当前蛋白身份：P00722
重新检索
差异标签只比较当前检索结果；所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。
相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1DP0 E. COLI BETA-GALACTOSIDASE AT 1.7 ANGSTROM 提交 1999-12-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
9–1023（1015 aa）
链 B
9–1023（1015 aa）
链 C
9–1023（1015 aa）
链 D
9–1023（1015 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 16 NA SODIUM ION × 20 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 112 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；288 K；10 % PEG 8000 100 MM BIS-TRIS 200 MM MGCL(2) 100 MM NACL 10 MM DTT, pH 6.50, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.211 |
| 1F4A E. COLI (LACZ) BETA-GALACTOSIDASE (NCS CONSTRAINED MONOMER-ORTHORHOMBIC) 提交 2000-06-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3–1023（1021 aa）
链 B
3–1023（1021 aa）
链 C
3–1023（1021 aa）
链 D
3–1023（1021 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；10% PEG 2KMME, 100 mM Bis-Tris, 200 mM MgCl(2), 1 mM DTT, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.198 |
| 1F4H E. COLI (LACZ) BETA-GALACTOSIDASE (ORTHORHOMBIC) 提交 2000-06-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3–1023（1021 aa）
链 B
3–1023（1021 aa）
链 C
3–1023（1021 aa）
链 D
3–1023（1021 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；10 % PEG 2KMME, 100 mM Bis-Tris, 200 mM MgCl(2), 1 mM DTT, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.279 |
| 1HN1 E. COLI (LAC Z) BETA-GALACTOSIDASE (ORTHORHOMBIC) 提交 2000-12-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
9–1023（1015 aa）
链 B
9–1023（1015 aa）
链 C
9–1023（1015 aa）
链 D
9–1023（1015 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 8 NA SODIUM ION × 7 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；288 K；10% PEG 8000, 100 mM BIS TRIS, 200 mM MGCL(2), 100 mM NACL, 10 mM DTT, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.299 |
| 1JYN E. COLI (lacZ) BETA-GALACTOSIDASE (E537Q) IN COMPLEX WITH LACTOSE 提交 2001-09-13 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1023（1023 aa）
链 B
1–1023（1023 aa）
链 C
1–1023（1023 aa）
链 D
1–1023（1023 aa）
|
突变：E537Q 突变：E537Q 突变：E537Q 突变：E537Q | MG MAGNESIUM ION × 14 NA SODIUM ION × 15 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 96 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；288 K；PEG 8000, NaCl, MgCl2, DTT, Bis-Tris, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 288K, pH 6.50
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.219 |
| 1JYV E. COLI (lacZ) BETA-GALACTOSIDASE (E537Q) IN COMPLEX WITH ONPG 提交 2001-09-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1023（1023 aa）
链 B
1–1023（1023 aa）
链 C
1–1023（1023 aa）
链 D
1–1023（1023 aa）
|
突变：E537Q 突变：E537Q 突变：E537Q 突变：E537Q | MG MAGNESIUM ION × 17 NA SODIUM ION × 16 145 2-nitrophenyl beta-D-galactopyranoside × 8 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 107 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；288 K；BIS-TRIS, PEG 8000, MGCL(2), NACL, DTT, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 288K, pH 6.50
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.240 |
| 1JYW E. COLI (lacZ) BETA-GALACTOSIDASE (E537Q) IN COMPLEX WITH PNPG 提交 2001-09-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1023（1023 aa）
链 B
1–1023（1023 aa）
链 C
1–1023（1023 aa）
链 D
1–1023（1023 aa）
|
突变：E537Q 突变：E537Q 突变：E537Q 突变：E537Q | 147 4-nitrophenyl beta-D-galactopyranoside × 4 MG MAGNESIUM ION × 15 NA SODIUM ION × 16 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 109 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；288 K；Bis-Tris, PEG 8000, MgCl2, NaCl, DTT, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 288K, pH 6.50
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.229 |
| 1JYX E. COLI (lacZ) BETA-GALACTOSIDASE IN COMPLEX WITH IPTG 提交 2001-09-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1023（1023 aa）
链 B
1–1023（1023 aa）
链 C
1–1023（1023 aa）
链 D
1–1023（1023 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 9 NA SODIUM ION × 14 IPT 1-methylethyl 1-thio-beta-D-galactopyranoside × 6 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 74 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；288 K；Bis-Tris, PEG 8000, MgCl2, NaCl, DTT, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 288K, pH 6.50
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.244 |
| 1JZ2 E. COLI (lacZ) BETA-GALACTOSIDASE-TRAPPED 2-F-GALACTOSYL-ENZYME INTERMEDIATE (ORTHORHOMBIC) 提交 2001-09-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1023（1023 aa）
链 B
1–1023（1023 aa）
链 C
1–1023（1023 aa）
链 D
1–1023（1023 aa）
|
未记录 | 2FG 2-deoxy-2-fluoro-beta-D-galactopyranose × 4 MG MAGNESIUM ION × 8 NA SODIUM ION × 12 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 69 BTB 2-[BIS-(2-HYDROXY-ETHYL)-AMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；288 K；Bis-Tris, PEG 8000, MgCl2, NaCl, DTT, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 288K, pH 6.50
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.270 |
| 1JZ3 E. COLI (lacZ) BETA-GALACTOSIDASE-TRAPPED 2-DEOXY-GALACTOSYL ENZYME INTERMEDIATE 提交 2001-09-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1023（1023 aa）
链 B
1–1023（1023 aa）
链 C
1–1023（1023 aa）
链 D
1–1023（1023 aa）
|
未记录 | 2DG 2-deoxy-alpha-D-galactopyranose × 4 MG MAGNESIUM ION × 17 NA SODIUM ION × 16 BTB 2-[BIS-(2-HYDROXY-ETHYL)-AMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 4 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 110 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；288 K；Bis-Tris, PEG 8000, MgCl2, NaCl, DTT, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 288K, pH 6.50
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.222 |
| 1JZ4 E. COLI (lacZ) BETA-GALACTOSIDASE-TRAPPED 2-DEOXY-GALACTOSYL-ENZYME INTERMEDIATE (Low Bis-Tris) 提交 2001-09-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1023（1023 aa）
链 B
1–1023（1023 aa）
链 C
1–1023（1023 aa）
链 D
1–1023（1023 aa）
|
