SAXSdb — 9rtz

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

AP-3 complex subunit beta

Pan troglodytes

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 14	AP-3 complex subunit delta × 2 （A0A8V8TQW4） ADP-ribosylation factor 1 × 6 （P84077） AP-3 complex subunit mu-1 × 2 （A6KKR5） AP-3 complex subunit sigma-1 × 2 （Q92572）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A2I3SW12_PANTR
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 13–658； UniProt 3–648 作者链 b； PDB构建体 13–658； UniProt 3–648

AP-3 complex subunit delta

Homo sapiens

UniProt A0A8V8TQW4

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 14	AP-3 complex subunit beta × 2 （A0A2I3SW12） ADP-ribosylation factor 1 × 6 （P84077） AP-3 complex subunit mu-1 × 2 （A6KKR5） AP-3 complex subunit sigma-1 × 2 （Q92572）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A8V8TQW4_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–1203； UniProt 1–1203 作者链 d； PDB构建体 1–1203； UniProt 1–1203

ADP-ribosylation factor 1

Homo sapiens

UniProt P84077

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 14	AP-3 complex subunit beta × 2 （A0A2I3SW12） AP-3 complex subunit delta × 2 （A0A8V8TQW4） AP-3 complex subunit mu-1 × 2 （A6KKR5） AP-3 complex subunit sigma-1 × 2 （Q92572）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ARF1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–181； UniProt 1–181 作者链 F； PDB构建体 1–181； UniProt 1–181 作者链 G； PDB构建体 1–181； UniProt 1–181 作者链 H； PDB构建体 1–181； UniProt 1–181 作者链 I； PDB构建体 1–181； UniProt 1–181 作者链 J； PDB构建体 1–181； UniProt 1–181

AP-3 complex subunit mu-1

Rattus norvegicus

UniProt A6KKR5

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 14	AP-3 complex subunit beta × 2 （A0A2I3SW12） AP-3 complex subunit delta × 2 （A0A8V8TQW4） ADP-ribosylation factor 1 × 6 （P84077） AP-3 complex subunit sigma-1 × 2 （Q92572）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A6KKR5_RAT
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 M； PDB构建体 1–418； UniProt 1–418 作者链 m； PDB构建体 1–418； UniProt 1–418

AP-3 complex subunit sigma-1

Homo sapiens

UniProt Q92572

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 14	AP-3 complex subunit beta × 2 （A0A2I3SW12） AP-3 complex subunit delta × 2 （A0A8V8TQW4） ADP-ribosylation factor 1 × 6 （P84077） AP-3 complex subunit mu-1 × 2 （A6KKR5）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	AP3S1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 S； PDB构建体 1–193； UniProt 1–193 作者链 s； PDB构建体 1–193； UniProt 1–193

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9rtz
沉积日期 deposition_date	2025-07-03
结构标题 title	Mammalian AP3 complex on tubular membranes (ARF1 centered Delta-ARF1 dimer-Delta3 interface)
关键词 keywords	Cargo adapter, Coat, trafficking, ENDOCYTOSIS; ENDOCYTOSIS
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9rtz__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9rtz__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

9rtz__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	86.08 Å
Rg（电子密度）	87.23 Å
总 Rg	86.94 Å
原子数	18000
残基数	4500
排除体积	247810 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`9rtz__assembly_1__model_1`	14-meric （14）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	AP-3 complex subunit beta
分子量 formula_weight	74584.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	b,B
原子数 atom_count	18000

HHHHHHHHHHMASNSFPYNEQSGGGEATELGQEATSTISPSGAFGLFSSDLKKNEDLKQMLESNKDSAKLDAMKRIVGMIAKGKNASELFPAVVKNVASKNIEIKKLVYVYLVRYAEEQQDLALLSISTFQRALKDPNQLIRASALRVLSSIRVPIIVPIMMLAIKEASADLSPYVRKNAAHAIQKLYSLDPEQKEMLIEVIEKLLKDKSTLVAGSVVMAFEEVCPDRIDLIHKNYRKLCNLLVDVEEWGQVVIIHMLTRYARTQFVSPWKEGDELEDNGKNFYESDDDQKEKTDKKKKPYTMDPDHRLLIRNTKPLLQSRNAAVVMAVAQLYWHISPKSEAGIISKSLVRLLRSNREVQYIVLQNIATMSIQRKGMFEPYLKSFYVRSTDPTMIKTLKLEILTNLANEANISTLLREFQTYVKSQDKQFAAATIQTIGRCATNILEVTDTCLNGLVCLLSNRDEIVVAESVVVIKKLLQMQPAQHGEIIKHMAKLLDSITVPVARASILWLIGENCERVPKIAPDVLRKMAKSFTSEDDLVKLQILNLGAKLYLTNSKQTKLLTQYILNLGKYDQNYDIRDRTRFIRQLIVPNEKSGALSKYAKKIFLAQKPAPLLESPFKDRDHFQLGTLSHTLNIKATGYLELSNWPEVAPDPSV

来源 Source

来源生物 organism	Pan troglodytes
通用名 common_name	chimpanzee
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9598
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	AP-3 complex subunit delta
分子量 formula_weight	135628.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	d,D

