当前蛋白身份：C3SHQ8
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6USM Structure of nuclease domain of human parvovirus B19 non-structural protein 1 in complex with zinc 提交 2019-10-28 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
27–392（366 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；1.2 M LiSo4 and sodium acetate tri-hydrate buffer of pH4.6
|
分辨率 3.37 Å |
| 6WH0 Crystal structure of HyBcl-2-4 with HyBax BH3 提交 2020-04-07 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
27–392（366 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；0.2M Magnesium chloride hexahydrate, 0.1 Bis Tris pH 5.5, 25% PEG 3350
|
分辨率 1.99 Å R-free 0.268 |
| 7JHG Cryo-EM structure of ATP-bound fully inactive AMPK in complex with Dorsomorphin (Compound C) and Fab-nanobody 提交 2020-07-20 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 M
26–392（367 aa）
|
未记录 | TAK 6-[4-(2-piperidin-1-ylethoxy)phenyl]-3-pyridin-4-ylpyrazolo[1,5-a]pyrimidine × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.47 Å |
| 7JHH Cryo-EM structure of ATP-bound fully inactive AMPK in complex with Fab and nanobody 提交 2020-07-20 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 M
26–392（367 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.92 Å |
| 8DEI Structure of the Cac1 KER domain 提交 2022-06-20 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
27–392（366 aa）
片段：KER domain, residues 136-225
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；288 K；0.1 M Phosphate/citrate pH 4.2 and 30 % PEG 300
|
分辨率 2.81 Å R-free 0.282 |
| 8DEI Structure of the Cac1 KER domain 提交 2022-06-20 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
27–392（366 aa）
片段：KER domain, residues 136-225
|
未记录 | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；288 K；0.1 M Phosphate/citrate pH 4.2 and 30 % PEG 300
|
分辨率 2.81 Å R-free 0.282 |
| 8DEI Structure of the Cac1 KER domain 提交 2022-06-20 | Assembly 3 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
27–392（366 aa）
片段：KER domain, residues 136-225
|
未记录 | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；288 K；0.1 M Phosphate/citrate pH 4.2 and 30 % PEG 300
|
分辨率 2.81 Å R-free 0.282 |
| 8DEI Structure of the Cac1 KER domain 提交 2022-06-20 | Assembly 4 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
27–392（366 aa）
片段：KER domain, residues 136-225
|
未记录 | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；288 K；0.1 M Phosphate/citrate pH 4.2 and 30 % PEG 300
|
分辨率 2.81 Å R-free 0.282 |
| 8E0P Crystal structure of mouse APCDD1 in fusion with engineered MBP 提交 2022-08-09 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
29–392（364 aa）
|
突变：D84A, K85A, E174A, N175A, A217H, K221H, K241A, A314V, I319V, E361A, K364A, D365A | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 PLM PALMITIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7；293 K；0.2 M ammonium citrate, pH 7.0, 20% PEG3350, 4% NDSB-256, 5% glycerol
|
分辨率 2.33 Å R-free 0.239 |
| 8E0P Crystal structure of mouse APCDD1 in fusion with engineered MBP 提交 2022-08-09 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
29–392（364 aa）
|
突变：D84A, K85A, E174A, N175A, A217H, K221H, K241A, A314V, I319V, E361A, K364A, D365A | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 GOL GLYCEROL × 2 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7；293 K；0.2 M ammonium citrate, pH 7.0, 20% PEG3350, 4% NDSB-256, 5% glycerol
|
分辨率 2.33 Å R-free 0.239 |
| 8E0P Crystal structure of mouse APCDD1 in fusion with engineered MBP 提交 2022-08-09 | Assembly 3 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
29–392（364 aa）
|
突变：D84A, K85A, E174A, N175A, A217H, K221H, K241A, A314V, I319V, E361A, K364A, D365A | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 PLM PALMITIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 1 DMX 3-[BENZYL(DIMETHYL)AMMONIO]PROPANE-1-SULFONATE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7；293 K；0.2 M ammonium citrate, pH 7.0, 20% PEG3350, 4% NDSB-256, 5% glycerol
|
分辨率 2.33 Å R-free 0.239 |