未记录 | 2DG 2-deoxy-alpha-D-galactopyranose × 4 MG MAGNESIUM ION × 10 NA SODIUM ION × 15 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 103 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；288 K；Bis-Tris, PEG 8000, MgCl2, NaCl, DTT, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 288K, pH 6.50
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.267 |
| 1JZ5 E. COLI (lacZ) BETA-GALACTOSIDASE IN COMPLEX WITH D-GALCTOPYRANOSYL-1-ON 提交 2001-09-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1023（1023 aa）
链 B
1–1023（1023 aa）
链 C
1–1023（1023 aa）
链 D
1–1023（1023 aa）
|
未记录 | 149 D-galactonolactone × 4 MG MAGNESIUM ION × 11 NA SODIUM ION × 16 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 87 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；288 K；Bis-Tris, PEG 8000, MgCl2, NaCl, DTT, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 288K, pH 6.50
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.231 |
| 1JZ6 E. COLI (lacZ) BETA-GALACTOSIDASE IN COMPLEX WITH GALACTO-TETRAZOLE 提交 2001-09-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1023（1023 aa）
链 B
1–1023（1023 aa）
链 C
1–1023（1023 aa）
链 D
1–1023（1023 aa）
|
未记录 | GTZ (5R, 6S, 7S, 8S)-5-HYDROXYMETHYL-6,7,8-TRIHYDROXY-TETRAZOLO[1,5-A]PIPERIDINE × 4 MG MAGNESIUM ION × 13 NA SODIUM ION × 11 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 74 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；288 K；Bis-Tris, PEG 8000, MgCl2, NaCl, DTT, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 288K, pH 6.50
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.270 |
| 1JZ7 E. COLI (lacZ) BETA-GALACTOSIDASE IN COMPLEX WITH GALACTOSE 提交 2001-09-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1023（1023 aa）
链 B
1–1023（1023 aa）
链 C
1–1023（1023 aa）
链 D
1–1023（1023 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | GAL beta-D-galactopyranose × 8 MG MAGNESIUM ION × 15 NA SODIUM ION × 16 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 91 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；288 K；Bis-Tris, PEG 8000, MgCl2, NaCl, DTT, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 288K, pH 6.50
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.219 |
| 1JZ8 E. COLI (lacZ) BETA-GALACTOSIDASE (E537Q) IN COMPLEX WITH ALLOLACTOSE 提交 2001-09-13 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1023（1023 aa）
链 B
1–1023（1023 aa）
链 C
1–1023（1023 aa）
链 D
1–1023（1023 aa）
|
突变：E537Q 突变：E537Q 突变：E537Q 突变：E537Q | MG MAGNESIUM ION × 16 NA SODIUM ION × 16 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 127 BGC beta-D-glucopyranose × 1 TAR D(-)-TARTARIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；288 K；Bis-Tris, PEG 8000, MgCl2, NaCl, DTT, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 288K, pH 6.50
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.208 |
| 1PX3 E. COLI (LACZ) BETA-GALACTOSIDASE (G794A) 提交 2003-07-02 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
9–1023（1015 aa）
链 B
9–1023（1015 aa）
链 C
9–1023（1015 aa）
链 D
9–1023（1015 aa）
|
突变：G794A 突变：G794A 突变：G794A 突变：G794A | MG MAGNESIUM ION × 12 NA SODIUM ION × 16 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 85 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；288 K；PEG 8000, NACL, MGCL2, DTT, BIS-TRIS, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.243 |
| 1PX4 E. COLI (LACZ) BETA-GALACTOSIDASE (G794A) WITH IPTG BOUND 提交 2003-07-02 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
9–1023（1015 aa）
链 B
9–1023（1015 aa）
链 C
9–1023（1015 aa）
链 D
9–1023（1015 aa）
|
突变：G794A 突变：G794A 突变：G794A 突变：G794A | MG MAGNESIUM ION × 16 NA SODIUM ION × 16 IPT 1-methylethyl 1-thio-beta-D-galactopyranoside × 4 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 94 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；288 K；PEG 8000, NACL, MGCL2, DTT, BIS-TRIS, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.239 |
| 28YO Beta-galactosidase from E.Coli 提交 2026-03-02 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1024（1024 aa）
链 B
1–1024（1024 aa）
链 C
1–1024（1024 aa）
链 D
1–1024（1024 aa）
|
突变：F1008L 突变：F1008L 突变：F1008L 突变：F1008L | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.48 Å |
| 3CZJ E. COLI (lacZ) BETA-GALACTOSIDASE (N460T) IN COMPLEX WITH D-GALCTOPYRANOSYL-1-ONE 提交 2008-04-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
10–1024（1015 aa）
链 B
10–1024（1015 aa）
链 D
10–1024（1015 aa）
|
突变：N461T 突变：N461T 突变：N461T | 149 D-galactonolactone × 3 MG MAGNESIUM ION × 7 NA SODIUM ION × 12 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 69 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；288 K；PEG 8000, NaCl, MgCl2, DTT, Bis-Tris, pH 6.5, HANGING DROP at 288K, pH 6.50, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.231 |
| 3CZJ E. COLI (lacZ) BETA-GALACTOSIDASE (N460T) IN COMPLEX WITH D-GALCTOPYRANOSYL-1-ONE 提交 2008-04-29 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
10–1024（1015 aa）
链 B
10–1024（1015 aa）
链 C
10–1024（1015 aa）
链 D
10–1024（1015 aa）
|
突变：N461T 突变：N461T 突变：N461T 突变：N461T | 149 D-galactonolactone × 4 MG MAGNESIUM ION × 9 NA SODIUM ION × 16 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 94 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；288 K；PEG 8000, NaCl, MgCl2, DTT, Bis-Tris, pH 6.5, HANGING DROP at 288K, pH 6.50, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.231 |
| 3DYM E. coli (lacZ) beta-galactosidase (H418E) 提交 2008-07-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
10–1024（1015 aa）
链 B
10–1024（1015 aa）
链 C
10–1024（1015 aa）
链 D
10–1024（1015 aa）
|
突变：H418E 突变：H418E 突变：H418E 突变：H418E | MG MAGNESIUM ION × 10 NA SODIUM ION × 16 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 82 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；288 K；pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288K
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.251 |
| 3DYO E. coli (lacZ) beta-galactosidase (H418N) in complex with IPTG 提交 2008-07-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
10–1024（1015 aa）
链 B
