Green fluorescent protein,Receptor-recognizing protein gp38
Escherichia phage PP01
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 信息不足 单体 蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白拷贝数一致 | 链 A; UniProt 3–238 | 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293.15 K;10% (w/v) PEG8000, 0.1M Na-HEPES-MOPS, pH7.5, 3mM CaCl2, 3mM MgCl2, 20 % (v/v) ethylene glycol | 分辨率 2.10 Å R-free 0.208 |
| 2 | 信息不足 单体 蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白拷贝数一致 | 链 C; UniProt 3–238 | 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293.15 K;10% (w/v) PEG8000, 0.1M Na-HEPES-MOPS, pH7.5, 3mM CaCl2, 3mM MgCl2, 20 % (v/v) ethylene glycol | 分辨率 2.10 Å R-free 0.208 |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 9V85 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 28QL GFP bound to distal DARPin (AHIR dodecamer scaffold system) 提交 2026-02-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
3–229(227 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.72 Å |
| 5BT0 Switching GFP fluorescence using genetically encoded phenyl azide chemistry through two different non-native post-translational modifications routes at the same position. 提交 2015-06-02 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
3–234(232 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | SO4 SULFATE ION × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;297 K;50 mM MMT, 2.5 M (NH4)2SO4
|
分辨率 2.03 Å R-free 0.204 |
| 5BT0 Switching GFP fluorescence using genetically encoded phenyl azide chemistry through two different non-native post-translational modifications routes at the same position. 提交 2015-06-02 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
3–234(232 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | SO4 SULFATE ION × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;297 K;50 mM MMT, 2.5 M (NH4)2SO4
|
分辨率 2.03 Å R-free 0.204 |
| 5BTT Switching GFP fluorescence using genetically encoded phenyl azide chemistry through two different non-native post-translational modifications routes at the same position. 提交 2015-06-03 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
3–231(229 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | SO4 SULFATE ION × 5 GOL GLYCEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;297 K;50 mM MMT, 2.5 M (NH4)2SO4
|
分辨率 2.14 Å R-free 0.207 |
| 5BTT Switching GFP fluorescence using genetically encoded phenyl azide chemistry through two different non-native post-translational modifications routes at the same position. 提交 2015-06-03 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
3–231(229 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | SO4 SULFATE ION × 6 GOL GLYCEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;297 K;50 mM MMT, 2.5 M (NH4)2SO4
|
分辨率 2.14 Å R-free 0.207 |
| 5DPG sfGFP mutant - 133 p-cyano-L-phenylalanine 提交 2015-09-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–238(238 aa)
|
突变:M1V, R2S, S30R, T65(CRO), Y66(CRO), G67(CRO), A72S, Q80R, D133(4CF), A206V 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 10 NA SODIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;298 K;22% PEG 3350, 2% Tacsimate pH 6, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.192 |
| 5DPH sfGFP mutant - 149 p-cyano-L-phenylalanine 提交 2015-09-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–238(238 aa)
|
突变:M1V, R2S, S30R, T65(CRO), Y66(CRO), G67(CRO), A72S, Q80R, A206V, N149(4CF) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | CO2 CARBON DIOXIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 5 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;298 K;0.1 M Tris pH 8.5, 20% PEG 4000, 0.21 M MgCl2-6H2O
|
分辨率 1.42 Å R-free 0.208 |
| 5DPH sfGFP mutant - 149 p-cyano-L-phenylalanine 提交 2015-09-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
1–238(238 aa)
|
突变:M1V, R2S, S30R, T65(CRO), Y66(CRO), G67(CRO), A72S, Q80R, A206V, N149(4CF) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | CO2 CARBON DIOXIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;298 K;0.1 M Tris pH 8.5, 20% PEG 4000, 0.21 M MgCl2-6H2O
|
分辨率 1.42 Å R-free 0.208 |
| 5DPI sfGFP double mutant - 133/149 p-cyano-L-phenylalanine 提交 2015-09-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–238(238 aa)
|
突变:M1V, R2S, S30R, T65(CRO), Y66(CRO), G67(CRO), A72S, Q80R, A206V, D133(4CF), N149(4CF) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;298 K;0.2 M potassium sodium formate, 30% PEG 3350
|
分辨率 2.54 Å R-free 0.243 |
| 5DPI sfGFP double mutant - 133/149 p-cyano-L-phenylalanine 提交 2015-09-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
1–238(238 aa)
|
突变:M1V, R2S, S30R, T65(CRO), Y66(CRO), G67(CRO), A72S, Q80R, A206V, D133(4CF), N149(4CF) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;298 K;0.2 M potassium sodium formate, 30% PEG 3350
|
分辨率 2.54 Å R-free 0.243 |
| 5DPI sfGFP double mutant - 133/149 p-cyano-L-phenylalanine 提交 2015-09-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 C
1–238(238 aa)
|
突变:M1V, R2S, S30R, T65(CRO), Y66(CRO), G67(CRO), A72S, Q80R, A206V, D133(4CF), N149(4CF) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;298 K;0.2 M potassium sodium formate, 30% PEG 3350
|
分辨率 2.54 Å R-free 0.243 |
| 5DPI sfGFP double mutant - 133/149 p-cyano-L-phenylalanine 提交 2015-09-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 D
1–238(238 aa)
|
突变:M1V, R2S, S30R, T65(CRO), Y66(CRO), G67(CRO), A72S, Q80R, A206V, D133(4CF), N149(4CF) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;298 K;0.2 M potassium sodium formate, 30% PEG 3350
|
分辨率 2.54 Å R-free 0.243 |
| 5DPI sfGFP double mutant - 133/149 p-cyano-L-phenylalanine 提交 2015-09-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 5 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 E
1–238(238 aa)
|
突变:M1V, R2S, S30R, T65(CRO), Y66(CRO), G67(CRO), A72S, Q80R, A206V, D133(4CF), N149(4CF) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;298 K;0.2 M potassium sodium formate, 30% PEG 3350
|
分辨率 2.54 Å R-free 0.243 |
| 5DPI sfGFP double mutant - 133/149 p-cyano-L-phenylalanine 提交 2015-09-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 6 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 F
