9z6u

The structure of TMD with 2 TARPs and 2 CNIHs from all native AMPA receptor subtypes

Method: ELECTRON MICROSCOPY

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Glutamate receptor 2

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 8	Mix of AMPAR subunit (GluA1, GluA2, GluA3 and GluA4) × 2 Mix of Protein cornichon homolog 2 and 3 × 2 Voltage-dependent calcium channel gamma-8 subunit × 2 （Q8VHW2） (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 20 TETRADECANE × 18 6-[2-chloro-6-(trifluoromethoxy)phenyl]-1H-benzimidazol-2-ol × 2 DODECANE × 6	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	GRIA2_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–37； UniProt 532–568 作者链 B； PDB构建体 59–120； UniProt 590–651 作者链 B； PDB构建体 274–310； UniProt 805–841 作者链 D； PDB构建体 1–37； UniProt 532–568 作者链 D； PDB构建体 59–120； UniProt 590–651 作者链 D； PDB构建体 274–310； UniProt 805–841

Voltage-dependent calcium channel gamma-8 subunit

物种未注明

UniProt Q8VHW2

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 8	Mix of AMPAR subunit (GluA1, GluA2, GluA3 and GluA4) × 2 Glutamate receptor 2 × 2 （P23819） Mix of Protein cornichon homolog 2 and 3 × 2 (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 20 TETRADECANE × 18 6-[2-chloro-6-(trifluoromethoxy)phenyl]-1H-benzimidazol-2-ol × 2 DODECANE × 6	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CCG8_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–422； UniProt 2–423 作者链 H； PDB构建体 1–422； UniProt 2–423

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9z6u
沉积日期 deposition_date	2025-11-14
结构标题 title	The structure of TMD with 2 TARPs and 2 CNIHs from all native AMPA receptor subtypes
关键词 keywords	Ionotropic glutamate receptor AMPA receptor, MEMBRANE PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9z6u__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9z6u__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

9z6u__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	35.55 Å
Rg（电子密度）	34.26 Å
总 Rg	34.92 Å
原子数	9242
残基数	1156
排除体积	171120 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`9z6u__assembly_1__model_1`	octameric （8）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Mix of AMPAR subunit (GluA1, GluA2, GluA3 and GluA4)
分子量 formula_weight	29723.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,C
原子数 atom_count	9242

KPGVFSFLDPLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXNEFGIFNSLWFSLGAFMQQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLTVERMVXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXSALSLSNVAGVFYILAGGLGLAMAVALIEFCYKSRA

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Glutamate receptor 2
分子量 formula_weight	29838.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,D

KPGVFSFLDPLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXNEFGIFNSLWFSLGAFMRQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLTVERMVXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTSALSLSNVAGVFYILVGGLGLAMLVALIEFCYKSRA

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Mix of Protein cornichon homolog 2 and 3
分子量 formula_weight	17901.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,F

AFTFAAFCYMLALVLCAALIFFAIWHIIAFDELRTDFKAPIDQANPAAARERLANIERICALLRKLVAPEYSIHALFCAMFLCAAEWATLGLNAPLLFYHAWRYFHAPADASEAAYDAAAAMNADALAYCQKEAWCKLAFYLLSFFYYLYAMAYTLVSA

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Voltage-dependent calcium channel gamma-8 subunit
分子量 formula_weight	43371.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G,H

ESLKRWNEERGLWCEKGVQVLLTTIGAFSAFGLMTIAISTDYWLYTRALICNTTNLTAGDDGPPHRGGSGSSEKKDPGGLTHSGLWRICCLEGLKRGVCVKINHFPEDTDYDHDSAEYLLRVVRASSIFPILSAILLLLGGVCVAASRVYKSKRNIILGAGILFVAAGLSNIIGVIVYISANAGEPGPKRDEEKKNHYSYGWSFYFGGLSFILAEVIGVLAVNIYIERSREAHCQSRSDLLKAGGGAGGSGGSGPSAILRLPSYRFRYRRRSRSSSRGSSEASPSRDASPGGPGGPGFASTDISMYTLSRDPSKGSVAAGLASAGGGGSGAGVGAYGGAAGAAGGGGAGSERDRGSSAGFLTLHNAFPKEAASGVTVTVTGPPAAPAPAPAPPAPAAPAPGTLSKEAAASNTNTLNRKTTPV

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	(2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate
分子量 formula_weight	760.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	20

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	TETRADECANE
分子量 formula_weight	198.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	18

实体 7 Entity 7 non-polymer

描述 description	6-[2-chloro-6-(trifluoromethoxy)phenyl]-1H-benzimidazol-2-ol
分子量 formula_weight	328.7 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 8 Entity 8 non-polymer

描述 description	DODECANE
分子量 formula_weight	170.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	triclinic

分辨率 resolution	2.87 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	88827

The structure of TMD with 2 TARPs and 2 CNIHs from all native AMPA receptor subtypes

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Glutamate receptor 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Voltage-dependent calcium channel gamma-8 subunit

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

9z6u__assembly_1__model_1

9z6u__assembly_1__model_1 | I(q)

9z6u__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 non-polymer

实体 8 Entity 8 non-polymer

7. 引用文献 (1)

The structure of TMD with 2 TARPs and 2 CNIHs from all native AMPA receptor subtypes

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Glutamate receptor 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Voltage-dependent calcium channel gamma-8 subunit

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

9z6u__assembly_1__model_1

9z6u__assembly_1__model_1 | I(q)

9z6u__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 non-polymer

实体 8 Entity 8 non-polymer

7. 引用文献 (1)