当前蛋白身份：P04133
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1P30 Refinement of Adenovirus Type 5 Hexon with CNS 提交 2003-04-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–951（951 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 3.2；298 K；0.5 SODIUM CITRATE , pH 3.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.207 |
| 3TG7 Crystal structure of Adenovirus serotype 5 hexon at 1.6A resolution 提交 2011-08-17 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
2–952（951 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；14% PEG 6000 in Bis-tris propane buffer., pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.57 Å R-free 0.223 |
| 4V4U The quasi-atomic model of Human Adenovirus type 5 capsid 提交 2005-03-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 840 PDB 声明：840-meric（840） 与蛋白数一致 |
链 F
1–951（951 aa）
链 G
1–951（951 aa）
链 H
1–951（951 aa）
链 I
1–951（951 aa）
链 J
1–951（951 aa）
链 K
1–951（951 aa）
链 L
1–951（951 aa）
链 M
1–951（951 aa）
链 N
1–951（951 aa）
链 O
1–951（951 aa）
链 P
1–951（951 aa）
链 Q
1–951（951 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
TRIS；pH 7.5；TRIS
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；LIQUID ETHANE
|
分辨率 10.00 Å |
| 4V4U The quasi-atomic model of Human Adenovirus type 5 capsid 提交 2005-03-03 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric（22） 与蛋白数一致 |
链 F
1–951（951 aa）
链 G
1–951（951 aa）
链 H
1–951（951 aa）
链 I
1–951（951 aa）
链 J
1–951（951 aa）
链 K
1–951（951 aa）
链 L
1–951（951 aa）
链 M
1–951（951 aa）
链 N
1–951（951 aa）
链 O
1–951（951 aa）
链 P
1–951（951 aa）
链 Q
1–951（951 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
TRIS；pH 7.5；TRIS
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；LIQUID ETHANE
|
分辨率 10.00 Å |
| 4V4U The quasi-atomic model of Human Adenovirus type 5 capsid 提交 2005-03-03 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric（22） 与蛋白数一致 |
链 F
1–951（951 aa）
链 G
1–951（951 aa）
链 H
1–951（951 aa）
链 I
1–951（951 aa）
链 J
1–951（951 aa）
链 K
1–951（951 aa）
链 L
1–951（951 aa）
链 M
1–951（951 aa）
链 N
1–951（951 aa）
链 O
1–951（951 aa）
链 P
1–951（951 aa）
链 Q
1–951（951 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
TRIS；pH 7.5；TRIS
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；LIQUID ETHANE
|
分辨率 10.00 Å |
| 5LDN A viral capsid:antibody complex 提交 2016-06-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
8–947（940 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；PEG 4000, sodium chloride,
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.223 |
| 5OGI Complex of a binding protein and human adenovirus C 5 hexon 提交 2017-07-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–952（952 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 7 DIO 1,4-DIETHYLENE DIOXIDE × 10 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；1.6 M (NH4)2SO4, 10 % dioxane, 0.1 M MES pH 6.5
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.235 |
| 6B1T Improved cryoEM structure of human adenovirus type 5 with atomic details of minor proteins VI and VII 提交 2017-09-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 1500 PDB 声明：1500-meric（1500） 与蛋白数一致 |
链 A
1–952（952 aa）
链 B
1–952（952 aa）
链 C
1–952（952 aa）
链 D
1–952（952 aa）
链 E
1–952（952 aa）
链 F
1–952（952 aa）
链 G
1–952（952 aa）
链 H
1–952（952 aa）
链 I
1–952（952 aa）
链 J
1–952（952 aa）
链 K
1–952（952 aa）
链 L
1–952（952 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 6B1T Improved cryoEM structure of human adenovirus type 5 with atomic details of minor proteins VI and VII 提交 2017-09-18 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 25 PDB 声明：25-meric（25） 与蛋白数一致 |
链 A
1–952（952 aa）
链 B
1–952（952 aa）
链 C
1–952（952 aa）
链 D
1–952（952 aa）
链 E
1–952（952 aa）
链 F
1–952（952 aa）
链 G
1–952（952 aa）
链 H
1–952（952 aa）
链 I
1–952（952 aa）
链 J
1–952（952 aa）
链 K
1–952（952 aa）
链 L
1–952（952 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 6B1T Improved cryoEM structure of human adenovirus type 5 with atomic details of minor proteins VI and VII 提交 2017-09-18 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 125 PDB 声明：125-meric（125） 与蛋白数一致 |
