloid beta oligomer displayed on the alpha hemolysin scaffold 提交 2021-03-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric |
链 A
672–713（42 aa）
链 B
672–713（42 aa）
链 C
672–713（42 aa）
链 D
672–713（42 aa）
链 E
672–713（42 aa）
链 F
672–713（42 aa）
链 G
672–713（42 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8；50 mM Tris-HCl, pH 8.0, 500 mM NaCl, 250 mM imidazole and 0.38 mM DDM
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 7OW1 Crystal Structure of TAP01 in complex with amyloid beta peptide 提交 2021-06-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
674–685（12 aa）
片段：UNP residues 674-683
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | FLC CITRATE ANION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；20% PEG3350
0.2 M ammonium citrate
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.200 |
| 7OXN Crystal Structure of TAP01 in complex with cyclised amyloid beta peptide 提交 2021-06-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
672–685（14 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 ZN ZINC ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；292 K；20% PEG 6K
0.1 M HEPES, pH 7.0
0.01 M zinc chloride
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.265 |
| 7Q4B Type I beta-amyloid 42 Filaments from Human Brain 提交 2021-10-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
672–713（42 aa）
链 B
672–713（42 aa）
链 C
672–713（42 aa）
链 D
672–713（42 aa）
链 E
672–713（42 aa）
链 F
672–713（42 aa）
链 G
672–713（42 aa）
链 H
672–713（42 aa）
链 I
672–713（42 aa）
链 R
672–713（42 aa）
|
未记录 | UNX UNKNOWN LIGAND × 10 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.50 Å |
| 7Q4M Type II beta-amyloid 42 Filaments from Human Brain 提交 2021-11-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
672–713（42 aa）
链 B
672–713（42 aa）
链 C
672–713（42 aa）
链 D
672–713（42 aa）
链 E
672–713（42 aa）
链 F
672–713（42 aa）
链 G
672–713（42 aa）
链 H
672–713（42 aa）
链 I
672–713（42 aa）
链 J
672–713（42 aa）
|
未记录 | UNX UNKNOWN LIGAND × 10 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 7RTZ X-ray crystallographic structure of a beta-hairpin peptide derived from amyloid beta 14-40 提交 2021-08-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 A
682–711（30 aa）
链 B
682–711（30 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CL CHLORIDE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；296.15 K；0.2 M magnesium acetate tetrahydrate, 0.1 M sodium cacodylate trihydrate pH 6.5, and 30% (v/v) 2-methyl-2,4-pentanediol
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.293 |
| 7U4P Covalently stabilized triangular trimer composed of Abeta17-36 beta-hairpins 提交 2022-02-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric |
链 A
687–707（21 aa）
链 B
687–707（21 aa）
链 C
687–707（21 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298.15 K；0.1 M Tris at pH 8.3, 0.2 M MgCl2, 2.8 M 1,6-hexanediol
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.247 |
| 7Y8Q Amyloid-beta assemblage on GM1-containing membranes 提交 2022-06-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 A
672–711（40 aa）
链 B
672–711（40 aa）
链 C
672–711（40 aa）
链 D
672–711（40 aa）
链 E
672–711（40 aa）
链 F
672–711（40 aa）
链 G
672–711（40 aa）
链 H
672–711（40 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLID-STATE NMR
NMR测量条件
pH 7.4；288 K；离子强度（mmCIF原始值）5；压力 1
NMR样品组成
1 mM [U-13C; U-15N] Amyloid beta(1-40), 8 mM GM1, 2 mM DMPC, none | none
|
分辨率未提供 |
| 8AZS Type I amyloid-beta 42 filaments from high-spin supernatants of aqueous extracts from Alzheimer's disease brains | ABeta42 提交 2022-09-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 H
672–713（42 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 8AZT Type II amyloid-beta 42 filaments from high-spin supernatants of aqueous extracts from Alzheimer's disease brains | ABeta42 提交 2022-09-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 B
672–713（42 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 8BFA Sarkosyl-extracted AppNL-G-F Abeta42 fibril structure 提交 2022-10-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
672–713（42 aa）
链 B
672–713（42 aa）
链 C
672–713（42 aa）
链 D
672–713（42 aa）
链 E
672–713（42 aa）
链 F
672–713（42 aa）
链 G
672–713（42 aa）
链 H
672–713（42 aa）
链 I
672–713（42 aa）
链 J
672–713（42 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；6s blot
|
分辨率 3.00 Å |
| 8BFB Sarkosyl-extracted AppNL-G-F Abeta42 fibril structure (Methoxy-X04-labelled mice) 提交 2022-10-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
