当前蛋白身份：P02930
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1EK9 2.1A X-RAY STRUCTURE OF TOLC: AN INTEGRAL OUTER MEMBRANE PROTEIN AND EFFLUX PUMP COMPONENT FROM ESCHERICHIA COLI 提交 2000-03-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
25–452（428 aa）
链 B
25–452（428 aa）
链 C
25–452（428 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；298 K；PEG 2000 MME, PEG 400, Sodium Chloride, Magnesium Chloride,
dodecyl glucopyrsanoside, hexyl glucopyranoside,
heptyl gluocopyranoside, octyl glucopyranoside, 1,2,3-heptanetriol,
Tris, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.257 |
| 1TQQ Structure of TolC in complex with hexamminecobalt 提交 2004-06-18 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
25–495（471 aa）
链 B
25–495（471 aa）
链 C
25–495（471 aa）
|
未记录 | NCO COBALT HEXAMMINE(III) × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；291 K；0.6% detergent mixture of n-dodecyl-beta-D glucopyranoside, n-hexyl-beta-D glucopyranoside, n-heptyl-beta-D glucopyranoside and n-octyl-beta-D glucopyranoside, 1.5% 1,2,3-heptanetriol, 7% polyethylene glycol 2000 monomethyl ether, 10% polyethylene glycol 400, 10mM NaCl, 20mM MgCl2, 20mM Tris, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.75 Å R-free 0.305 |
| 2VDD Crystal Structure of the Open State of TolC Outer Membrane Component of Mutlidrug Efflux Pumps 提交 2007-10-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–450（450 aa）
片段：RESIDUES 1-450
链 B
1–450（450 aa）
片段：RESIDUES 1-450
链 C
1–450（450 aa）
片段：RESIDUES 1-450
|
突变：YES 突变：YES 突变：YES | CL CHLORIDE ION × 3 K POTASSIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；PROTEIN WAS CRYSTALLISED FROM 0.1M HEPES 7.5, 5% ISOPROPANOL, 10% PEG4000
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.295 |
| 2VDE Crystal Structure of the Open State of TolC Outer Membrane Component of Mutlidrug Efflux Pumps 提交 2007-10-04 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–450（450 aa）
片段：RESIDUES 1-450
链 B
1–450（450 aa）
片段：RESIDUES 1-450
链 C
1–450（450 aa）
片段：RESIDUES 1-450
|
突变：YES 突变：YES 突变：YES | CL CHLORIDE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 10.5；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 0.1M CAPS PH10.5, 30% PEG400
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.315 |
| 2WMZ Structure of a mutated TolC 提交 2009-07-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
23–450（428 aa）
片段：MATURE PROTEIN WITH 43 C-TERMINAL RESIDUES REMOVED, RESIDUES 23-450
链 B
23–450（428 aa）
片段：MATURE PROTEIN WITH 43 C-TERMINAL RESIDUES REMOVED, RESIDUES 23-450
链 C
23–450（428 aa）
片段：MATURE PROTEIN WITH 43 C-TERMINAL RESIDUES REMOVED, RESIDUES 23-450
|
突变：YES 突变：YES 突变：YES | CL CHLORIDE ION × 3 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 5 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7；50 MM TRIS PH 8.2, 50 MM NACL, 14% PEG2000, 0.075% N-DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE, 0.3% N-OCTYL BETA-D-GLUCOPYRANOSIDE
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.301 |
| 2XMN High resolution snapshots of defined TolC open states present an iris- like movement of periplasmic entrance helices 提交 2010-07-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
23–450（428 aa）
片段：RESIDUES 23-450
链 B
23–450（428 aa）
片段：RESIDUES 23-450
链 C
23–450（428 aa）
片段：RESIDUES 23-450
|
突变：YES 突变：YES 突变：YES | CL CHLORIDE ION × 3 LMT DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.4；PH 7.4
|
分辨率 2.85 Å R-free 0.309 |
| 5NG5 multi-drug efflux; membrane transport; RND superfamily; Drug resistance 提交 2017-03-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric（15） 与蛋白数一致 |
链 C
1–493（493 aa）
链 F
1–493（493 aa）
链 I
1–493（493 aa）
|
未记录 | 5QF 6-[2-(3,4-dimethoxyphenyl)ethylsulfanyl]-8-[4-(2-methoxyethyl)piperazin-1-yl]-3,3-dimethyl-1,4-dihydropyrano[3,4-c]pyridine-5-carbonitrile × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；a 3ul aliquot at a concentration of 2 mg per ml was applied onto glow-discharged holey carbon grid (Quantifoil Au R1.21.3, 300 mesh)
|
分辨率 6.50 Å |
| 5NIK Structure of the MacAB-TolC ABC-type tripartite multidrug efflux pump 提交 2017-03-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric（11） 与蛋白数一致 |
链 A
23–493（471 aa）
链 B
23–493（471 aa）
链 C
23–493（471 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 5NIL Structure of the MacAB-TolC ABC-type tripartite multidrug efflux pump-MacB section 提交 2017-03-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric（11） 与蛋白数一致 |
链 A
23–493（471 aa）
链 B
23–493（471 aa）
链 C
23–493（471 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.30 Å |
| 5O66 Asymmetric AcrABZ-TolC 提交 2017-06-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric（15） 与蛋白数一致 |
链 A
1–493（493 aa）
链 B
1–493（493 aa）
链 C
1–493（493 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.90 Å |
| 5V5S multi-drug efflux; membrane transport; RND superfamily; Drug resistance 提交 2017-03-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
23–464（442 aa）
链 B
23–464（442 aa）
链 C
23–464（442 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；a 3ul aliquot at a concentration of 2 mg per ml was applied onto glow-discharged holey carbon grid (Quantifoil Au R1.21.3, 300 mesh)
|
分辨率 6.50 Å |
| 6WXH Colicin E1 fragment in nanodisc-embedded TolC 提交 2020-05-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–493（493 aa）
链 B
1–493（493 aa）
链 C
1–493（493 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.09 Å |
| 6WXI Colicin E1 fragment in nanodisc-embedded TolC 提交 2020-05-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–493（493 aa）
链 B
1–493（493 aa）
链 C
1–493（493 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.84 Å |
| 8ZAL EmrAB-TolC MFS-type tripartite multidrug efflux pump EA 提交 2024-04-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 G
23–450（428 aa）
链 H
23–450（428 aa）
链 I
23–450（428 aa）
|
突变：V169L 突变：V169L 突变：V169L | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.11 Å |
| 8ZAR EmrAB-TolC MFS-type tripartite multidrug efflux pump FA 提交 2024-04-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 G
1–493（493 aa）
链 H
1–493（493 aa）
链 I
1–493（493 aa）
|
突变：V191L 突变：V191L 突变：V191L | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.59 Å |
| 9QGY Structure of the YbjP lipoprotein bound to the MacAB-TolC tripartite efflux pump 提交 2025-03-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：14-meric（14） 与蛋白数一致 |
链 A
23–493（471 aa）
链 B
23–493（471 aa）
链 C
23–493（471 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 3 Z41 (2S)-3-hydroxypropane-1,2-diyl dihexadecanoate × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.48 Å |
| 9TG4 Structure of the YbjP lipoprotein bound to the AcrABZ-TolC efflux pump 提交 2025-11-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：18-meric（18） 与蛋白数一致 |
链 A
23–493（471 aa）
链 B
23–493（471 aa）
链 C
23–493（471 aa）
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.17 Å |
| 9V52 Structure of TolC and YbjP closed state complex 提交 2025-05-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 C1
1–493（493 aa）
链 C2
1–493（493 aa）
链 C3
1–493（493 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 3.56 Å |
| 9V53 Structure of TolC, YbjP, and AcrABZ complex 提交 2025-05-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric（18） 与蛋白数一致 |
链 C1
1–493（493 aa）
链 C2
1–493（493 aa）
链 C3
1–493（493 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 3.39 Å |
| 9V55 Structure of TolC, YbjP, and AcrA complex 提交 2025-05-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 C1
1–493（493 aa）
链 C2
1–493（493 aa）
链 C3
1–493（493 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 3.26 Å |