9yb4

Localized reconstruction of the asymmetric unit of the low pH treated back neutralized SINV/EEEV.

Method: ELECTRON MICROSCOPY D_max: 209.9 Å Quality: GOOD

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

E1 glycoprotein

Eastern equine encephalitis virus

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合异源复合物蛋白 × 12 其他聚合物 4 PDB 声明：12-meric（12）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 802–1242 链 B； UniProt 802–1242 链 C； UniProt 802–1242 链 D； UniProt 802–1242	片段：UNP residues 802-1242	Capsid protein × 4 （Q88793） E2 glycoprotein × 2 （A9XR09） E2 glycoprotein × 2 （A9XR09） beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 9YB4	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
6MUI CryoEM structure of chimeric Eastern Equine Encephalitis Virus with Fab of EEEV-42 antibody 提交 2018-10-23	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 960 PDB 声明：960-meric	链 A 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 E 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 I 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 M 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242)	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 HELIUM	分辨率 7.70 Å
6MUI CryoEM structure of chimeric Eastern Equine Encephalitis Virus with Fab of EEEV-42 antibody 提交 2018-10-23	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric	链 A 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 E 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 I 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 M 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242)	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 HELIUM	分辨率 7.70 Å
6MUI CryoEM structure of chimeric Eastern Equine Encephalitis Virus with Fab of EEEV-42 antibody 提交 2018-10-23	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：80-meric	链 A 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 E 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 I 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 M 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242)	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 HELIUM	分辨率 7.70 Å
6MUI CryoEM structure of chimeric Eastern Equine Encephalitis Virus with Fab of EEEV-42 antibody 提交 2018-10-23	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 96 PDB 声明：96-meric	链 A 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 E 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 I 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 M 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242)	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 HELIUM	分辨率 7.70 Å
6MUI CryoEM structure of chimeric Eastern Equine Encephalitis Virus with Fab of EEEV-42 antibody 提交 2018-10-23	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric	链 A 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 E 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 I 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 M 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242)	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 HELIUM	分辨率 7.70 Å
6MW9 CryoEM structure of chimeric Eastern Equine Encephalitis Virus with Fab of EEEV-3 antibody 提交 2018-10-29	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 960 PDB 声明：960-meric	链 A 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 E 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 I 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 M 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242)	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 HELIUM	分辨率 7.30 Å
6MW9 CryoEM structure of chimeric Eastern Equine Encephalitis Virus with Fab of EEEV-3 antibody 提交 2018-10-29	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric	链 A 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 E 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 I 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 M 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242)	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 HELIUM	分辨率 7.30 Å
6MW9 CryoEM structure of chimeric Eastern Equine Encephalitis Virus with Fab of EEEV-3 antibody 提交 2018-10-29	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：80-meric	链 A 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 E 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 I 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 M 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242)	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 HELIUM	分辨率 7.30 Å
6MW9 CryoEM structure of chimeric Eastern Equine Encephalitis Virus with Fab of EEEV-3 antibody 提交 2018-10-29	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 96 PDB 声明：96-meric	链 A 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 E 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 I 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 M 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242)	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 HELIUM	分辨率 7.30 Å
6MW9 CryoEM structure of chimeric Eastern Equine Encephalitis Virus with Fab of EEEV-3 antibody 提交 2018-10-29	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric	链 A 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 E 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 I 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 M 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242)	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 HELIUM	分辨率 7.30 Å
6MWC CryoEM structure of chimeric Eastern Equine Encephalitis Virus with Fab of EEEV-5 antibody 提交 2018-10-29	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 960 PDB 声明：960-meric	链 A 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 E 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 I 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 M 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242)	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 HELIUM	分辨率 7.50 Å
