当前蛋白身份：P08476
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1NYS Crystal Structure of Activin A Bound to the ECD of ActRIIB P41 提交 2003-02-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
311–426（116 aa）
片段：Mature Domain (residues 311-426)
链 D
311–426（116 aa）
片段：Mature Domain (residues 311-426)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；PEG 4000, sodium chloride, hepes, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 3.05 Å R-free 0.299 |
| 1NYU Crystal Structure of Activin A Bound to the ECD of ActRIIB 提交 2003-02-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
311–426（116 aa）
片段：Mature Domain (residues 311-426)
链 D
311–426（116 aa）
片段：Mature Domain (residues 311-426)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；PEG 4000, sodium chloride, hepes, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.291 |
| 1S4Y Crystal structure of the activin/actrIIb extracellular domain 提交 2004-01-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
311–426（116 aa）
链 D
311–426（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.7；277 K；PEG 3350, magnesium chloride, bis tris, pH 6.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.286 |
| 2ARP Activin A in complex with Fs12 fragment of follistatin 提交 2005-08-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
311–426（116 aa）
|
未记录 | NI NICKEL (II) ION × 6 1PG 2-(2-{2-[2-(2-METHOXY-ETHOXY)-ETHOXY]-ETHOXY}-ETHOXY)-ETHANOL × 2 GOL GLYCEROL × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；PEG-MME 2000, Nickel chloride, Tris-HCl, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.254 |
| 2ARV Structure of human Activin A 提交 2005-08-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
311–426（116 aa）
链 B
311–426（116 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 4 GOL GLYCEROL × 3 1PG 2-(2-{2-[2-(2-METHOXY-ETHOXY)-ETHOXY]-ETHOXY}-ETHOXY)-ETHANOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；298 K；Ammonium sulphate, PEG300, Na-Hepes, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.259 |
| 2B0U The Structure of the Follistatin:Activin Complex 提交 2005-09-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
311–426（116 aa）
片段：Activin (mature form)
链 B
311–426（116 aa）
片段：Activin (mature form)
|
未记录 | IR3 IRIDIUM (III) ION × 5 MLI MALONATE ION × 4 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；PEG 3350, 200 mM Malonate, pH 7.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 295K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.297 |
| 2P6A The structure of the Activin:Follistatin 315 complex 提交 2007-03-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
311–426（116 aa）
链 B
311–426（116 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；20-23% PEG 1000, 200mM MgCl2, 3% EtOH, 20mM Trimethyl-amine HCl, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298 K
|
分辨率 3.40 Å R-free 0.324 |
| 3B4V X-Ray structure of Activin in complex with FSTL3 提交 2007-10-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
311–426（116 aa）
链 B
311–426（116 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 SO4 SULFATE ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；PEG 3350, ammonium sulfate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.48 Å R-free 0.279 |
| 3B4V X-Ray structure of Activin in complex with FSTL3 提交 2007-10-24 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 E
311–426（116 aa）
链 F
311–426（116 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；PEG 3350, ammonium sulfate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.48 Å R-free 0.279 |
| 5HLY Structure of Pro-Activin A Precursor at 2.3 A Resolution 提交 2016-01-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
30–426（397 aa）
|
突变：C35S, C38S, deletion:K259-D282 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；292 K；25% w/v polyethylene glycol 1000, 100 mM MES pH 6.5; cryo: 15% v/v PEG 400 added