1–238(238 aa)
|
突变:M1V, R2S, S30R, T65(CRO), Y66(CRO), G67(CRO), A72S, Q80R, A206V, D133(4CF), N149(4CF) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;298 K;0.2 M potassium sodium formate, 30% PEG 3350
|
分辨率 2.54 Å R-free 0.243 |
| 5DPJ sfGFP double mutant - 133/149 p-ethynyl-L-phenylalanine 提交 2015-09-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–238(238 aa)
|
突变:M1V, R2S, S30R, T65(CRO), Y66(CRO), G67(CRO), A72S, Q80R, D133(5DW), N149(5DW), A206V 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;298 K;22% PEG 3350 and 0.20 M sodium citrate tribasic, pH 7
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.244 |
| 5DPJ sfGFP double mutant - 133/149 p-ethynyl-L-phenylalanine 提交 2015-09-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
1–238(238 aa)
|
突变:M1V, R2S, S30R, T65(CRO), Y66(CRO), G67(CRO), A72S, Q80R, D133(5DW), N149(5DW), A206V 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;298 K;22% PEG 3350 and 0.20 M sodium citrate tribasic, pH 7
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.244 |
| 5DPJ sfGFP double mutant - 133/149 p-ethynyl-L-phenylalanine 提交 2015-09-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 C
1–238(238 aa)
|
突变:M1V, R2S, S30R, T65(CRO), Y66(CRO), G67(CRO), A72S, Q80R, D133(5DW), N149(5DW), A206V 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;298 K;22% PEG 3350 and 0.20 M sodium citrate tribasic, pH 7
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.244 |
| 5DPJ sfGFP double mutant - 133/149 p-ethynyl-L-phenylalanine 提交 2015-09-12 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 D
1–238(238 aa)
|
突变:M1V, R2S, S30R, T65(CRO), Y66(CRO), G67(CRO), A72S, Q80R, D133(5DW), N149(5DW), A206V 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;298 K;22% PEG 3350 and 0.20 M sodium citrate tribasic, pH 7
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.244 |
| 5DY6 Enhanced superfolder GFP with DBCO at 148 提交 2015-09-24 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
5–232(228 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | SO4 SULFATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;294 K;0.1 M PCTP Buffer, 15% PEG 1500
|
分辨率 2.66 Å R-free 0.290 |
| 5DY6 Enhanced superfolder GFP with DBCO at 148 提交 2015-09-24 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
5–232(228 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;294 K;0.1 M PCTP Buffer, 15% PEG 1500
|
分辨率 2.66 Å R-free 0.290 |
| 5EHU sfGFP mutant with unnatural amino acid 4-azidoethoxy-L-phenylalanine incorporated at the 149 site 提交 2015-10-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
2–238(237 aa)
|
突变:S30R, A72S, Q80R, N149(4LZ), A206V 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;298 K;A 40 mg/mL solution of sfGFP-149-AePhe in a 20 mM Hepes buffer pH 7.5 was combined with a precipitation solution (20% PEG 8000, 100 mM Hepes pH 7.5) in a 1:1 ratio to form crystals in a sitting drop well at room temperature
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.208 |
| 5EHU sfGFP mutant with unnatural amino acid 4-azidoethoxy-L-phenylalanine incorporated at the 149 site 提交 2015-10-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
2–238(237 aa)
|
突变:S30R, A72S, Q80R, N149(4LZ), A206V 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;298 K;A 40 mg/mL solution of sfGFP-149-AePhe in a 20 mM Hepes buffer pH 7.5 was combined with a precipitation solution (20% PEG 8000, 100 mM Hepes pH 7.5) in a 1:1 ratio to form crystals in a sitting drop well at room temperature
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.208 |
| 5JZK The Structure of Ultra Stable Green Fluorescent Protein 提交 2016-05-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
3–238(236 aa)
片段:UNP residues 3-238
链 B
3–238(236 aa)
片段:UNP residues 3-238
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | NO3 NITRATE ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 CL CHLORIDE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;281 K;20 % w/v PEG 3350, 0.1 M Bis-Tris propane pH 6.5, 0.2 M Sodium nitrate
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.176 |
| 5JZL The Structure of Monomeric Ultra Stable Green Fluorescent Protein 提交 2016-05-17 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
3–238(236 aa)
片段:UNP residues 3-238
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | CL CHLORIDE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;281 K;22% w/v PEG 8000, 0.2 M sodium chloride, 0.1 M phosphate-citrate buffer pH 3.7, 4% v/v acetone
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.217 |
| 5JZL The Structure of Monomeric Ultra Stable Green Fluorescent Protein 提交 2016-05-17 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
3–238(236 aa)
片段:UNP residues 3-238
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | CL CHLORIDE ION × 1 NA SODIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;281 K;22% w/v PEG 8000, 0.2 M sodium chloride, 0.1 M phosphate-citrate buffer pH 3.7, 4% v/v acetone
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.217 |
| 5MFC Designed armadillo repeat protein YIIIM5AII in complex with (KR)4-GFP 提交 2016-11-18 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
3–238(236 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | ACT ACETATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.6;277 K;8% w/v PEG 4000, 0.1M Na acetate trihydrate pH 4.6,
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.240 |
| 5MFC Designed armadillo repeat protein YIIIM5AII in complex with (KR)4-GFP 提交 2016-11-18 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 D
3–238(236 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.6;277 K;8% w/v PEG 4000, 0.1M Na acetate trihydrate pH 4.6,
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.240 |
| 5NHN Super-Folder Green Fluorescent Protein Artificiall dimer linked via 148 position 提交 2017-03-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
3–231(229 aa)
链 B
3–231(229 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | DB5 [(4~{S})-4,5,6,7,8,9-hexahydro-1~{H}-cycloocta[d][1,2,3]triazol-4-yl] hydrogen carbonate × 1 GOL GLYCEROL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;300 K;Condition C6 of the PACT Premier screen:
0.1 M PCTP Buffer, pH 9.0, 25% PEG 1500
|
分辨率 1.96 Å R-free 0.209 |
| 5NI3 sfGFP 204-204 mutant dimer 提交 2017-03-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
3–229(227 aa)
链 D
3–233(231 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | NA SODIUM ION × 6 DB5 [(4~{S})-4,5,6,7,8,9-hexahydro-1~{H}-cycloocta[d][1,2,3]triazol-4-yl] hydrogen carbonate × 1 GOL GLYCEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;291 K;PACT condition C6: 0.1M PCTP Buffer, pH 9.0, 25% PEG 1500
|
分辨率 1.28 Å R-free 0.191 |
| 5NI3 sfGFP 204-204 mutant dimer 提交 2017-03-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
3–233(231 aa)
链 C
3–233(231 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | NA SODIUM ION × 4 DB5 [(4~{S})-4,5,6,7,8,9-hexahydro-1~{H}-cycloocta[d][1,2,3]triazol-4-yl] hydrogen carbonate × 1 GOL GLYCEROL × 4 CL CHLORIDE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;291 K;PACT condition C6: 0.1M PCTP Buffer, pH 9.0, 25% PEG 1500
|
分辨率 1.28 Å R-free 0.191 |
| 5YR2 Structure of cpGFP66BPA 提交 2017-11-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
146–235(90 aa)
链 A
3–144(142 aa)
|
突变:Y163(BPA) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 突变:Y163(BPA) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;289.15 K;PEG 3350 25%, 0.2M MgCl2,0.1M Bis-Tris pH 5.5
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.215 |
| 5YR2 Structure of cpGFP66BPA 提交 2017-11-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
146–235(90 aa)
链 B
3–144(142 aa)
|
突变:Y163(BPA) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 突变:Y163(BPA) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;289.15 K;PEG 3350 25%, 0.2M MgCl2,0.1M Bis-Tris pH 5.5
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.215 |
| 5Z6Y Structure of sfYFP48S95C66BPA 提交 2018-01-25 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
3–230(228 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4;289 K;0.1M sodium malonate pH 4.0, 12% PEG 3350
|
分辨率 1.87 Å R-free 0.236 |
| 6B9C Superfolder Green Fluorescent Protein with 4-nitro-L-phenylalanine at the chromophore (position 66) 提交 2017-10-10 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
3–238(236 aa)
|
突变:S30R, A72S, Q80R, A206V 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | CO2 CARBON DIOXIDE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;298 K;1.4 M DL-Malic acid
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.195 |
| 6B9C Superfolder Green Fluorescent Protein with 4-nitro-L-phenylalanine at the chromophore (position 66) 提交 2017-10-10 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
3–238(236 aa)
|
突变:S30R, A72S, Q80R, A206V 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | CO2 CARBON DIOXIDE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;298 K;1.4 M DL-Malic acid
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.195 |
| 6H01 Crystal structure of a domain-swapped dark-state sfGFP containing the unnatural amino acid ortho-nitrobenzyl-tyrosine (ONBY) at residue 66 提交 2018-07-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
3–238(236 aa)
链 C
3–238(236 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;291 K;1.1 M tri-Na-citrate
0.1 M Na-HEPES
|
分辨率 2.78 Å R-free 0.239 |
| 6H01 Crystal structure of a domain-swapped dark-state sfGFP containing the unnatural amino acid ortho-nitrobenzyl-tyrosine (ONBY) at residue 66 提交 2018-07-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
3–238(236 aa)
链 D
3–238(236 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;291 K;1.1 M tri-Na-citrate
0.1 M Na-HEPES
|
分辨率 2.78 Å R-free 0.239 |
| 6HUT GFP8 - a stabilized variant of cycle-3 GFP 提交 2018-10-09 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–245(245 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;296 K;200 mM HEPES, 10% v/v isopropanol, 200 mM NaCl
|
分辨率 1.29 Å R-free 0.203 |
| 6KRG Crystal structure of sfGFP Y182TMSiPhe 提交 2019-08-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–236(236 aa)
|
突变:Y182T 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | GOL GLYCEROL × 2 CL CHLORIDE ION × 3 NA SODIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;289 K;PEG 6000, SODIUM CHLORIDE
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.173 |
| 6OA8 Superfolder Green Fluorescent Protein with 4-cyano-L-phenylalanine at the chromophore (position 66) 提交 2019-03-15 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
3–238(236 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 SO4 SULFATE ION × 8 NA SODIUM ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;295 K;0.1 M Tris-HCl, 2.0 M ammonium sulfate, pH 8.5
|
分辨率 1.37 Å R-free 0.189 |
| 6UN5 Crystal structure of green fluorescent protein (GFP); S65T, Y66(2,3,5-F3Y); ih circular permutant (50-51) 提交 2019-10-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
51–237(187 aa)
链 B
51–237(187 aa)
|
突变:;A72S, Q80R, T105K, E111V, I128T, K166T, I167V, S205T, A206V, S232R, Y241I, C250S,A72S, Q80R, T105K, E111V, I128T, K166T, I167V, S205T, A206V ; 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 突变:;A72S, Q80R, T105K, E111V, I128T, K166T, I167V, S205T, A206V, S232R, Y241I, C250S,A72S, Q80R, T105K, E111V, I128T, K166T, I167V, S205T, A206V ; 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.15 M ammonium acetate, 31% PEG 3350
|
分辨率 1.36 Å R-free 0.205 |
| 6UN6 Crystal structure of green fluorescent protein (GFP); S65T, Y66(3-NO2Y); ih circular permutant (50-51) 提交 2019-10-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
51–237(187 aa)
链 B
51–237(187 aa)
|
突变:A72S, Q80R, T105K, E111V, I128T, K166T, I167V, S205T, A206V, S232R, Y241I, C250S 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 突变:A72S, Q80R, T105K, E111V, I128T, K166T, I167V, S205T, A206V, S232R, Y241I, C250S 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.15 M ammonium acetate, 34% PEG 3350
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.181 |
| 6UN7 Crystal structure of green fluorescent protein (GFP); S65T, Y66(3-OMeY); ih circular permutant (50-51) 提交 2019-10-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
51–237(187 aa)
链 B
51–237(187 aa)
|
