9lwl

HBx-Smc5/6 ubiquitination complex

Method: ELECTRON MICROSCOPY

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Structural maintenance of chromosomes protein 6

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 10	DNA damage-binding protein 1 × 1 （Q16531） Protein X × 1 （Q2F514） EP300-interacting inhibitor of differentiation 3 × 1 （Q8N140） Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog × 1 （Q96MG7） Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog × 1 （Q8WV22） Cullin-4A × 1 （Q13619） E3 ubiquitin-protein ligase RBX1 × 1 （P62877） Structural maintenance of chromosomes protein 5 × 1 （Q8IY18） E3 SUMO-protein ligase NSE2 × 1 （Q96MF7） ZINC ION × 6	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	SMC6_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–1091； UniProt 1–1091

DNA damage-binding protein 1

Homo sapiens

UniProt Q16531

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 10	Structural maintenance of chromosomes protein 6 × 1 （Q96SB8） Protein X × 1 （Q2F514） EP300-interacting inhibitor of differentiation 3 × 1 （Q8N140） Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog × 1 （Q96MG7） Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog × 1 （Q8WV22） Cullin-4A × 1 （Q13619） E3 ubiquitin-protein ligase RBX1 × 1 （P62877） Structural maintenance of chromosomes protein 5 × 1 （Q8IY18） E3 SUMO-protein ligase NSE2 × 1 （Q96MF7） ZINC ION × 6	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	DDB1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–1140； UniProt 1–1140

Protein X

Hepatitis B virus

UniProt Q2F514

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 10	Structural maintenance of chromosomes protein 6 × 1 （Q96SB8） DNA damage-binding protein 1 × 1 （Q16531） EP300-interacting inhibitor of differentiation 3 × 1 （Q8N140） Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog × 1 （Q96MG7） Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog × 1 （Q8WV22） Cullin-4A × 1 （Q13619） E3 ubiquitin-protein ligase RBX1 × 1 （P62877） Structural maintenance of chromosomes protein 5 × 1 （Q8IY18） E3 SUMO-protein ligase NSE2 × 1 （Q96MF7） ZINC ION × 6	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	Q2F514_HBV
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–154； UniProt 1–154

EP300-interacting inhibitor of differentiation 3

Homo sapiens

UniProt Q8N140

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 10	Structural maintenance of chromosomes protein 6 × 1 （Q96SB8） DNA damage-binding protein 1 × 1 （Q16531） Protein X × 1 （Q2F514） Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog × 1 （Q96MG7） Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog × 1 （Q8WV22） Cullin-4A × 1 （Q13619） E3 ubiquitin-protein ligase RBX1 × 1 （P62877） Structural maintenance of chromosomes protein 5 × 1 （Q8IY18） E3 SUMO-protein ligase NSE2 × 1 （Q96MF7） ZINC ION × 6	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	EID3_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–333； UniProt 1–333

Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog

Homo sapiens

UniProt Q96MG7

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 10	Structural maintenance of chromosomes protein 6 × 1 （Q96SB8） DNA damage-binding protein 1 × 1 （Q16531） Protein X × 1 （Q2F514） EP300-interacting inhibitor of differentiation 3 × 1 （Q8N140） Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog × 1 （Q8WV22） Cullin-4A × 1 （Q13619） E3 ubiquitin-protein ligase RBX1 × 1 （P62877） Structural maintenance of chromosomes protein 5 × 1 （Q8IY18） E3 SUMO-protein ligase NSE2 × 1 （Q96MF7） ZINC ION × 6	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	NSE3_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–304； UniProt 1–304

Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog

Homo sapiens

UniProt Q8WV22

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 10	Structural maintenance of chromosomes protein 6 × 1 （Q96SB8） DNA damage-binding protein 1 × 1 （Q16531） Protein X × 1 （Q2F514） EP300-interacting inhibitor of differentiation 3 × 1 （Q8N140） Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog × 1 （Q96MG7） Cullin-4A × 1 （Q13619） E3 ubiquitin-protein ligase RBX1 × 1 （P62877） Structural maintenance of chromosomes protein 5 × 1 （Q8IY18） E3 SUMO-protein ligase NSE2 × 1 （Q96MF7） ZINC ION × 6	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	NSE1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–266； UniProt 1–266

