当前蛋白身份：P03732
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1Z1Z NMR structure of the gpu tail protein from lambda bacteriophage 提交 2005-03-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–131（131 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7.8；293 K；离子强度（mmCIF原始值）50 mM KCl；压力 1
NMR样品组成
0.9 mM gpU, U-15N,13C, 10 mM Tris-d11, pH 7.8, 50 mM potassium chloride, 0.02% sodium azide, 10% D2O, 90% H2O | 10% D2O, 90% H2O
|
分辨率未提供 |
| 3FZ2 Crystal structure of the tail terminator protein from phage lambda (gpU-D74A) 提交 2009-01-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
1–131（131 aa）
链 B
1–131（131 aa）
链 E
1–131（131 aa）
链 F
1–131（131 aa）
链 I
1–131（131 aa）
链 K
1–131（131 aa）
|
突变：D74A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：D74A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：D74A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：D74A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：D74A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：D74A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 7 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；0.2M Di-ammonium tartrate, 2.2M Ammonium sulfate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.283 |
| 3FZ2 Crystal structure of the tail terminator protein from phage lambda (gpU-D74A) 提交 2009-01-23 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 C
1–131（131 aa）
链 D
1–131（131 aa）
链 G
1–131（131 aa）
链 H
1–131（131 aa）
链 J
1–131（131 aa）
链 L
1–131（131 aa）
|
突变：D74A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：D74A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：D74A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：D74A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：D74A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：D74A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；0.2M Di-ammonium tartrate, 2.2M Ammonium sulfate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.283 |
| 3FZ2 Crystal structure of the tail terminator protein from phage lambda (gpU-D74A) 提交 2009-01-23 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
1–131（131 aa）
链 B
1–131（131 aa）
链 C
1–131（131 aa）
链 D
1–131（131 aa）
链 E
1–131（131 aa）
链 F
1–131（131 aa）
链 G
1–131（131 aa）
链 H
1–131（131 aa）
链 I
1–131（131 aa）
链 J
1–131（131 aa）
链 K
1–131（131 aa）
链 L
1–131（131 aa）
|
突变：D74A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：D74A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：D74A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：D74A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：D74A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：D74A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：D74A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：D74A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：D74A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：D74A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：D74A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：D74A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 13 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；0.2M Di-ammonium tartrate, 2.2M Ammonium sulfate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.283 |
| 3FZB Crystal structure of the tail terminator protein from phage lambda (gpU-WT) 提交 2009-01-24 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
1–131（131 aa）
链 B
1–131（131 aa）
链 F
1–131（131 aa）
链 H
1–131（131 aa）
链 I
1–131（131 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；0.2M Tri-sodium citrate, 2.2M Ammonium sulfate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.309 |
| 3FZB Crystal structure of the tail terminator protein from phage lambda (gpU-WT) 提交 2009-01-24 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 C
1–131（131 aa）
链 D
1–131（131 aa）
链 E
1–131（131 aa）
链 G
1–131（131 aa）
链 J
1–131（131 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；0.2M Tri-sodium citrate, 2.2M Ammonium sulfate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.309 |
| 8IYD Tail cap of phage lambda tail 提交 2023-04-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric（30） 与蛋白数一致 |
链 G
1–131（131 aa）
链 K
1–131（131 aa）
链 Q
1–131（131 aa）
链 U
1–131（131 aa）
链 W
1–131（131 aa）
链 u
1–131（131 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 3.10 Å |
| 8K37 Structure of the bacteriophage lambda neck 提交 2023-07-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric（18） 与蛋白数一致 |
链 A
1–131（131 aa）
链 B
1–131（131 aa）
链 C
1–131（131 aa）
链 D
1–131（131 aa）
链 E
1–131（131 aa）
链 F
1–131（131 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 8XOW Mature virion portal of bacteriophage lambda 提交 2024-01-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：36-meric（36） 与蛋白数一致 |
链 U
1–131（131 aa）
链 U1
1–131（131 aa）
链 U2
1–131（131 aa）
链 U3
1–131（131 aa）
链 U4
1–131（131 aa）
链 U5
1–131（131 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 3.32 Å |
| 8XPM Mature virion portal of phage lambda with DNA 提交 2024-01-04 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 66 PDB 声明：68-meric（68） 与全部聚合物一致 |
链 U
1–131（131 aa）
链 U1
1–131（131 aa）
链 U2
1–131（131 aa）
链 U3
1–131（131 aa）
链 U4
1–131（131 aa）
链 U5
1–131（131 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 3.90 Å |
| 8XQB Mature virion portal vertex of bacteriophage lambda 提交 2024-01-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 71 PDB 声明：71-meric（71） 与蛋白数一致 |
链 U
1–131（131 aa）
链 U1
1–131（131 aa）
链 U2
1–131（131 aa）
链 U3
1–131（131 aa）
链 U4
1–131（131 aa）
链 U5
1–131（131 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 4.07 Å |