9v29

Cryo- EM structure of small subunit (body) of 75S ribosome with A/P- & P/E- tRNAs from Entamoeba histolytica bound to antibiotic paromomycin

Method: ELECTRON MICROSCOPY

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

40S ribosomal protein S26

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 15 RNA 4	Small ribosomal subunit protein eS27 × 1 （P38654） A/P-tRNA × 1 P/E-tRNA × 1 mRNA × 1 17S rRNA × 1 Small ribosomal subunit protein uS2 × 1 （C4M5A0） Small ribosomal subunit protein uS5 × 1 （C4M7U0） Small ribosomal subunit protein eS1 × 1 （C4M609） 40S ribosomal protein S4, putative × 1 （C4LYF4） 40S ribosomal protein S6 × 1 （C4LXN2） 40S ribosomal protein S7 × 1 （C4M9F9） 40S ribosomal protein S8 × 1 （C4M0Q2） Small ribosomal subunit protein uS4 × 1 （O15612） 40S ribosomal protein S11, putative × 1 （C4M979） 40S ribosomal protein S13, putative × 1 （A0A175JJM9） Ribosomal protein S14, putative × 1 （B1N2I3） 40S ribosomal protein S15a, putative × 1 （C4LXM0） 40S ribosomal protein S23, putative × 1 （C4M5B7） PAROMOMYCIN × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	C4M7G9_ENTH1
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 sB； PDB构建体 1–144； UniProt 1–144

Small ribosomal subunit protein eS27

物种未注明

UniProt P38654

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 15 RNA 4	40S ribosomal protein S26 × 1 （C4M7G9） A/P-tRNA × 1 P/E-tRNA × 1 mRNA × 1 17S rRNA × 1 Small ribosomal subunit protein uS2 × 1 （C4M5A0） Small ribosomal subunit protein uS5 × 1 （C4M7U0） Small ribosomal subunit protein eS1 × 1 （C4M609） 40S ribosomal protein S4, putative × 1 （C4LYF4） 40S ribosomal protein S6 × 1 （C4LXN2） 40S ribosomal protein S7 × 1 （C4M9F9） 40S ribosomal protein S8 × 1 （C4M0Q2） Small ribosomal subunit protein uS4 × 1 （O15612） 40S ribosomal protein S11, putative × 1 （C4M979） 40S ribosomal protein S13, putative × 1 （A0A175JJM9） Ribosomal protein S14, putative × 1 （B1N2I3） 40S ribosomal protein S15a, putative × 1 （C4LXM0） 40S ribosomal protein S23, putative × 1 （C4M5B7） PAROMOMYCIN × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RS27_ENTH1
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 sC； PDB构建体 1–84； UniProt 1–84

Small ribosomal subunit protein uS2

物种未注明

UniProt C4M5A0

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 15 RNA 4	40S ribosomal protein S26 × 1 （C4M7G9） Small ribosomal subunit protein eS27 × 1 （P38654） A/P-tRNA × 1 P/E-tRNA × 1 mRNA × 1 17S rRNA × 1 Small ribosomal subunit protein uS5 × 1 （C4M7U0） Small ribosomal subunit protein eS1 × 1 （C4M609） 40S ribosomal protein S4, putative × 1 （C4LYF4） 40S ribosomal protein S6 × 1 （C4LXN2） 40S ribosomal protein S7 × 1 （C4M9F9） 40S ribosomal protein S8 × 1 （C4M0Q2） Small ribosomal subunit protein uS4 × 1 （O15612） 40S ribosomal protein S11, putative × 1 （C4M979） 40S ribosomal protein S13, putative × 1 （A0A175JJM9） Ribosomal protein S14, putative × 1 （B1N2I3） 40S ribosomal protein S15a, putative × 1 （C4LXM0） 40S ribosomal protein S23, putative × 1 （C4M5B7） PAROMOMYCIN × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	C4M5A0_ENTH1
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 sb； PDB构建体 1–254； UniProt 1–254