Cullin-4A

Homo sapiens

UniProt Q13619

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 10	Structural maintenance of chromosomes protein 6 × 1 （Q96SB8） DNA damage-binding protein 1 × 1 （Q16531） Protein X × 1 （Q2F514） EP300-interacting inhibitor of differentiation 3 × 1 （Q8N140） Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog × 1 （Q96MG7） Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog × 1 （Q8WV22） E3 ubiquitin-protein ligase RBX1 × 1 （P62877） Structural maintenance of chromosomes protein 5 × 1 （Q8IY18） E3 SUMO-protein ligase NSE2 × 1 （Q96MF7） ZINC ION × 6	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	CUL4A_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–759； UniProt 1–759

E3 ubiquitin-protein ligase RBX1

Homo sapiens

UniProt P62877

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 10	Structural maintenance of chromosomes protein 6 × 1 （Q96SB8） DNA damage-binding protein 1 × 1 （Q16531） Protein X × 1 （Q2F514） EP300-interacting inhibitor of differentiation 3 × 1 （Q8N140） Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog × 1 （Q96MG7） Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog × 1 （Q8WV22） Cullin-4A × 1 （Q13619） Structural maintenance of chromosomes protein 5 × 1 （Q8IY18） E3 SUMO-protein ligase NSE2 × 1 （Q96MF7） ZINC ION × 6	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RBX1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 1–108； UniProt 1–108

Structural maintenance of chromosomes protein 5

Homo sapiens

UniProt Q8IY18

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 10	Structural maintenance of chromosomes protein 6 × 1 （Q96SB8） DNA damage-binding protein 1 × 1 （Q16531） Protein X × 1 （Q2F514） EP300-interacting inhibitor of differentiation 3 × 1 （Q8N140） Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog × 1 （Q96MG7） Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog × 1 （Q8WV22） Cullin-4A × 1 （Q13619） E3 ubiquitin-protein ligase RBX1 × 1 （P62877） E3 SUMO-protein ligase NSE2 × 1 （Q96MF7） ZINC ION × 6	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	SMC5_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 1–1101； UniProt 1–1101

E3 SUMO-protein ligase NSE2

Homo sapiens

UniProt Q96MF7

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 10	Structural maintenance of chromosomes protein 6 × 1 （Q96SB8） DNA damage-binding protein 1 × 1 （Q16531） Protein X × 1 （Q2F514） EP300-interacting inhibitor of differentiation 3 × 1 （Q8N140） Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog × 1 （Q96MG7） Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog × 1 （Q8WV22） Cullin-4A × 1 （Q13619） E3 ubiquitin-protein ligase RBX1 × 1 （P62877） Structural maintenance of chromosomes protein 5 × 1 （Q8IY18） ZINC ION × 6	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	NSE2_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 J； PDB构建体 1–247； UniProt 1–247

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9lwl
沉积日期 deposition_date	2025-02-15
结构标题 title	HBx-Smc5/6 ubiquitination complex
关键词 keywords	HBx, Smc5/6, Cul4A-RBx, HBV, ANTIVIRAL PROTEIN; ANTIVIRAL PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9lwl__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9lwl__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

9lwl__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	0.00 Å
Rg（电子密度）	133.80 Å
总 Rg	133.30 Å
原子数	39737
残基数	4914
排除体积	708420 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`9lwl__assembly_1__model_1`	decameric （10）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (11)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Structural maintenance of chromosomes protein 6
分子量 formula_weight	126530.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	39737