672–713（42 aa）
链 B
672–713（42 aa）
链 C
672–713（42 aa）
链 D
672–713（42 aa）
链 E
672–713（42 aa）
链 F
672–713（42 aa）
链 G
672–713（42 aa）
链 H
672–713（42 aa）
链 I
672–713（42 aa）
链 J
672–713（42 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；6s blot
|
分辨率 3.20 Å |
| 8BFZ Amyloid-beta 42 filaments extracted from the human brain with Arctic mutation (E22G) of Alzheimer's disease | ABeta42 提交 2022-10-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
672–713（42 aa）
链 B
672–713（42 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 8BG0 Amyloid-beta tetrameric filaments with the Arctic mutation (E22G) from Alzheimer's disease brains | ABeta40 提交 2022-10-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric |
链 A
616–655（40 aa）
链 B
616–655（40 aa）
链 C
616–655（40 aa）
链 D
616–655（40 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 1.99 Å |
| 8C3H Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex a long aspartimide degron peptide 提交 2022-12-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 D
763–770（8 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ZN ZINC ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；274 K；0.5 M (NH4)H2PO4
|
分辨率 1.71 Å R-free 0.210 |
| 8C3H Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex a long aspartimide degron peptide 提交 2022-12-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric |
链 E
763–770（8 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ZN ZINC ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；274 K；0.5 M (NH4)H2PO4
|
分辨率 1.71 Å R-free 0.210 |
| 8EZD Brain-derived 42-residue amyloid-beta fibril type A 提交 2022-10-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 A
672–713（42 aa）
片段：residues 672-713
链 B
672–713（42 aa）
片段：residues 672-713
链 C
672–713（42 aa）
片段：residues 672-713
链 D
672–713（42 aa）
片段：residues 672-713
链 E
672–713（42 aa）
片段：residues 672-713
链 F
672–713（42 aa）
片段：residues 672-713
链 G
672–713（42 aa）
片段：residues 672-713
链 H
672–713（42 aa）
片段：residues 672-713
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；10mM Na-phosphate, 0.1% sodium azide
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Preblot for 12-13 seconds and blot for 2.5-3.0 seconds before plunging
|
分辨率 2.83 Å |
| 8EZE Brain-derived 42-residue amyloid-beta fibril type B 提交 2022-10-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 A
672–713（42 aa）
片段：residues 672-713
链 B
672–713（42 aa）
片段：residues 672-713
链 C
672–713（42 aa）
片段：residues 672-713
链 D
672–713（42 aa）
片段：residues 672-713
链 E
672–713（42 aa）
片段：residues 672-713
链 F
672–713（42 aa）
片段：residues 672-713
链 G
672–713（42 aa）
片段：residues 672-713
链 H
672–713（42 aa）
片段：residues 672-713
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；10mM Na-phosphate, 0.1% sodium azide
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Preblot for 12-13 seconds and blot for 2.5-3.0 seconds before plunging
|
分辨率 2.76 Å |
| 8FF2 Amyloid-beta (1-40) fibrils derived from a CAA patient 提交 2022-12-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
653–692（40 aa）
片段：UNP residues 653-692
链 B
653–692（40 aa）
片段：UNP residues 653-692
链 C
653–692（40 aa）
片段：UNP residues 653-692
链 D
653–692（40 aa）
片段：UNP residues 653-692
链 E
653–692（40 aa）
片段：UNP residues 653-692
链 F
653–692（40 aa）
片段：UNP residues 653-692
链 G
653–692（40 aa）
片段：UNP residues 653-692
链 I
653–692（40 aa）
片段：UNP residues 653-692
链 J
653–692（40 aa）
片段：UNP residues 653-692
链 K
653–692（40 aa）
片段：UNP residues 653-692
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.87 Å |
| 8FF3 Amyloid-beta (1-40) fibrils derived from familial Dutch-type CAA patient (population B) 提交 2022-12-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
653–692（40 aa）
片段：UNP residues 653-692
链 B
653–692（40 aa）
片段：UNP residues 653-692
链 C
653–692（40 aa）
片段：UNP residues 653-692
链 a
653–692（40 aa）
片段：UNP residues 653-692
链 b
653–692（40 aa）
片段：UNP residues 653-692
链 c
653–692（40 aa）
片段：UNP residues 653-692
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.09 Å |
| 8KEW The cryo-EM structure of type1 amyloid beta 42 fibril. 提交 2023-08-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–770（770 aa）
链 B
1–770（770 aa）
链 C
1–770（770 aa）
链 D
1–770（770 aa）
链 F
1–770（770 aa）
链 G
1–770（770 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 8KF1 The cryo-EM structure of AV-45 bound type1 amyloid beta 42 fibril. 提交 2023-08-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric |
链 A
1–770（770 aa）
链 B
1–770（770 aa）
链 C
1–770（770 aa）
链 D
1–770（770 aa）
链 E
1–770（770 aa）
链 F
1–770（770 aa）
链 G
1–770（770 aa）
链 H
1–770（770 aa）
链 I
1–770（770 aa）
链 J
1–770（770 aa）
链 K
1–770（770 aa）
链 L
1–770（770 aa）
|
未记录 | VW6 4-[2-[6-[2-[2-(2-fluoranylethoxy)ethoxy]ethoxy]pyridin-3-yl]ethyl]-~{N}-methyl-aniline × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 8KF3 The cryo-EM structure of type3 amyloid beta 42 fibril. 提交 2023-08-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric |
链 A
1–770（770 aa）
链 B
1–770（770 aa）
链 C
1–770（770 aa）
链 D
1–770（770 aa）
链 E
1–770（770 aa）
链 F
1–770（770 aa）
链 G
1–770（770 aa）
链 H
1–770（770 aa）
链 I
1–770（770 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 8KF4 The cryo-EM structure of type1 amyloid beta 42 fibril in AD2 patient. 提交 2023-08-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–770（770 aa）
链 B
1–770（770 aa）
链 C
1–770（770 aa）
链 D
1–770（770 aa）
链 E
1–770（770 aa）
链 F
1–770（770 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8KF5 The cryo-EM structure of type1 amyloid beta 42 fibril in AD3. 提交 2023-08-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–770（770 aa）
链 B
1–770（770 aa）
链 C
1–770（770 aa）
链 D
1–770（770 aa）
链 E
1–770（770 aa）
链 F
1–770（770 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 8KF6 The cryo-EM structure of AV-45 bound type3 amyloid beta 42 fibril. 提交 2023-08-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric |
链 A
1–770（770 aa）
链 B
1–770（770 aa）
链 C
1–770（770 aa）
链 D
1–770（770 aa）
链 E
1–770（770 aa）
链 F
1–770（770 aa）
链 G
1–770（770 aa）
链 H
1–770（770 aa）
链 I
1–770（770 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 8OL2 Murine type II Abeta fibril from APP23 mouse 提交 2023-03-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
672–713（42 aa）
链 B
672–713（42 aa）
链 C
672–713（42 aa）
链 D
672–713（42 aa）
链 E
672–713（42 aa）
链 F
672–713（42 aa）
链 G
672–713（42 aa）
链 H
672–713（42 aa）
链 I
672–713（42 aa）
链 J
672–713（42 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8OL3 Murine type III Abeta fibril from APP/PS1 mouse 提交 2023-03-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
672–713（42 aa）
链 B
672–713（42 aa）
链 C
672–713（42 aa）
链 D
672–713（42 aa）
链 E
672–713（42 aa）
链 F
672–713（42 aa）
链 G
672–713（42 aa）
链 H
672–713（42 aa）
链 I
672–713（42 aa）
链 J
672–713（42 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 8OL5 Murine type II Abeta fibril from ARTE10 mouse 提交 2023-03-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
672–713（42 aa）
链 B
672–713（42 aa）
链 C
672–713（42 aa）
链 D
672–713（42 aa）
链 E
672–713（42 aa）
链 F
672–713（42 aa）
链 G
672–713（42 aa）
链 H
672–713（42 aa）
链 I
672–713（42 aa）
链 J
672–713（42 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 8OL6 Murine type II Abeta fibril from tgAPPSwe mouse 提交 2023-03-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
672–713（42 aa）
链 B
672–713（42 aa）
链 C
672–713（42 aa）
链 D
672–713（42 aa）
链 E
672–713（42 aa）
链 F
672–713（42 aa）
链 G
672–713（42 aa）
链 H
672–713（42 aa）
链 I
672–713（42 aa）
链 J
672–713（42 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 8OL7 MurineArc type I Abeta fibril from tg-APPArcSwe mouse 提交 2023-03-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
672–713（42 aa）
链 B
672–713（42 aa）
链 C
672–713（42 aa）
链 D
672–713（42 aa）
链 E
672–713（42 aa）
链 F
672–713（42 aa）
链 G
672–713（42 aa）
链 H
672–713（42 aa）
链 I
672–713（42 aa）
链 J
672–713（42 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8OLG DI2 Abeta fibril from tg-SwDI mouse 提交 2023-03-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 A
672–713（42 aa）
链 B
672–713（42 aa）
链 C
672–713（42 aa）
链 D
672–713（42 aa）
链 E
672–713（42 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.20 Å |
| 8OLN DI1 Abeta fibril from tg-SwDI mouse 提交 2023-03-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
672–713（42 aa）
链 B
672–713（42 aa）
链 C
672–713（42 aa）
链 D
672–713（42 aa）
链 E
672–713（42 aa）
链 F
672–713（42 aa）
链 G
672–713（42 aa）
链 H
672–713（42 aa）
链 I
672–713（42 aa）
链 J
672–713（42 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 8OLO Murine type III Abeta fibril from ARTE10 mouse 提交 2023-03-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
672–713（42 aa）
链 B
672–713（42 aa）
链 C
672–713（42 aa）
链 D
672–713（42 aa）
链 E
672–713（42 aa）
链 F
672–713（42 aa）
链 G
672–713（42 aa）
链 H
672–713（42 aa）
链 I
672–713（42 aa）
链 J
672–713（42 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 8OLQ DI3 Abeta fibril from tg-SwDI mouse 提交 2023-03-30 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 A
