9mew

JUNV GP1, GP2, SSP and CR1-28 Fab complex in a pseudotyped virus membrane

Method: ELECTRON MICROSCOPY

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Pre-glycoprotein polyprotein GP complex

Mammarenavirus juninense

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	异源复合物	蛋白 15 其他聚合物 6	CR1-28 Fab Light Chain × 3 CR1-28 Fab Heavy Chain × 3 beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 MYRISTIC ACID × 3 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 15	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	GLYC_JUNIN
Isoform	—
PDB实体	1, 2, 3
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–58； UniProt 1–58 作者链 F； PDB构建体 1–58； UniProt 1–58 作者链 K； PDB构建体 1–58； UniProt 1–58 作者链 B； PDB构建体 1–193； UniProt 59–251 作者链 G； PDB构建体 1–193； UniProt 59–251 作者链 L； PDB构建体 1–193； UniProt 59–251 作者链 C； PDB构建体 1–234； UniProt 252–485 作者链 H； PDB构建体 1–234； UniProt 252–485 作者链 M； PDB构建体 1–234； UniProt 252–485

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9mew
沉积日期 deposition_date	2024-12-09
最后修订 last_revision	2025-07-23
结构标题 title	JUNV GP1, GP2, SSP and CR1-28 Fab complex in a pseudotyped virus membrane
关键词 keywords	;Viral protein, Glycoprotein, GPC, JUNV, Junin mammarenavirus, GP1, GP2, signal peptide, virus membrane, CR1-28 Fab, VIRAL PROTEIN-IMMUNE SYSTEM complex ;; VIRAL PROTEIN/IMMUNE SYSTEM
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9mew__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9mew__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

9mew__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	61.86 Å
Rg（电子密度）	62.71 Å
总 Rg	62.60 Å
原子数	21744
残基数	2703
排除体积	387650 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`9mew__assembly_1__model_1`	15-meric （15）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Pre-glycoprotein polyprotein GP complex
分子量 formula_weight	6373.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,F,K
原子数 atom_count	21744

MGQFISFMQEIPTFLQEALNIALVAVSLIAIIKGVVNLYKSGLFQFFVFLALAGRSCT

来源 Source

来源生物 organism	Mammarenavirus juninense
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	2169991
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	JUNV GP1
分子量 formula_weight	22311.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,G,L

EEAFKIGLHTEFQTVSFSMVGLFSNNPHDLPLLCTLNKSHLYIKGGNASFKISFDDIAVLLPEYDVIIQHPADMSWCSKSDDQIWLSQWFMNAVGHDWYLDPPFLCRNRTKTEGFIFQVNTSKTGINENYAKKFKTGMHHLYREYPDSCLDGKLCLMKAQPTSWPLQCPLDHVNTLHFLTRGKNIQLPRRSLK

来源 Source

来源生物 organism	Mammarenavirus juninense
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	2169991
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	JUNV GP2
分子量 formula_weight	27026.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,H,M

AFFSWSLTDSSGKDTPGGYCLEEWMLVAAKMKCFGNTAVAKCNLNHDSEFCDMLRLFDYNKNAIKTLNDETKKQVNLMGQTINALISDNLLMKNKIRELMSVPYCNYTKFWYVNHTLSGQHSLPRCWLIKNNSYLNISDFRNDWILESDFLISEMLSKEYSDRQGKTPLTLVDICFWSTVFFTASLFLHLVGIPTHRHIRGEACPLPHRLNSLGGCRCGKYPNLKKPTVWRRGH

来源 Source

来源生物 organism	Mammarenavirus juninense
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	2169991
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	CR1-28 Fab Light Chain
分子量 formula_weight	22621.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D,I,N

IQMTQSPSTLSASVGDRVTITCRASQSIDNWLAWYQQKPGKAPKLLIYTASRLESGVPSRFSGSGSGTEFTLTISSLQPDDFATYYCQHRTFGQGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRG

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	CR1-28 Fab Heavy Chain
分子量 formula_weight	24168.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,J,O

QVQLVESGGGVVQPGRSLRLSCAASGFTFSSSAMHWVRQAPGKGLEWVAVIWSDGSNENYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMSSLRAEDTAVYYCATDKTYVSGYTSTWYYFNYWGQGTLVTVSGASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEP

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 6 Entity 6 branched

描述 description	beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	586.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	6

实体 7 Entity 7 non-polymer

描述 description	MYRISTIC ACID
分子量 formula_weight	228.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 8 Entity 8 non-polymer

描述 description	2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	221.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	15

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.80 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	397489

JUNV GP1, GP2, SSP and CR1-28 Fab complex in a pseudotyped virus membrane

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Pre-glycoprotein polyprotein GP complex

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

9mew__assembly_1__model_1

9mew__assembly_1__model_1 | I(q)

9mew__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 6 Entity 6 branched

实体 7 Entity 7 non-polymer

实体 8 Entity 8 non-polymer

7. 引用文献 (1)

JUNV GP1, GP2, SSP and CR1-28 Fab complex in a pseudotyped virus membrane

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Pre-glycoprotein polyprotein GP complex

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

9mew__assembly_1__model_1

9mew__assembly_1__model_1 | I(q)

9mew__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 6 Entity 6 branched

实体 7 Entity 7 non-polymer

实体 8 Entity 8 non-polymer

7. 引用文献 (1)