MAKRKEENFSSPKNAKRPRQEELEDFDKDGDEDECKGTTLTAAEVGIIESIHLKNFMCHSMLGPFKFGSNVNFVVGNNGSGKSAVLTALIVGLGGRAVATNRGSSLKGFVKDGQNSADISITLRNRGDDAFKASVYGNSILIQQHISIDGSRSYKLKSATGSVVSTRKEELIAILDHFNIQVDNPVSVLTQEMSKQFLQSKNEGDKYKFFMKATQLEQMKEDYSYIMETKERTKEQIHQGEERLTELKRQCVEKEERFQSIAGLSTMKTNLESLKHEMAWAVVNEIEKQLNAIRDNIKIGEDRAARLDRKMEEQQVRLNEAEQKYKDIQDKLEKISEETNARAPECMALKADVVAKKRAYNEAEVLYNRSLNEYKALKKDDEQLCKRIEELKKSTDQSLEPERLERQKKISWLKERVKAFQNQENSVNQEIEQFQQAIEKDKEEHGKIKREELDVKHALSYNQRQLKELKDSKTDRLKRFGPNVPALLEAIDDAYRQGHFTYKPVGPLGACIHLRDPELALAIESCLKGLLQAYCCHNHADERVLQALMKRFYLPGTSRPPIIVSEFRNEIYDVRHRAAYHPDFPTVLTALEIDNAVVANSLIDMRGIETVLLIKNNSVARAVMQSQKPPKNCREAFTADGDQVFAGRYYSSENTRPKFLSRDVDSEISDLENEVENKTAQILNLQQHLSALEKDIKHNEELLKRCQLHYKELKMKIRKNISEIRELENIEEHQSVDIATLEDEAQENKSKMKMVEEHMEQQKENMEHLKSLKIEAENKYDAIKFKINQLSELADPLKDELNLADSEVDNQKRGKRHYEEKQKEHLDTLNKKKRELDMKEKELEEKMSQARQICPERIEVEKSASILDKEINRLRQKIQAEHASHGDREEIMRQYQEARETYLDLDSKVRTLKKFIKLLGEIMEHRFKTYQQFRRCLTLRCKLYFDNLLSQRAYCGKMNFDHKNETLSISVQPGEGNKAAFNDMRALSGGERSFSTVCFILSLWSIAESPFRCLDEFDVYMDMVNRRIAMDLILKMADSQRFRQFILLTPQSMSSLPSSKLIRILRMSDPERGQTTLPFRPVTQEEDDDQR

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	DNA damage-binding protein 1
分子量 formula_weight	127097.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MSYNYVVTAQKPTAVNGCVTGHFTSAEDLNLLIAKNTRLEIYVVTAEGLRPVKEVGMYGKIAVMELFRPKGESKDLLFILTAKYNACILEYKQSGESIDIITRAHGNVQDRIGRPSETGIIGIIDPECRMIGLRLYDGLFKVIPLDRDNKELKAFNIRLEELHVIDVKFLYGCQAPTICFVYQDPQGRHVKTYEVSLREKEFNKGPWKQENVEAEASMVIAVPEPFGGAIIIGQESITYHNGDKYLAIAPPIIKQSTIVCHNRVDPNGSRYLLGDMEGRLFMLLLEKEEQMDGTVTLKDLRVELLGETSIAECLTYLDNGVVFVGSRLGDSQLVKLNVDSNEQGSYVVAMETFTNLGPIVDMCVVDLERQGQGQLVTCSGAFKEGSLRIIRNGIGIHEHASIDLPGIKGLWPLRSDPNRETDDTLVLSFVGQTRVLMLNGEEVEETELMGFVDDQQTFFCGNVAHQQLIQITSASVRLVSQEPKALVSEWKEPQAKNISVASCNSSQVVVAVGRALYYLQIHPQELRQISHTEMEHEVACLDITPLGDSNGLSPLCAIGLWTDISARILKLPSFELLHKEMLGGEIIPRSILMTTFESSHYLLCALGDGALFYFGLNIETGLLSDRKKVTLGTQPTVLRTFRSLSTTNVFACSDRPTVIYSSNHKLVFSNVNLKEVNYMCPLNSDGYPDSLALANNSTLTIGTIDEIQKLHIRTVPLYESPRKICYQEVSQCFGVLSSRIEVQDTSGGTTALRPSASTQALSSSVSSSKLFSSSTAPHETSFGEEVEVHNLLIIDQHTFEVLHAHQFLQNEYALSLVSCKLGKDPNTYFIVGTAMVYPEEAEPKQGRIVVFQYSDGKLQTVAEKEVKGAVYSMVEFNGKLLASINSTVRLYEWTTEKELRTECNHYNNIMALYLKTKGDFILVGDLMRSVLLLAYKPMEGNFEEIARDFNPNWMSAVEILDDDNFLGAENAFNLFVCQKDSAATTDEERQHLQEVGLFHLGEFVNVFCHGSLVMQNLGETSTPTQGSVLFGTVNGMIGLVTSLSESWYNLLLDMQNRLNKVIKSVGKIEHSFWRSFHTERKTEPATGFIDGDLIESFLDISRPKMQEVVANLQYDDGSGMKREATADDLIKVVEELTRIH

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Protein X
分子量 formula_weight	16587.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

