当前蛋白身份：P06786
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1BGW TOPOISOMERASE RESIDUES 410-1202, 提交 1996-02-20 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
409–1201（793 aa）
片段：RESIDUES 410 - 1202
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.70 Å R-free 0.277 |
| 1BJT TOPOISOMERASE II RESIDUES 409-1201 提交 1998-06-29 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
409–1201（793 aa）
片段：DNA-BINDING AND CLEAVAGE CORE, RESIDUES 409-1201
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8；pH 8.0
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分辨率 2.50 Å R-free 0.269 |
| 1PVG Crystal Structure of the ATPase region of Saccharomyces Cerevisiae topoisomerase II 提交 2003-06-27 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–413（413 aa）
片段：N-terminal ATPase region
链 B
1–413（413 aa）
片段：N-terminal ATPase region
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 2 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
microbatch under oil；pH 6.5；293 K；PEG 1500, Potassium Chloride, Glycerol, Sodium Cacodylate, pH 6.5, microbatch under oil, temperature 293K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.241 |
| 1QZR CRYSTAL STRUCTURE OF THE ATPASE REGION OF SACCHAROMYCES CEREVISIAE TOPOISOMERASE II BOUND TO ICRF-187 (DEXRAZOXANE) 提交 2003-09-17 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–413（413 aa）
片段：N-terminal ATPase Region
链 B
1–413（413 aa）
片段：N-terminal ATPase Region
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 CDX (S)-4,4'-(1-METHYL-1,2-ETHANEDIYL)BIS-2,6-PIPERAZINEDIONE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
microbatch under oil；pH 6.5；293 K；PEG 1500, POTASSIUM CHLORIDE, GLYCEROL, SODIUM CACODYLATE, pH 6.5, microbatch under oil, temperature 293K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.237 |
| 2RGR Topoisomerase IIA bound to G-segment DNA 提交 2007-10-04 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
419–1177（759 aa）
片段：DNA binding and cleavage domain (residues 419-1177)
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；12-20% PEG 1000, 100-250 mM MgCl2, 100 mM sodium cacodylate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.278 |
| 3L4J Topoisomerase II-DNA cleavage complex, apo 提交 2009-12-20 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：pentameric（5） 与全部聚合物一致 |
链 A
421–1177（757 aa）
片段：RESIDUES 421-1177
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | TSP 3'-THIO-THYMIDINE-5'-PHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；291 K；20% 1,4-BUTANEDIOL, 0.1M SODIUM ACETATE, pH 4.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.48 Å R-free 0.259 |
| 3L4K Topoisomerase II-DNA cleavage complex, metal-bound 提交 2009-12-20 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：pentameric（5） 与全部聚合物一致 |
链 A
421–1177（757 aa）
片段：RESIDUES 421-1177
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ZN ZINC ION × 8 TSP 3'-THIO-THYMIDINE-5'-PHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291 K；20% 1,4-BUTANEDIOL, 0.1M SODIUM ACETATE, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
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分辨率 2.98 Å R-free 0.273 |
| 4GFH Topoisomerase II-DNA-AMPPNP complex 提交 2012-08-03 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：decameric（10） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–1177（1177 aa）
片段：UNP RESIDUES 1-1177
链 F
1–1177（1177 aa）
片段：UNP RESIDUES 1-1177
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非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | MG MAGNESIUM ION × 2 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；23% PEG 300, 100 mM Tris (8.0), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
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分辨率 4.41 Å R-free 0.275 |