SAXSdb — 9o52

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

;Intermediate conductance calcium-activated potassium channel protein 4,Small conductance calcium-activated potassium channel protein 2 chimera ;

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 9	Calmodulin-1 × 4 （P0DP23） Apamin × 1 （P01500） POTASSIUM ION × 4 CALCIUM ION × 16	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	KCNN4_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–14； UniProt 1–14 作者链 A； PDB构建体 304–426； UniProt 305–427 作者链 B； PDB构建体 1–14； UniProt 1–14 作者链 B； PDB构建体 304–426； UniProt 305–427 作者链 C； PDB构建体 1–14； UniProt 1–14 作者链 C； PDB构建体 304–426； UniProt 305–427 作者链 D； PDB构建体 1–14； UniProt 1–14 作者链 D； PDB构建体 304–426； UniProt 305–427

;Intermediate conductance calcium-activated potassium channel protein 4,Small conductance calcium-activated potassium channel protein 2 chimera ;

Homo sapiens

UniProt Q9H2S1

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 9	Calmodulin-1 × 4 （P0DP23） Apamin × 1 （P01500） POTASSIUM ION × 4 CALCIUM ION × 16	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	KCNN2_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 15–303； UniProt 124–412 作者链 B； PDB构建体 15–303； UniProt 124–412 作者链 C； PDB构建体 15–303； UniProt 124–412 作者链 D； PDB构建体 15–303； UniProt 124–412

Calmodulin-1

Homo sapiens

UniProt P0DP23

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 9	;Intermediate conductance calcium-activated potassium channel protein 4,Small conductance calcium-activated potassium channel protein 2 chimera ; × 4 （O15554,Q9H2S1） Apamin × 1 （P01500） POTASSIUM ION × 4 CALCIUM ION × 16	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CALM1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–149； UniProt 1–149 作者链 F； PDB构建体 1–149； UniProt 1–149 作者链 G； PDB构建体 1–149； UniProt 1–149 作者链 H； PDB构建体 1–149； UniProt 1–149

Apamin

物种未注明

UniProt P01500

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 9	;Intermediate conductance calcium-activated potassium channel protein 4,Small conductance calcium-activated potassium channel protein 2 chimera ; × 4 （O15554,Q9H2S1） Calmodulin-1 × 4 （P0DP23） POTASSIUM ION × 4 CALCIUM ION × 16	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	APAM_APIME
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 1–18； UniProt 28–45

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9o52
沉积日期 deposition_date	2025-04-09
结构标题 title	Cryo-EM structure of the human SK2-4 chimera/calmodulin channel complex bound to the bee toxin apamin
关键词 keywords	Ion channel, Toxin, Apamin, Potassium, TRANSPORT PROTEIN-TOXIN complex; TRANSPORT PROTEIN/TOXIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9o52__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9o52__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

9o52__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	42.44 Å
Rg（电子密度）	41.38 Å
总 Rg	41.61 Å
原子数	16185
残基数	2056
排除体积	291140 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`9o52__assembly_1__model_1`	nonameric （9）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	;Intermediate conductance calcium-activated potassium channel protein 4,Small conductance calcium-activated potassium channel protein 2 chimera ;
分子量 formula_weight	49382.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D
原子数 atom_count	16185

MGGDLVLGLGALRRRRALFEKRKRLSDYALIFGMFGIVVMVIETELSWGAYDKASLYSLALKCLISLSTIILLGLIIVYHAREIQLFMVDNGADDWRIAMTYERIFFICLEILVCAIHPIPGNYTFTWTARLAFSYAPSTTTADVDIILSIPMFLRLYLIARVMLLHSKLFTDASSRSIGALNKINFNTRFVMKTLMTICPGTVLLVFSISLWIIAAWTVRACERYHDQQDVTSNFLGAMWLISITFLSIGYGDMVPNTYCGKGVCLLTGIMGAGCTALVVAVVARKLELTKAEKHVHNFMMDIQYTKEMKESAARVLQEAWMFYKHTRRKESHAARRHQRKLLAAINAFRQVRLKHRKLREQVNSMVDISKMHMILYDLQQNLSSSHRALEKQIDTLAGKLDALTELLSTALGPRQLPEPSQQSKSSSLEVLFQ

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Calmodulin-1
分子量 formula_weight	16852.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,F,G,H

MADQLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEEFVQMMTAK

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Apamin
分子量 formula_weight	2036.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I

CNCKAPETALCARRCQQH

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	POTASSIUM ION
分子量 formula_weight	39.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	CALCIUM ION
分子量 formula_weight	40.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	16

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.180 Å
最低分辨率 resolution_low	— Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	—
R_free r_free	—

分辨率 resolution	3.18 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	734192

Cryo-EM structure of the human SK2-4 chimera/calmodulin channel complex bound to the bee toxin apamin

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

;Intermediate conductance calcium-activated potassium channel protein 4,Small conductance calcium-activated potassium channel protein 2 chimera ;

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

;Intermediate conductance calcium-activated potassium channel protein 4,Small conductance calcium-activated potassium channel protein 2 chimera ;

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Calmodulin-1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Apamin

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

9o52__assembly_1__model_1

9o52__assembly_1__model_1 | I(q)

9o52__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

7. 引用文献 (1)

Cryo-EM structure of the human SK2-4 chimera/calmodulin channel complex bound to the bee toxin apamin

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

;Intermediate conductance calcium-activated potassium channel protein 4,Small conductance calcium-activated potassium channel protein 2 chimera ;

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

;Intermediate conductance calcium-activated potassium channel protein 4,Small conductance calcium-activated potassium channel protein 2 chimera ;

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Calmodulin-1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Apamin

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

9o52__assembly_1__model_1

9o52__assembly_1__model_1 | I(q)

9o52__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

7. 引用文献 (1)