Small ribosomal subunit protein uS5

物种未注明

UniProt C4M7U0

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 15 RNA 4	40S ribosomal protein S26 × 1 （C4M7G9） Small ribosomal subunit protein eS27 × 1 （P38654） A/P-tRNA × 1 P/E-tRNA × 1 mRNA × 1 17S rRNA × 1 Small ribosomal subunit protein uS2 × 1 （C4M5A0） Small ribosomal subunit protein eS1 × 1 （C4M609） 40S ribosomal protein S4, putative × 1 （C4LYF4） 40S ribosomal protein S6 × 1 （C4LXN2） 40S ribosomal protein S7 × 1 （C4M9F9） 40S ribosomal protein S8 × 1 （C4M0Q2） Small ribosomal subunit protein uS4 × 1 （O15612） 40S ribosomal protein S11, putative × 1 （C4M979） 40S ribosomal protein S13, putative × 1 （A0A175JJM9） Ribosomal protein S14, putative × 1 （B1N2I3） 40S ribosomal protein S15a, putative × 1 （C4LXM0） 40S ribosomal protein S23, putative × 1 （C4M5B7） PAROMOMYCIN × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	C4M7U0_ENTH1
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 sc； PDB构建体 1–255； UniProt 1–255

Small ribosomal subunit protein eS1

物种未注明

UniProt C4M609

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 15 RNA 4	40S ribosomal protein S26 × 1 （C4M7G9） Small ribosomal subunit protein eS27 × 1 （P38654） A/P-tRNA × 1 P/E-tRNA × 1 mRNA × 1 17S rRNA × 1 Small ribosomal subunit protein uS2 × 1 （C4M5A0） Small ribosomal subunit protein uS5 × 1 （C4M7U0） 40S ribosomal protein S4, putative × 1 （C4LYF4） 40S ribosomal protein S6 × 1 （C4LXN2） 40S ribosomal protein S7 × 1 （C4M9F9） 40S ribosomal protein S8 × 1 （C4M0Q2） Small ribosomal subunit protein uS4 × 1 （O15612） 40S ribosomal protein S11, putative × 1 （C4M979） 40S ribosomal protein S13, putative × 1 （A0A175JJM9） Ribosomal protein S14, putative × 1 （B1N2I3） 40S ribosomal protein S15a, putative × 1 （C4LXM0） 40S ribosomal protein S23, putative × 1 （C4M5B7） PAROMOMYCIN × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	C4M609_ENTH1
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 se； PDB构建体 1–256； UniProt 1–256

40S ribosomal protein S4, putative

物种未注明

UniProt C4LYF4

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 15 RNA 4	40S ribosomal protein S26 × 1 （C4M7G9） Small ribosomal subunit protein eS27 × 1 （P38654） A/P-tRNA × 1 P/E-tRNA × 1 mRNA × 1 17S rRNA × 1 Small ribosomal subunit protein uS2 × 1 （C4M5A0） Small ribosomal subunit protein uS5 × 1 （C4M7U0） Small ribosomal subunit protein eS1 × 1 （C4M609） 40S ribosomal protein S6 × 1 （C4LXN2） 40S ribosomal protein S7 × 1 （C4M9F9） 40S ribosomal protein S8 × 1 （C4M0Q2） Small ribosomal subunit protein uS4 × 1 （O15612） 40S ribosomal protein S11, putative × 1 （C4M979） 40S ribosomal protein S13, putative × 1 （A0A175JJM9） Ribosomal protein S14, putative × 1 （B1N2I3） 40S ribosomal protein S15a, putative × 1 （C4LXM0） 40S ribosomal protein S23, putative × 1 （C4M5B7） PAROMOMYCIN × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	C4LYF4_ENTH1
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 sf； PDB构建体 1–326； UniProt 1–326

40S ribosomal protein S6

物种未注明

UniProt C4LXN2

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 15 RNA 4	40S ribosomal protein S26 × 1 （C4M7G9） Small ribosomal subunit protein eS27 × 1 （P38654） A/P-tRNA × 1 P/E-tRNA × 1 mRNA × 1 17S rRNA × 1 Small ribosomal subunit protein uS2 × 1 （C4M5A0） Small ribosomal subunit protein uS5 × 1 （C4M7U0） Small ribosomal subunit protein eS1 × 1 （C4M609） 40S ribosomal protein S4, putative × 1 （C4LYF4） 40S ribosomal protein S7 × 1 （C4M9F9） 40S ribosomal protein S8 × 1 （C4M0Q2） Small ribosomal subunit protein uS4 × 1 （O15612） 40S ribosomal protein S11, putative × 1 （C4M979） 40S ribosomal protein S13, putative × 1 （A0A175JJM9） Ribosomal protein S14, putative × 1 （B1N2I3） 40S ribosomal protein S15a, putative × 1 （C4LXM0） 40S ribosomal protein S23, putative × 1 （C4M5B7） PAROMOMYCIN × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	C4LXN2_ENTH1
Isoform	—
PDB实体	11
链与序列区间	作者链 sh； PDB构建体 1–266； UniProt 1–266