10–1024（1015 aa）
链 C
10–1024（1015 aa）
链 D
10–1024（1015 aa）
|
突变：H418N 突变：H418N 突变：H418N 突变：H418N | MG MAGNESIUM ION × 14 NA SODIUM ION × 18 IPT 1-methylethyl 1-thio-beta-D-galactopyranoside × 12 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 97 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；288 K；pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.241 |
| 3DYP E. coli (lacZ) beta-galactosidase (H418N) 提交 2008-07-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
10–1024（1015 aa）
链 B
10–1024（1015 aa）
链 C
10–1024（1015 aa）
链 D
10–1024（1015 aa）
|
突变：H418N 突变：H418N 突变：H418N 突变：H418N | MG MAGNESIUM ION × 16 NA SODIUM ION × 16 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 107 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；288 K；pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288K
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.217 |
| 3E1F E.Coli (lacZ) beta-galactosidase (H418E) in complex with galactose 提交 2008-08-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 1
10–1024（1015 aa）
片段：BETA-GALACTOSIDASE
链 2
10–1024（1015 aa）
片段：BETA-GALACTOSIDASE
链 3
10–1024（1015 aa）
片段：BETA-GALACTOSIDASE
链 4
10–1024（1015 aa）
片段：BETA-GALACTOSIDASE
|
突变：H418E 突变：H418E 突变：H418E 突变：H418E | MG MAGNESIUM ION × 10 NA SODIUM ION × 13 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 73 GAL beta-D-galactopyranose × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；288 K；Bis-Tris, PEG 8000, MgCl2, NaCl, DTT, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 288K, pH 6.50
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.249 |
| 3J7H Structure of beta-galactosidase at 3.2-A resolution obtained by cryo-electron microscopy 提交 2014-06-30 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1024（1024 aa）
链 B
1–1024（1024 aa）
链 C
1–1024（1024 aa）
链 D
1–1024（1024 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
25 mM Tris, pH 8.0, 50 mM NaCl, 2 mM MgCl2, 0.5 mM TCEP；pH 8；25 mM Tris, pH 8.0, 50 mM NaCl, 2 mM MgCl2, 0.5 mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件
Blot for 2 seconds before plunging.；90.15 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 2 seconds before plunging into liquid ethane (LEICA EM GP).
|
分辨率 3.20 Å |
| 3SEP E. coli (lacZ) beta-galactosidase (S796A) 提交 2011-06-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
10–1024（1015 aa）
片段：Unp residues 10-1024
链 B
10–1024（1015 aa）
片段：Unp residues 10-1024
链 C
10–1024（1015 aa）
片段：Unp residues 10-1024
链 D
10–1024（1015 aa）
片段：Unp residues 10-1024
|
突变：S796A 突变：S796A 突变：S796A 突变：S796A | MG MAGNESIUM ION × 9 NA SODIUM ION × 14 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 78 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；288 K；8-10% PEG 8000, 100 MM BIS-TRIS, 200 MM MGCL2, 100 MM NACL, 10 MM DTT, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288.0K
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.221 |
| 3T08 E. coli (LacZ) beta-galactosidase (S796A) IPTG complex 提交 2011-07-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
10–1024（1015 aa）
片段：Unp residues 10-1024
链 B
10–1024（1015 aa）
片段：Unp residues 10-1024
链 C
10–1024（1015 aa）
片段：Unp residues 10-1024
链 D
10–1024（1015 aa）
片段：Unp residues 10-1024
|
突变：S796A 突变：S796A 突变：S796A 突变：S796A | MG MAGNESIUM ION × 9 NA SODIUM ION × 13 IPT 1-methylethyl 1-thio-beta-D-galactopyranoside × 4 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 71 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；288 K；8-10% PEG 8000, 100 MM BIS-TRIS, 200 MM MGCL2, 100 MM NACL, 10 MM DTT, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288.0K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.223 |
| 3T09 E. coli (LacZ) beta-galactosidase (S796A) galactonolactone complex 提交 2011-07-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
10–1024（1015 aa）
片段：Unp residues 10-1024
链 B
10–1024（1015 aa）
片段：Unp residues 10-1024
链 C
10–1024（1015 aa）
片段：Unp residues 10-1024
链 D
10–1024（1015 aa）
片段：Unp residues 10-1024
|
突变：S796A 突变：S796A 突变：S796A 突变：S796A | 149 D-galactonolactone × 4 MG MAGNESIUM ION × 11 NA SODIUM ION × 16 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 107 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；288 K；8-10% PEG 8000, 100 MM BIS-TRIS, 200 MM MGCL2, 100 MM NACL, 10 MM DTT, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288.0K
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.254 |
| 3T0A E. coli (LacZ) beta-galactosidase (S796T) 提交 2011-07-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
10–1024（1015 aa）
片段：Unp residues 10-1024
链 B
10–1024（1015 aa）
片段：Unp residues 10-1024
链 C
10–1024（1015 aa）
片段：Unp residues 10-1024
链 D
10–1024（1015 aa）
片段：Unp residues 10-1024
|
突变：S796T 突变：S796T 突变：S796T 突变：S796T | MG MAGNESIUM ION × 12 NA SODIUM ION × 17 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 110 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；288 K；8-10% PEG 8000, 100 MM BIS-TRIS, 200 MM MGCL2, 100 MM NACL, 10 MM DTT, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288.0K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.214 |
| 3T0B E. coli (LacZ) beta-galactosidase (S796T) IPTG complex 提交 2011-07-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
10–1024（1015 aa）
片段：Unp residues 10-1024
链 B
10–1024（1015 aa）
片段：Unp residues 10-1024
链 C
10–1024（1015 aa）
片段：Unp residues 10-1024
链 D
10–1024（1015 aa）
片段：Unp residues 10-1024
|
突变：S796T 突变：S796T 突变：S796T 突变：S796T | MG MAGNESIUM ION × 8 NA SODIUM ION × 14 IPT 1-methylethyl 1-thio-beta-D-galactopyranoside × 4 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 69 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；288 K；8-10% PEG 8000, 100 MM BIS-TRIS, 200 MM MGCL2, 100 MM NACL, 10 MM DTT, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288.0K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.233 |
| 3T0D E.coli (lacZ) beta-galactosidase (S796T) in complex with galactonolactone 提交 2011-07-20 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