突变:A72S, Q80R, T105K, E111V, I128T, K166T, I167V, S205T, A206V, S232R, Y241I, C250S 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 突变:A72S, Q80R, T105K, E111V, I128T, K166T, I167V, S205T, A206V, S232R, Y241I, C250S 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.15 M ammonium acetate, 34% PEG 3350
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.191 |
| 6WV3 Human VKOR with warfarin 提交 2020-05-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–144(144 aa)
片段:GPF (UNP residues 1-144) + VKOR + GFP (UNP residues 146-231)
链 A
146–231(86 aa)
片段:GPF (UNP residues 1-144) + VKOR + GFP (UNP residues 146-231)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 3 SWF S-WARFARIN × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE;pH 6.5;295 K;37% PEG400, 0.1 M MES, pH 6.5
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.223 |
| 6WV4 Human VKOR C43S with warfarin 提交 2020-05-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–144(144 aa)
片段:GPF (UNP residues 1-144) + VKOR + GFP (UNP residues 146-231)
链 A
146–231(86 aa)
片段:GPF (UNP residues 1-144) + VKOR + GFP (UNP residues 146-231)
|
突变:C43S 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 突变:C43S 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | SWF S-WARFARIN × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE;pH 6.5;295 K;25-33% PEG400, 185-220 mM potassium formate, 0.1 M MES, pH 6.5
|
分辨率 3.01 Å R-free 0.292 |
| 6WV5 Human VKOR C43S mutant with vitamin K1 epoxide 提交 2020-05-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–144(144 aa)
片段:GPF (UNP residues 1-144) + VKOR + GFP (UNP residues 146-231)
链 A
146–231(86 aa)
片段:GPF (UNP residues 1-144) + VKOR + GFP (UNP residues 146-231)
|
突变:C43S 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 突变:C43S 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | UAV (2R,3R)-2-hydroxy-3-methyl-2-[(2E,7S)-3,7,11,15-tetramethylhexadec-2-en-1-yl]-2,3-dihydronaphthalene-1,4-dione × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE;pH 6.5;295 K;25% PEG400, 0.1 M ammonium citrate dibasic, 0.1 M MES, pH 6.5
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.270 |
| 6WV6 Human VKOR with phenindione 提交 2020-05-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–144(144 aa)
片段:GPF (UNP residues 1-144) + VKOR + GFP (UNP residues 146-231)
链 A
146–231(86 aa)
片段:GPF (UNP residues 1-144) + VKOR + GFP (UNP residues 146-231)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 2 UAS Phenindione × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE;pH 6.5;295 K;34% PEG400, 80 mM lithium sulfate, 0.1 M MES, pH 6.5
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.268 |
| 6WV7 Human VKOR with Chlorophacinone 提交 2020-05-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–144(144 aa)
片段:GPF (UNP residues 1-144) + VKOR + GFP (UNP residues 146-231)
链 A
146–231(86 aa)
片段:GPF (UNP residues 1-144) + VKOR + GFP (UNP residues 146-231)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | UAJ Chlorophacinone × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE;pH 6.5;295 K;33% PEG400, 5% DMSO, 0.1 M sodium acetate, 0.1 M MES, pH 6.5
|
分辨率 2.48 Å R-free 0.245 |
| 6WV7 Human VKOR with Chlorophacinone 提交 2020-05-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
1–144(144 aa)
片段:GPF (UNP residues 1-144) + VKOR + GFP (UNP residues 146-231)
链 B
146–231(86 aa)
片段:GPF (UNP residues 1-144) + VKOR + GFP (UNP residues 146-231)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | UAJ Chlorophacinone × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE;pH 6.5;295 K;33% PEG400, 5% DMSO, 0.1 M sodium acetate, 0.1 M MES, pH 6.5
|
分辨率 2.48 Å R-free 0.245 |
| 6WV8 Takifugu rubripes VKOR-like C138S mutant with vitamin K1 提交 2020-05-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
146–238(93 aa)
|
突变:C138S 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | PQN PHYLLOQUINONE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE;pH 6;295 K;25% PEG 400, 300 mM ammonium fluoride, 0.1 M MES pH 6.0
|
分辨率 3.01 Å R-free 0.293 |
| 6WVB Takifugu rubripes VKOR-like with warfarin 提交 2020-05-05 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
146–238(93 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | SWF S-WARFARIN × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE;pH 5.5;295 K;23% PEG400, 0.1 M Sodium nitrate, 0.1 M MES pH 5.5
|
分辨率 2.87 Å R-free 0.286 |
| 6WVH Human VKOR with Brodifacoum 提交 2020-05-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–144(144 aa)
片段:GPF (UNP residues 1-144) + VKOR + GFP (UNP residues 146-231)
链 A
146–231(86 aa)
片段:GPF (UNP residues 1-144) + VKOR + GFP (UNP residues 146-231)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | UA7 Brodifacoum × 1 OLC (2R)-2,3-dihydroxypropyl (9Z)-octadec-9-enoate × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE;pH 6.5;295 K;32% PEG400, 0.1 M ammonium acetate, 1% 1,2,3-heptanetriol, 0.1 M MES, pH 6.5
|
分辨率 1.99 Å R-free 0.215 |
| 6WVH Human VKOR with Brodifacoum 提交 2020-05-06 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
1–144(144 aa)
片段:GPF (UNP residues 1-144) + VKOR + GFP (UNP residues 146-231)
链 B
146–231(86 aa)
片段:GPF (UNP residues 1-144) + VKOR + GFP (UNP residues 146-231)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | UA7 Brodifacoum × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
LIPIDIC CUBIC PHASE;pH 6.5;295 K;32% PEG400, 0.1 M ammonium acetate, 1% 1,2,3-heptanetriol, 0.1 M MES, pH 6.5
|
分辨率 1.99 Å R-free 0.215 |
| 7A7M rsGreen0.7b in the green-on state 提交 2020-08-30 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
3–238(236 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;150 mM KBr
30 % PEG 2000 mme
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.198 |
| 7A7N rsGreen0.7b in the green-off state 提交 2020-08-30 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
3–238(236 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;100 mM MMT pH 5.0
25 % PEG 1500
|
分辨率 1.20 Å R-free 0.170 |
| 7A7O rsGreen0.7-K206A in the green-on state 提交 2020-08-30 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
3–238(236 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;200 mM Ammonium acetate
100 mM Bis-tris pH 5.5
25 % PEG 3350
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.241 |