MAARLCCQLDPARDVLCLRPVGAESCGRPFSGSLGTLSSPSPSAVPTDHGAHLSLRGLPVCAFSSAGPCALRFTSARRMETTVNAHQILPKVLHKRTLGLSAMSTTDLEAYFKDCLFKDWEELGEEIRLKVFVLGGCRHKLVCAPAPCNFFTSA

来源 Source

来源生物 organism	Hepatitis B virus
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10407
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	EP300-interacting inhibitor of differentiation 3
分子量 formula_weight	38213.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

MKMDVSVRAAGCSDDLSSGEADVDPKLLELTADEEKCRSIRRQYRQLMYCVRQNREDIVSSANNSLTEALEEANVLFDGVSRTREAALDARFLVMASDLGKEKAKQLNSDMNFFNQLAFCDFLFLFVGLNWMEGDPDKLSDCDDSIALSFWKAIEKEATSWMVKAETFHFVFGSFKLERSAPKPRLEHQKKVRKMEENGNMPTKLQKLDLSSYPEATEKNVERILGLLQTYFRKYPDTPVSYFEFVIDPNSFSRTVENIFYVSFIVRDGFARIRLDEDRLPILEPMNVNQMGEGNDSSCHGRKQGVISLTLQEWKNIVAAFEISEAMITYSSY

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog
分子量 formula_weight	34361.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E

MLQKPRNRGRSGGQAERDRDWSHSGNPGASRAGEDARVLRDGFAEEAPSTSRGPGGSQGSQGPSPQGARRAQAAPAVGPRSQKQLELKVSELVQFLLIKDQKKIPIKRADILKHVIGDYKDIFPDLFKRAAERLQYVFGYKLVELEPKSNTYILINTLEPVEEDAEMRGDQGTPTTGLLMIVLGLIFMKGNTIKETEAWDFLRRLGVYPTKKHLIFGDPKKLITEDFVRQRYLEYRRIPHTDPVDYEFQWGPRTNLETSKMKVLKFVAKVHNQDPKDWPAQYCEALADEENRARPQPSGPAPSS

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog
分子量 formula_weight	30903.5 kDa
EC 编号 ec_number	2.3.2.27
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F

MQGSTRRMGVMTDVHRRFLQLLMTHGVLEEWDVKRLQTHCYKVHDRNATVDKLEDFINNINSVLESLYIEIKRGVTEDDGRPIYALVNLATTSISKMATDFAENELDLFRKALELIIDSETGFASSTNILNLVDQLKGKKMRKKEAEQVLQKFVQNKWLIEKEGEFTLHGRAILEMEQYIRETYPDAVKICNICHSLLIQGQSCETCGIRMHLPCVAKYFQSNAEPRCPHCNDYWPHEIPKVFDPEKERESGVLKSNKKSLRSRQH

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	Cullin-4A
分子量 formula_weight	87871.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G

MADEAPRKGSFSALVGRTNGLTKPAALAAAPAKPGGAGGSKKLVIKNFRDRPRLPDNYTQDTWRKLHEAVRAVQSSTSIRYNLEELYQAVENLCSHKVSPMLYKQLRQACEDHVQAQILPFREDSLDSVLFLKKINTCWQDHCRQMIMIRSIFLFLDRTYVLQNSTLPSIWDMGLELFRTHIISDKMVQSKTIDGILLLIERERSGEAVDRSLLRSLLGMLSDLQVYKDSFELKFLEETNCLYAAEGQRLMQEREVPEYLNHVSKRLEEEGDRVITYLDHSTQKPLIACVEKQLLGEHLTAILQKGLDHLLDENRVPDLAQMYQLFSRVRGGQQALLQHWSEYIKTFGTAIVINPEKDKDMVQDLLDFKDKVDHVIEVCFQKNERFVNLMKESFETFINKRPNKPAELIAKHVDSKLRAGNKEATDEELERTLDKIMILFRFIHGKDVFEAFYKKDLAKRLLVGKSASVDAEKSMLSKLKHECGAAFTSKLEGMFKDMELSKDIMVHFKQHMQNQSDSGPIDLTVNILTMGYWPTYTPMEVHLTPEMIKLQEVFKAFYLGKHSGRKLQWQTTLGHAVLKAEFKEGKKEFQVSLFQTLVLLMFNEGDGFSFEEIKMATGIEDSELRRTLQSLACGKARVLIKSPKGKEVEDGDKFIFNGEFKHKLFRIKINQIQMKETVEEQVSTTERVFQDRQYQIDAAIVRIMKMRKTLGHNLLVSELYNQLKFPVKPGDLKKRIESLIDRDYMERDKDNPNQYHYVAG

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	E3 ubiquitin-protein ligase RBX1
分子量 formula_weight	12290.0 kDa
EC 编号 ec_number	2.3.2.27,2.3.2.32
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H

MAAAMDVDTPSGTNSGAGKKRFEVKKWNAVALWAWDIVVDNCAICRNHIMDLCIECQANQASATSEECTVAWGVCNHAFHFHCISRWLKTRQVCPLDNREWEFQKYGH

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	Structural maintenance of chromosomes protein 5
分子量 formula_weight	129014.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I

MATPSKKTSTPSPQPSKRALPRDPSSEVPSKRKNSAPQLPLLQSSGPFVEGSIVRISMENFLTYDICEVSPGPHLNMIVGANGTGKSSIVCAICLGLAGKPAFMGRADKVGFFVKRGCSRGMVEIELFRASGNLVITREIDVAKNQSFWFINKKSTTQKIVEEKVAALNIQVGNLCQFLPQDKVGEFAKLSKIELLEATEKSIGPPEMHKYHCELKNLREKEKQLETSCKEKTEYLQKMVQRNERYKQDVERFYERKRHLDLIEMLEAKRPWVEYENVRQEYEEVKLVRDRVKEEVRKLKEGQIPVTCRIEEMENERHNLEARIKEKATDIKEASQKCKQKQDVIERKDKHIEELQQALIVKQNEELDRQRRIGNTRKMIEDLQNELKTTENCENLQPQIDAITNDLRRIQDEKALCEGEIIDKRRERETLEKEKKSVDDHIVRFDNLMNQKEDKLRQRFRDTYDAVLWLRNNRDKFKQRVCEPIMLTINMKDNKNAKYIENHIPSNDLRAFVFESQEDMEVFLKEVRDNKKLRVNAVIAPKSSYADKAPSRSLNELKQYGFFSYLRELFDAPDPVMSYLCCQYHIHEVPVGTEKTRERIERVIQETRLKQIYTAEEKYVVKTSFYSNKVISSNTSLKVAQFLTVTVDLEQRRHLEEQLKEIHRKLQAVDSGLIALRETSKHLEHKDNELRQKKKELLERKTKKRQLEQKISSKLGSLKLMEQDTCNLEEEERKASTKIKEINVQKAKLVTELTNLIKICTSLHIQKVDLILQNTTVISEKNKLESDYMAASSQLRLTEQHFIELDENRQRLLQKCKELMKRARQVCNLGAEQTLPQEYQTQVPTIPNGHNSSLPMVFQDLPNTLDEIDALLTEERSRASCFTGLNPTIVQEYTKREEEIEQLTEELKGKKVELDQYRENISQVKERWLNPLKELVEKINEKFSNFFSSMQCAGEVDLHTENEEDYDKYGIRIRVKFRSSTQLHELTPHHQSGGERSVSTMLYLMALQELNRCPFRVVDEINQGMDPINERRVFEMVVNTACKENTSQYFFITPKLLQNLPYSEKMTVLFVYNGPHMLEPNTWNLKAFQRRRRRITFTQPS

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	E3 SUMO-protein ligase NSE2
分子量 formula_weight	27977.6 kDa
EC 编号 ec_number	2.3.2.-
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J

MPGRSSSNSGSTGFISFSGVESALSSLKNFQACINSGMDTASSVALDLVESQTEVSSEYSMDKAMVEFATLDRQLNHYVKAVQSTINHVKEERPEKIPDLKLLVEKKFLALQSKNSDADFQNNEKFVQFKQQLKELKKQCGLQADREADGTEGVDEDIIVTQSQTNFTCPITKEEMKKPVKNKVCGHTYEEDAIVRMIESRQKRKKKAYCPQIGCSHTDIRKSDLIQDEALRRAIENHNKKRHRHSE

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 11 Entity 11 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	7.25 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	69510

HBx-Smc5/6 ubiquitination complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Structural maintenance of chromosomes protein 6

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA damage-binding protein 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Protein X

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

EP300-interacting inhibitor of differentiation 3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Cullin-4A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

E3 ubiquitin-protein ligase RBX1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Structural maintenance of chromosomes protein 5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

E3 SUMO-protein ligase NSE2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体