当前蛋白身份：O49003
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2V0U n- and c-terminal helices of oat lov2 (404-546) are involved in light-induced signal transduction (cryo dark structure of lov2 (404-546)) 提交 2007-05-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
404–546（143 aa）
片段：LIGHT, OXYGEN, VOLTAGE DOMAIN, RESIDUES 404-546
|
未记录 | FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 GOL GLYCEROL × 6 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.40 Å R-free 0.197 |
| 2V0W N- and C-terminal helices of oat LOV2 (404-546) are involved in light- induced signal transduction (cryo-trapped light structure of LOV2 (404-546)) 提交 2007-05-20 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
404–546（143 aa）
片段：LIGHT, OXYGEN, VOLTAGE DOMAIN, RESIDUES 404-546
|
未记录 | FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 GOL GLYCEROL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；Reservoir: 0.07 M sodium acetate, pH 4.6, 5.6% PEG 4000, 30% glycerol
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.215 |
| 2V1A N- and C-terminal helices of oat LOV2 (404-546) are involved in light-induced signal transduction (room temperature (293K) dark structure of LOV2 (404-546)) 提交 2007-05-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
404–546（143 aa）
片段：LIGHT, OXYGEN, VOLTAGE DOMAIN, RESIDUES 404-546
|
未记录 | FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.195 |
| 2V1B N- and C-terminal helices of oat LOV2 (404-546) are involved in light-induced signal transduction (room temperature (293K) light structure of LOV2 (404-546)) 提交 2007-05-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
404–546（143 aa）
片段：LIGHT, OXYGEN, VOLTAGE DOMAIN, RESIDUES 404-546
|
未记录 | FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.55 Å R-free 0.212 |
| 2WKP Structure of a photoactivatable Rac1 containing Lov2 Wildtype 提交 2009-06-16 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
404–546（143 aa）
片段：NPH1-1, RESIDUES 404-546 AND P21-RAC1, RESIDUES 4-180
|
突变：YES | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
100 MM CA ACETATE, 100 MM SODIUM CACODYLATE PH 5.5, 12 % (W/V) PEG 8000
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.195 |
| 2WKQ Structure of a photoactivatable Rac1 containing the Lov2 C450A Mutant 提交 2009-06-16 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
404–546（143 aa）
片段：NPH1-1 RESIDUES 404-546 AND P21-RAC1, RESIDUES 4-180
|
突变：YES | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
100 MM POTASSIUM CHLORIDE, 5% (W/V) PEG 4000
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.186 |
| 2WKR Structure of a photoactivatable Rac1 containing the Lov2 C450M Mutant 提交 2009-06-16 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
404–546（143 aa）
片段：NPH1-1, RESIDUES 404-546 AND P21-RAC1, RESIDUES 4-180
|
突变：YES | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
18 % (V/V) PEG 600
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分辨率 2.20 Å R-free 0.226 |
| 4WF0 Crystal Structure of iLID - an Improved Light-Inducible Dimer 提交 2014-09-11 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
404–543（140 aa）
片段：UNP residues 405-543
|
未记录 | FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；Grown in dark for 3 days. Conditions: 100mM TRIS:HCl pH 8.5, 800mM Lithium Chloride, 32% PEG 4000
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.244 |
| 4WF0 Crystal Structure of iLID - an Improved Light-Inducible Dimer 提交 2014-09-11 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
404–543（140 aa）
片段：UNP residues 405-543
|
未记录 | FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；Grown in dark for 3 days. Conditions: 100mM TRIS:HCl pH 8.5, 800mM Lithium Chloride, 32% PEG 4000
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.244 |
| 5EFW Crystal structure of LOV2-Zdk1 - the complex of oat LOV2 and the affibody protein Zdark1 提交 2015-10-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
404–546（143 aa）
片段：UNP residues 404-546
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突变：C450A | FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 SO4 SULFATE ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 3.5；293.15 K；2 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium citrate pH 3.5
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.257 |
| 5HZH Crystal structure of photoinhibitable Rac1 containing C450A mutant LOV2 domain 提交 2016-02-02 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
404–546（143 aa）
|
突变：Q61L,Q61L,Q61L,Q61L,Q61L,Q61L,Q61L,Q61L,Q61L | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；0.2 M calcium acetate, 26% (w/v) PEG 3350