| 7A7P rsGreen0.7-K206A partially in the green-off state 提交 2020-08-30 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
3–238(236 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | NO3 NITRATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;22 % PEG 4000
140 mM Mg(NO3)2
|
分辨率 1.48 Å R-free 0.197 |
| 7A7Q rsGreenF-K206A in the green-on state 提交 2020-08-30 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
3–238(236 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 GOL GLYCEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;200 mM NaCl
100 mM MES pH 6.0
20 % PEG 6000
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.218 |
| 7A7R rsGreenF-K206A in the green-off state 提交 2020-08-30 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
3–238(236 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 GOL GLYCEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;200 mM NaCl
100 mM MES pH 6.0
20 % PEG 6000
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.243 |
| 7A7S rsGreenF in the green-on state 提交 2020-08-30 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
3–238(236 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;100 mM MIB pH 4.0
25 % PEG 1500
|
分辨率 1.73 Å R-free 0.235 |
| 7A7T rsGreenF partially in the green-off state 提交 2020-08-30 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
3–238(236 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;100 mM MIB pH 4.0
25 % PEG 1500
|
分辨率 1.58 Å R-free 0.197 |
| 7A7U rsGreen1 in the green-on state 提交 2020-08-30 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
3–238(236 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;2.0 M (NH4)2SO4
200 mM NaCl
100 mM Na-cacodylate pH 6.5
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.201 |
| 7A7V rsGreen1-K206A partially in the green-off state 提交 2020-08-30 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
3–238(236 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | GOL GLYCEROL × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;100 mM Bis-tris pH 5.5
200 mM (NH4)2SO4
16 % PEG 8000
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.194 |
| 7A7W rsGreen0.7-F145M partially in the green-on state 提交 2020-08-30 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
3–238(236 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;200 mM NH4HCO2
20 % PEG 4000
|
分辨率 1.30 Å R-free 0.165 |
| 7A7X rsGreen0.7-F145M in the green-off state 提交 2020-08-30 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
3–238(236 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;100 mM MMT pH 8.0
25 % PEG 1500
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.207 |
| 7A7Y rsGreen0.7-F145Q in the green-on state 提交 2020-08-30 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
3–238(236 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | NO3 NITRATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;293 K;200 mM KNO3
20 % PEG 3350
|
分辨率 0.97 Å R-free 0.142 |
| 7A7Z rsGreen0.7-K206A-E222G in the green-on state 提交 2020-08-30 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
3–238(236 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;200 mM (Li)2SO4
100 mM Tris pH 8.5
40 % PEG 400
|
分辨率 1.10 Å R-free 0.142 |
| 7A80 rsGreen0.7-K206A-E222V in the green-on state 提交 2020-08-30 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
3–238(236 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | NO3 NITRATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;291 K;26 % PEG 4000
500 mM Mg(NO3)
50 mM HEPES pH 7.5
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.234 |
| 7A80 rsGreen0.7-K206A-E222V in the green-on state 提交 2020-08-30 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
3–238(236 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | NO3 NITRATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;291 K;26 % PEG 4000
500 mM Mg(NO3)
50 mM HEPES pH 7.5
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.234 |
| 7A80 rsGreen0.7-K206A-E222V in the green-on state 提交 2020-08-30 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 C
3–238(236 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | NO3 NITRATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;291 K;26 % PEG 4000
500 mM Mg(NO3)
50 mM HEPES pH 7.5
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.234 |
| 7A80 rsGreen0.7-K206A-E222V in the green-on state 提交 2020-08-30 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 D
3–238(236 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | NO3 NITRATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;291 K;26 % PEG 4000
500 mM Mg(NO3)
50 mM HEPES pH 7.5
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.234 |
| 7A81 rsGreen0.7-K206A-F145A partially in the green-on state 提交 2020-08-30 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
3–238(236 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;200 mM NaCl
100 mM MES pH 6.0
20 % PEG 6000
4% 2,2,2-trifluoroethanol
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.248 |
| 7A82 rsGreen0.7-K206A-F145A partially in the green-off state 提交 2020-08-30 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
3–238(236 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;200 mM NaCl
100 mM MES pH 6.0
20 % PEG 6000
200 mM NDSB-211
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.250 |
| 7A83 rsGreen0.7-K206A-F145H in the green-on-state 提交 2020-08-30 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
3–238(236 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;125 mM MES pH 6.0
9 % PEG 4000
|
分辨率 1.73 Å R-free 0.192 |
| 7A84 rsGreen0.7-K206A-F145H partially in the green-off state 提交 2020-08-30 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
3–238(236 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;100 mM MES pH 6.0
14 % PEG 400
300 mM NGSB-195
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.269 |
| 7A85 rsGreen0.7-K206A-F145L in the green-on state 提交 2020-08-30 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
3–238(236 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;100 mM MES pH 6.5
12 % PEG 20 000
10 mM NaBr
|
分辨率 1.52 Å R-free 0.237 |
