当前蛋白身份:A0JNT9 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
6F1T Cryo-EM structure of two dynein tail domains bound to dynactin and BICDR1 提交 2017-11-23 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 45 PDB 声明:45-meric(45) 与蛋白数一致
链 X 1–325(325 aa)
链 x 1–325(325 aa)
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6F1U N terminal region of dynein tail domains in complex with dynactin filament and BICDR-1 提交 2017-11-23 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 13 PDB 声明:tridecameric(13) 与蛋白数一致
链 X 1–577(577 aa)
链 x 1–577(577 aa)
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6ZNM The pointed end complex of dynactin bound to BICDR1 提交 2020-07-06 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 X 1–325(325 aa)
链 x 1–325(325 aa)
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
7Z8F Composite structure of dynein-dynactin-BICDR on microtubules 提交 2022-03-17 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 43 PDB 声明:43-meric(43) 与蛋白数一致
链 W 1–577(577 aa)
链 X 1–577(577 aa)
链 w 1–577(577 aa)
链 x 1–577(577 aa)
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 13 MG MAGNESIUM ION × 14 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 ZN ZINC ION × 3 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;20 second incubation
分辨率 20.00 Å
7Z8I The barbed end complex of dynactin bound to BICDR1 and the cytoplasmic dynein tails (A2, B1, B2) 提交 2022-03-17 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 17 PDB 声明:heptadecameric(17) 与蛋白数一致
链 X 1–577(577 aa)
链 x 1–577(577 aa)
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;20 second incubation
分辨率 3.30 Å
7Z8J Cytoplasmic dynein (A2) bound to BICDR1 提交 2022-03-17 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric(9) 与蛋白数一致
链 X 1–577(577 aa)
链 x 1–577(577 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;20 second incubation
分辨率 3.93 Å
7Z8K Cytoplasmic dynein (A1) bound to BICDR1 提交 2022-03-17 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric(9) 与蛋白数一致
链 W 1–577(577 aa)
链 X 1–577(577 aa)
链 w 1–577(577 aa)
链 x 1–577(577 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;20 second incubation
分辨率 4.37 Å
7Z8M The pointed end complex of dynactin bound to BICDR1 提交 2022-03-17 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric(9) 与蛋白数一致
链 X 1–577(577 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 3 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;20 second incubation
分辨率 3.37 Å
9DGT structure of dynactin, dynein tail with one BICDR from dynein-dynactin-BICDR on microtubules 提交 2024-09-03 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 35 PDB 声明:35-meric(35) 与蛋白数一致
链 c 1–577(577 aa)
链 d 1–577(577 aa)
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.20 Å
9DGU structure of dynactin, dynein tail with two BICDR from dynein-dynactin-BICDR on microtubules 提交 2024-09-03 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 37 PDB 声明:37-meric(37) 与蛋白数一致
链 a 1–577(577 aa)
链 b 1–577(577 aa)
链 c 1–577(577 aa)
链 d 1–577(577 aa)
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.10 Å