10–1024（1015 aa）
片段：Unp residues 10-1024
链 B
10–1024（1015 aa）
片段：Unp residues 10-1024
链 C
10–1024（1015 aa）
片段：Unp residues 10-1024
链 D
10–1024（1015 aa）
片段：Unp residues 10-1024
|
突变：S796T 突变：S796T 突变：S796T 突变：S796T | 149 D-galactonolactone × 4 MG MAGNESIUM ION × 9 NA SODIUM ION × 16 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 104 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；288 K；8-10% PEG 8000, 100 mM Bis-tris, 200 mM MgCl2, 100 mM NaCl, 10 mM DTT, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288.0K
|
分辨率 1.93 Å R-free 0.209 |
| 3T2O E. coli (lacZ) beta-galactosidase (S796D) 提交 2011-07-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
10–1024（1015 aa）
片段：Unp residues 10-1024
链 B
10–1024（1015 aa）
片段：Unp residues 10-1024
链 C
10–1024（1015 aa）
片段：Unp residues 10-1024
链 D
10–1024（1015 aa）
片段：Unp residues 10-1024
|
突变：S796D 突变：S796D 突变：S796D 突变：S796D | MG MAGNESIUM ION × 16 NA SODIUM ION × 16 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 112 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；288 K；8-10% PEG 8000, 100 MM BIS-TRIS, 200 MM MGCL2, 100 MM NACL, 10 MM DTT, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288.0K
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.182 |
| 3T2P E. coli (lacZ) beta-galactosidase (S796D) in complex with IPTG 提交 2011-07-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
10–1024（1015 aa）
片段：Unp residues 10-1024
链 B
10–1024（1015 aa）
片段：Unp residues 10-1024
链 C
10–1024（1015 aa）
片段：Unp residues 10-1024
链 D
10–1024（1015 aa）
片段：Unp residues 10-1024
|
突变：S796D 突变：S796D 突变：S796D 突变：S796D | IPT 1-methylethyl 1-thio-beta-D-galactopyranoside × 4 MG MAGNESIUM ION × 8 NA SODIUM ION × 10 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 63 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；288 K；8-10% PEG 8000, 100 MM BIS-TRIS, 200 MM MGCL2, 100 MM NACL, 10 MM DTT, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288.0K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.242 |
| 3T2Q E. coli (lacZ) beta-galactosidase (S796D) in complex with galactonolactone 提交 2011-07-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
10–1024（1015 aa）
片段：Unp residues 10-1024
链 B
10–1024（1015 aa）
片段：Unp residues 10-1024
链 C
10–1024（1015 aa）
片段：Unp residues 10-1024
链 D
10–1024（1015 aa）
片段：Unp residues 10-1024
|
突变：S796D 突变：S796D 突变：S796D 突变：S796D | 149 D-galactonolactone × 4 MG MAGNESIUM ION × 8 NA SODIUM ION × 11 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 49 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；288 K；8-10% PEG 8000, 100 MM BIS-TRIS, 200 MM MGCL2, 100 MM NACL, 10 MM DTT, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288.0K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.239 |
| 3VD3 E. coli (lacZ) beta-galactosidase (N460D) 提交 2012-01-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
10–1024（1015 aa）
链 B
10–1024（1015 aa）
链 C
10–1024（1015 aa）
链 D
10–1024（1015 aa）
|
突变：N460D 突变：N460D 突变：N460D 突变：N460D | MG MAGNESIUM ION × 7 NA SODIUM ION × 12 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 45 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；288 K；10% PEG8000, 100 mM Bis-Tris, pH 6.5, 200 mM magnesium chloride, 100 mM sodium chloride, 10 mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.282 |
| 3VD4 E. coli (lacZ) beta-galactosidase (N460D) in complex with IPTG 提交 2012-01-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
10–1024（1015 aa）
链 B
10–1024（1015 aa）
链 C
10–1024（1015 aa）
链 D
10–1024（1015 aa）
|
突变：N460D 突变：N460D 突变：N460D 突变：N460D | MG MAGNESIUM ION × 9 NA SODIUM ION × 14 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 68 IPT 1-methylethyl 1-thio-beta-D-galactopyranoside × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；288 K；10% PEG8000, 100 mM Bis-Tris, pH 6.5, 200 mM magnesium chloride, 100 mM sodium chloride, 10 mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.212 |
| 3VD5 E. coli (lacZ) beta-galactosidase (N460S) 提交 2012-01-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
10–1024（1015 aa）
链 B
10–1024（1015 aa）
链 C
10–1024（1015 aa）
链 D
10–1024（1015 aa）
|
突变：N460S 突变：N460S 突变：N460S 突变：N460S | MG MAGNESIUM ION × 8 NA SODIUM ION × 11 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 24 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；288 K；10% PEG8000, 100 mM Bis-Tris, pH 6.5, 200 mM magnesium chloride, 100 mM sodium chloride, 10 mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.276 |
| 3VD7 E. coli (lacZ) beta-galactosidase (N460S) in complex with galactotetrazole 提交 2012-01-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
10–1024（1015 aa）
链 B
10–1024（1015 aa）
链 C
10–1024（1015 aa）
链 D
10–1024（1015 aa）
|
突变：N460S 突变：N460S 突变：N460S 突变：N460S | GTZ (5R, 6S, 7S, 8S)-5-HYDROXYMETHYL-6,7,8-TRIHYDROXY-TETRAZOLO[1,5-A]PIPERIDINE × 4 MG MAGNESIUM ION × 6 NA SODIUM ION × 8 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 29 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；288 K；10% PEG8000, 100 mM Bis-Tris, pH 6.5, 200 mM magnesium chloride, 100 mM sodium chloride, 10 mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288K
|
分辨率 2.87 Å R-free 0.250 |
| 3VD9 E. coli (lacZ) beta-galactosidase (N460S) in complex with IPTG 提交 2012-01-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
10–1024（1015 aa）
链 B
10–1024（1015 aa）
链 C
10–1024（1015 aa）
链 D
10–1024（1015 aa）
|
突变：N460S 突变：N460S 突变：N460S 突变：N460S | MG MAGNESIUM ION × 9 NA SODIUM ION × 16 IPT 1-methylethyl 1-thio-beta-D-galactopyranoside × 4 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 64 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；288 K；10% PEG8000, 100 mM Bis-Tris, pH 6.5, 200 mM magnesium chloride, 100 mM sodium chloride, 10 mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288K
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.223 |
| 3VDA E. coli (lacZ) beta-galactosidase (N460T) 提交 2012-01-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