40S ribosomal protein S7

物种未注明

UniProt C4M9F9

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 15 RNA 4	40S ribosomal protein S26 × 1 （C4M7G9） Small ribosomal subunit protein eS27 × 1 （P38654） A/P-tRNA × 1 P/E-tRNA × 1 mRNA × 1 17S rRNA × 1 Small ribosomal subunit protein uS2 × 1 （C4M5A0） Small ribosomal subunit protein uS5 × 1 （C4M7U0） Small ribosomal subunit protein eS1 × 1 （C4M609） 40S ribosomal protein S4, putative × 1 （C4LYF4） 40S ribosomal protein S6 × 1 （C4LXN2） 40S ribosomal protein S8 × 1 （C4M0Q2） Small ribosomal subunit protein uS4 × 1 （O15612） 40S ribosomal protein S11, putative × 1 （C4M979） 40S ribosomal protein S13, putative × 1 （A0A175JJM9） Ribosomal protein S14, putative × 1 （B1N2I3） 40S ribosomal protein S15a, putative × 1 （C4LXM0） 40S ribosomal protein S23, putative × 1 （C4M5B7） PAROMOMYCIN × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	C4M9F9_ENTH1
Isoform	—
PDB实体	12
链与序列区间	作者链 si； PDB构建体 1–201； UniProt 1–201

40S ribosomal protein S8

物种未注明

UniProt C4M0Q2

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 15 RNA 4	40S ribosomal protein S26 × 1 （C4M7G9） Small ribosomal subunit protein eS27 × 1 （P38654） A/P-tRNA × 1 P/E-tRNA × 1 mRNA × 1 17S rRNA × 1 Small ribosomal subunit protein uS2 × 1 （C4M5A0） Small ribosomal subunit protein uS5 × 1 （C4M7U0） Small ribosomal subunit protein eS1 × 1 （C4M609） 40S ribosomal protein S4, putative × 1 （C4LYF4） 40S ribosomal protein S6 × 1 （C4LXN2） 40S ribosomal protein S7 × 1 （C4M9F9） Small ribosomal subunit protein uS4 × 1 （O15612） 40S ribosomal protein S11, putative × 1 （C4M979） 40S ribosomal protein S13, putative × 1 （A0A175JJM9） Ribosomal protein S14, putative × 1 （B1N2I3） 40S ribosomal protein S15a, putative × 1 （C4LXM0） 40S ribosomal protein S23, putative × 1 （C4M5B7） PAROMOMYCIN × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	C4M0Q2_ENTH1
Isoform	—
PDB实体	13
链与序列区间	作者链 sj； PDB构建体 1–237； UniProt 1–237

Small ribosomal subunit protein uS4

物种未注明

UniProt O15612

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 15 RNA 4	40S ribosomal protein S26 × 1 （C4M7G9） Small ribosomal subunit protein eS27 × 1 （P38654） A/P-tRNA × 1 P/E-tRNA × 1 mRNA × 1 17S rRNA × 1 Small ribosomal subunit protein uS2 × 1 （C4M5A0） Small ribosomal subunit protein uS5 × 1 （C4M7U0） Small ribosomal subunit protein eS1 × 1 （C4M609） 40S ribosomal protein S4, putative × 1 （C4LYF4） 40S ribosomal protein S6 × 1 （C4LXN2） 40S ribosomal protein S7 × 1 （C4M9F9） 40S ribosomal protein S8 × 1 （C4M0Q2） 40S ribosomal protein S11, putative × 1 （C4M979） 40S ribosomal protein S13, putative × 1 （A0A175JJM9） Ribosomal protein S14, putative × 1 （B1N2I3） 40S ribosomal protein S15a, putative × 1 （C4LXM0） 40S ribosomal protein S23, putative × 1 （C4M5B7） PAROMOMYCIN × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RS9_ENTH1
Isoform	—
PDB实体	14
链与序列区间	作者链 sk； PDB构建体 1–185； UniProt 1–185