6MWC CryoEM structure of chimeric Eastern Equine Encephalitis Virus with Fab of EEEV-5 antibody 提交 2018-10-29	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric	链 A 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 E 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 I 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 M 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242)	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 HELIUM	分辨率 7.50 Å
6MWC CryoEM structure of chimeric Eastern Equine Encephalitis Virus with Fab of EEEV-5 antibody 提交 2018-10-29	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：80-meric	链 A 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 E 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 I 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 M 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242)	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 HELIUM	分辨率 7.50 Å
6MWC CryoEM structure of chimeric Eastern Equine Encephalitis Virus with Fab of EEEV-5 antibody 提交 2018-10-29	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 96 PDB 声明：96-meric	链 A 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 E 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 I 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 M 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242)	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 HELIUM	分辨率 7.50 Å
6MWC CryoEM structure of chimeric Eastern Equine Encephalitis Virus with Fab of EEEV-5 antibody 提交 2018-10-29	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric	链 A 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 E 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 I 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 M 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242)	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 HELIUM	分辨率 7.50 Å
6MWV CryoEM structure of Chimeric Eastern Equine Encephalitis Virus with Fab of EEEV-58 Antibody 提交 2018-10-30	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 960 PDB 声明：960-meric	链 A 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 E 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 I 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 M 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242)	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 HELIUM	分辨率 7.30 Å
6MWV CryoEM structure of Chimeric Eastern Equine Encephalitis Virus with Fab of EEEV-58 Antibody 提交 2018-10-30	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric	链 A 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 E 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 I 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 M 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242)	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 HELIUM	分辨率 7.30 Å
6MWV CryoEM structure of Chimeric Eastern Equine Encephalitis Virus with Fab of EEEV-58 Antibody 提交 2018-10-30	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：80-meric	链 A 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 E 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 I 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 M 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242)	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 HELIUM	分辨率 7.30 Å
6MWV CryoEM structure of Chimeric Eastern Equine Encephalitis Virus with Fab of EEEV-58 Antibody 提交 2018-10-30	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 96 PDB 声明：96-meric	链 A 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 E 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 I 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 M 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242)	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 HELIUM	分辨率 7.30 Å
6MWV CryoEM structure of Chimeric Eastern Equine Encephalitis Virus with Fab of EEEV-58 Antibody 提交 2018-10-30	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric	链 A 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 E 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 I 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 M 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242)	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 HELIUM	分辨率 7.30 Å
6MWX CryoEM structure of Chimeric Eastern Equine Encephalitis Virus with Fab of EEEV-69 Antibody 提交 2018-10-30	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 960 PDB 声明：960-meric	链 A 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 E 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 I 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 M 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242)	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 HELIUM	分辨率 8.20 Å
6MWX CryoEM structure of Chimeric Eastern Equine Encephalitis Virus with Fab of EEEV-69 Antibody 提交 2018-10-30	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric	链 A 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 E 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 I 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 M 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242)	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 HELIUM	分辨率 8.20 Å
6MWX CryoEM structure of Chimeric Eastern Equine Encephalitis Virus with Fab of EEEV-69 Antibody 提交 2018-10-30	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：80-meric	链 A 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 E 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 I 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 M 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242)	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 HELIUM	分辨率 8.20 Å
6MWX CryoEM structure of Chimeric Eastern Equine Encephalitis Virus with Fab of EEEV-69 Antibody 提交 2018-10-30	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 96 PDB 声明：96-meric	链 A 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 E 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 I 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 M 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242)	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 HELIUM	分辨率 8.20 Å