10–1024（1015 aa）
链 B
10–1024（1015 aa）
链 C
10–1024（1015 aa）
链 D
10–1024（1015 aa）
|
突变：N460T 突变：N460T 突变：N460T 突变：N460T | MG MAGNESIUM ION × 8 NA SODIUM ION × 10 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 32 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；288 K；10% PEG8000, 100 mM Bis-Tris, pH 6.5, 200 mM magnesium chloride, 100 mM sodium chloride, 10 mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.237 |
| 3VDB E. coli (lacZ) beta-galactosidase (N460T) in complex with galactonolactone 提交 2012-01-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
10–1024（1015 aa）
链 B
10–1024（1015 aa）
链 C
10–1024（1015 aa）
链 D
10–1024（1015 aa）
|
突变：N460T 突变：N460T 突变：N460T 突变：N460T | 149 D-galactonolactone × 4 MG MAGNESIUM ION × 9 NA SODIUM ION × 14 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 77 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；288 K；10% PEG8000, 100 mM Bis-Tris, pH 6.5, 200 mM magnesium chloride, 100 mM sodium chloride, 10 mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288K
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.205 |
| 3VDC E. coli (lacZ) beta-galactosidase (N460T) in complex with IPTG 提交 2012-01-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
10–1024（1015 aa）
链 B
10–1024（1015 aa）
链 C
10–1024（1015 aa）
链 D
10–1024（1015 aa）
|
突变：N460T 突变：N460T 突变：N460T 突变：N460T | IPT 1-methylethyl 1-thio-beta-D-galactopyranoside × 4 MG MAGNESIUM ION × 8 NA SODIUM ION × 10 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 46 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；288 K；10% PEG8000, 100 mM Bis-Tris, pH 6.5, 200 mM magnesium chloride, 100 mM sodium chloride, 10 mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288K
|
分辨率 2.55 Å R-free 0.236 |
| 4CKD Model of complex between the E.coli enzyme beta-galactosidase and four single chain Fv antibody domains scFv13R4. 提交 2014-01-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1024（1024 aa）
链 B
1–1024（1024 aa）
链 C
1–1024（1024 aa）
链 D
1–1024（1024 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
20% PHOSPHATE BUFFERED SALINE (PBS)；pH 7.4；20% PHOSPHATE BUFFERED SALINE (PBS)
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 100, TEMPERATURE- 100, INSTRUMENT- OTHER, METHOD- BLOT FOR 10-20 SECONDS UNTIL DIAMETER OF BLOTTED MENISCUS CEASES TO EXPAND, BEFORE PLUNGING.
|
分辨率 13.00 Å |
| 4DUV E. coli (lacZ) beta-galactosidase (G974A) 2-deoxy-galactosyl-enzyme and bis-Tris complex 提交 2012-02-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
10–1024（1015 aa）
片段：unp residues 10-1024
链 B
10–1024（1015 aa）
片段：unp residues 10-1024
链 C
10–1024（1015 aa）
片段：unp residues 10-1024
链 D
10–1024（1015 aa）
片段：unp residues 10-1024
|
突变：G794A 突变：G794A 突变：G794A 突变：G794A | 2DG 2-deoxy-alpha-D-galactopyranose × 4 BTB 2-[BIS-(2-HYDROXY-ETHYL)-AMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 4 MG MAGNESIUM ION × 9 NA SODIUM ION × 16 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 90 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；288 K；10% PEG 8000, 100 MM BIS-TRIS, 200 MM MGCL2, 100 MM NACL, 10 MM DTT, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.206 |
| 4DUW E. coli (lacZ) beta-galactosidase (G974A) in complex with allolactose 提交 2012-02-22 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
10–1024（1015 aa）
片段：unp residues 10-1024
链 B
10–1024（1015 aa）
片段：unp residues 10-1024
链 C
10–1024（1015 aa）
片段：unp residues 10-1024
链 D
10–1024（1015 aa）
片段：unp residues 10-1024
|
突变：G794A 突变：G794A 突变：G794A 突变：G794A | MG MAGNESIUM ION × 10 NA SODIUM ION × 16 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 77 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；288 K；10% PEG 8000, 100 MM BIS-TRIS, 200 MM MGCL2, 100 MM NACL, 10 MM DTT , pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.213 |
| 4DUX E. coli (lacZ) beta-galactosidase (N460S) in complex with L-ribose 提交 2012-02-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
10–1024（1015 aa）
片段：unp residues 10-1024
链 B
10–1024（1015 aa）
片段：unp residues 10-1024
链 C
10–1024（1015 aa）
片段：unp residues 10-1024
链 D
10–1024（1015 aa）
片段：unp residues 10-1024
|
突变：N460S 突变：N460S 突变：N460S 突变：N460S | 0MK beta-L-ribopyranose × 9 MG MAGNESIUM ION × 8 NA SODIUM ION × 14 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 65 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；288 K；10% PEG 8000, 100 MM BIS-TRIS, 200 MM MGCL2, 100 MM NACL, 10 MM DTT , pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.221 |
| 4V40 BETA-GALACTOSIDASE 提交 1994-07-18 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1023（1023 aa）
链 B
1–1023（1023 aa）
链 C
1–1023（1023 aa）
链 D
1–1023（1023 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.50 Å |
| 4V40 BETA-GALACTOSIDASE 提交 1994-07-18 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 E
1–1023（1023 aa）
链 F
1–1023（1023 aa）
链 G
1–1023（1023 aa）
链 H
1–1023（1023 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.50 Å |
| 4V40 BETA-GALACTOSIDASE 提交 1994-07-18 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 I
1–1023（1023 aa）
链 J
1–1023（1023 aa）
链 K
1–1023（1023 aa）
链 L
1–1023（1023 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.50 Å |
| 4V40 BETA-GALACTOSIDASE 提交 1994-07-18 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 M
1–1023（1023 aa）
链 N
1–1023（1023 aa）
链 O
1–1023（1023 aa）
链 P
1–1023（1023 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 7 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.50 Å |
| 4V41 E. COLI (LAC Z) BETA-GALACTOSIDASE (NCS CONSTRAINED MONOMER-MONOCLINIC) 提交 2000-06-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1023（1023 aa）
链 B
1–1023（1023 aa）
链 C
1–1023（1023 aa）
链 D
1–1023（1023 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.9；293 K；PEG 8000, Cacodylate, pH 5.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 20K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.207 |
| 4V41 E. COLI (LAC Z) BETA-GALACTOSIDASE (NCS CONSTRAINED MONOMER-MONOCLINIC) 提交 2000-06-07 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 E