40S ribosomal protein S11, putative

物种未注明

UniProt C4M979

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 15 RNA 4	40S ribosomal protein S26 × 1 （C4M7G9） Small ribosomal subunit protein eS27 × 1 （P38654） A/P-tRNA × 1 P/E-tRNA × 1 mRNA × 1 17S rRNA × 1 Small ribosomal subunit protein uS2 × 1 （C4M5A0） Small ribosomal subunit protein uS5 × 1 （C4M7U0） Small ribosomal subunit protein eS1 × 1 （C4M609） 40S ribosomal protein S4, putative × 1 （C4LYF4） 40S ribosomal protein S6 × 1 （C4LXN2） 40S ribosomal protein S7 × 1 （C4M9F9） 40S ribosomal protein S8 × 1 （C4M0Q2） Small ribosomal subunit protein uS4 × 1 （O15612） 40S ribosomal protein S13, putative × 1 （A0A175JJM9） Ribosomal protein S14, putative × 1 （B1N2I3） 40S ribosomal protein S15a, putative × 1 （C4LXM0） 40S ribosomal protein S23, putative × 1 （C4M5B7） PAROMOMYCIN × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	C4M979_ENTH1
Isoform	—
PDB实体	15
链与序列区间	作者链 sm； PDB构建体 1–156； UniProt 1–156

40S ribosomal protein S13, putative

物种未注明

UniProt A0A175JJM9

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 15 RNA 4	40S ribosomal protein S26 × 1 （C4M7G9） Small ribosomal subunit protein eS27 × 1 （P38654） A/P-tRNA × 1 P/E-tRNA × 1 mRNA × 1 17S rRNA × 1 Small ribosomal subunit protein uS2 × 1 （C4M5A0） Small ribosomal subunit protein uS5 × 1 （C4M7U0） Small ribosomal subunit protein eS1 × 1 （C4M609） 40S ribosomal protein S4, putative × 1 （C4LYF4） 40S ribosomal protein S6 × 1 （C4LXN2） 40S ribosomal protein S7 × 1 （C4M9F9） 40S ribosomal protein S8 × 1 （C4M0Q2） Small ribosomal subunit protein uS4 × 1 （O15612） 40S ribosomal protein S11, putative × 1 （C4M979） Ribosomal protein S14, putative × 1 （B1N2I3） 40S ribosomal protein S15a, putative × 1 （C4LXM0） 40S ribosomal protein S23, putative × 1 （C4M5B7） PAROMOMYCIN × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A175JJM9_ENTH1
Isoform	—
PDB实体	16
链与序列区间	作者链 so； PDB构建体 1–151； UniProt 1–151

Ribosomal protein S14, putative

物种未注明

UniProt B1N2I3

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 15 RNA 4	40S ribosomal protein S26 × 1 （C4M7G9） Small ribosomal subunit protein eS27 × 1 （P38654） A/P-tRNA × 1 P/E-tRNA × 1 mRNA × 1 17S rRNA × 1 Small ribosomal subunit protein uS2 × 1 （C4M5A0） Small ribosomal subunit protein uS5 × 1 （C4M7U0） Small ribosomal subunit protein eS1 × 1 （C4M609） 40S ribosomal protein S4, putative × 1 （C4LYF4） 40S ribosomal protein S6 × 1 （C4LXN2） 40S ribosomal protein S7 × 1 （C4M9F9） 40S ribosomal protein S8 × 1 （C4M0Q2） Small ribosomal subunit protein uS4 × 1 （O15612） 40S ribosomal protein S11, putative × 1 （C4M979） 40S ribosomal protein S13, putative × 1 （A0A175JJM9） 40S ribosomal protein S15a, putative × 1 （C4LXM0） 40S ribosomal protein S23, putative × 1 （C4M5B7） PAROMOMYCIN × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	B1N2I3_ENTH1
Isoform	—
PDB实体	17
链与序列区间	作者链 sp； PDB构建体 1–146； UniProt 1–146