6MWX CryoEM structure of Chimeric Eastern Equine Encephalitis Virus with Fab of EEEV-69 Antibody 提交 2018-10-30	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric	链 A 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 E 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 I 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 M 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242)	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 HELIUM	分辨率 8.20 Å
6MX4 CryoEM structure of chimeric Eastern Equine Encephalitis Virus 提交 2018-10-30	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 720 PDB 声明：720-meric	链 A 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 D 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 G 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 J 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242)	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 240	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 HELIUM	分辨率 4.40 Å
6MX4 CryoEM structure of chimeric Eastern Equine Encephalitis Virus 提交 2018-10-30	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 D 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 G 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 J 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242)	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 HELIUM	分辨率 4.40 Å
6MX4 CryoEM structure of chimeric Eastern Equine Encephalitis Virus 提交 2018-10-30	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 其他组合异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：60-meric	链 A 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 D 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 G 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 J 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242)	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 20	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 HELIUM	分辨率 4.40 Å
6MX4 CryoEM structure of chimeric Eastern Equine Encephalitis Virus 提交 2018-10-30	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 其他组合异源复合物；蛋白 × 72 PDB 声明：72-meric	链 A 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 D 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 G 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 J 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242)	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 24	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 HELIUM	分辨率 4.40 Å
6MX4 CryoEM structure of chimeric Eastern Equine Encephalitis Virus 提交 2018-10-30	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 其他组合异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 D 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 G 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242) 链 J 802–1242（441 aa）片段：ectodomain (UNP residues 802-1242)	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 HELIUM	分辨率 4.40 Å
6ODF EEEV glycoproteins bound with heparan sulfate 提交 2019-03-26	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 480 PDB 声明：480-meric	链 A 802–1242（441 aa）片段：UNP residues 802-1242 链 C 802–1242（441 aa）片段：UNP residues 802-1242 链 E 802–1242（441 aa）片段：UNP residues 802-1242 链 G 802–1242（441 aa）片段：UNP residues 802-1242	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；Tris cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.80 Å
6ODF EEEV glycoproteins bound with heparan sulfate 提交 2019-03-26	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 802–1242（441 aa）片段：UNP residues 802-1242 链 C 802–1242（441 aa）片段：UNP residues 802-1242 链 E 802–1242（441 aa）片段：UNP residues 802-1242 链 G 802–1242（441 aa）片段：UNP residues 802-1242	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；Tris cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.80 Å
6ODF EEEV glycoproteins bound with heparan sulfate 提交 2019-03-26	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 其他组合异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：40-meric	链 A 802–1242（441 aa）片段：UNP residues 802-1242 链 C 802–1242（441 aa）片段：UNP residues 802-1242 链 E 802–1242（441 aa）片段：UNP residues 802-1242 链 G 802–1242（441 aa）片段：UNP residues 802-1242	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；Tris cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.80 Å
6ODF EEEV glycoproteins bound with heparan sulfate 提交 2019-03-26	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 其他组合异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：48-meric	链 A 802–1242（441 aa）片段：UNP residues 802-1242 链 C 802–1242（441 aa）片段：UNP residues 802-1242 链 E 802–1242（441 aa）片段：UNP residues 802-1242 链 G 802–1242（441 aa）片段：UNP residues 802-1242	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；Tris cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.80 Å
6ODF EEEV glycoproteins bound with heparan sulfate 提交 2019-03-26	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 其他组合异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 802–1242（441 aa）片段：UNP residues 802-1242 链 C 802–1242（441 aa）片段：UNP residues 802-1242 链 E 802–1242（441 aa）片段：UNP residues 802-1242 链 G 802–1242（441 aa）片段：UNP residues 802-1242	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；Tris cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.80 Å
9YAW Localized reconstruction of the asymmetric unit of SINV/EEEV in complex with Fab EEEV-33 at arm 4 at pH 5.6. 提交 2025-09-16	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：14-meric	链 A 802–1242（441 aa）片段：UNP residues 802-1242 链 B 802–1242（441 aa）片段：UNP residues 802-1242 链 C 802–1242（441 aa）片段：UNP residues 802-1242 链 D 802–1242（441 aa）片段：UNP residues 802-1242	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 5.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å
9YB3 Localized reconstruction of the asymmetric unit of SINV/EEEV. 提交 2025-09-16	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric	链 A 802–1242（441 aa）片段：UNP residues 802-1242 链 B 802–1242（441 aa）片段：UNP residues 802-1242 链 C 802–1242（441 aa）片段：UNP residues 802-1242 链 D 802–1242（441 aa）片段：UNP residues 802-1242	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å