672–713（42 aa）
链 B
672–713（42 aa）
链 C
672–713（42 aa）
链 D
672–713（42 aa）
链 E
672–713（42 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.00 Å |
| 8OTF Ab typeII filament from Guam ALS/PDC 提交 2023-04-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–770（770 aa）
链 B
1–770（770 aa）
链 C
1–770（770 aa）
链 D
1–770（770 aa）
链 E
1–770（770 aa）
链 F
1–770（770 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 8SEJ Type I beta-amyloid 42 Filaments from Down syndrome 提交 2023-04-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
680–713（34 aa）
链 B
680–713（34 aa）
链 C
680–713（34 aa）
链 D
680–713（34 aa）
链 E
680–713（34 aa）
链 F
680–713（34 aa）
链 G
680–713（34 aa）
链 H
680–713（34 aa）
链 I
680–713（34 aa）
链 J
680–713（34 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.17 Å |
| 8SEK Type IIIa beta-amyloid 40 Filaments from Down syndrome 提交 2023-04-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
672–711（40 aa）
链 B
672–711（40 aa）
链 C
672–711（40 aa）
链 D
672–711（40 aa）
链 E
672–711（40 aa）
链 F
672–711（40 aa）
链 G
672–711（40 aa）
链 H
672–711（40 aa）
链 I
672–711（40 aa）
链 J
672–711（40 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 8SEL Type IIIb beta-amyloid 40 Filaments from Down Syndrome 提交 2023-04-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric |
链 A
672–711（40 aa）
链 B
672–711（40 aa）
链 C
672–711（40 aa）
链 D
672–711（40 aa）
链 E
672–711（40 aa）
链 F
672–711（40 aa）
链 G
672–711（40 aa）
链 H
672–711（40 aa）
链 I
672–711（40 aa）
链 J
672–711（40 aa）
链 K
672–711（40 aa）
链 L
672–711（40 aa）
链 M
672–711（40 aa）
链 N
672–711（40 aa）
链 O
672–711（40 aa）
链 P
672–711（40 aa）
链 Q
672–711（40 aa）
链 R
672–711（40 aa）
链 S
672–711（40 aa）
链 T
672–711（40 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 8X52 Cryo-EM structure of human gamma-secretase in complex with Abeta49 提交 2023-11-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 E
540–639（100 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 PC1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 2 CLR CHOLESTEROL × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 8X53 Cryo-EM structure of human gamma-secretase in complex with Abeta46 提交 2023-11-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 E
541–586（46 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 PC1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 3 CLR CHOLESTEROL × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8X54 Cryo-EM structure of human gamma-secretase in complex with APP-C99 提交 2023-11-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric |
链 E
540–639（100 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 PC1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 3 CLR CHOLESTEROL × 3 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 8Z9V Amyloid beta and TTR 提交 2024-04-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 e
678–713（36 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.82
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 7.84 Å |
| 9CK6 Cryo-EM structure of sarkosyl insoluble amyloid-beta 42 filaments extracted from human brain tissue 提交 2024-07-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
链 B
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
链 C
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
链 D
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
链 E
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
链 F
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
链 G
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
链 H
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
链 I
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
链 R
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 3.00 Å |
| 9CKI Cryo-EM structure of the poly(4-styrenesulfonic acid-co-maleic acid) [PSCMA]-extractable amyloid-beta 42 oligomer from human brain tissue (Conformation 2) 提交 2024-07-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
链 B
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
链 C
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
链 D
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
链 E
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
链 F
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
链 G
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
链 H
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
链 I
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
