当前蛋白身份:A0A6A5PRZ0 重新检索
本组结构的主要差异维度
组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
7ML1 RNA polymerase II pre-initiation complex (PIC2) 提交 2021-04-27 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 28 PDB 声明:30-meric(30) 与全部聚合物一致
链 V 1–122(122 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
7ML2 RNA polymerase II pre-initiation complex (PIC3) 提交 2021-04-27 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 28 PDB 声明:30-meric(30) 与全部聚合物一致
链 V 1–122(122 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7ML4 RNA polymerase II initially transcribing complex (ITC) 提交 2021-04-27 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 28 PDB 声明:31-meric(31) 与全部聚合物一致
链 V 1–122(122 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 15 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7OH9 Nucleosome with TBP and TFIIA bound at SHL -6 提交 2021-05-09 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 11 PDB 声明:tridecameric(13) 与全部聚合物一致
链 M 1–122(122 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7OHA nucleosome with TBP and TFIIA bound at SHL +2 提交 2021-05-09 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 11 PDB 声明:tridecameric(13) 与全部聚合物一致
链 M 1–122(122 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8CEN Yeast RNA polymerase II transcription pre-initiation complex with core Mediator 提交 2023-02-02 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 44 PDB 声明:46-meric(46) 与全部聚合物一致
链 V 1–122(122 aa)
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8CEO Yeast RNA polymerase II transcription pre-initiation complex with core Mediator and the +1 nucleosome 提交 2023-02-02 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 52 PDB 声明:54-meric(54) 与全部聚合物一致
链 V 1–122(122 aa)
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8UMH Consensus map of PICdeltaTFIIK form2 提交 2023-10-17 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 28 PDB 声明:30-meric(30) 与全部聚合物一致
链 V 1–122(122 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 15 MG MAGNESIUM ION × 2 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6;20 mM HEPES PH 7.6 50 mM KOAc 5 mM DTT 2 mM MgOAc
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
8UMI consensus map of PICdeltaTFIIK form1 提交 2023-10-17 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 28 PDB 声明:30-meric(30) 与全部聚合物一致
链 V 1–122(122 aa)
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 15 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6;20 mM HEPES PH 7.6 50 mM KOAc 5 mM DTT 2 mM MgOAc
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å