1–1023（1023 aa）
链 F
1–1023（1023 aa）
链 G
1–1023（1023 aa）
链 H
1–1023（1023 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.9；293 K；PEG 8000, Cacodylate, pH 5.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 20K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.207 |
| 4V41 E. COLI (LAC Z) BETA-GALACTOSIDASE (NCS CONSTRAINED MONOMER-MONOCLINIC) 提交 2000-06-07 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 I
1–1023（1023 aa）
链 J
1–1023（1023 aa）
链 K
1–1023（1023 aa）
链 L
1–1023（1023 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.9；293 K；PEG 8000, Cacodylate, pH 5.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 20K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.207 |
| 4V41 E. COLI (LAC Z) BETA-GALACTOSIDASE (NCS CONSTRAINED MONOMER-MONOCLINIC) 提交 2000-06-07 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 M
1–1023（1023 aa）
链 N
1–1023（1023 aa）
链 O
1–1023（1023 aa）
链 P
1–1023（1023 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.9；293 K；PEG 8000, Cacodylate, pH 5.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 20K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.207 |
| 4V44 E. COLI (lacZ) BETA-GALACTOSIDASE IN COMPLEX WITH 2-F-LACTOSE 提交 2001-09-13 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1023（1023 aa）
链 B
1–1023（1023 aa）
链 C
1–1023（1023 aa）
链 D
1–1023（1023 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 8 NA SODIUM ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.9；295 K；Cacodylate, PEG 8000, MgSO4, NaCl, BME, pH 5.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 295K, pH 5.90
|
分辨率 2.70 Å |
| 4V44 E. COLI (lacZ) BETA-GALACTOSIDASE IN COMPLEX WITH 2-F-LACTOSE 提交 2001-09-13 | Assembly 2 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 E
1–1023（1023 aa）
链 F
1–1023（1023 aa）
链 G
1–1023（1023 aa）
链 H
1–1023（1023 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 8 NA SODIUM ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.9；295 K；Cacodylate, PEG 8000, MgSO4, NaCl, BME, pH 5.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 295K, pH 5.90
|
分辨率 2.70 Å |
| 4V44 E. COLI (lacZ) BETA-GALACTOSIDASE IN COMPLEX WITH 2-F-LACTOSE 提交 2001-09-13 | Assembly 3 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 I
1–1023（1023 aa）
链 J
1–1023（1023 aa）
链 K
1–1023（1023 aa）
链 L
1–1023（1023 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 8 NA SODIUM ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.9；295 K；Cacodylate, PEG 8000, MgSO4, NaCl, BME, pH 5.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 295K, pH 5.90
|
分辨率 2.70 Å |
| 4V44 E. COLI (lacZ) BETA-GALACTOSIDASE IN COMPLEX WITH 2-F-LACTOSE 提交 2001-09-13 | Assembly 4 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 M
1–1023（1023 aa）
链 N
1–1023（1023 aa）
链 O
1–1023（1023 aa）
链 P
1–1023（1023 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 8 NA SODIUM ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.9；295 K；Cacodylate, PEG 8000, MgSO4, NaCl, BME, pH 5.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 295K, pH 5.90
|
分辨率 2.70 Å |
| 4V45 E. COLI (lacZ) BETA-GALACTOSIDASE-TRAPPED 2-F-GALACTOSYL-ENZYME INTERMEDIATE 提交 2001-09-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1023（1023 aa）
链 B
1–1023（1023 aa）
链 C
1–1023（1023 aa）
链 D
1–1023（1023 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 2FG 2-deoxy-2-fluoro-beta-D-galactopyranose × 4 MG MAGNESIUM ION × 8 NA SODIUM ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.9；295 K；Cacodylate, PEG 8000, MgSO4, NaCl, BME, pH 5.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 295K, pH 5.90
|
分辨率 2.60 Å |
| 4V45 E. COLI (lacZ) BETA-GALACTOSIDASE-TRAPPED 2-F-GALACTOSYL-ENZYME INTERMEDIATE 提交 2001-09-13 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 E
1–1023（1023 aa）
链 F
1–1023（1023 aa）
链 G
1–1023（1023 aa）
链 H
1–1023（1023 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 2FG 2-deoxy-2-fluoro-beta-D-galactopyranose × 4 MG MAGNESIUM ION × 8 NA SODIUM ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.9；295 K；Cacodylate, PEG 8000, MgSO4, NaCl, BME, pH 5.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 295K, pH 5.90
|
分辨率 2.60 Å |
| 4V45 E. COLI (lacZ) BETA-GALACTOSIDASE-TRAPPED 2-F-GALACTOSYL-ENZYME INTERMEDIATE 提交 2001-09-13 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 I
1–1023（1023 aa）
链 J
1–1023（1023 aa）
链 K
1–1023（1023 aa）
链 L
1–1023（1023 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 2FG 2-deoxy-2-fluoro-beta-D-galactopyranose × 4 MG MAGNESIUM ION × 8 NA SODIUM ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.9；295 K；Cacodylate, PEG 8000, MgSO4, NaCl, BME, pH 5.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 295K, pH 5.90
|
分辨率 2.60 Å |
| 4V45 E. COLI (lacZ) BETA-GALACTOSIDASE-TRAPPED 2-F-GALACTOSYL-ENZYME INTERMEDIATE 提交 2001-09-13 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 M
1–1023（1023 aa）
链 N
1–1023（1023 aa）
链 O
1–1023（1023 aa）
链 P
1–1023（1023 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 2FG 2-deoxy-2-fluoro-beta-D-galactopyranose × 4 MG MAGNESIUM ION × 8 NA SODIUM ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.9；295 K；Cacodylate, PEG 8000, MgSO4, NaCl, BME, pH 5.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 295K, pH 5.90
|
分辨率 2.60 Å |
| 5A1A 2.2 A resolution cryo-EM structure of beta-galactosidase in complex with a cell-permeant inhibitor 提交 2015-04-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3–1024（1022 aa）
链 B
3–1024（1022 aa）
链 C
3–1024（1022 aa）
链 D
3–1024（1022 aa）
|
未记录 | PTQ 2-phenylethyl 1-thio-beta-D-galactopyranoside × 4 MG MAGNESIUM ION × 8 NA SODIUM ION × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
25 MM TRIS, PH 8.0, 50 MM NACL, 2 MM MGCL2, 0.5 MM TCEP；pH 8；25 MM TRIS, PH 8.0, 50 MM NACL, 2 MM MGCL2, 0.5 MM TCEP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；BLOT FOR 2 SECONDS BEFORE PLUNGING INTO LIQUID ETHANE (LEICA EM GP).