链 J
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 3.10 Å |
| 9CO4 Cryo-EM structure of the receptor-bound amyloid-beta 42 oligomer from human brain tissue (Conformation 1) 提交 2024-07-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
链 B
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
链 C
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
链 D
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
链 E
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
链 F
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
链 G
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
链 H
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
链 I
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
链 J
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 2.80 Å |
| 9CZN Type Ic amyloid-beta 42 filaments in dominantly inherited Alzheimer disease with cotton wool plaques 提交 2024-08-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric |
链 A
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
链 B
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
链 C
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
链 D
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
链 E
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
链 F
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
链 G
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
链 H
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
链 I
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
链 J
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
链 K
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
链 L
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
链 M
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
链 N
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
链 O
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
链 P
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
链 Q
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
链 R
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
链 S
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
链 T
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.60 Å |
| 9CZP Type Id amyloid-beta 42 filaments in dominantly inherited Alzheimer disease with cotton wool plaques 提交 2024-08-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric |
链 A
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
链 B
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
链 C
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
链 D
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
链 E
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
链 F
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
链 G
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
链 H
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
链 I
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
链 J
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
链 K
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
链 L
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
链 M
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
链 N
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
链 O
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
链 P
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
链 Q
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
链 R
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
链 S
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
链 T
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 9FH2 Cryo-EM Structure of Amyloid-beta Fibrils Carrying the Uppsala AbetaUpp(1-42)delta(19-24) Mutation - Polymorph 1 提交 2024-05-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
672–713（42 aa）
链 B
672–713（42 aa）
链 C
672–713（42 aa）
链 D
672–713（42 aa）
链 E
672–713（42 aa）
链 F
672–713（42 aa）
链 G
672–713（42 aa）
链 H
672–713（42 aa）
链 I
672–713（42 aa）
链 J
672–713（42 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 2；30% (v/v) acetonitrile (AcN), 0.1% (v/v) trifluoroacetic acid (TFA) at pH 2 (~300 uM monomer concentration)
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 9FH3 Cryo-EM Structure of Amyloid-beta Fibrils Carrying the Uppsala AbetaUpp(1-42)delta(19-24) Mutation - Polymorph 2 提交 2024-05-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
672–713（42 aa）
链 B
672–713（42 aa）
链 C
672–713（42 aa）
链 D
672–713（42 aa）
链 E
672–713（42 aa）
链 F
672–713（42 aa）
链 G
672–713（42 aa）
链 H
672–713（42 aa）
链 I
672–713（42 aa）
