9ydo

LPHT-ring in Vibrio cholerae at assembled, opened state

Method: ELECTRON MICROSCOPY
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Flagellar L-ring protein

物种未注明

UniProt Q9KQ13

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 156 Flagellar P-ring protein × 26 (Q9KQ14) Flagellar protein FlgT × 26 (Q9KPZ9) Sodium-type flagellar protein MotY × 26 (Q9KT95) Flagellar assembly lipoprotein FlgP × 52 (A0A2V4N6M7) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 FLGH_VIBCH
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 Aa; PDB构建体 1–227; UniProt 32–258 作者链 Ab; PDB构建体 1–227; UniProt 32–258 作者链 Ac; PDB构建体 1–227; UniProt 32–258 作者链 Ad; PDB构建体 1–227; UniProt 32–258 作者链 Ae; PDB构建体 1–227; UniProt 32–258 作者链 Af; PDB构建体 1–227; UniProt 32–258 作者链 Ag; PDB构建体 1–227; UniProt 32–258 作者链 Ah; PDB构建体 1–227; UniProt 32–258 作者链 Ai; PDB构建体 1–227; UniProt 32–258 作者链 Aj; PDB构建体 1–227; UniProt 32–258 作者链 Ak; PDB构建体 1–227; UniProt 32–258 作者链 Al; PDB构建体 1–227; UniProt 32–258 作者链 Am; PDB构建体 1–227; UniProt 32–258 作者链 An; PDB构建体 1–227; UniProt 32–258 作者链 Ao; PDB构建体 1–227; UniProt 32–258 作者链 Ap; PDB构建体 1–227; UniProt 32–258 作者链 Aq; PDB构建体 1–227; UniProt 32–258 作者链 Ar; PDB构建体 1–227; UniProt 32–258 作者链 As; PDB构建体 1–227; UniProt 32–258 作者链 At; PDB构建体 1–227; UniProt 32–258 作者链 Au; PDB构建体 1–227; UniProt 32–258 作者链 Av; PDB构建体 1–227; UniProt 32–258 作者链 Aw; PDB构建体 1–227; UniProt 32–258 作者链 Ax; PDB构建体 1–227; UniProt 32–258 作者链 Ay; PDB构建体 1–227; UniProt 32–258 作者链 Az; PDB构建体 1–227; UniProt 32–258

Flagellar P-ring protein

物种未注明

UniProt Q9KQ14

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 156 Flagellar L-ring protein × 26 (Q9KQ13) Flagellar protein FlgT × 26 (Q9KPZ9) Sodium-type flagellar protein MotY × 26 (Q9KT95) Flagellar assembly lipoprotein FlgP × 52 (A0A2V4N6M7) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 FLGI_VIBCH
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 Ba; PDB构建体 1–343; UniProt 19–361 作者链 Bb; PDB构建体 1–343; UniProt 19–361 作者链 Bc; PDB构建体 1–343; UniProt 19–361 作者链 Bd; PDB构建体 1–343; UniProt 19–361 作者链 Be; PDB构建体 1–343; UniProt 19–361 作者链 Bf; PDB构建体 1–343; UniProt 19–361 作者链 Bg; PDB构建体 1–343; UniProt 19–361 作者链 Bh; PDB构建体 1–343; UniProt 19–361 作者链 Bi; PDB构建体 1–343; UniProt 19–361 作者链 Bj; PDB构建体 1–343; UniProt 19–361 作者链 Bk; PDB构建体 1–343; UniProt 19–361 作者链 Bl; PDB构建体 1–343; UniProt 19–361 作者链 Bm; PDB构建体 1–343; UniProt 19–361 作者链 Bn; PDB构建体 1–343; UniProt 19–361 作者链 Bo; PDB构建体 1–343; UniProt 19–361 作者链 Bp; PDB构建体 1–343; UniProt 19–361 作者链 Bq; PDB构建体 1–343; UniProt 19–361 作者链 Br; PDB构建体 1–343; UniProt 19–361 作者链 Bs; PDB构建体 1–343; UniProt 19–361 作者链 Bt; PDB构建体 1–343; UniProt 19–361 作者链 Bu; PDB构建体 1–343; UniProt 19–361 作者链 Bv; PDB构建体 1–343; UniProt 19–361 作者链 Bw; PDB构建体 1–343; UniProt 19–361 作者链 Bx; PDB构建体 1–343; UniProt 19–361 作者链 By; PDB构建体 1–343; UniProt 19–361 作者链 Bz; PDB构建体 1–343; UniProt 19–361

