SAXSdb — 9rtw

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

AP-3 complex subunit beta

Pan troglodytes

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 8	AP-3 complex subunit delta-1 × 1 （O14617） ADP-ribosylation factor 1 × 4 （P84077） AP-3 complex subunit mu-1 × 1 （A6KKR5） AP-3 complex subunit sigma-1 × 1 （Q92572）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A2I3SW12_PANTR
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–563； UniProt 43–636

AP-3 complex subunit delta-1

Homo sapiens

UniProt O14617

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 8	AP-3 complex subunit beta × 1 （A0A2I3SW12） ADP-ribosylation factor 1 × 4 （P84077） AP-3 complex subunit mu-1 × 1 （A6KKR5） AP-3 complex subunit sigma-1 × 1 （Q92572）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	AP3D1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–615； UniProt 18–632

ADP-ribosylation factor 1

Homo sapiens

UniProt P84077

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 8	AP-3 complex subunit beta × 1 （A0A2I3SW12） AP-3 complex subunit delta-1 × 1 （O14617） AP-3 complex subunit mu-1 × 1 （A6KKR5） AP-3 complex subunit sigma-1 × 1 （Q92572）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ARF1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–167； UniProt 15–181 作者链 F； PDB构建体 1–167； UniProt 15–181 作者链 G； PDB构建体 1–167； UniProt 15–181 作者链 H； PDB构建体 1–167； UniProt 15–181

AP-3 complex subunit mu-1

Rattus norvegicus

UniProt A6KKR5

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 8	AP-3 complex subunit beta × 1 （A0A2I3SW12） AP-3 complex subunit delta-1 × 1 （O14617） ADP-ribosylation factor 1 × 4 （P84077） AP-3 complex subunit sigma-1 × 1 （Q92572）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A6KKR5_RAT
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 M； PDB构建体 1–418； UniProt 1–418

AP-3 complex subunit sigma-1

Homo sapiens

UniProt Q92572

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 8	AP-3 complex subunit beta × 1 （A0A2I3SW12） AP-3 complex subunit delta-1 × 1 （O14617） ADP-ribosylation factor 1 × 4 （P84077） AP-3 complex subunit mu-1 × 1 （A6KKR5）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	AP3S1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 S； PDB构建体 1–153； UniProt 1–153

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9rtw
沉积日期 deposition_date	2025-07-03
结构标题 title	Mammalian AP3 complex on tubular membranes (AP3 centered)
关键词 keywords	Cargo adapter, Coat, trafficking, ENDOCYTOSIS; ENDOCYTOSIS
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9rtw__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9rtw__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

9rtw__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	52.38 Å
Rg（电子密度）	52.41 Å
总 Rg	52.44 Å
原子数	9669
残基数	2417
排除体积	133150 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`9rtw__assembly_1__model_1`	octameric （8）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	AP-3 complex subunit beta
分子量 formula_weight	63957.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B
原子数 atom_count	9669

KNEDLKQMLESNKDSAKLDAMKRIVGMIAKGKNASELFPAVVKNVASKNIEIKKLVYVYLVRYAEEQQDLALLSISTFQRALKDPNQLIRASALRVLSSIRVPIIVPIMMLAIKEASADLSPYVRKNAAHAIQKLYSLDPEQKEMLIEVIEKLLKDKSTLVAGSVVMAFEEVCPDRIDLIHKNYRKLCNLLVDVEEWGQVVIIHMLTRYARTQFVSPWTMDPDHRLLIRNTKPLLQSRNAAVVMAVAQLYWHISPKSEAGIISKSLVRLLRSNREVQYIVLQNIATMSIQRKGMFEPYLKSFYVRSTDPTMIKTLKLEILTNLANEANISTLLREFQTYVKSQDKQFAAATIQTIGRCATNILEVTDTCLNGLVCLLSNRDEIVVAESVVVIKKLLQMQPAQHGEIIKHMAKLLDSITVPVARASILWLIGENCERVPKIAPDVLRKMAKSFTSEDDLVKLQILNLGAKLYLTNSKQTKLLTQYILNLGKYDQNYDIRDRTRFIRQLIVPNEKSGALSKYAKKIFLAQKPAPLLESPFKDRDHFQLGTLSHTLNIKATGYLEL