链 J
672–713（42 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 2；30% (v/v) acetonitrile (AcN), 0.1% (v/v) trifluoroacetic acid (TFA) at pH 2 (~300 uM monomer concentration)
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 9FH4 Cryo-EM Structure of Amyloid-beta Fibrils Carrying the Uppsala AbetaUpp(1-42)delta(19-24) Mutation - Polymorph 3 提交 2024-05-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
672–713（42 aa）
链 B
672–713（42 aa）
链 C
672–713（42 aa）
链 D
672–713（42 aa）
链 E
672–713（42 aa）
链 F
672–713（42 aa）
链 G
672–713（42 aa）
链 H
672–713（42 aa）
链 I
672–713（42 aa）
链 J
672–713（42 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 2；30% (v/v) acetonitrile (AcN), 0.1% (v/v) trifluoroacetic acid (TFA) at pH 2 (~300 uM monomer concentration)
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.00 Å |
| 9FH5 Cryo-EM Structure of Amyloid-beta Fibrils Carrying the Uppsala AbetaUpp(1-42)delta(19-24) Mutation - Polymorph 4 提交 2024-05-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 20 PDB 声明：20-meric |
链 A
672–713（42 aa）
链 B
672–713（42 aa）
链 C
672–713（42 aa）
链 D
672–713（42 aa）
链 E
672–713（42 aa）
链 F
672–713（42 aa）
链 G
672–713（42 aa）
链 H
672–713（42 aa）
链 I
672–713（42 aa）
链 J
672–713（42 aa）
链 K
672–713（42 aa）
链 L
672–713（42 aa）
链 M
672–713（42 aa）
链 N
672–713（42 aa）
链 O
672–713（42 aa）
链 P
672–713（42 aa）
链 Q
672–713（42 aa）
链 R
672–713（42 aa）
链 S
672–713（42 aa）
链 T
672–713（42 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 2；30% (v/v) acetonitrile (AcN), 0.1% (v/v) trifluoroacetic acid (TFA) at pH 2 (~300 uM monomer concentration)
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 9IIO J-shaped conformer of amyloid beta (1-40) 提交 2024-06-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 40 PDB 声明：40-meric |
链 2
672–711（40 aa）
链 3
672–711（40 aa）
链 4
672–711（40 aa）
链 5
672–711（40 aa）
链 6
672–711（40 aa）
链 A
672–711（40 aa）
链 B
672–711（40 aa）
链 C
672–711（40 aa）
链 D
672–711（40 aa）
链 E
672–711（40 aa）
链 F
672–711（40 aa）
链 G
672–711（40 aa）
链 H
672–711（40 aa）
链 I
672–711（40 aa）
链 J
672–711（40 aa）
链 K
672–711（40 aa）
链 L
672–711（40 aa）
链 M
672–711（40 aa）
链 N
672–711（40 aa）
链 O
672–711（40 aa）
链 P
672–711（40 aa）
链 Q
672–711（40 aa）
链 R
672–711（40 aa）
链 S
672–711（40 aa）
链 T
672–711（40 aa）
链 U
672–711（40 aa）
链 V
672–711（40 aa）
链 W
672–711（40 aa）
链 X
672–711（40 aa）
链 Y
672–711（40 aa）
链 Z
672–711（40 aa）
链 a
672–711（40 aa）
链 b
672–711（40 aa）
链 c
672–711（40 aa）
链 d
672–711（40 aa）
链 e
672–711（40 aa）
链 f
672–711（40 aa）
链 g
672–711（40 aa）
链 h
672–711（40 aa）
链 i
672–711（40 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 9JB0 Cryo-EM structure of the class II amyloid-beta 42 fibril containing a D-Asp at position 23 提交 2024-08-26 | 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric |
链 A
672–713（42 aa）
链 AA
672–713（42 aa）
链 B
672–713（42 aa）
链 BB
672–713（42 aa）
链 C
672–713（42 aa）
链 CC
672–713（42 aa）
链 D
672–713（42 aa）
链 DD
672–713（42 aa）
链 E
672–713（42 aa）
链 EE
672–713（42 aa）
链 F
672–713（42 aa）
链 FF
672–713（42 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 9JB1 Cryo-EM structure of the type I amyloid-beta 42 fibril containing a D-Asp at positions 7 and 23 提交 2024-08-26 | 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric |
链 FF
672–713（42 aa）
链 FG
672–713（42 aa）
链 FH
672–713（42 aa）
链 FI
672–713（42 aa）
链 FJ
672–713（42 aa）
链 FK
672–713（42 aa）
链 FL
672–713（42 aa）
链 FM
672–713（42 aa）
链 FN
672–713（42 aa）
链 FO
672–713（42 aa）
链 FP
672–713（42 aa）
链 FQ
672–713（42 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.50 Å |
| 9JB2 Cryo-EM structure of the type II amyloid-beta 42 fibril containing a D-Asp at positions 7 and 23 提交 2024-08-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric |
链 A
672–713（42 aa）
链 B
672–713（42 aa）
链 BA
672–713（42 aa）
链 BB
672–713（42 aa）
链 BC
672–713（42 aa）
链 BD
672–713（42 aa）
链 BE
672–713（42 aa）
链 C
672–713（42 aa）
链 CA
672–713（42 aa）
链 CB
672–713（42 aa）
链 CC
672–713（42 aa）
链 CD
672–713（42 aa）
链 CE
672–713（42 aa）
链 D
672–713（42 aa）
链 E
672–713（42 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 9K0D Cryo-EM structure of Amyloid-beta42-4b polymorph 1 提交 2024-10-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：18-meric |
链 B
680–692（13 aa）
链 F
680–692（13 aa）
链 K
680–692（13 aa）
链 L
680–692（13 aa）
链 S
680–692（13 aa）
链 T
680–692（13 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.60 Å |
| 9K0E Cryo-EM structure of Amyloid-beta42-4b polymorph 2 提交 2024-10-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric |
链 A
680–692（13 aa）
链 D
680–692（13 aa）
链 E
680–692（13 aa）
链 F
680–692（13 aa）
链 L
680–692（13 aa）
链 M
680–692（13 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 9K0F Cryo-EM structure of Amyloid-beta42-4b polymorph 3 提交 2024-10-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric |
链 K
680–692（13 aa）
链 N
680–692（13 aa）
链 O
680–692（13 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 9LLM Structure of C-Terminal of AB40 Peptide containing GXXXG Motif in SDS Micelles 提交 2025-01-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric |
链 A
692–711（20 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 5.2；298 K；离子强度（mmCIF原始值）20；压力 1
NMR样品组成
1 mM AV20, 0.1 mM SDS, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 9M5P I-type amyloid fibril (40) of Tottori (D7N) mutant 提交 2025-03-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric |
链 1
672–711（40 aa）
链 2
672–711（40 aa）
链 3
672–711（40 aa）
链 4
672–711（40 aa）
链 5
672–711（40 aa）
链 6
672–711（40 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 9M5Q V-type (V1-type) amyloid fibril (40) of Tottori (D7N) mutant 提交 2025-03-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric |
链 AL
672–711（40 aa）
链 AM
672–711（40 aa）
链 AN
672–711（40 aa）
链 AO
672–711（40 aa）
链 AP
672–711（40 aa）
链 AQ
672–711（40 aa）
链 AR
672–711（40 aa）
链 AS
672–711（40 aa）
链 AT
672–711（40 aa）
链 AU
672–711（40 aa）
链 AV
672–711（40 aa）
链 AW
672–711（40 aa）
链 AX
672–711（40 aa）
链 AY
672–711（40 aa）
链 AZ
672–711（40 aa）
链 Aa
672–711（40 aa）
链 Ab
672–711（40 aa）
链 Ac
672–711（40 aa）
链 Ad
672–711（40 aa）
链 Ae
672–711（40 aa）
链 Af
672–711（40 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 9M5R ES-type (short pitch) amyloid fibril (40) of Tottori (D7N) mutant 提交 2025-03-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 172 PDB 声明：172-meric |
链 0
672–711（40 aa）
链 1
672–711（40 aa）
链 2
672–711（40 aa）
链 3
672–711（40 aa）
链 4
672–711（40 aa）
链 5
672–711（40 aa）
链 6
672–711（40 aa）
链 7
672–711（40 aa）
链 8
672–711（40 aa）
链 9
672–711（40 aa）
链 A
672–711（40 aa）
链 A0
672–711（40 aa）
链 A1
672–711（40 aa）
链 A2
672–711（40 aa）
链 A3
672–711（40 aa）
链 A4
672–711（40 aa）
链 A5
672–711（40 aa）
链 A6
672–711（40 aa）
链 A7
672–711（40 aa）
链 A8
672–711（40 aa）
链 A9
672–711（40 aa）
链 AA
672–711（40 aa）
链 AB
672–711（40 aa）
链 AC
672–711（40 aa）
链 AD
672–711（40 aa）
链 AE
672–711（40 aa）
链 AF
672–711（40 aa）
链 AG
672–711（40 aa）
链 AH
672–711（40 aa）
链 AI
672–711（40 aa）
链 AJ
672–711（40 aa）
链 AK
672–711（40 aa）
链 AL
672–711（40 aa）
链 AM
672–711（40 aa）
链 AN
672–711（40 aa）
链 AO
672–711（40 aa）
链 AP
672–711（40 aa）
链 AQ
672–711（40 aa）
链 AR
672–711（40 aa）
链 AS
672–711（40 aa）
链 AT
672–711（40 aa）
链 AU
672–711（40 aa）
链 AV
672–711（40 aa）
链 AW
672–711（40 aa）
链 AX
672–711（40 aa）
链 AY
672–711（40 aa）
链 AZ
672–711（40 aa）
链 Aa
672–711（40 aa）
链 Ab
672–711（40 aa）
链 Ac
672–711（40 aa）
链 Ad
672–711（40 aa）
链 Ae
672–711（40 aa）
链 Af
672–711（40 aa）
链 Ag
672–711（40 aa）
链 Ah
672–711（40 aa）
链 Ai
672–711（40 aa）
链 Aj
672–711（40 aa）
链 Ak
672–711（40 aa）
链 Al
672–711（40 aa）
链 Am
672–711（40 aa）
链 An
672–711（40 aa）
链 Ao
672–711（40 aa）
链 Ap
672–711（40 aa）
链 Aq
672–711（40 aa）
链 Ar
672–711（40 aa）
链 As
672–711（40 aa）
链 At
672–711（40 aa）
链 Au
672–711（40 aa）
链 Av
672–711（40 aa）
链 Aw
672–711（40 aa）
链 Ax
672–711（40 aa）
链 Ay
672–711（40 aa）
链 Az
672–711（40 aa）
链 B
672–711（40 aa）
链 BA
672–711（40 aa）
链 BB
672–711（40 aa）
链 BC
672–711（40 aa）
链 BD
672–711（40 aa）
链 BE
672–711（40 aa）
链 BF
672–711（40 aa）
链 BG
672–711（40 aa）
链 BH
672–711（40 aa）
链 BI
672–711（40 aa）
链 BJ
672–711（40 aa）
链 BK
672–711（40 aa）
链 BL
672–711（40 aa）
链 BM
672–711（40 aa）
链 BN
672–711（40 aa）
链 BO
672–711（40 aa）
链 BP
672–711（40 aa）
链 BQ
672–711（40 aa）
链 BR
672–711（40 aa）
链 BS
672–711（40 aa）
链 BT
672–711（40 aa）
链 BU
672–711（40 aa）
链 BV
672–711（40 aa）
链 BW
672–711（40 aa）
链 BX
672–711（40 aa）
链 BY
672–711（40 aa）
链 BZ
672–711（40 aa）
链 Ba
672–711（40 aa）
链 Bb
672–711（40 aa）
链 Bc
672–711（40 aa）
链 Bd
672–711（40 aa）
链 Be
672–711（40 aa）
链 Bf
672–711（40 aa）
链 Bg
672–711（40 aa）
链 Bh
672–711（40 aa）
链 Bi
672–711（40 aa）
链 Bj
672–711（40 aa）
链 Bk
672–711（40 aa）
链 Bl
672–711（40 aa）
链 Bm
672–711（40 aa）
链 Bn
672–711（40 aa）
链 Bo
672–711（40 aa）
链 Bp
672–711（40 aa）
链 Bq
672–711（40 aa）
链 Br
672–711（40 aa）
链 Bs
672–711（40 aa）
链 Bt
672–711（40 aa）
链 Bu
672–711（40 aa）
链 Bv
672–711（40 aa）
链 C
672–711（40 aa）
链 D
672–711（40 aa）
链 E
672–711（40 aa）
链 F
672–711（40 aa）
链 G
672–711（40 aa）
链 H
672–711（40 aa）
链 I
672–711（40 aa）
链 J
