当前蛋白身份:A0A6A5PRZ0
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7ML1 RNA polymerase II pre-initiation complex (PIC2) 提交 2021-04-27 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 28 PDB 声明:30-meric(30) 与全部聚合物一致 |
链 V
1–122(122 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.00 Å |
| 7ML2 RNA polymerase II pre-initiation complex (PIC3) 提交 2021-04-27 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 28 PDB 声明:30-meric(30) 与全部聚合物一致 |
链 V
1–122(122 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 7ML4 RNA polymerase II initially transcribing complex (ITC) 提交 2021-04-27 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 28 PDB 声明:31-meric(31) 与全部聚合物一致 |
链 V
1–122(122 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 15 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 7OH9 Nucleosome with TBP and TFIIA bound at SHL -6 提交 2021-05-09 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 11 PDB 声明:tridecameric(13) 与全部聚合物一致 |
链 M
1–122(122 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 7OHA nucleosome with TBP and TFIIA bound at SHL +2 提交 2021-05-09 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 11 PDB 声明:tridecameric(13) 与全部聚合物一致 |
链 M
1–122(122 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 8CEN Yeast RNA polymerase II transcription pre-initiation complex with core Mediator 提交 2023-02-02 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 44 PDB 声明:46-meric(46) 与全部聚合物一致 |
链 V
1–122(122 aa)
|
未记录 | SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8CEO Yeast RNA polymerase II transcription pre-initiation complex with core Mediator and the +1 nucleosome 提交 2023-02-02 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 52 PDB 声明:54-meric(54) 与全部聚合物一致 |
链 V
1–122(122 aa)
|
未记录 | SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 8UMH Consensus map of PICdeltaTFIIK form2 提交 2023-10-17 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 28 PDB 声明:30-meric(30) 与全部聚合物一致 |
链 V
1–122(122 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 15 MG MAGNESIUM ION × 2 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6;20 mM HEPES PH 7.6
50 mM KOAc
5 mM DTT
2 mM MgOAc
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.10 Å |
| 8UMI consensus map of PICdeltaTFIIK form1 提交 2023-10-17 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 28 PDB 声明:30-meric(30) 与全部聚合物一致 |
链 V
1–122(122 aa)
|
未记录 | SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 15 MG MAGNESIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6;20 mM HEPES PH 7.6
50 mM KOAc
5 mM DTT
2 mM MgOAc
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |