当前蛋白身份：P00873
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1GK8 Rubisco from Chlamydomonas reinhardtii 提交 2001-08-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白数一致 |
链 I
46–185（140 aa）
链 K
46–185（140 aa）
链 M
46–185（140 aa）
链 O
46–185（140 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 8 CAP 2-CARBOXYARABINITOL-1,5-DIPHOSPHATE × 8 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 66 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；291 K；50 MM HEPES PH 7.5, 8-12% PEG 4000, 50 MM NAHCO3, 5 MM MGCL2, 50 UM 2-CABP, 18 DEG C, 10-15 MG/ML PROTEIN
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.162 |
| 1UW9 L290F-A222T chlamydomonas Rubisco mutant 提交 2004-02-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白数一致 |
链 C
46–185（140 aa）
链 F
46–185（140 aa）
链 I
46–185（140 aa）
链 J
46–185（140 aa）
链 M
46–185（140 aa）
链 P
46–185（140 aa）
链 T
46–185（140 aa）
链 W
46–185（140 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 8 CAP 2-CARBOXYARABINITOL-1,5-DIPHOSPHATE × 8 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 55 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；291 K；0 MM HEPES PH 7.5, 8-12% PEG 4 50 MM NAHCO3, 5 MM MGCL2, 50 UM 2-CABP, 18 DEG C, 10-15 MG PROTEIN
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.194 |
| 1UWA L290F mutant rubisco from chlamydomonas 提交 2004-02-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白数一致 |
链 C
46–185（140 aa）
链 F
46–185（140 aa）
链 I
46–185（140 aa）
链 J
46–185（140 aa）
链 M
46–185（140 aa）
链 P
46–185（140 aa）
链 T
46–185（140 aa）
链 W
46–185（140 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 8 CAP 2-CARBOXYARABINITOL-1,5-DIPHOSPHATE × 8 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 59 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；291 K；HEPES PH 7.5, 8-12% PEG 4 50 MM NAHCO3, 5 MM MGCL2, 50 UM 2-CABP, 18 DEG C, 10-15 MG PROTEIN
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.205 |
| 1UZD Chlamydomonas,Spinach Chimeric Rubisco 提交 2004-03-11 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白数一致 |
链 C
46–90（45 aa）
链 C
116–185（70 aa）
链 F
46–90（45 aa）
链 F
116–185（70 aa）
链 I
46–90（45 aa）
链 I
116–185（70 aa）
链 J
46–90（45 aa）
链 J
116–185（70 aa）
链 M
46–90（45 aa）
链 M
116–185（70 aa）
链 P
46–90（45 aa）
链 P
116–185（70 aa）
链 T
46–90（45 aa）
链 T
116–185（70 aa）
链 W
46–90（45 aa）
链 W
116–185（70 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 8 CAP 2-CARBOXYARABINITOL-1,5-DIPHOSPHATE × 8 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 54 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；291 K；50 MM HEPES PH 7.5, 8-12% PEG 4 50 MM NAHCO3, 5 MM MGCL2, 50 UM 2-CABP, 18 DEG C, 10-15 MG PROTEIN
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.230 |
| 1UZH A CHIMERIC CHLAMYDOMONAS, SYNECHOCOCCUS RUBISCO ENZYME 提交 2004-03-12 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白数一致 |
链 C
46–91（46 aa）
链 C
117–185（69 aa）
链 F
46–91（46 aa）
链 F
117–185（69 aa）
链 I
46–91（46 aa）
链 I
117–185（69 aa）
链 J
46–91（46 aa）
链 J
117–185（69 aa）
链 M
46–91（46 aa）
链 M
117–185（69 aa）
链 P
46–91（46 aa）
链 P
117–185（69 aa）
链 T
46–91（46 aa）
链 T
117–185（69 aa）
链 W
46–91（46 aa）
链 W
117–185（69 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 8 CAP 2-CARBOXYARABINITOL-1,5-DIPHOSPHATE × 8 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 50 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；291 K；50 MM HEPES PH 7.5, 8-12% PEG 4 50 MM NAHCO3, 5 MM MGCL2, 50 UM 2-CABP, 18 DEG C, 10-15 MG PROTEIN
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.193 |
| 2V63 Crystal structure of Rubisco from Chlamydomonas reinhardtii with a large-subunit V331A mutation 提交 2007-07-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白数一致 |
链 I
46–185（140 aa）
链 J
46–185（140 aa）
链 K
46–185（140 aa）
链 L
46–185（140 aa）
链 M
46–185（140 aa）
链 N
46–185（140 aa）
链 O
46–185（140 aa）
链 P
46–185（140 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CAP 2-CARBOXYARABINITOL-1,5-DIPHOSPHATE × 8 MG MAGNESIUM ION × 8 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 46 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；pH 7.5
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.214 |