共 9 个其他 PDB 条目、37 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	E9KXM2_EEEV
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–441； UniProt 802–1242 作者链 B； PDB构建体 1–441； UniProt 802–1242 作者链 C； PDB构建体 1–441； UniProt 802–1242 作者链 D； PDB构建体 1–441； UniProt 802–1242

Capsid protein

Eastern equine encephalitis virus

UniProt Q88793

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合异源复合物蛋白 × 12 其他聚合物 4 PDB 声明：12-meric（12）与蛋白拷贝数一致	链 P； UniProt 102–261 链 Q； UniProt 102–261 链 R； UniProt 102–261 链 S； UniProt 102–261	片段：Capsid c-terminal domain	E1 glycoprotein × 4 （E9KXM2） E2 glycoprotein × 2 （A9XR09） E2 glycoprotein × 2 （A9XR09） beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 9YB4	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
9YAX Localized reconstruction of the asymmetric unit of the low pH treated back neutralized SINV/EEEV in complex with Fab fragment of the antibody EEEV-179 提交 2025-09-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：17-meric	链 P 102–261（160 aa）片段：Capsid protein c-terminal domain 链 Q 102–261（160 aa）片段：Capsid protein c-terminal domain 链 R 102–261（160 aa）片段：Capsid protein c-terminal domain 链 S 102–261（160 aa）片段：Capsid protein c-terminal domain 链 T 102–261（160 aa）片段：Capsid protein c-terminal domain	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å
9YAZ Localized reconstruction of the asymmetric unit of SINV/EEEV in complex with Fab EEEV-179 at 40C sample. 提交 2025-09-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：17-meric	链 P 102–261（160 aa）片段：Capsid c-terminal domain 链 Q 102–261（160 aa）片段：Capsid c-terminal domain 链 R 102–261（160 aa）片段：Capsid c-terminal domain 链 S 102–261（160 aa）片段：Capsid c-terminal domain 链 T 102–261（160 aa）片段：Capsid c-terminal domain	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
9YB1 Localized reconstruction of the asymmetric unit of SINV/EEEV at pH 5.6. 提交 2025-09-16	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric	链 P 102–261（160 aa）片段：Capsid c-terminal domain 链 Q 102–261（160 aa）片段：Capsid c-terminal domain 链 R 102–261（160 aa）片段：Capsid c-terminal domain 链 S 102–261（160 aa）片段：Capsid c-terminal domain	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 5.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.70 Å
9YB2 Localized reconstruction of the asymmetric unit of SINV/EEEV at 40C sample. 提交 2025-09-16	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric	链 P 102–261（160 aa）片段：Capsid c-terminal domain 链 Q 102–261（160 aa）片段：Capsid c-terminal domain 链 R 102–261（160 aa）片段：Capsid c-terminal domain 链 S 102–261（160 aa）片段：Capsid c-terminal domain	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
9YB3 Localized reconstruction of the asymmetric unit of SINV/EEEV. 提交 2025-09-16	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric	链 P 102–261（160 aa）片段：Capsid protein c-terminal domain 链 Q 102–261（160 aa）片段：Capsid protein c-terminal domain 链 R 102–261（160 aa）片段：Capsid protein c-terminal domain 链 S 102–261（160 aa）片段：Capsid protein c-terminal domain	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å

共 5 个其他 PDB 条目、5 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q88793_EEEV
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 P； PDB构建体 1–160； UniProt 102–261 作者链 Q； PDB构建体 1–160； UniProt 102–261 作者链 R； PDB构建体 1–160； UniProt 102–261 作者链 S； PDB构建体 1–160； UniProt 102–261

E2 glycoprotein

Eastern equine encephalitis virus

UniProt A9XR09

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合异源复合物蛋白 × 12 其他聚合物 4 PDB 声明：12-meric（12）与蛋白拷贝数一致	链 a； UniProt 2–419 链 b； UniProt 1–419 链 c； UniProt 1–419 链 d； UniProt 2–419	未记录	E1 glycoprotein × 4 （E9KXM2） Capsid protein × 4 （Q88793） beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 9YB4	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
8VSV Cryo-EM structure of SINV/EEEV in complex with a potently neutralizing intact human antibody EEEV-373 提交 2024-01-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：16-meric	链 a 1–338（338 aa）链 b 1–338（338 aa）链 c 1–338（338 aa）链 d 1–338（338 aa）链 e 1–338（338 aa）链 f 1–338（338 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
9AY1 Cryo-EM structure of SINV/EEEV in complex with a potently neutralizing human antibody IgG EEEV-373 提交 2024-03-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 600 PDB 声明：600-meric	链 a 1–338（338 aa）链 b 1–338（338 aa）链 c 1–338（338 aa）链 d 1–338（338 aa）	未记录	BMA beta-D-mannopyranose × 60 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 240	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.60 Å
9AY1 Cryo-EM structure of SINV/EEEV in complex with a potently neutralizing human antibody IgG EEEV-373 提交 2024-03-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 a 1–338（338 aa）链 b 1–338（338 aa）链 c 1–338（338 aa）链 d 1–338（338 aa）	未记录	BMA beta-D-mannopyranose × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.60 Å
9AY1 Cryo-EM structure of SINV/EEEV in complex with a potently neutralizing human antibody IgG EEEV-373 提交 2024-03-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 其他组合异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：50-meric	链 a 1–338（338 aa）链 b 1–338（338 aa）链 c 1–338（338 aa）链 d 1–338（338 aa）	未记录	BMA beta-D-mannopyranose × 5 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 20	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.60 Å
9AY1 Cryo-EM structure of SINV/EEEV in complex with a potently neutralizing human antibody IgG EEEV-373 提交 2024-03-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 其他组合异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：60-meric	链 a 1–338（338 aa）链 b 1–338（338 aa）链 c 1–338（338 aa）链 d 1–338（338 aa）	未记录	BMA beta-D-mannopyranose × 6 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 24	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.60 Å
9AY1 Cryo-EM structure of SINV/EEEV in complex with a potently neutralizing human antibody IgG EEEV-373 提交 2024-03-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 其他组合异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 a 1–338（338 aa）链 b 1–338（338 aa）链 c 1–338（338 aa）链 d 1–338（338 aa）	未记录	BMA beta-D-mannopyranose × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.60 Å
9YAW Localized reconstruction of the asymmetric unit of SINV/EEEV in complex with Fab EEEV-33 at arm 4 at pH 5.6. 提交 2025-09-16	聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：14-meric	链 a 2–419（418 aa）链 b 1–419（419 aa）链 c 1–419（419 aa）链 d 2–419（418 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 5.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å
9YB3 Localized reconstruction of the asymmetric unit of SINV/EEEV. 提交 2025-09-16	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric	链 a 2–419（418 aa）链 b 1–419（419 aa）链 c 1–419（419 aa）链 d 2–419（418 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å

共 4 个其他 PDB 条目、8 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A9XR09_EEEV
Isoform	—
PDB实体	3, 4
链与序列区间	作者链 a； PDB构建体 1–418； UniProt 2–419 作者链 d； PDB构建体 1–418； UniProt 2–419 作者链 b； PDB构建体 1–419； UniProt 1–419 作者链 c； PDB构建体 1–419； UniProt 1–419

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9yb4
沉积日期 deposition_date	2025-09-16
结构标题 title	Localized reconstruction of the asymmetric unit of the low pH treated back neutralized SINV/EEEV.
关键词 keywords	;Eastern Equine Encephalitis Virus, Cryo-EM, Single Particle Averaging, localized reconstruction, asymmetric unit, low pH back neutralization., VIRUS ;; VIRUS
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	65.65 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	65.14 Å
零角强度 I(0) i0	2916680000.00
分子量 molecular_weight	452590.0 kDa
排除体积 excluded_volume	565200 Å³
包络体积 envelope_volume	988630 Å³
水化壳体积 shell_volume	127300 Å³
包络直径 envelope_diameter	211.1 Å
壳层 Rg shell_rg	67.66 Å
包络 Rg envelope_rg	61.76 Å
形状 Rg shape_rg	65.08 Å
总 Rg total_rg	65.40 Å
总原子数 total_atoms	31820
残基数 n_residues	4078
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	209.9 Å
Rg (实空间) rg_real	65.32 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	2.67 Å
I(0) (实空间) i0_real	2.9170e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	6.4680e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal	65.88 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	2919000000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8770
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	87.4 Å
偏度 Skewness skewness	0.082
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.621
角度范围 angular_range	— – 0.1200 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	127600000.0000
实空间数据点数 n_real_points	25
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.949; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.976; Smooth: 0.574

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	E1 glycoprotein
分子量 formula_weight	47938.1 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.21.90
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D
原子数 atom_count	31820

YEHTAVMPNKVGIPYKALVERPGYAPVHLQIQLVNTRIIPSTNLEYITCKYKTKVPSPVVKCCGATQCTSKPHPDYQCQVFTGVYPFMWGGAYCFCDTENTQMSEAYVERSEECSIDHAKAYKVHTGTVQAMVNITYGSVSWRSADVYVNGETPAKIGDAKLIIGPLSSAWSPFDNKVVVYGHEVYNYDFPEYGTGKAGSFGDLQSRTSTSNDLYANTNLKLQRPQAGIVHTPFTQAPSGFERWKRDKGAPLNDVAPFGCSIALEPLRAENCAVGSIPISIDIPDAAFTRISETPTVSDLECKITECTYASDFGGIATVAYKSSKAGNCPIHSPSGVAVIKENDVTLAESGSFTFHFSTANIHPAFKLQVCTSAVTCKGDCKPPKDHIVDYPAQHTESFTSAISATAWSWLKVLVGGTSAFIVLGLIATAVVALVLFFHRH