| 8E0P Crystal structure of mouse APCDD1 in fusion with engineered MBP 提交 2022-08-09 | Assembly 4 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
29–392（364 aa）
|
突变：D84A, K85A, E174A, N175A, A217H, K221H, K241A, A314V, I319V, E361A, K364A, D365A | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 GOL GLYCEROL × 1 CL CHLORIDE ION × 1 DMX 3-[BENZYL(DIMETHYL)AMMONIO]PROPANE-1-SULFONATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7；293 K；0.2 M ammonium citrate, pH 7.0, 20% PEG3350, 4% NDSB-256, 5% glycerol
|
分辨率 2.33 Å R-free 0.239 |
| 8IIY Crystal structure of MBP fused GAS41 YEATS domain in complex with H3K14ac peptide 提交 2023-02-24 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
27–392（366 aa）
|
突变：D108A, K109A, E198A, N199A, K265A | GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM Tris buffer (pH 8.5) containing 20% (w/v) PEG monomethyl ether 2000, 200 mM trimethylamine N-oxide
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.247 |
| 8IIZ Crystal structure of MBP fused GAS41 YEATS domain in complex with H3K27ac peptide 提交 2023-02-24 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
27–392（366 aa）
|
突变：D108A, K109A, E198A, N199A, K265A | GOL GLYCEROL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM Tris buffer (pH 8.5) containing 20% (w/v) PEG monomethyl ether 2000, 200 mM trimethylamine N-oxide
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.301 |
| 8SQB The cryo-EM structure of the EcBAM/EspP(beta7-12) complex 提交 2023-05-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 F
26–392（367 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 9B83 Cryo-EM structure of human ADAR1 in complex with dsRNA derived from human GLI1 gene 提交 2024-03-28 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
27–392（366 aa）
链 B
27–392（366 aa）
|
未记录 | IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.01 Å |
| 9B84 Cryo-EM structure of human ADAR1 in complex with dsRNA derived from HT2C gene 提交 2024-03-28 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
27–392（366 aa）
链 B
27–392（366 aa）
|
未记录 | IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 9B89 Cryo-EM structure of human ADAR1 in complex with dsRNA derived from HT2C gene in the pre-editing state 提交 2024-03-29 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物一致 |
链 A
27–392（366 aa）
链 B
27–392（366 aa）
|
未记录 | IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.87 Å |
| 9BDT Apolipoprotein B 100 bound to LDL receptor and legobody 提交 2024-04-12 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 B
27–384（358 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 CA CALCIUM ION × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.40 Å |
| 9COO Nanobody 4 bound to Apolipoprotein B 100 提交 2024-07-17 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 B
27–384（358 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 CA CALCIUM ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.73 Å |
| 9IVP 24-mer DARPin-apoferritin scaffold in complex with the maltose binding protein 提交 2024-07-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：48-meric（48） 与蛋白数一致 |
链 AA
27–392（366 aa）
链 B
27–392（366 aa）
链 CA
27–392（366 aa）
链 D
27–392（366 aa）
链 EA
27–392（366 aa）
链 F
27–392（366 aa）
链 GA
27–392（366 aa）
链 H
27–392（366 aa）
链 IA
27–392（366 aa）
链 J
27–392（366 aa）
链 KA
27–392（366 aa）
链 L
27–392（366 aa）
链 MA
27–392（366 aa）
链 N
27–392（366 aa）
链 OA
27–392（366 aa）
链 P
27–392（366 aa）
链 QA
27–392（366 aa）
链 R
27–392（366 aa）
链 SA
27–392（366 aa）
链 T
27–392（366 aa）
链 UA
27–392（366 aa）
链 W
27–392（366 aa）
链 WA
27–392（366 aa）
链 Y
27–392（366 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 9ZVM Dimer structure of Thlaspi arvense plastid biotin carboxylase 提交 2025-12-30 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
27–392（366 aa）
链 D
27–392（366 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；50mM HEPES pH 8.0, 4mM MgCl2, 5% glycerol, 0.5mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.85 Å |