9mom

Structure of native murine cardiac thin filament at pCa=5.8 in Ca2+-bound partially activated state (upper strand)

Method: ELECTRON MICROSCOPY

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Actin, alpha cardiac muscle 1

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 15	Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles × 1 （P19123） Troponin I, cardiac muscle × 1 （P48787） Isoform A2 of Troponin T, cardiac muscle × 2 （P50752） Tropomyosin alpha-1 chain × 4 （P58771） ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MAGNESIUM ION × 7 CALCIUM ION × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ACTC_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–377； UniProt 1–377 作者链 B； PDB构建体 1–377； UniProt 1–377 作者链 C； PDB构建体 1–377； UniProt 1–377 作者链 D； PDB构建体 1–377； UniProt 1–377 作者链 E； PDB构建体 1–377； UniProt 1–377 作者链 F； PDB构建体 1–377； UniProt 1–377 作者链 G； PDB构建体 1–377； UniProt 1–377

Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles

物种未注明

UniProt P19123

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 15	Actin, alpha cardiac muscle 1 × 7 （P68033） Troponin I, cardiac muscle × 1 （P48787） Isoform A2 of Troponin T, cardiac muscle × 2 （P50752） Tropomyosin alpha-1 chain × 4 （P58771） ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MAGNESIUM ION × 7 CALCIUM ION × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TNNC1_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 1–161； UniProt 1–161

Troponin I, cardiac muscle

物种未注明

UniProt P48787

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 15	Actin, alpha cardiac muscle 1 × 7 （P68033） Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles × 1 （P19123） Isoform A2 of Troponin T, cardiac muscle × 2 （P50752） Tropomyosin alpha-1 chain × 4 （P58771） ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MAGNESIUM ION × 7 CALCIUM ION × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TNNI3_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 1–211； UniProt 1–211

Isoform A2 of Troponin T, cardiac muscle

物种未注明

UniProt P50752

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 15	Actin, alpha cardiac muscle 1 × 7 （P68033） Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles × 1 （P19123） Troponin I, cardiac muscle × 1 （P48787） Tropomyosin alpha-1 chain × 4 （P58771） ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MAGNESIUM ION × 7 CALCIUM ION × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TNNT2_MOUSE
Isoform	P50752-3
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 J； PDB构建体 1–291； UniProt 1–291 作者链 K； PDB构建体 1–291； UniProt 1–291

Tropomyosin alpha-1 chain

物种未注明

UniProt P58771

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 15	Actin, alpha cardiac muscle 1 × 7 （P68033） Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles × 1 （P19123） Troponin I, cardiac muscle × 1 （P48787） Isoform A2 of Troponin T, cardiac muscle × 2 （P50752） ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MAGNESIUM ION × 7 CALCIUM ION × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TPM1_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 L； PDB构建体 1–284； UniProt 1–284 作者链 M； PDB构建体 1–284； UniProt 1–284 作者链 N； PDB构建体 1–284； UniProt 1–284 作者链 O； PDB构建体 1–284； UniProt 1–284

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9mom
沉积日期 deposition_date	2024-12-26
结构标题 title	Structure of native murine cardiac thin filament at pCa=5.8 in Ca2+-bound partially activated state (upper strand)
关键词 keywords	thin filament, cryo-EM, troponin, tropomyosin, muscle structure, motor protein; MOTOR PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9mom__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9mom__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

9mom__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	0.00 Å
Rg（电子密度）	109.10 Å
总 Rg	108.40 Å
原子数	28656
残基数	3599
排除体积	508810 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`9mom__assembly_1__model_1`	pentadecameric （15）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Actin, alpha cardiac muscle 1
分子量 formula_weight	42064.9 kDa
EC 编号 ec_number	3.6.4.-
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	7

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D,E,F,G
原子数 atom_count	28656

MCDDEETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDEAGPSIVHRKCF

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles
分子量 formula_weight	18437.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H

MDDIYKAAVEQLTEEQKNEFKAAFDIFVLGAEDGCISTKELGKVMRMLGQNPTPEELQEMIDEVDEDGSGTVDFDEFLVMMVRCMKDDSKGKSEEELSDLFRMFDKNADGYIDLDELKMMLQATGETITEDDIEELMKDGDKNNDGRIDYDEFLEFMKGVE

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Troponin I, cardiac muscle
分子量 formula_weight	24308.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I

MADESSDAAGEPQPAPAPVRRRSSANYRAYATEPHAKKKSKISASRKLQLKTLMLQIAKQEMEREAEERRGEKGRVLRTRCQPLELDGLGFEELQDLCRQLHARVDKVDEERYDVEAKVTKNITEIADLTQKIYDLRGKFKRPTLRRVRISADAMMQALLGTRAKESLDLRAHLKQVKKEDIEKENREVGDWRKNIDALSGMEGRKKKFEG

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Isoform A2 of Troponin T, cardiac muscle
分子量 formula_weight	34616.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J,K

MSDAEEVVEEYEEEQEEQEEAVEEEEAGGAEPEPEGEAETEEANVEEVGPDEEAKDAEEGPVEDTKPKPSRLFMPNLVPPKIPDGERVDFDDIHRKRVEKDLNELQTLIEAHFENRKKEEEELISLKDRIEKRRAERAEQQRIRNEREKERQNRLAEERARREEEENRRKAEDEARKKKALSNMMHFGGYIQKQAQTERKSGKRQTEREKKKKILAERRKALAIDHLNEDQLREKAKELWQSIHNLEAEKFDLQEKFKQQKYEINVLRNRINDNQKVSKTRGKAKVTGRWK

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Tropomyosin alpha-1 chain
分子量 formula_weight	32735.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L,M,N,O

MDAIKKKMQMLKLDKENALDRAEQAEADKKAAEDRSKQLEDELVSLQKKLKGTEDELDKYSEALKDAQEKLELAEKKATDAEADVASLNRRIQLVEEELDRAQERLATALQKLEEAEKAADESERGMKVIESRAQKDEEKMEIQEIQLKEAKHIAEDADRKYEEVARKLVIIESDLERAEERAELSEGKCAELEEELKTVTNNLKSLEAQAEKYSQKEDKYEEEIKVLSDKLKEAETRAEFAERSVTKLEKSIDDLEDELYAQKLKYKAISEELDHALNDMTSI

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	427.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	7

实体 7 Entity 7 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	7

实体 8 Entity 8 non-polymer

描述 description	CALCIUM ION
分子量 formula_weight	40.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

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分辨率 resolution	5.10 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	67709

Structure of native murine cardiac thin filament at pCa=5.8 in Ca2+-bound partially activated state (upper strand)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Actin, alpha cardiac muscle 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Troponin I, cardiac muscle

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Isoform A2 of Troponin T, cardiac muscle

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Tropomyosin alpha-1 chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

9mom__assembly_1__model_1

9mom__assembly_1__model_1 | I(q)

9mom__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 non-polymer

实体 8 Entity 8 non-polymer

7. 引用文献 (1)

Structure of native murine cardiac thin filament at pCa=5.8 in Ca2+-bound partially activated state (upper strand)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Actin, alpha cardiac muscle 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Troponin I, cardiac muscle

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Isoform A2 of Troponin T, cardiac muscle

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Tropomyosin alpha-1 chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

9mom__assembly_1__model_1

9mom__assembly_1__model_1 | I(q)

9mom__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 non-polymer

实体 8 Entity 8 non-polymer

7. 引用文献 (1)