来源 Source

来源生物 organism	Pan troglodytes
通用名 common_name	chimpanzee
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9598
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	AP-3 complex subunit delta-1
分子量 formula_weight	69061.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

LQDLVRGIRNHKEDEAKYISQCIDEIKQELKQDNIAVKANAVCKLTYLQMLGYDISWAAFNIIEVMSASKFTFKRIGYLAASQSFHEGTNVIMLTTNQIRKDLSSPSQYDTGVALTGLSCFVTPDLARDLANDIMTLMSHTKPYIRKKAVLIMYKVFLKYPESLRPAFPRLKEKLEDPDPGVQSAAVNVICELARRNPKNYLSLAPLFFKLMTSSTNNWVLIKIIKLFGALTPLEPRLGKKLIEPLTNLIHSTSAMSLLYECVNTVIAVLISLSSGMPNHSASIQLCVQKLRILIEDSDQNLKYLGLLAMSKILKTHPKSVQSHKDLILQCLDDKDESIRLRALDLLYGMVSKKNLMEIVKKLMTHVDKAEGTTYRDELLTKIIDICSQSNYQYITNFEWYISILVELTRLEGTRHGHLIAAQMLDVAIRVKAIRKFAVSQMSALLDSAHLLASSTQRNGICEVLYAAAWICGEFSEHLQEPHHTLEAMLRPRVTTLPGHIQAVYVQNVVKLYASILQQKEQAGEAEGAQAVTQLMVDRLPQFVQSADLEVQERASCILQLVKHIQKLQAKDVPVAEEVSALFAGELNPVAPKAQKKVPVPEGLDLDAWINEPLS

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	ADP-ribosylation factor 1
分子量 formula_weight	19209.9 kDa
EC 编号 ec_number	3.6.5.2
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,F,G,H

KKEMRILMVGLDAAGKTTILYKLKLGEIVTTIPTIGFNVETVEYKNISFTVWDVGGQDKIRPLWRHYFQNTQGLIFVVDSNDRERVNEAREELMRMLAEDELRDAVLLVFANKQDLPNAMNAAEITDKLGLHSLRHRNWYIQATCATSGDGLYEGLDWLSNQLRNQK

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	AP-3 complex subunit mu-1
分子量 formula_weight	47018.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	M

MIHSLFLINCSGDIFLEKHWKSVVSQSVCDYFFEAQEKAADVENVPPVISTPHHYLISIYRDKLFFVSVIQTEVSPLFVIEFLHRVADTFQDYFGECSEAAIKDNVVIVYELLEEMLDNGFPLATESNILKELIKPPTILRSVVNSITGSSNVGDTLPTGQLSNIPWRRAGVKYTNNEAYFDVVEEIDAIIDKSGSTVFAEIQGVIDACIKLSGMPDLSLSFMNPRLLDDVSFHPCIRFKRWESERVLSFIPPDGNFRLISYRVSSQNLVAIPVYVKHNISFKENSSCGRFDITIGPKQNMGKTIEGITVTVHMPKVVLNMNLTPTQGSYTFDPVTKVLAWDVGKITPQKLPSLKGLVNLQSGAPKPEENPNLNIQFKIQQLAISGLKVNRLDMYGEKYKPFKGVKYITKAGKFQVRT

来源 Source

来源生物 organism	Rattus norvegicus
通用名 common_name	Norway rat
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10116
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	AP-3 complex subunit sigma-1
分子量 formula_weight	17566.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	S

MIKAILIFNNYGKPRLSKFYQPYSEDTQQQIIRETFHLVSKRDENVCNFLEGGLLIGGSDNKLIYRHYATLYFVFCVDSSESELGILDLIQVFVETLDKCFENVCELDLIFHVDKVHNILAEMVMGGMVLETNMNEIVTQIDAQNKLEKSEAG

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

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分辨率 resolution	7.40 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	42469

Mammalian AP3 complex on tubular membranes (AP3 centered)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

AP-3 complex subunit beta

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

AP-3 complex subunit delta-1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

ADP-ribosylation factor 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

AP-3 complex subunit mu-1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

AP-3 complex subunit sigma-1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

9rtw__assembly_1__model_1

9rtw__assembly_1__model_1 | I(q)

9rtw__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 引用文献 (1)