来源 Source

来源生物 organism	Eastern equine encephalitis virus
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	11021
宿主生物 host_organism	Mesocricetus auratus

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Capsid protein
分子量 formula_weight	17650.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	P,Q,R,S

QRMCMKLESDKTFPIMLNGQVNGYACVVGGRVFKPLHVEGRIDNEQLAAIKLKKASIYDLEYGDVPQCMKSDTLQYTSDKPPGFYNWHHGAVQYENNRFTVPRGVGGKGDSGRPILDNKGRVVAIVLGGVNEGSRTALSVVTWNQKGVTVKDTPEGSEPW

来源 Source

来源生物 organism	Eastern equine encephalitis virus
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	11021
宿主生物 host_organism	Mesocricetus auratus

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	E2 glycoprotein
分子量 formula_weight	46860.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	a,d

LDTHFTQYKLARPYIADCPNCGHSRCDSPIAIEEVRGDAHAGVIRIQTSAMFGLKTDGVDLAYMSFMNGKTQKSIKIDNLHVRTSAPCSLVSHHGYYILAQCPPGDTVTVGFHDGPNRHTCTVAHKVEFRPVGREKYRHPPEHGVELPCNRYTHKRADQGHYVEMHQPGLVADHSLLSIHSAKVKITVPSGAQVKYYCKCPDVREGITSSDHTTTCTDVKQCRAYLIDNKKWVYNSGRLPRGEGDTFKGKLHVPFVPVKAKCIATLAPEPLVEHKHRTLILHLHPDHPTLLTTRSLGSDANPTRQWIERPTTVNFTVTGEGLEYTWGNHPPKRVWAQESGEGNPHGWPHEVVVYYYNRYPLTTIIGLCTCVAIIMVSCVTSVWLLCRTRNLCITPYKLAPNAQVPILLALLCCIKPTR

来源 Source

来源生物 organism	Eastern equine encephalitis virus
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	11021
宿主生物 host_organism	Mesocricetus auratus

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	E2 glycoprotein
分子量 formula_weight	46975.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	b,c

DLDTHFTQYKLARPYIADCPNCGHSRCDSPIAIEEVRGDAHAGVIRIQTSAMFGLKTDGVDLAYMSFMNGKTQKSIKIDNLHVRTSAPCSLVSHHGYYILAQCPPGDTVTVGFHDGPNRHTCTVAHKVEFRPVGREKYRHPPEHGVELPCNRYTHKRADQGHYVEMHQPGLVADHSLLSIHSAKVKITVPSGAQVKYYCKCPDVREGITSSDHTTTCTDVKQCRAYLIDNKKWVYNSGRLPRGEGDTFKGKLHVPFVPVKAKCIATLAPEPLVEHKHRTLILHLHPDHPTLLTTRSLGSDANPTRQWIERPTTVNFTVTGEGLEYTWGNHPPKRVWAQESGEGNPHGWPHEVVVYYYNRYPLTTIIGLCTCVAIIMVSCVTSVWLLCRTRNLCITPYKLAPNAQVPILLALLCCIKPTR

来源 Source

来源生物 organism	Eastern equine encephalitis virus
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	11021
宿主生物 host_organism	Mesocricetus auratus

实体 5 Entity 5 branched

描述 description	beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	586.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	221.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.100 Å
最低分辨率 resolution_low	— Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	—
R_free r_free	—

分辨率 resolution	3.10 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	958879

fit	/app/data/saxs_computation/yb/9yb4/9yb4.fit
pddf	/app/data/pr_computation/yb/9yb4/9yb4.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/yb/9yb4/9yb4.dat

Localized reconstruction of the asymmetric unit of the low pH treated back neutralized SINV/EEEV.

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

E1 glycoprotein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Capsid protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

E2 glycoprotein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

冷冻电镜 EM 3D

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 5 Entity 5 branched

实体 6 Entity 6 non-polymer

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)