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.255 |
| 5HZI Crystal structure of photoinhibitable Intersectin1 containing C450M mutant LOV2 domain 提交 2016-02-02 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
404–546（143 aa）
|
未记录 | FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 9% (w/v) PEG 8000, 9% (v/v) ethylene glycol
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.285 |
| 5HZI Crystal structure of photoinhibitable Intersectin1 containing C450M mutant LOV2 domain 提交 2016-02-02 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
404–546（143 aa）
|
未记录 | FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 9% (w/v) PEG 8000, 9% (v/v) ethylene glycol
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.285 |
| 5HZJ Crystal structure of photoinhibitable Intersectin1 containing wildtype LOV2 domain 提交 2016-02-02 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
404–546（143 aa）
|
未记录 | FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 9% (w/v) PEG 8000, 9% (v/v) ethylene glycol
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.281 |
| 5HZJ Crystal structure of photoinhibitable Intersectin1 containing wildtype LOV2 domain 提交 2016-02-02 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
404–546（143 aa）
|
未记录 | FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 9% (w/v) PEG 8000, 9% (v/v) ethylene glycol
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.281 |
| 5HZK Crystal structure of photoinhibitable Intersectin1 containing wildtype LOV2 domain in complex with Cdc42 提交 2016-02-02 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
404–546（143 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；0.1 M MES, 20% (w/v) PEG 6000
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.257 |
| 5HZK Crystal structure of photoinhibitable Intersectin1 containing wildtype LOV2 domain in complex with Cdc42 提交 2016-02-02 | Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
404–546（143 aa）
|
未记录 | GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；0.1 M MES, 20% (w/v) PEG 6000
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.257 |
| 6NTP PTP1B Domain of PTP1B-LOV2 Chimera 提交 2019-01-30 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
407–546（140 aa）
片段：residues 2-282
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未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；100 mM HEPES, 200 mM magnesium acetate, and 14% polyethylene glycol 8000, pH 7.5
|
分辨率 1.89 Å R-free 0.212 |
| 6NTP PTP1B Domain of PTP1B-LOV2 Chimera 提交 2019-01-30 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
407–546（140 aa）
片段：residues 2-282
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；100 mM HEPES, 200 mM magnesium acetate, and 14% polyethylene glycol 8000, pH 7.5
|
分辨率 1.89 Å R-free 0.212 |
| 7PGX Structure of dark-adapted AsLOV2 wild type 提交 2021-08-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 AAA
404–546（143 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 GOL GLYCEROL × 10 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 ACT ACETATE ION × 1 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；295 K；0.1 M sodium acetate pH 4.6-5.0, 6-8% (w/v) PEG 4000, 30% (v/v) glycerol
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.147 |
| 7PGY Structure of light-adapted AsLOV2 wild type 提交 2021-08-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 AAA
404–546（143 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 GOL GLYCEROL × 7 ACT ACETATE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.8；298 K；0.1 M sodium acetate pH 4.6-5.0, 6-8% (w/v) PEG 4000, 30% (v/v) glycerol
|
分辨率 1.09 Å R-free 0.161 |
| 7PGZ Structure of dark-adapted AsLOV2 Q513L 提交 2021-08-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 AAA
404–546（143 aa）
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突变：Q513L | MG MAGNESIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 13 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；298 K；0.1 M sodium acetate pH 4.6-5.0, 6-8% (w/v) PEG 4000, 30% (v/v) glycerol
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分辨率 0.90 Å R-free 0.139 |
| 7PH0 Structure of light-adapted AsLOV2 Q513L 提交 2021-08-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 AAA
404–546（143 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 1 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 GOL GLYCEROL × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 ACT ACETATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；298 K；0.1 M sodium acetate pH 4.6-5.0, 6-8% (w/v) PEG 4000, 30% (v/v) glycerol
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分辨率 0.98 Å R-free 0.136 |