Flagellar protein FlgT

物种未注明

UniProt Q9KPZ9

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 156 Flagellar L-ring protein × 26 (Q9KQ13) Flagellar P-ring protein × 26 (Q9KQ14) Sodium-type flagellar protein MotY × 26 (Q9KT95) Flagellar assembly lipoprotein FlgP × 52 (A0A2V4N6M7) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q9KPZ9_VIBCH
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 Ca; PDB构建体 1–352; UniProt 26–377 作者链 Cb; PDB构建体 1–352; UniProt 26–377 作者链 Cc; PDB构建体 1–352; UniProt 26–377 作者链 Cd; PDB构建体 1–352; UniProt 26–377 作者链 Ce; PDB构建体 1–352; UniProt 26–377 作者链 Cf; PDB构建体 1–352; UniProt 26–377 作者链 Cg; PDB构建体 1–352; UniProt 26–377 作者链 Ch; PDB构建体 1–352; UniProt 26–377 作者链 Ci; PDB构建体 1–352; UniProt 26–377 作者链 Cj; PDB构建体 1–352; UniProt 26–377 作者链 Ck; PDB构建体 1–352; UniProt 26–377 作者链 Cl; PDB构建体 1–352; UniProt 26–377 作者链 Cm; PDB构建体 1–352; UniProt 26–377 作者链 Cn; PDB构建体 1–352; UniProt 26–377 作者链 Co; PDB构建体 1–352; UniProt 26–377 作者链 Cp; PDB构建体 1–352; UniProt 26–377 作者链 Cq; PDB构建体 1–352; UniProt 26–377 作者链 Cr; PDB构建体 1–352; UniProt 26–377 作者链 Cs; PDB构建体 1–352; UniProt 26–377 作者链 Ct; PDB构建体 1–352; UniProt 26–377 作者链 Cu; PDB构建体 1–352; UniProt 26–377 作者链 Cv; PDB构建体 1–352; UniProt 26–377 作者链 Cw; PDB构建体 1–352; UniProt 26–377 作者链 Cx; PDB构建体 1–352; UniProt 26–377 作者链 Cy; PDB构建体 1–352; UniProt 26–377 作者链 Cz; PDB构建体 1–352; UniProt 26–377

Sodium-type flagellar protein MotY

物种未注明

UniProt Q9KT95

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 156 Flagellar L-ring protein × 26 (Q9KQ13) Flagellar P-ring protein × 26 (Q9KQ14) Flagellar protein FlgT × 26 (Q9KPZ9) Flagellar assembly lipoprotein FlgP × 52 (A0A2V4N6M7) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q9KT95_VIBCH
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 Da; PDB构建体 1–272; UniProt 23–294 作者链 Db; PDB构建体 1–272; UniProt 23–294 作者链 Dc; PDB构建体 1–272; UniProt 23–294 作者链 Dd; PDB构建体 1–272; UniProt 23–294 作者链 De; PDB构建体 1–272; UniProt 23–294 作者链 Df; PDB构建体 1–272; UniProt 23–294 作者链 Dg; PDB构建体 1–272; UniProt 23–294 作者链 Dh; PDB构建体 1–272; UniProt 23–294 作者链 Di; PDB构建体 1–272; UniProt 23–294 作者链 Dj; PDB构建体 1–272; UniProt 23–294 作者链 Dk; PDB构建体 1–272; UniProt 23–294 作者链 Dl; PDB构建体 1–272; UniProt 23–294 作者链 Dm; PDB构建体 1–272; UniProt 23–294 作者链 Dn; PDB构建体 1–272; UniProt 23–294 作者链 Do; PDB构建体 1–272; UniProt 23–294 作者链 Dp; PDB构建体 1–272; UniProt 23–294 作者链 Dq; PDB构建体 1–272; UniProt 23–294 作者链 Dr; PDB构建体 1–272; UniProt 23–294 作者链 Ds; PDB构建体 1–272; UniProt 23–294 作者链 Dt; PDB构建体 1–272; UniProt 23–294 作者链 Du; PDB构建体 1–272; UniProt 23–294 作者链 Dv; PDB构建体 1–272; UniProt 23–294 作者链 Dw; PDB构建体 1–272; UniProt 23–294 作者链 Dx; PDB构建体 1–272; UniProt 23–294 作者链 Dy; PDB构建体 1–272; UniProt 23–294 作者链 Dz; PDB构建体 1–272; UniProt 23–294