40S ribosomal protein S15a, putative

物种未注明

UniProt C4LXM0

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 15 RNA 4	40S ribosomal protein S26 × 1 （C4M7G9） Small ribosomal subunit protein eS27 × 1 （P38654） A/P-tRNA × 1 P/E-tRNA × 1 mRNA × 1 17S rRNA × 1 Small ribosomal subunit protein uS2 × 1 （C4M5A0） Small ribosomal subunit protein uS5 × 1 （C4M7U0） Small ribosomal subunit protein eS1 × 1 （C4M609） 40S ribosomal protein S4, putative × 1 （C4LYF4） 40S ribosomal protein S6 × 1 （C4LXN2） 40S ribosomal protein S7 × 1 （C4M9F9） 40S ribosomal protein S8 × 1 （C4M0Q2） Small ribosomal subunit protein uS4 × 1 （O15612） 40S ribosomal protein S11, putative × 1 （C4M979） 40S ribosomal protein S13, putative × 1 （A0A175JJM9） Ribosomal protein S14, putative × 1 （B1N2I3） 40S ribosomal protein S23, putative × 1 （C4M5B7） PAROMOMYCIN × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	C4LXM0_ENTH1
Isoform	—
PDB实体	18
链与序列区间	作者链 sr； PDB构建体 1–130； UniProt 1–130

40S ribosomal protein S23, putative

物种未注明

UniProt C4M5B7

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 15 RNA 4	40S ribosomal protein S26 × 1 （C4M7G9） Small ribosomal subunit protein eS27 × 1 （P38654） A/P-tRNA × 1 P/E-tRNA × 1 mRNA × 1 17S rRNA × 1 Small ribosomal subunit protein uS2 × 1 （C4M5A0） Small ribosomal subunit protein uS5 × 1 （C4M7U0） Small ribosomal subunit protein eS1 × 1 （C4M609） 40S ribosomal protein S4, putative × 1 （C4LYF4） 40S ribosomal protein S6 × 1 （C4LXN2） 40S ribosomal protein S7 × 1 （C4M9F9） 40S ribosomal protein S8 × 1 （C4M0Q2） Small ribosomal subunit protein uS4 × 1 （O15612） 40S ribosomal protein S11, putative × 1 （C4M979） 40S ribosomal protein S13, putative × 1 （A0A175JJM9） Ribosomal protein S14, putative × 1 （B1N2I3） 40S ribosomal protein S15a, putative × 1 （C4LXM0） PAROMOMYCIN × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	C4M5B7_ENTH1
Isoform	—
PDB实体	19
链与序列区间	作者链 sy； PDB构建体 1–141； UniProt 1–141

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9v29
沉积日期 deposition_date	2025-05-19
最后修订 last_revision	2025-10-08
结构标题 title	Cryo- EM structure of small subunit (body) of 75S ribosome with A/P- & P/E- tRNAs from Entamoeba histolytica bound to antibiotic paromomycin
关键词 keywords	SSU-body of 75S Ribosome-PAR complex, A/P-tRNA, P/E-tRNA, Entamoeba histolytica, Ribosome; RIBOSOME
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9v29__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9v29__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

9v29__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	52.59 Å
Rg（电子密度）	53.27 Å
总 Rg	53.33 Å
原子数	30600
残基数	2218
排除体积	469070 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`9v29__assembly_1__model_1`	nonadecameric （19）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (20)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	40S ribosomal protein S26
分子量 formula_weight	16455.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	sB
原子数 atom_count	30600

MTSKRRNNGRSKKGRGHTQNVRCSHCGRCVPKDKAIKRYQIKNIVEAAAVRDISDNSALTKYKLPKTYMKLEYCVSCGIHGRVVRVRSRTDRRNRLPPKRVVKKTNKQQAVKPSTEAVKVEIPADVVTAPKVAAQKERPFKYLQ

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Small ribosomal subunit protein eS27
分子量 formula_weight	9338.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	sC

MPLIEVDLLNPTAASEAKAHKMKRLVPTPNSYFLEIKCPKCGATTTTFSHAHRQILCQKCGQPLGQPTGGKLKLTQQCKFRIKK

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	A/P-tRNA
分子量 formula_weight	24484.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	sI

GGCCCCAUAGCUCAGGGAUGAGAGCACGCGACUUUUAAUCGCGUGGUCGCAGGUUCAAGUCCUGCUGGGGCCACCA

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	P/E-tRNA
分子量 formula_weight	24617.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	sJ

CUCUUCAUGGUGCAGCCCGUUAGCUCGUCGGGCUUUUAACCCGAAGGUCUUCGGUUCAAAUCCGGCCGAAGAAACCA

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	mRNA
分子量 formula_weight	3194.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	sK

UUGAAAAAAU

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	17S rRNA
分子量 formula_weight	628401.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	sa