|
分辨率 2.20 Å |
| 6CVM Atomic resolution cryo-EM structure of beta-galactosidase 提交 2018-03-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3–1023（1021 aa）
链 B
3–1023（1021 aa）
链 C
3–1023（1021 aa）
链 D
3–1023（1021 aa）
|
未记录 | PTQ 2-phenylethyl 1-thio-beta-D-galactopyranoside × 4 MG MAGNESIUM ION × 8 NA SODIUM ION × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；25 mM Tris, pH 8.0, 50 mM NaCl, 2 mM MgCl2, 1.0 mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Blot for 2 seconds before plunging.
|
分辨率 1.90 Å |
| 6DRV Beta-galactosidase 提交 2018-06-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1024（1024 aa）
链 B
1–1024（1024 aa）
链 C
1–1024（1024 aa）
链 D
1–1024（1024 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.20 Å |
| 6KUZ E.coli beta-galactosidase (E537Q) in complex with fluorescent probe KSL01 提交 2019-09-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1024（1024 aa）
链 B
1–1024（1024 aa）
|
突变：E537Q 突变：E537Q | DVL 3-(1,3-benzothiazol-2-yl)-2-[[4-[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R},6~{R})-6-(hydroxymethyl)-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]oxyphenyl]methoxy]-5-methyl-benzaldehyde × 4 NA SODIUM ION × 12 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 42 MG MAGNESIUM ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.9；291 K；10% PEG8000, 100mM Bis-Tris ph5,9, 200mM Nacl, 10mM DTT, 0.1M Guanidine Hydrochloride 10% glycerol
|
分辨率 2.83 Å R-free 0.224 |
| 6KUZ E.coli beta-galactosidase (E537Q) in complex with fluorescent probe KSL01 提交 2019-09-03 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
1–1024（1024 aa）
链 D
1–1024（1024 aa）
|
突变：E537Q 突变：E537Q | DVL 3-(1,3-benzothiazol-2-yl)-2-[[4-[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R},6~{R})-6-(hydroxymethyl)-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]oxyphenyl]methoxy]-5-methyl-benzaldehyde × 4 NA SODIUM ION × 12 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 28 MG MAGNESIUM ION × 8 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.9；291 K；10% PEG8000, 100mM Bis-Tris ph5,9, 200mM Nacl, 10mM DTT, 0.1M Guanidine Hydrochloride 10% glycerol
|
分辨率 2.83 Å R-free 0.224 |
| 6X1Q 1.8 Angstrom resolution structure of b-galactosidase with a 200 kV cryoARM electron microscope 提交 2020-05-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3–1023（1021 aa）
链 B
3–1023（1021 aa）
链 C
3–1023（1021 aa）
链 D
3–1023（1021 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 8 NA SODIUM ION × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；25mM Tris pH 8.0, 50mM NaCl, 0.5mM TCEP, 2mM MgCl
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 1.80 Å |
| 7BRS E.coli beta-galactosidase (E537Q) in complex with fluorescent probe KSA02 提交 2020-03-30 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1024（1024 aa）
链 C
1–1024（1024 aa）
|
突变：E537Q 突变：E537Q | F4X 8-[2-[(E)-2-[4-[(2S,3R,4S,5R,6R)-6-(hydroxymethyl)-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]oxyphenyl]ethenyl]-3,3-dimethyl-indol-1-ium-1-yl]octanoic acid × 4 MG MAGNESIUM ION × 8 NA SODIUM ION × 6 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 54 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；291 K；100mM Bis-Tris, pH=5.9, 200mM NaCl, 200mM MgCl2, 10% PEG8000, 10% glycerol, 0.1M guanidine hydrochloride, 10mM DTT
|
分辨率 2.67 Å R-free 0.244 |
| 7BRS E.coli beta-galactosidase (E537Q) in complex with fluorescent probe KSA02 提交 2020-03-30 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
1–1024（1024 aa）
链 D
1–1024（1024 aa）
|
突变：E537Q 突变：E537Q | F4X 8-[2-[(E)-2-[4-[(2S,3R,4S,5R,6R)-6-(hydroxymethyl)-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]oxyphenyl]ethenyl]-3,3-dimethyl-indol-1-ium-1-yl]octanoic acid × 4 MG MAGNESIUM ION × 8 NA SODIUM ION × 8 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 38 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；291 K；100mM Bis-Tris, pH=5.9, 200mM NaCl, 200mM MgCl2, 10% PEG8000, 10% glycerol, 0.1M guanidine hydrochloride, 10mM DTT
|
分辨率 2.67 Å R-free 0.244 |
| 7BTK E.coli beta-galactosidase (E537Q) in complex with fluorescent probe KSA01 提交 2020-04-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1024（1024 aa）
链 C
1–1024（1024 aa）
|
突变：E537Q 突变：E537Q | F6L 4-[[2-[(E)-2-[4-[(2S,3R,4S,5R,6R)-6-(hydroxymethyl)-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]oxyphenyl]ethenyl]-3,3-dimethyl-2H-indol-1-yl]methyl]benzoic acid × 4 MG MAGNESIUM ION × 8 NA SODIUM ION × 8 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 40 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；291 K；100 mM Bis-Tris, pH = 5.9, 200 mM NaCl, 200 mM MgCl2, 10% PEG8000, 10% glycerol, 0.1 M guanidine hydrochloride and 10 mM DTT
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.233 |
| 7BTK E.coli beta-galactosidase (E537Q) in complex with fluorescent probe KSA01 提交 2020-04-01 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
1–1024（1024 aa）
链 D
1–1024（1024 aa）
|
突变：E537Q 突变：E537Q | F6L 4-[[2-[(E)-2-[4-[(2S,3R,4S,5R,6R)-6-(hydroxymethyl)-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]oxyphenyl]ethenyl]-3,3-dimethyl-2H-indol-1-yl]methyl]benzoic acid × 4 MG MAGNESIUM ION × 6 NA SODIUM ION × 6 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 36 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；291 K；100 mM Bis-Tris, pH = 5.9, 200 mM NaCl, 200 mM MgCl2, 10% PEG8000, 10% glycerol, 0.1 M guanidine hydrochloride and 10 mM DTT