| 7A86 rsGreen0.7-K206A-F145L partially in the green-off state 提交 2020-08-30 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
3–238(236 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;100 mM MES pH 6.5
12 % PEG 20 000
4 % Pentaerythritol ethoxylate
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.210 |
| 7A86 rsGreen0.7-K206A-F145L partially in the green-off state 提交 2020-08-30 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
3–238(236 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;100 mM MES pH 6.5
12 % PEG 20 000
4 % Pentaerythritol ethoxylate
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.210 |
| 7A87 rsGreen0.7-K206A-F145M in the green-on state 提交 2020-08-30 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
3–238(236 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;100 mM Bis-tris pH 6.5
20 % PEG 1500
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.228 |
| 7A88 rsGreen0.7-K206A-F145M in the green-off state 提交 2020-08-30 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
3–238(236 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;100 mM MMT
25 % PEG 1500
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.226 |
| 7A89 rsGreen0.7-K206A-F145Q in the green-on state 提交 2020-08-30 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
3–238(236 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;22 % PEG 4000
140 mM Mg(NO3)2
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.234 |
| 7A89 rsGreen0.7-K206A-F145Q in the green-on state 提交 2020-08-30 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
3–238(236 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;22 % PEG 4000
140 mM Mg(NO3)2
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.234 |
| 7A8A rsGreen0.7-K206A-F145Q partially in the green-off state 提交 2020-08-30 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
3–238(236 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;200 mM NaCl
100 mM MES pH 6.0
20 % PEG 6000
|
分辨率 1.93 Å R-free 0.254 |
| 7A8B rsGreen0.7-K206A-F145S partially in the green-on state 提交 2020-08-30 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
3–238(236 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;100 mM MES pH 6.0
14 % PEG 4000
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.232 |
| 7A8C rsGreen0.7-K206A-F145S in the green-off state 提交 2020-08-30 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
3–238(236 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;100 mM MES pH 6.5
25 % PEG 4000
400 mM D-galactose
|
分辨率 2.13 Å R-free 0.253 |
| 7A8D rsGreen0.7-K206A-F165W partially in the green-on state 提交 2020-08-30 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
3–238(236 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;291 K;200 mM NH4F
20 % PEG 3350
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.219 |
| 7A8E rsGreen0.7-K206A-F165W partially in the green-off state 提交 2020-08-30 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
3–238(236 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;100 mM HEPES pH 7.5
25 % PEG 4000
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.261 |
| 7A8F rsGreen0.7-K206A-F165L in the green-on state 提交 2020-08-30 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
3–238(236 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;100 mM HEPES pH 7.5
25 % PEG 4000
|
分辨率 2.27 Å R-free 0.257 |
| 7A8G rsGreen0.7-K206A-H148G in the green-on state 提交 2020-08-30 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
3–238(236 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;200 mM TMAO
100mM Tris pH 8.5
20 % Peg 2000 mme
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.217 |
| 7A8G rsGreen0.7-K206A-H148G in the green-on state 提交 2020-08-30 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
3–238(236 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;200 mM TMAO
100mM Tris pH 8.5
20 % Peg 2000 mme
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.217 |
| 7A8H rsGreen0.7-K206A-H148S in the green-on state 提交 2020-08-30 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
3–238(236 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;100 mM Bis-tris pH 6.5
20 % PEG 5000 mme
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.209 |
| 7A8H rsGreen0.7-K206A-H148S in the green-on state 提交 2020-08-30 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
3–238(236 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;100 mM Bis-tris pH 6.5
20 % PEG 5000 mme
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.209 |
| 7A8H rsGreen0.7-K206A-H148S in the green-on state 提交 2020-08-30 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 C
3–238(236 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;100 mM Bis-tris pH 6.5
20 % PEG 5000 mme
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.209 |
| 7A8H rsGreen0.7-K206A-H148S in the green-on state 提交 2020-08-30 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 D
3–238(236 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;100 mM Bis-tris pH 6.5
20 % PEG 5000 mme
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.209 |
| 7A8I rsGreen0.7-K206A-H148S partially in the green-off state 提交 2020-08-30 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
3–238(236 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;100 mM Bis-tris pH 6.5
20 % PEG 5000 mme
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.228 |
| 7A8I rsGreen0.7-K206A-H148S partially in the green-off state 提交 2020-08-30 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
3–238(236 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;100 mM Bis-tris pH 6.5
20 % PEG 5000 mme
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.228 |
| 7A8I rsGreen0.7-K206A-H148S partially in the green-off state 提交 2020-08-30 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 C
3–238(236 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;100 mM Bis-tris pH 6.5
20 % PEG 5000 mme
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.228 |
| 7A8I rsGreen0.7-K206A-H148S partially in the green-off state 提交 2020-08-30 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 D
3–238(236 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;100 mM Bis-tris pH 6.5
20 % PEG 5000 mme