UAUCUGGUUGAUCCUGCCAGUAUUAUAUGCUGAUGUUAAAGAUUAAGCCAUGCAUGUGUAAGUAUAAAGACCAAGUAGGAUGAAACUGCGGACGGCUCAUUAUAACAGUAAUAGUUUCUUUGGUUAGUAAAAUACAAGGAUAGCUUUGUGAAUGAUAAAGAUAAUACUUGAGACGAUCCAGUUUGUAUUAGUACAAAAUGGCCAAUUCAUUCAAUGAAUUGAGAAAUGACAUUCUAAGUGAGUUAGGAUGCCACGACAAUUGUAGAACACACAGUGUUUAACAAGUAACCAAUGAGAAUUUCUGAUCUAUCAAUCAGUUGGUAGUAUCGAGGACUACCAAGAUUAUAACGGAUAACGAGGAAUUGGGGUUCGACAUCGGAGAGGGAGCUUUACAGAUGGCUACCACUUCUAAGGAAGGCAGCAGGCGCGUAAAUUACCCACUUUCGAAUUGAAGAGGUAGUGACGACACAUAACUCUAGAGUUGAGUAAAAUCAAUUCUUGAAGGAAUGAGUAGGAGGUAAAUUCUCCUACGAAAUCAAUUGGAGGGCAAGUCUGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUUCCAGCUCCAAUAGUGUAUAUUAAAGUUGCUGUGAUUAAAACGCUCGUAGUUGAAUUAAAAUGUGGUUUUAUACAUUUUGAAGACUUUAUGUAAGUAAAGUUUCUAGAAAUGUUAAAUUAAAAUCAAAGAAGGAAACAAUUCAAGUAAUUGAGUUGUUAUUACUUUGAAUAAAAUAAGGUGUUUAAAGCAAAACAUUAUGUUAAUGAAUAUUCAAGCAUGGGACAAUGCUGAGGGGAUGUCAAUAAGACAUUUCGAGAGAAGGAUUAAAAGGAACAAUUGGGGUGAUUCAGAAAAUAACGGGAGAGGUGAAAAUCCAUGAUCGCUAUAAGAUGCACGAGAGCGAAAGCAUUUCACUCAACUGUGUCCAUUAAUCAAGAACGAAAGUUAGGGGAUCGAAGACGAUCAGAUACCGUCGUAGUCCUAACUAUAAACGAUGUCAACCAAGGAUUGGAUGAAAUUCAGAUGUACAAAGAUAGAGAAGCAUUGUUUCUAGAUCUGAGUAUAUCAAUAUUACCUUGUUCAGAACUUAAAGAGAAAUCUUGAGUUUAUGGACUUCAGGGGGAGUAUGGUCACAAGGCUGAAACUUAAAGGAAUUGACGGAAGGGCACACCAGGAGUGGAGCCUGCGGCUUAAUUUGACUCAACACGGGAAAACUUACCAAGACCGAACAGUAGAAGGAAUGACAGAUUAAGAGUUCUUUCAUGAUUUAUUGGGUAGUGGUGCAUGGCCGUUCUUAGUUGGUGGAGUGAUUUGUCAGGUUAAUUCCGGUAACGAACGAGACUGAAACCUAUUAAUUAGUUUUCUGCCUAUAAGACAGAAAUGUUCGCAAGAACAGGUGCGUAAGUACCACUUCUUAAAGGGACACAUUUCAAUUGUCCUAUUUUAAUUGUAGUUAUCUAAUUUCGGUUAGACCUCUUUUAACGUGGGAAAAAGAAAAAGGAAGCAUUCAGCAAUAACAGGUCUGUGAUGCCCUUAGACAUCUUGGGCCGCACGCGCGCUACAAUGGAGUUACUAGAGAGUAUUUUAUCAUUUACACCUUAUUUAUUAGGCUUUGUCUAAUAAUUAAGGAUAGUAAGUGGUGUACCGAGAUUGAAAUAGUUAAGGAAAACUCAAAAGAACGUACAUGACAGGGAUAAAUGAUUGGAAUUAUUUGUUUUGAACGAGGAAUUCCUUGUAAUAUCGAGUCAUUAACUCGAGAUGAAUACGUCCCUGCCCUUUGUACACACCGCCCGUCGCUCCUACCGAUUGAAUAAAGAGGUGAAAUUCUAGGAUUCUGUCUUAUAGAUAGAAAAAUGGAUUUAAAUCUCCUUAUUUAGAGGAAGGAGAAGUCGUAACAAGGUUUCCGUAGGUGAACCUGCGGAAGGAUCAUUA