672–711（40 aa）
链 K
672–711（40 aa）
链 L
672–711（40 aa）
链 M
672–711（40 aa）
链 N
672–711（40 aa）
链 O
672–711（40 aa）
链 P
672–711（40 aa）
链 Q
672–711（40 aa）
链 R
672–711（40 aa）
链 S
672–711（40 aa）
链 T
672–711（40 aa）
链 U
672–711（40 aa）
链 V
672–711（40 aa）
链 W
672–711（40 aa）
链 X
672–711（40 aa）
链 Y
672–711（40 aa）
链 Z
672–711（40 aa）
链 a
672–711（40 aa）
链 b
672–711（40 aa）
链 c
672–711（40 aa）
链 d
672–711（40 aa）
链 e
672–711（40 aa）
链 f
672–711（40 aa）
链 g
672–711（40 aa）
链 h
672–711（40 aa）
链 i
672–711（40 aa）
链 j
672–711（40 aa）
链 k
672–711（40 aa）
链 l
672–711（40 aa）
链 m
672–711（40 aa）
链 n
672–711（40 aa）
链 o
672–711（40 aa）
链 p
672–711（40 aa）
链 q
672–711（40 aa）
链 r
672–711（40 aa）
链 s
672–711（40 aa）
链 t
672–711（40 aa）
链 u
672–711（40 aa）
链 v
672–711（40 aa）
链 w
672–711（40 aa）
链 x
672–711（40 aa）
链 y
672–711（40 aa）
链 z
672–711（40 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 9OBK A-beta42-Met-R-SO amyloidal fibril 提交 2025-04-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
685–712（28 aa）
链 B
685–712（28 aa）
链 C
685–712（28 aa）
链 D
685–712（28 aa）
链 E
685–712（28 aa）
链 F
685–712（28 aa）
链 G
685–712（28 aa）
链 H
685–712（28 aa）
链 I
685–712（28 aa）
链 J
685–712（28 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.01 Å |
| 9ONC A-beta42-Met-R-SO amyloidal fibril - class3 提交 2025-05-14 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
688–713（26 aa）
链 B
688–713（26 aa）
链 C
688–713（26 aa）
链 D
688–713（26 aa）
链 E
688–713（26 aa）
链 F
688–713（26 aa）
链 G
688–713（26 aa）
链 H
688–713（26 aa）
链 I
688–713（26 aa）
链 J
688–713（26 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.64 Å |
| 9RIV Population B fibril generated from the Heterotypic interaction of Abeta40 and Medin. 提交 2025-06-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric |
链 A
672–711（40 aa）
链 B
672–711（40 aa）
链 C
672–711（40 aa）
链 D
672–711（40 aa）
链 E
672–711（40 aa）
链 F
672–711（40 aa）
链 G
672–711（40 aa）
链 H
672–711（40 aa）
链 I
672–711（40 aa）
链 J
672–711（40 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.63 Å |
| 9RIW Population A fibril generated from the Heterotypic interaction of Abeta40 and Medin. 提交 2025-06-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric |
链 A
672–711（40 aa）
链 B
672–711（40 aa）
链 C
672–711（40 aa）
链 D
672–711（40 aa）
链 E
672–711（40 aa）
链 F
672–711（40 aa）
链 G
672–711（40 aa）
链 H
672–711（40 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 9UMH V-type (V2-type) amyloid fibril (40) of Tottori (D7N) mutant 提交 2025-04-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric |
链 AL
672–711（40 aa）
链 AM
672–711（40 aa）
链 AN
672–711（40 aa）
链 AO
672–711（40 aa）
链 AP
672–711（40 aa）
链 AQ
672–711（40 aa）
链 AR
672–711（40 aa）
链 AS
672–711（40 aa）
链 AT
672–711（40 aa）
链 AU
672–711（40 aa）
链 AV
672–711（40 aa）
链 AW
672–711（40 aa）
链 AX
672–711（40 aa）
链 AY
672–711（40 aa）
链 AZ
672–711（40 aa）
链 Aa
672–711（40 aa）
链 Ab
672–711（40 aa）
链 Ac
672–711（40 aa）
链 Ad
672–711（40 aa）
链 Ae
672–711（40 aa）
链 Af
672–711（40 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 9WAO Structure of type II Abeta fibrils from 5xFAD mice 提交 2025-08-12 | 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric |
链 A
672–713（42 aa）
链 B
672–713（42 aa）
链 C
672–713（42 aa）
链 D
672–713（42 aa）
链 E
672–713（42 aa）
链 F
672–713（42 aa）
链 G
672–713（42 aa）
链 H
672–713（42 aa）
链 I
672–713（42 aa）
链 J
672–713（42 aa）
链 K
672–713（42 aa）
链 L
672–713（42 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 9WAP Structure of Type II Abeta fibrils from AppNL-FPsen1P117L mice 提交 2025-08-12 | 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric |
链 A
672–713（42 aa）
链 B
672–713（42 aa）
链 C
672–713（42 aa）
链 D
672–713（42 aa）
链 E
672–713（42 aa）
链 F
672–713（42 aa）
链 G
672–713（42 aa）
链 H
672–713（42 aa）
链 I
672–713（42 aa）
链 J
672–713（42 aa）
链 K
672–713（42 aa）
链 L
672–713（42 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.22 Å |
共 211 个其他 PDB 条目、282 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态
查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | A4_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–42； UniProt 672–713 作者链 AA； PDB构建体 1–42； UniProt 672–713 作者链 B； PDB构建体 1–42； UniProt 672–713 作者链 BB； PDB构建体 1–42； UniProt 672–713 作者链 C； PDB构建体 1–42； UniProt 672–713 作者链 CC； PDB构建体 1–42； UniProt 672–713 作者链 D； PDB构建体 1–42； UniProt 672–713 作者链 DD； PDB构建体 1–42； UniProt 672–713 作者链 E； PDB构建体 1–42； UniProt 672–713 作者链 EE； PDB构建体 1–42； UniProt 672–713 作者链 F； PDB构建体 1–42； UniProt 672–713 作者链 FF； PDB构建体 1–42； UniProt 672–713 |
