当前蛋白身份:P03749 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果;所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
8IYK Tail tip conformation 1 of phage lambda tail 提交 2023-04-05 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 42 PDB 声明:42-meric(42) 与蛋白数一致
链 F 1–1132(1132 aa)
链 J 1–1132(1132 aa)
链 Z 1–1132(1132 aa)
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN
分辨率 2.95 Å
8IYL Tail tip conformation 2 of phage lambda tail 提交 2023-04-05 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 42 PDB 声明:42-meric(42) 与蛋白数一致
链 E 1–1132(1132 aa)
链 J 1–1132(1132 aa)
链 Y 1–1132(1132 aa)
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN
分辨率 3.00 Å
8JVM AHS-CSF domains of phage lambda tail 提交 2023-06-28 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 F 830–995(166 aa) 片段:AHS-CSF domains
链 J 830–995(166 aa) 片段:AHS-CSF domains
链 Z 830–995(166 aa) 片段:AHS-CSF domains
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN
分辨率 3.86 Å
8K35 Structure of the bacteriophage lambda tail tip complex 提交 2023-07-14 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 24 PDB 声明:24-meric(24) 与蛋白数一致
链 A 1–1132(1132 aa)
链 B 1–1132(1132 aa)
链 I 1–1132(1132 aa)
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.44 Å
8XCG Tail tip complex of bacteriophage lambda in the open state 提交 2023-12-09 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 15 PDB 声明:pentadecameric(15) 与蛋白数一致
链 F 1–1132(1132 aa)
链 J 1–1132(1132 aa)
链 Z 1–1132(1132 aa)
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.46 Å
8XCI Open state of central tail fiber of bacteriophage lambda upon binding to LamB 提交 2023-12-09 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 F 1–1132(1132 aa)
链 J 1–1132(1132 aa)
链 Z 1–1132(1132 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.57 Å
8XCJ Open State of central tail fiber of bacteriophage lambda upon binding to LamB (gpJ713-LamB complex) 提交 2023-12-09 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 F 713–1132(420 aa)
链 J 713–1132(420 aa)
链 Z 713–1132(420 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.98 Å
8XCK Closed state of central tail fiber of bacteriophage lambda 提交 2023-12-09 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 F 713–1132(420 aa)
链 J 713–1132(420 aa)
链 Z 713–1132(420 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.75 Å
9E7M In situ cryoEM structure of bacteriophage Ur-lambda tail tip complex 提交 2024-11-03 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 36 PDB 声明:36-meric(36) 与蛋白数一致
链 Ja 1–835(835 aa)
链 Jb 1–835(835 aa)
链 Jc 1–835(835 aa)
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.37 Å
9OIK Structure of S. Typhimurium 14028 Gifsy-1 prophage HepS bound to bacteriophage lambda J Tail Tip 提交 2025-05-06 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 C 902–933(32 aa)
链 D 902–933(32 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291 K;0.2 M Sodium Acetate, 16% PEG 4000, 0.1 M Tris pH 8.5
分辨率 1.86 Å R-free 0.209