Flagellar assembly lipoprotein FlgP

物种未注明

UniProt A0A2V4N6M7

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 156 Flagellar L-ring protein × 26 (Q9KQ13) Flagellar P-ring protein × 26 (Q9KQ14) Flagellar protein FlgT × 26 (Q9KPZ9) Sodium-type flagellar protein MotY × 26 (Q9KT95) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 A0A2V4N6M7_VIBCL
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 Fa; PDB构建体 1–15; UniProt 131–145 作者链 Fb; PDB构建体 1–15; UniProt 131–145 作者链 Fc; PDB构建体 1–15; UniProt 131–145 作者链 Fd; PDB构建体 1–15; UniProt 131–145 作者链 Fe; PDB构建体 1–15; UniProt 131–145 作者链 Ff; PDB构建体 1–15; UniProt 131–145 作者链 Fg; PDB构建体 1–15; UniProt 131–145 作者链 Fh; PDB构建体 1–15; UniProt 131–145 作者链 Fi; PDB构建体 1–15; UniProt 131–145 作者链 Fj; PDB构建体 1–15; UniProt 131–145 作者链 Fk; PDB构建体 1–15; UniProt 131–145 作者链 Fl; PDB构建体 1–15; UniProt 131–145 作者链 Fm; PDB构建体 1–15; UniProt 131–145 作者链 Fn; PDB构建体 1–15; UniProt 131–145 作者链 Fo; PDB构建体 1–15; UniProt 131–145 作者链 Fp; PDB构建体 1–15; UniProt 131–145 作者链 Fq; PDB构建体 1–15; UniProt 131–145 作者链 Fr; PDB构建体 1–15; UniProt 131–145 作者链 Fs; PDB构建体 1–15; UniProt 131–145 作者链 Ft; PDB构建体 1–15; UniProt 131–145 作者链 Fu; PDB构建体 1–15; UniProt 131–145 作者链 Fv; PDB构建体 1–15; UniProt 131–145 作者链 Fw; PDB构建体 1–15; UniProt 131–145 作者链 Fx; PDB构建体 1–15; UniProt 131–145 作者链 Fy; PDB构建体 1–15; UniProt 131–145 作者链 Fz; PDB构建体 1–15; UniProt 131–145 作者链 Ga; PDB构建体 1–15; UniProt 131–145 作者链 Gb; PDB构建体 1–15; UniProt 131–145 作者链 Gc; PDB构建体 1–15; UniProt 131–145 作者链 Gd; PDB构建体 1–15; UniProt 131–145 作者链 Ge; PDB构建体 1–15; UniProt 131–145 作者链 Gf; PDB构建体 1–15; UniProt 131–145 作者链 Gg; PDB构建体 1–15; UniProt 131–145 作者链 Gh; PDB构建体 1–15; UniProt 131–145 作者链 Gi; PDB构建体 1–15; UniProt 131–145 作者链 Gj; PDB构建体 1–15; UniProt 131–145 作者链 Gk; PDB构建体 1–15; UniProt 131–145 作者链 Gl; PDB构建体 1–15; UniProt 131–145 作者链 Gm; PDB构建体 1–15; UniProt 131–145 作者链 Gn; PDB构建体 1–15; UniProt 131–145 作者链 Go; PDB构建体 1–15; UniProt 131–145 作者链 Gp; PDB构建体 1–15; UniProt 131–145 作者链 Gq; PDB构建体 1–15; UniProt 131–145 作者链 Gr; PDB构建体 1–15; UniProt 131–145 作者链 Gs; PDB构建体 1–15; UniProt 131–145 作者链 Gt; PDB构建体 1–15; UniProt 131–145 作者链 Gu; PDB构建体 1–15; UniProt 131–145 作者链 Gv; PDB构建体 1–15; UniProt 131–145 作者链 Gw; PDB构建体 1–15; UniProt 131–145 作者链 Gx; PDB构建体 1–15; UniProt 131–145 作者链 Gy; PDB构建体 1–15; UniProt 131–145 作者链 Gz; PDB构建体 1–15; UniProt 131–145

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id9ydo
沉积日期 deposition_date2025-09-22
结构标题 titleLPHT-ring in Vibrio cholerae at assembled, opened state
关键词 keywordsIn situ cryo-EM, sheathed flagellar motor, Vibrio cholerae, LP-ring, assembled state, MOTOR PROTEIN; MOTOR PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9ydo__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9ydo__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 109 1010 1011 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

9ydo__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)0.00 Å
Rg(电子密度)120.70 Å
总 Rg120.60 Å
原子数236015
残基数30589
排除体积4185200 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 9ydo__assembly_1__model_1 156-meric (156) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

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7. 引用文献 (1)