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.228 |
| 7A8J rsGreen0.7-K206A-H148V in the green-on state 提交 2020-08-30 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
3–238(236 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | GOL GLYCEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;100 mM MES pH 6.5
25 % PEG 550 mme
10 mM ZnSO4
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.232 |
| 7A8K rsGreen0.7-K206A-H148V partially in the green-off state 提交 2020-08-30 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
3–238(236 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;50 mM HEPES pH 7.5
12 % PEG 4000
1% tryptone
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.263 |
| 7A8L rsGreen0.7-K206A-N205C in the green-on state 提交 2020-08-30 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
3–238(236 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;100 mM MES pH 6.5
25 % PEG 3000
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.225 |
| 7A8M rsGreen0.7-K206A-N205G in the green-on state 提交 2020-08-30 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
3–238(236 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;100 mM MES pH 6.0
20 % PEG 2000 mme
10 mM BaCl2
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.245 |
| 7A8N rsGreen0.7-K206A-N205L in the green-on state 提交 2020-08-30 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
3–238(236 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;100 mM HEPES pH 7.5
25 % PEG 8000
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.258 |
| 7A8O rsGreen0.7-K206A-N205S in the green-on state 提交 2020-08-30 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
3–238(236 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;200 mM Maic acid pH 7.0
20 % PEG 3350
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.201 |
| 7BWN Crystal Structure of a Designed Protein Heterocatenane 提交 2020-04-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 F
1–238(238 aa)
|
突变:R2S,S30R,A72S,Q80R,A206V,M340E,L344K | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;298.15 K;Bis-Tris, (NH4)2SO4
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.239 |
| 7BWN Crystal Structure of a Designed Protein Heterocatenane 提交 2020-04-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–238(238 aa)
|
突变:R2S,S30R,A72S,Q80R,A206V,M340E,L344K | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;298.15 K;Bis-Tris, (NH4)2SO4
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.239 |
| 7BWN Crystal Structure of a Designed Protein Heterocatenane 提交 2020-04-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 C
1–238(238 aa)
|
突变:R2S,S30R,A72S,Q80R,A206V,M340E,L344K | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;298.15 K;Bis-Tris, (NH4)2SO4
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.239 |
| 7BWN Crystal Structure of a Designed Protein Heterocatenane 提交 2020-04-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 E
1–238(238 aa)
|
突变:R2S,S30R,A72S,Q80R,A206V,M340E,L344K | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;298.15 K;Bis-Tris, (NH4)2SO4
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.239 |
| 7BWN Crystal Structure of a Designed Protein Heterocatenane 提交 2020-04-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 H
1–238(238 aa)
|
突变:R2S,S30R,A72S,Q80R,A206V,M340E,L344K | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;298.15 K;Bis-Tris, (NH4)2SO4
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.239 |
| 7BWN Crystal Structure of a Designed Protein Heterocatenane 提交 2020-04-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 J
1–238(238 aa)
|
突变:R2S,S30R,A72S,Q80R,A206V,M340E,L344K | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;298.15 K;Bis-Tris, (NH4)2SO4
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.239 |
| 7BWN Crystal Structure of a Designed Protein Heterocatenane 提交 2020-04-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 M
1–238(238 aa)
|
突变:R2S,S30R,A72S,Q80R,A206V,M340E,L344K | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;298.15 K;Bis-Tris, (NH4)2SO4
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.239 |
| 7BWN Crystal Structure of a Designed Protein Heterocatenane 提交 2020-04-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 8 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 O
1–238(238 aa)
|
突变:R2S,S30R,A72S,Q80R,A206V,M340E,L344K | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;298.15 K;Bis-Tris, (NH4)2SO4
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.239 |
| 7E53 Crystal structure of sfGFP complexed with the nanobody nb2 at 2.2 Angstron resolution 提交 2021-02-16 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
3–232(230 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;30% (w/v) Polyethylene glycol 400, 100mM CAPS/ Sodium hydroxide, pH 10.5
|
分辨率 2.21 Å R-free 0.258 |
| 8DHY N-terminal fragment of MsbA fused to GFP in complex with copper(II) 提交 2022-06-28 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
3–239(237 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | CU COPPER (II) ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;70% Tacsimate pH 7.0
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.228 |
| 8GW6 AtSLAC1 6D mutant in closed state 提交 2022-09-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
1–240(240 aa)
链 B
1–240(240 aa)
链 C
1–240(240 aa)
|
突变:T62D,S65D,S107D,S124D,S146D,T152D 突变:T62D,S65D,S107D,S124D,S146D,T152D 突变:T62D,S65D,S107D,S124D,S146D,T152D | CL CHLORIDE ION × 3 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 3 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 8GW7 AtSLAC1 6D mutant in open state 提交 2022-09-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
1–240(240 aa)
链 B
1–240(240 aa)
链 C
1–240(240 aa)
|
突变:T62D,S65D,S107D,S124D,S146D,T152D 突变:T62D,S65D,S107D,S124D,S146D,T152D 突变:T62D,S65D,S107D,S124D,S146D,T152D | CL CHLORIDE ION × 6 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 3 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 8J6M SIDT1 protein 提交 2023-04-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
3–236(234 aa)
链 B
3–236(234 aa)
|