MALKMVKGSIDRMFDKNLQDLVRGIRNHKEDEAKYISQCIDEIKQELKQDNIAVKANAVCKLTYLQMLGYDISWAAFNIIEVMSASKFTFKRIGYLAASQSFHEGTNVIMLTTNQIRKDLSSPSQYDTGVALTGLSCFVTPDLARDLANDIMTLMSHTKPYIRKKAVLIMYKVFLKYPESLRPAFPRLKEKLEDPDPGVQSAAVNVICELARRNPKNYLSLAPLFFKLMTSSTNNWVLIKIIKLFGALTPLEPRLGKKLIEPLTNLIHSTSAMSLLYECVNTVIAVLISLSSGMPNHSASIQLCVQKLRILIEDSDQNLKYLGLLAMSKILKTHPKSVQSHKDLILQCLDDKDESIRLRALDLLYGMVSKKNLMEIVKKLMTHVDKAEGTTYRDELLTKIIDICSQSNYQYITNFEWYISILVELTRLEGTRHGHLIAAQMLDVAIRVKAIRKFAVSQMSALLDSAHLLASSTQRNGICEVLYAAAWICGEFSEHLQEPHHTLEAMLRPRVTTLPGHIQAVYVQNVVKLYASILQQKEQAGEAEGAQAVTQLMVDRLPQFVQSADLEVQERASCILQLVKHIQKLQAKDVPVAEEVSALFAGELNPVAPKAQKKVPVPEGLDLDAWINEPLSDSESEDERPRAVFHEEEQRRPKHRPSEADEEELARRREARKQEQANNPFYIKSSPSPQKRYQDTPGVEHIPVVQIDLSVPLKVPGLPMSDQYVKLEEERRHRQKLEKDKRRKKRKEKEKKGKRRHSSLPTESDEDIAPAQQVDIVTEEMPENALPSDEDDKDPNDPYRALDIDLDKPLADSEKLPIQKHRNTETSKSPEKDVPMVEKKSKKPKKKEKKHKEKERDKEKKKEKEKKAEDLDFWLSTTPPPAPAPAPAPVPSTDECEDAKTEAQGEEDDAEGQDQDKKSPKPKKKKHRKEKEERTKGKKKSKKQPPGSEEAAGEPVQNGAPEEEQLPPESSYSLLAENSYVKMTCDIRGSLQEDSQVTVAIVLENRSSSILKGMELSVLDSLNARMARPQGSSVHDGVPVPFQLPPGVSNEAQYVFTIQSIVMAQKLKGTLSFIAKNDEGATHEKLDFRLHFSCSSYLITTPCYSDAFAKLLESGDLSMSSIKVDGIRMSFQNLLAKICFHHHFSVVERVDSCASMYSRSIQGHHVCLLVKKGENSVSVDGKCSDSTLLSNLLEEMKATLAKC

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	ADP-ribosylation factor 1
分子量 formula_weight	20721.7 kDa
EC 编号 ec_number	3.6.5.2
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I,J,G,H,E,F

MGNIFANLFKGLFGKKEMRILMVGLDAAGKTTILYKLKLGEIVTTIPTIGFNVETVEYKNISFTVWDVGGQDKIRPLWRHYFQNTQGLIFVVDSNDRERVNEAREELMRMLAEDELRDAVLLVFANKQDLPNAMNAAEITDKLGLHSLRHRNWYIQATCATSGDGLYEGLDWLSNQLRNQK

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	AP-3 complex subunit mu-1
分子量 formula_weight	47018.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	m,M

MIHSLFLINCSGDIFLEKHWKSVVSQSVCDYFFEAQEKAADVENVPPVISTPHHYLISIYRDKLFFVSVIQTEVSPLFVIEFLHRVADTFQDYFGECSEAAIKDNVVIVYELLEEMLDNGFPLATESNILKELIKPPTILRSVVNSITGSSNVGDTLPTGQLSNIPWRRAGVKYTNNEAYFDVVEEIDAIIDKSGSTVFAEIQGVIDACIKLSGMPDLSLSFMNPRLLDDVSFHPCIRFKRWESERVLSFIPPDGNFRLISYRVSSQNLVAIPVYVKHNISFKENSSCGRFDITIGPKQNMGKTIEGITVTVHMPKVVLNMNLTPTQGSYTFDPVTKVLAWDVGKITPQKLPSLKGLVNLQSGAPKPEENPNLNIQFKIQQLAISGLKVNRLDMYGEKYKPFKGVKYITKAGKFQVRT

来源 Source

来源生物 organism	Rattus norvegicus
通用名 common_name	Norway rat
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10116
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	AP-3 complex subunit sigma-1
分子量 formula_weight	21780.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	s,S

MIKAILIFNNYGKPRLSKFYQPYSEDTQQQIIRETFHLVSKRDENVCNFLEGGLLIGGSDNKLIYRHYATLYFVFCVDSSESELGILDLIQVFVETLDKCFENVCELDLIFHVDKVHNILAEMVMGGMVLETNMNEIVTQIDAQNKLEKSEAGLAGAPARAVSAVKNMNLPEIPRNINIGDISIKVPNLPSFK

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

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分辨率 resolution	13.00 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	2935

Mammalian AP3 complex on tubular membranes (ARF1 centered Delta-ARF1 dimer-Delta3 interface)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

AP-3 complex subunit beta

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

AP-3 complex subunit delta

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

ADP-ribosylation factor 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

AP-3 complex subunit mu-1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

AP-3 complex subunit sigma-1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

9rtz__assembly_1__model_1

9rtz__assembly_1__model_1 | I(q)

9rtz__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 引用文献 (1)