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	Small ribosomal subunit protein uS2
分子量 formula_weight	28634.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	sb

MSKNVKTNFPDILKPSAEDIKMMVACRVHIGATNLNFAMEEYVYERGNNNECIFNLMKTWEKLSLAARVIAGISNETPSDVVAVAGREMAHRASLKFMKYTGCTAVAGRFTPGSFTNQIQKKFMEPRLIIVSDPSVDHQALRESGYINVPTIAFCNSDNSLKNVDIAIPCNNRSRLSIGLMWWMLTREILRYQGKLARDEKWDVMVDLFLHRELDAKKDAPVIAGEEKVAKVEDKKAASDATVASTEWDDQKKN

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	Small ribosomal subunit protein uS5
分子量 formula_weight	27737.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	sc

MDAKQQRGEKRQFGNRRGGRGAPRGRGARKDGASDGWTPVTKLGRLVKDGKVKSIDQIFEFGIKIKEYQIVDHLLPGLKEEVMTMQSVQKQTSAGQRTRLKAYVAIGDHNGHAGLGVKCAKEVAEAIKGAMIQAKLAMVPVRRGYWGATIGEVHTVPCKLTGACGSVRVRLVPAPRGTGIVAAPTPKKFLILAGIEDVFTQTTGHTKTLGNFVKATYDAVRQSYGFQTKDLWKVGGVKQSPMDKYAKILAESKKN

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	Small ribosomal subunit protein eS1
分子量 formula_weight	29094.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	se

MATGKNKKYKAGNVKKGSKRKIAEPFSKKEWYNVKVPKNFKRRTVGQIVVNKTAGTRIASEQLKGRVVEVNLADLMENEKFGAYNYKFKCEDVNGKDCLMIFHGLKLTTDKLRSIVKKWCTLIETSVDVKTTDGHLIRIFCIGFTSRKSNQIKKTSYAKSAQIKKIRKIMNNLITKEAASRELTQFVDYLRENKLPKEIVAKCSKVFSMDNVYIRKVKILKAGKIDSLKLLDQHQDTSAPVEAAPVAEEKGEVVEA

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	40S ribosomal protein S4, putative
分子量 formula_weight	36830.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	sf

MARGPRHHLKRLNAPHHWMLSKLGGTFAPKPSHGPHGMKECLPLILILRNRLNYALNGREVTMIVKNRTIKIDGKIRTDTRYPVGFMDVLSIPRTKENFRLMYNTKRRFCLVPLTAEQAKFKLCKIEKRVLGTGAIPYIVTHDGRTIRYPHPELQANDTIKLNLETGKIVDFVKFDIGNTAMMIGGNGMGRVGVIVKREVHPGSFEIVHIKDAKGNTFTTRLNNVFVIGKGTETLVNLPLDKGIKKPLLQQVNETIKKNKMQKAGIQKASKKSKTTTEKKVTPKAAVEKKEEQVEKIYKKYPKKQAAPKKSKGNKKVVPGKKIGKK

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	40S ribosomal protein S6
分子量 formula_weight	29822.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	sh

MKINVANPATGRIKKFDFEEEKNYRPFLDKRIGQEVDASSLGDEFKGYILKITGGCDKDGFPMMTGVATNNRVRLLLDGRNGCYKPLRNGERRRKTVRGAIVAGDISVLNTIVVKKGEGEIEGVTNDALPMRAGPKRASHIRKLFNLSQKDDVKKFVIRREVAKKHPKEGKSTKRSKAPKIQRLVTPRRLQHKAQKLEAKKLHKIAMLKEAKRYAAILNRYKVLKAHGMKVVSFADTDAVFKQNKAGSKKAASKGKKVGSKKTGKK

实体 12 Entity 12 polymer

描述 description	40S ribosomal protein S7
分子量 formula_weight	21999.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	si

MSGKMTAAKSAARAQVSTEVVVKKPGFDAYSKLVKEAVAGIPELKGVKVISAKKVTISKDKKATVIFIPLRMMRICRASFEKVIEALEKKLNGPVFIIGKRVVAHTKKVGQSGKTDYKPRSRTSKAVHEAYLNEMLYPVEVAGQRVHATLVHKKVANSKTVFVAVDDAKLKNSVKAKLPIYSAVYKNITGEKVKFAFPVVA