未记录 | CLR CHOLESTEROL × 8 ZN ZINC ION × 2 NA SODIUM ION × 1 OLA OLEIC ACID × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.77 Å |
| 8J6O transport T2 提交 2023-04-26 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
3–236(234 aa)
链 B
3–236(234 aa)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 ZN ZINC ION × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.25 Å |
| 8J7M ion channel 提交 2023-04-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
3–235(233 aa)
链 B
3–235(233 aa)
链 C
3–235(233 aa)
链 D
3–235(233 aa)
|
未记录 | POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 4 CLR CHOLESTEROL × 10 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 8RL9 RECQL5:sfGFP hetero dimer assembled by Di-Gluebody 提交 2024-01-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 B
1–238(238 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.22 Å |
| 8RLB RECQL5:sfGFP hetero dimer assembled by Di-Gluebody - sfGFP local refinement 提交 2024-01-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 B
1–238(238 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.99 Å |
| 8RLC SPNS2:sfGFP hetero dimer assembled by Di-Gluebody 提交 2024-01-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 B
1–238(238 aa)
|
未记录 | LMT DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 8RLE SPNS2:sfGFP hetero dimer assembled by Di-Gluebody - sfGFP local refinement 提交 2024-01-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 B
1–238(238 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.75 Å |
| 8UBG DpHF19 filament 提交 2023-09-22 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 20 PDB 声明:20-meric |
链 A
3–238(236 aa)
链 B
3–238(236 aa)
链 C
3–238(236 aa)
链 D
3–238(236 aa)
链 E
3–238(236 aa)
链 F
3–238(236 aa)
链 G
3–238(236 aa)
链 H
3–238(236 aa)
链 I
3–238(236 aa)
链 J
3–238(236 aa)
链 K
3–238(236 aa)
链 L
3–238(236 aa)
链 M
3–238(236 aa)
链 N
3–238(236 aa)
链 O
3–238(236 aa)
链 P
3–238(236 aa)
链 Q
3–238(236 aa)
链 R
3–238(236 aa)
链 S
3–238(236 aa)
链 T
3–238(236 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 8XAL Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 S-BQ.1 in complex with ACE2 提交 2023-12-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric |
链 I
3–238(236 aa)
链 J
3–238(236 aa)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 31 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
|
分辨率 3.20 Å |
| 9BCF Chimeric protein of crocodile allergen Cro p 1.0101 and GFP 提交 2024-04-09 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
3–238(236 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;0.2 M calcium acetate, 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 40% v/v PEG 300
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.238 |
| 9BCF Chimeric protein of crocodile allergen Cro p 1.0101 and GFP 提交 2024-04-09 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
3–238(236 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | CA CALCIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;0.2 M calcium acetate, 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 40% v/v PEG 300
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.238 |
| 9BCF Chimeric protein of crocodile allergen Cro p 1.0101 and GFP 提交 2024-04-09 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 信息不足 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 C
3–238(236 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;0.2 M calcium acetate, 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5, 40% v/v PEG 300
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.238 |
| 9C74 superfolder Green Fluorescent Protein with meta-nitro-tyrosine incorporated at position 66 提交 2024-06-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
1–238(238 aa)
|
突变:Y66mNO2Y 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | NA SODIUM ION × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;298 K;1% tryptone, 0.001 M NaN3, 0.05 M Hepes pH 7.0, 20% w/v PEG350
|
分辨率 1.51 Å R-free 0.220 |
| 9IRV MultiBody Refinement of dimeric DARPin and its bound GFP on a symmetric scaffold 提交 2024-07-16 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 C
1–231(231 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.47 Å |
| 9J48 GFP bound to 24-mer DARPin-apoferritin model 6c 提交 2024-08-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 48 PDB 声明:48-meric |
链 a
1–231(231 aa)
链 b
1–231(231 aa)
链 c
1–231(231 aa)
链 d
1–231(231 aa)
链 e
1–231(231 aa)
链 f
1–231(231 aa)
链 g
1–231(231 aa)
链 h
1–231(231 aa)
链 i
1–231(231 aa)
链 j
1–231(231 aa)
链 k
1–231(231 aa)
链 l
1–231(231 aa)
链 m
1–231(231 aa)
链 n
1–231(231 aa)
链 o
1–231(231 aa)
链 p
1–231(231 aa)
链 q
1–231(231 aa)
链 r
1–231(231 aa)
链 s
1–231(231 aa)
链 t
1–231(231 aa)
链 v
1–231(231 aa)
链 w
1–231(231 aa)
链 x
1–231(231 aa)
链 y
1–231(231 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.04 Å |
| 9N6A GP23 C-termimal receptor binding domain from TM4 phage 提交 2025-02-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric |
链 A
1–238(238 aa)
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;289 K;0.2 M Lithium Sulfate
0.1 M MES: NaOH, pH 6
20 % (v/v) 1,4-Butanediol
|
分辨率 2.91 Å R-free 0.280 |
| 9ZG5 Structure of superfolder GFP bound to nanobody 15 提交 2025-12-02 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
3–239(237 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.40 Å R-free 0.331 |
| 9ZG5 Structure of superfolder GFP bound to nanobody 15 提交 2025-12-02 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
3–239(237 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.40 Å R-free 0.331 |
| 9ZG5 Structure of superfolder GFP bound to nanobody 15 提交 2025-12-02 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 E
3–239(237 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.40 Å R-free 0.331 |
| 9ZG5 Structure of superfolder GFP bound to nanobody 15 提交 2025-12-02 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 G
3–239(237 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.40 Å R-free 0.331 |
共 91 个其他 PDB 条目、136 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态
查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | A0A059PIQ0_AEQVI |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A; PDB构建体 2–235; UniProt 3–238 作者链 C; PDB构建体 2–235; UniProt 3–238 |