| 2V67 Crystal structure of Chlamydomonas reinhardtii Rubisco with a large- subunit supressor mutation T342I 提交 2007-07-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白数一致 |
链 I
46–185（140 aa）
片段：RESIDUES 46-185
链 J
46–185（140 aa）
片段：RESIDUES 46-185
链 K
46–185（140 aa）
片段：RESIDUES 46-185
链 L
46–185（140 aa）
片段：RESIDUES 46-185
链 M
46–185（140 aa）
片段：RESIDUES 46-185
链 N
46–185（140 aa）
片段：RESIDUES 46-185
链 O
46–185（140 aa）
片段：RESIDUES 46-185
链 P
46–185（140 aa）
片段：RESIDUES 46-185
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 8 CAP 2-CARBOXYARABINITOL-1,5-DIPHOSPHATE × 8 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 58 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；pH 7.5
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.208 |
| 2V68 Crystal structure of Chlamydomonas reinhardtii Rubisco with large- subunit mutations V331A, T342I 提交 2007-07-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白数一致 |
链 I
46–185（140 aa）
片段：RESIDUES 46-185
链 J
46–185（140 aa）
片段：RESIDUES 46-185
链 K
46–185（140 aa）
片段：RESIDUES 46-185
链 L
46–185（140 aa）
片段：RESIDUES 46-185
链 M
46–185（140 aa）
片段：RESIDUES 46-185
链 N
46–185（140 aa）
片段：RESIDUES 46-185
链 O
46–185（140 aa）
片段：RESIDUES 46-185
链 P
46–185（140 aa）
片段：RESIDUES 46-185
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 8 CAP 2-CARBOXYARABINITOL-1,5-DIPHOSPHATE × 8 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 49 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；pH 7.5
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.203 |
| 2V69 Crystal structure of Chlamydomonas reinhardtii Rubisco with a large- subunit mutation D473E 提交 2007-07-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白数一致 |
链 I
46–185（140 aa）
链 J
46–185（140 aa）
链 K
46–185（140 aa）
链 L
46–185（140 aa）
链 M
46–185（140 aa）
链 N
46–185（140 aa）
链 O
46–185（140 aa）
链 P
46–185（140 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 8 CAP 2-CARBOXYARABINITOL-1,5-DIPHOSPHATE × 8 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 24 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；pH 7.5
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.228 |
| 2V6A Crystal structure of Chlamydomonas reinhardtii Rubisco with large- subunit mutations V331A, G344S 提交 2007-07-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白数一致 |
链 I
46–185（140 aa）
链 J
46–185（140 aa）
链 K
46–185（140 aa）
链 L
46–185（140 aa）
链 M
46–185（140 aa）
链 N
46–185（140 aa）
链 O
46–185（140 aa）
链 P
46–185（140 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 8 CAP 2-CARBOXYARABINITOL-1,5-DIPHOSPHATE × 8 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 59 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；pH 7.5
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.192 |
| 2VDH Crystal structure of Chlamydomonas reinhardtii Rubisco with a large- subunit C172S mutation 提交 2007-10-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白数一致 |
链 I
46–185（140 aa）
链 J
46–185（140 aa）
链 K
46–185（140 aa）
链 L
46–185（140 aa）
链 M
46–185（140 aa）
链 N
46–185（140 aa）
链 O
46–185（140 aa）
链 P
46–185（140 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 8 CAP 2-CARBOXYARABINITOL-1,5-DIPHOSPHATE × 8 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 57 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；pH 7.5
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.203 |
| 2VDI Crystal structure of Chlamydomonas reinhardtii Rubisco with a large- subunit C192S mutation 提交 2007-10-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白数一致 |
链 I
46–185（140 aa）
链 J
46–185（140 aa）
链 K
46–185（140 aa）
链 L
46–185（140 aa）
链 M
46–185（140 aa）
链 N
46–185（140 aa）
链 O
46–185（140 aa）
链 P
46–185（140 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 8 CAP 2-CARBOXYARABINITOL-1,5-DIPHOSPHATE × 8 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 43 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；pH 7.5
|
分辨率 2.65 Å R-free 0.234 |
| 9HVM In-cell Structure of Pyrenoid Rubisco 提交 2024-12-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：16-meric（16） 与蛋白数一致 |
链 B
46–177（132 aa）
链 D
46–177（132 aa）
链 F
46–177（132 aa）
链 H
46–177（132 aa）
链 J
46–177（132 aa）
链 L
46–177（132 aa）
链 N
46–177（132 aa）
链 P
46–177（132 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 8.10 Å |