链 A
1–952（952 aa）
链 B
1–952（952 aa）
链 C
1–952（952 aa）
链 D
1–952（952 aa）
链 E
1–952（952 aa）
链 F
1–952（952 aa）
链 G
1–952（952 aa）
链 H
1–952（952 aa）
链 I
1–952（952 aa）
链 J
1–952（952 aa）
链 K
1–952（952 aa）
链 L
1–952（952 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 6B1T Improved cryoEM structure of human adenovirus type 5 with atomic details of minor proteins VI and VII 提交 2017-09-18 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 150 PDB 声明：150-meric（150） 与蛋白数一致 |
链 A
1–952（952 aa）
链 B
1–952（952 aa）
链 C
1–952（952 aa）
链 D
1–952（952 aa）
链 E
1–952（952 aa）
链 F
1–952（952 aa）
链 G
1–952（952 aa）
链 H
1–952（952 aa）
链 I
1–952（952 aa）
链 J
1–952（952 aa）
链 K
1–952（952 aa）
链 L
1–952（952 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 6B1T Improved cryoEM structure of human adenovirus type 5 with atomic details of minor proteins VI and VII 提交 2017-09-18 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 25 PDB 声明：25-meric（25） 与蛋白数一致 |
链 A
1–952（952 aa）
链 B
1–952（952 aa）
链 C
1–952（952 aa）
链 D
1–952（952 aa）
链 E
1–952（952 aa）
链 F
1–952（952 aa）
链 G
1–952（952 aa）
链 H
1–952（952 aa）
链 I
1–952（952 aa）
链 J
1–952（952 aa）
链 K
1–952（952 aa）
链 L
1–952（952 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 6CGV Revised crystal structure of human adenovirus 提交 2018-02-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 1260 PDB 声明：1260-meric（1260） 与蛋白数一致 |
链 A
4–952（949 aa）
链 B
4–952（949 aa）
链 C
4–952（949 aa）
链 D
4–952（949 aa）
链 E
4–952（949 aa）
链 F
4–952（949 aa）
链 G
4–952（949 aa）
链 H
4–952（949 aa）
链 I
4–952（949 aa）
链 J
4–952（949 aa）
链 K
4–952（949 aa）
链 L
4–952（949 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；100MM HEPES PH 7.0, 200MM CALCIUM ACETATE, 14% PEG550 MME, 15% GLYCEROL.
|
分辨率 3.80 Å R-free 0.427 |
| 6CGV Revised crystal structure of human adenovirus 提交 2018-02-21 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric（21） 与蛋白数一致 |
链 A
4–952（949 aa）
链 B
4–952（949 aa）
链 C
4–952（949 aa）
链 D
4–952（949 aa）
链 E
4–952（949 aa）
链 F
4–952（949 aa）
链 G
4–952（949 aa）
链 H
4–952（949 aa）
链 I
4–952（949 aa）
链 J
4–952（949 aa）
链 K
4–952（949 aa）
链 L
4–952（949 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；100MM HEPES PH 7.0, 200MM CALCIUM ACETATE, 14% PEG550 MME, 15% GLYCEROL.
|
分辨率 3.80 Å R-free 0.427 |
| 6CGV Revised crystal structure of human adenovirus 提交 2018-02-21 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 105 PDB 声明：105-meric（105） 与蛋白数一致 |
链 A
4–952（949 aa）
链 B
4–952（949 aa）
链 C
4–952（949 aa）
链 D
4–952（949 aa）
链 E
4–952（949 aa）
链 F
4–952（949 aa）
链 G
4–952（949 aa）
链 H
4–952（949 aa）
链 I
4–952（949 aa）
链 J
4–952（949 aa）
链 K
4–952（949 aa）
链 L
4–952（949 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；100MM HEPES PH 7.0, 200MM CALCIUM ACETATE, 14% PEG550 MME, 15% GLYCEROL.
|
分辨率 3.80 Å R-free 0.427 |
| 6CGV Revised crystal structure of human adenovirus 提交 2018-02-21 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 126 PDB 声明：126-meric（126） 与蛋白数一致 |
链 A
4–952（949 aa）
链 B
4–952（949 aa）
链 C
4–952（949 aa）
链 D
4–952（949 aa）
链 E
4–952（949 aa）
链 F
4–952（949 aa）
链 G
4–952（949 aa）
链 H
4–952（949 aa）
链 I
4–952（949 aa）
链 J
4–952（949 aa）
链 K
4–952（949 aa）
链 L
4–952（949 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；100MM HEPES PH 7.0, 200MM CALCIUM ACETATE, 14% PEG550 MME, 15% GLYCEROL.
|
分辨率 3.80 Å R-free 0.427 |
| 6CGV Revised crystal structure of human adenovirus 提交 2018-02-21 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric（21） 与蛋白数一致 |
链 A
4–952（949 aa）
链 B
4–952（949 aa）
链 C
4–952（949 aa）
链 D
4–952（949 aa）
链 E
4–952（949 aa）
链 F
4–952（949 aa）
链 G
4–952（949 aa）
链 H
4–952（949 aa）
链 I
4–952（949 aa）
链 J
4–952（949 aa）
链 K
4–952（949 aa）
链 L
4–952（949 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；100MM HEPES PH 7.0, 200MM CALCIUM ACETATE, 14% PEG550 MME, 15% GLYCEROL.