实体 13 Entity 13 polymer

描述 description	40S ribosomal protein S8
分子量 formula_weight	27031.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	sj

MGITRDSRHKRRATGGKKNSMQKKKKNTMGRQPANTRLGAIRVHDVRCRYGIIKRRALRLENGNFSWASQSITKGTKILNVVYNASDNDFVRTNTLVKGAIIEIDPAPFRLWFLKFYGKDIASTDYYKSLESATFKTEKKVVLPKEEENKEKTIAQQIAETQVALMNPSKTMQKKYAKKLEVLKNMKFDEALLEGFQSGRVLACISSRPGQTGSVEGYILEGKELDFYSKKISDKKK

实体 14 Entity 14 polymer

描述 description	Small ribosomal subunit protein uS4
分子量 formula_weight	21548.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	sk

MGRCLRNHSITYKTPKVPYERERFDAELKLVGQFGLKNKKEIQRVHYMLGHMRTIAKVMLMKDAKDPKRLLEGAALLRRLHNLGILPRDQNKLEFVLALKEENLLERRLQTLVYRKGFAKSIHHARVLIRGKMIKVGKQVVDVPSFLVRVESEPLIQLADNTPLTNPEINGRRKRKNNHAGKEDN

实体 15 Entity 15 polymer

描述 description	40S ribosomal protein S11, putative
分子量 formula_weight	18248.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	sm

MAEQTERAYQKQVFHHHSRNEKGEIDFGNVKRYHKQIGMGFVTPAEAIKGTYIDKKCPFTSDVSIRGRTLSGIVKSCHMKRTIIVRRDYFHYVSKYQRYEKRHKNIAVHCSPAFRQLKEGDHVVIGQCRPLSKTVRFNVLKFTSRGTGDKKQFAIF

实体 16 Entity 16 polymer

描述 description	40S ribosomal protein S13, putative
分子量 formula_weight	17038.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	so

MGRMYNPGRGISRRCIPYRRSAPSWLKTSTLEVIDEMCKLAKKGIAPSQIGAIMRDTHGVGLVKSVTGSKVLRILKLAGLAPKIPEDLYFLMKRAVSVRKHLEKNKKDKDAKYHLILIESKIHRLTRYYKSAKVLEASFKYDANTASAIVS

实体 17 Entity 17 polymer

描述 description	Ribosomal protein S14, putative
分子量 formula_weight	15670.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	sp

MSKKVAAKSNVPEVIPGSTKDAFGVAHIYATFNDTFVHVTDISGKETIIRITGGMRVKADRDESSPYAAMTAAQDVAKRCKDLGVTSLHIKMRGEGGVYSKTPGPGAQAALRALARANMKIGRIEDVTPIPTDCTKRKGGRRGRRL

实体 18 Entity 18 polymer

描述 description	40S ribosomal protein S15a, putative
分子量 formula_weight	14692.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	sr

MVRVNVLADALKSITNAEKQGKRQVMIRPASKVICEFLNVMMKHQYITDYTVVDTHRSGKIVVNLNGRLNKCAVISPRFNVTLSEFDKWEANLLPSRHFGALVLTTSYGILDNTEARAKHTGGRILGFFY

实体 19 Entity 19 polymer

描述 description	40S ribosomal protein S23, putative
分子量 formula_weight	15745.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	sy

MARGLHAARKMLAQRRANKWADKEWKKGKLVTRYKCNPLGTASHAKGLVQEKLGIETKQPNSGIRKCVRVRLLKNGKKITAFVPRDGSLNYVNENDEVLISGFGRRGHAVGDIPGVRFKVVCVAGVSLWGLWTNKKQKPHA

实体 20 Entity 20 non-polymer

描述 description	PAROMOMYCIN
分子量 formula_weight	615.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	triclinic

分辨率 resolution	3.20 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	37355

Cryo- EM structure of small subunit (body) of 75S ribosome with A/P- & P/E- tRNAs from Entamoeba histolytica bound to antibiotic paromomycin

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

40S ribosomal protein S26

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Small ribosomal subunit protein eS27

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Small ribosomal subunit protein uS2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Small ribosomal subunit protein uS5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Small ribosomal subunit protein eS1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

40S ribosomal protein S4, putative

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

40S ribosomal protein S6

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

40S ribosomal protein S7

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

40S ribosomal protein S8

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Small ribosomal subunit protein uS4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体