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.233 |
| 8BK7 Cryo-EM structure of beta-galactosidase at 3.3 A resolution plunged 5 ms after mixing with apoferritin 提交 2022-11-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1024（1024 aa）
链 B
1–1024（1024 aa）
链 C
1–1024（1024 aa）
链 D
1–1024（1024 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；contains Amaranth dye (acid red 27) 32 mM
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 8BK8 Cryo-EM structure of beta-galactosidase at 2.9 A resolution plunged 205 ms after mixing with apoferritin 提交 2022-11-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1024（1024 aa）
链 B
1–1024（1024 aa）
链 C
1–1024（1024 aa）
链 D
1–1024（1024 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；contains Amaranth dye (acid red 27) 32 mM
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 8BKG Cryo-EM structure of beta-galactosidase at 3.2 A resolution plunged 35 ms after mixing with apoferritin 提交 2022-11-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1024（1024 aa）
链 B
1–1024（1024 aa）
链 C
1–1024（1024 aa）
链 D
1–1024（1024 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；contains Amaranth dye (acid red 27) 32 mM
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 8Q7Y ESIBD structure of beta-galactosidase 提交 2023-08-17 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1024（1024 aa）
链 B
1–1024（1024 aa）
链 C
1–1024（1024 aa）
链 D
1–1024（1024 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 6.9；Soft-landed sample
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 OTHER；Soft-landed as described in manuscript
|
分辨率 2.60 Å |
| 8RI6 Beta-galactosidase (LacZ) purified from E. coli. 提交 2023-12-18 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1024（1024 aa）
链 B
1–1024（1024 aa）
链 C
1–1024（1024 aa）
链 D
1–1024（1024 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 8 NA SODIUM ION × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；25 mM Tris, 50 mM NaCl, 2 mM MgCl2, 2 mM EDTA, 1 mM TCEP, pH 8.0
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.06 Å |
| 8RI7 Beta-galactosidase (LacZ) in complex with glycosyrin from Pseudomonas syringae. 提交 2023-12-18 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1024（1024 aa）
链 B
1–1024（1024 aa）
链 C
1–1024（1024 aa）
链 D
1–1024（1024 aa）
|
未记录 | A1H05 (2S,3R,4S)-2-[bis(oxidanyl)methyl]pyrrolidine-3,4-diol × 4 MG MAGNESIUM ION × 8 NA SODIUM ION × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；25 mM Tris, 50 mM NaCl, 2 mM MgCl2, 2 mM EDTA, 1 mM TCEP, pH 8.0
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 1.93 Å |
| 8RI8 Beta-galactosidase (LacZ) in complex with synthetic glycosyrin. 提交 2023-12-18 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1024（1024 aa）
链 B
1–1024（1024 aa）
链 C
1–1024（1024 aa）
链 D
1–1024（1024 aa）
|
未记录 | A1H05 (2S,3R,4S)-2-[bis(oxidanyl)methyl]pyrrolidine-3,4-diol × 4 MG MAGNESIUM ION × 8 NA SODIUM ION × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；25 mM Tris, 50 mM NaCl, 2 mM MgCl2, 2 mM EDTA, 1 mM TCEP, pH 8.0
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 1.42 Å |
| 9HKI Plunge-frozen beta-galactosidase 提交 2024-12-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3–1023（1021 aa）
链 B
3–1023（1021 aa）
链 C
3–1023（1021 aa）
链 D
3–1023（1021 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 4 NA SODIUM ION × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.9；25 mM Tris (pH 7.9), 50 mM NaCl, 10 mM EDTA, and 2 mM MgCl2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 1.90 Å |
| 9HLM Soft-landed and rehydrated beta-galactosidase (best particles) 提交 2024-12-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
3–1023（1021 aa）
链 B
3–1023（1021 aa）
链 C
3–1023（1021 aa）
链 D
3–1023（1021 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
|
分辨率 3.70 Å |
| 9HPL E. coli beta-galactosidase labeled with Chromeo P503 dye purified using MISO 提交 2024-12-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1024（1024 aa）
链 B
1–1024（1024 aa）
链 C
1–1024（1024 aa）
链 D
1–1024（1024 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；25 mM HEPES pH 8.0, 100 mM NaCl, 500 mM imidazole and 1mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.30 Å |
| 9HPM E. coli beta-galactosidase labeled with Chromeo P503 dye purified using MISO from 1ug 提交 2024-12-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1024（1024 aa）
链 B
1–1024（1024 aa）
链 C
1–1024（1024 aa）
链 D
1–1024（1024 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；25 mM HEPES pH 8.0, 100 mM NaCl, 500 mM imidazole and 1mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.20 Å |
| 9Y45 His-tagged beta galactosidase (LacZ) on a Ni-NTA lipid monolayer grid 提交 2025-09-02 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–1024（1024 aa）
链 B
1–1024（1024 aa）
链 C
1–1024（1024 aa）
链 D
1–1024（1024 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 8 NA SODIUM ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 2.41 Å |