|
分辨率 3.80 Å R-free 0.427 |
| 6CGV Revised crystal structure of human adenovirus 提交 2018-02-21 | Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 1260 PDB 声明：1260-meric（1260） 与蛋白数一致 |
链 A
4–952（949 aa）
链 B
4–952（949 aa）
链 C
4–952（949 aa）
链 D
4–952（949 aa）
链 E
4–952（949 aa）
链 F
4–952（949 aa）
链 G
4–952（949 aa）
链 H
4–952（949 aa）
链 I
4–952（949 aa）
链 J
4–952（949 aa）
链 K
4–952（949 aa）
链 L
4–952（949 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；100MM HEPES PH 7.0, 200MM CALCIUM ACETATE, 14% PEG550 MME, 15% GLYCEROL.
|
分辨率 3.80 Å R-free 0.427 |
| 6EQC Cryo-EM reconstruction of a complex of a binding protein and human adenovirus C5 hexon 提交 2017-10-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
1–952（952 aa）
链 B
1–952（952 aa）
链 C
1–952（952 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 7.40 Å |
| 7S78 Structure of a cell-entry defective human adenovirus provides insights into precursor proteins and capsid maturation 提交 2021-09-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 1860 PDB 声明：1860-meric（1860） 与蛋白数一致 |
链 A
1–952（952 aa）
链 B
1–952（952 aa）
链 C
1–952（952 aa）
链 D
1–952（952 aa）
链 E
1–952（952 aa）
链 F
1–952（952 aa）
链 G
1–952（952 aa）
链 H
1–952（952 aa）
链 I
1–952（952 aa）
链 J
1–952（952 aa）
链 K
1–952（952 aa）
链 L
1–952（952 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8.1；40 mM Tris, pH 8.1
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.72 Å |
| 7S78 Structure of a cell-entry defective human adenovirus provides insights into precursor proteins and capsid maturation 提交 2021-09-15 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric（31） 与蛋白数一致 |
链 A
1–952（952 aa）
链 B
1–952（952 aa）
链 C
1–952（952 aa）
链 D
1–952（952 aa）
链 E
1–952（952 aa）
链 F
1–952（952 aa）
链 G
1–952（952 aa）
链 H
1–952（952 aa）
链 I
1–952（952 aa）
链 J
1–952（952 aa）
链 K
1–952（952 aa）
链 L
1–952（952 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8.1；40 mM Tris, pH 8.1
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.72 Å |
| 7S78 Structure of a cell-entry defective human adenovirus provides insights into precursor proteins and capsid maturation 提交 2021-09-15 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 155 PDB 声明：155-meric（155） 与蛋白数一致 |
链 A
1–952（952 aa）
链 B
1–952（952 aa）
链 C
1–952（952 aa）
链 D
1–952（952 aa）
链 E
1–952（952 aa）
链 F
1–952（952 aa）
链 G
1–952（952 aa）
链 H
1–952（952 aa）
链 I
1–952（952 aa）
链 J
1–952（952 aa）
链 K
1–952（952 aa）
链 L
1–952（952 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8.1；40 mM Tris, pH 8.1
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.72 Å |
| 7S78 Structure of a cell-entry defective human adenovirus provides insights into precursor proteins and capsid maturation 提交 2021-09-15 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 186 PDB 声明：186-meric（186） 与蛋白数一致 |
链 A
1–952（952 aa）
链 B
1–952（952 aa）
链 C
1–952（952 aa）
链 D
1–952（952 aa）
链 E
1–952（952 aa）
链 F
1–952（952 aa）
链 G
1–952（952 aa）
链 H
1–952（952 aa）
链 I
1–952（952 aa）
链 J
1–952（952 aa）
链 K
1–952（952 aa）
链 L
1–952（952 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8.1；40 mM Tris, pH 8.1
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.72 Å |
| 7S78 Structure of a cell-entry defective human adenovirus provides insights into precursor proteins and capsid maturation 提交 2021-09-15 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：31-meric（31） 与蛋白数一致 |
链 A
1–952（952 aa）
链 B
1–952（952 aa）
链 C
1–952（952 aa）
链 D
1–952（952 aa）
链 E
1–952（952 aa）
链 F
1–952（952 aa）
链 G
1–952（952 aa）
链 H
1–952（952 aa）
链 I
1–952（952 aa）
链 J
1–952（952 aa）
链 K
1–952（952 aa）
链 L
1–952（952 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8.1；40 mM Tris, pH 8.1
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.72 Å |
| 8Q7C Cryo-EM structure of Adenovirus C5 hexon 提交 2023-08-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–952（952 aa）
链 B
1–952（952 aa）
链 C
1–952（952 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 9CLI Cryo-EM model derived from localized reconstruction of human adenovirus (Ad5)-hexon-FX complex at 3.6A resolution 提交 2024-07-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 J
1–952（952 aa）
链 K
1–952（952 aa）
链 L
1–952（952 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.61 Å |
| 9CLN Cryo-EM model derived from localized reconstruction of human adenovirus 5 (Ad5)-hexon-FII complex at 3.9A resolution 提交 2024-07-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 J
1–952（952 aa）
链 K
1–952（952 aa）
链 L
1–952（952 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.13 Å |