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.252 |
| 5HLZ Structure of Pro-Activin A Complex at 2.85 A resolution 提交 2016-01-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
30–305（276 aa）
片段：Pro domain, UNP Residues 30-305
链 B
311–426（116 aa）
片段：Mature domain, UNP Residues 311-426
链 C
30–305（276 aa）
片段：Pro domain, UNP Residues 30-305
链 D
311–426（116 aa）
片段：Mature domain, UNP Residues 311-426
|
突变：;C35S, C38S, deletion of K259-D282, furin cleavage site (RRRRR) replaced by HRV 3C protease cleavage site (LEVLFQGP),C35S, C38S, deletion of K259-D282, furin cleavage site replaced by HRV 3C protease cleavage site (LEVLFQGP),C35S, C38S, deletion of K259-D282, furin cleavage site (RRRRR) replaced by HRV 3C protease cleavage site (LEVLFQGP),C35S, C38S, deletion of K259-D282, furin cleavage site replaced by HRV 3C protease cleavage site (LEVLFQGP) ; 突变：;C35S, C38S, deletion of K259-D282, furin cleavage site (RRRRR) replaced by HRV 3C protease cleavage site (LEVLFQGP),C35S, C38S, deletion of K259-D282, furin cleavage site replaced by HRV 3C protease cleavage site (LEVLFQGP),C35S, C38S, deletion of K259-D282, furin cleavage site (RRRRR) replaced by HRV 3C protease cleavage site (LEVLFQGP),C35S, C38S, deletion of K259-D282, furin cleavage site replaced by HRV 3C protease cleavage site (LEVLFQGP) ; | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；292 K；20% w/v polyethylene glycol 3350, 0.2 M calcium chloride; cryo: 15% v/v PEG 400 added
|
分辨率 2.85 Å R-free 0.274 |
| 5HLZ Structure of Pro-Activin A Complex at 2.85 A resolution 提交 2016-01-15 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 E
30–305（276 aa）
片段：Pro domain, UNP Residues 30-305
链 F
311–426（116 aa）
片段：Mature domain, UNP Residues 311-426
链 G
30–305（276 aa）
片段：Pro domain, UNP Residues 30-305
链 H
311–426（116 aa）
片段：Mature domain, UNP Residues 311-426
|
突变：;C35S, C38S, deletion of K259-D282, furin cleavage site (RRRRR) replaced by HRV 3C protease cleavage site (LEVLFQGP),C35S, C38S, deletion of K259-D282, furin cleavage site replaced by HRV 3C protease cleavage site (LEVLFQGP),C35S, C38S, deletion of K259-D282, furin cleavage site (RRRRR) replaced by HRV 3C protease cleavage site (LEVLFQGP),C35S, C38S, deletion of K259-D282, furin cleavage site replaced by HRV 3C protease cleavage site (LEVLFQGP) ; 突变：;C35S, C38S, deletion of K259-D282, furin cleavage site (RRRRR) replaced by HRV 3C protease cleavage site (LEVLFQGP),C35S, C38S, deletion of K259-D282, furin cleavage site replaced by HRV 3C protease cleavage site (LEVLFQGP),C35S, C38S, deletion of K259-D282, furin cleavage site (RRRRR) replaced by HRV 3C protease cleavage site (LEVLFQGP),C35S, C38S, deletion of K259-D282, furin cleavage site replaced by HRV 3C protease cleavage site (LEVLFQGP) ; | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；292 K；20% w/v polyethylene glycol 3350, 0.2 M calcium chloride; cryo: 15% v/v PEG 400 added
|
分辨率 2.85 Å R-free 0.274 |
| 6Y6N Structure of mature activin A with small molecule 2 提交 2020-02-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
311–426（116 aa）
链 B
311–426（116 aa）
|
未记录 | ODQ (3~{R})-3,4-dimethyl-3-propyl-1~{H}-1,4-benzodiazepine-2,5-dione × 1 SO4 SULFATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；291 K；1.65 M (NH4)2SO4, 4 % PEG 300, 100 mM Hepes pH 7.4, 2 % DMSO
|
分辨率 2.03 Å R-free 0.251 |
| 6Y6O Structure of mature activin A with small molecule 42 提交 2020-02-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
311–426（116 aa）
链 B
311–426（116 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 10 OCK (3~{R})-4-ethyl-3-methyl-3-propyl-1~{H}-1,4-benzodiazepine-2,5-dione × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；291 K；1.65 M (NH4)2SO4, 4 % PEG 300, 100 mM Hepes pH 7.4, 2 % DMSO
|
分辨率 2.04 Å R-free 0.254 |
| 7OLY Structure of activin A in complex with an ActRIIB-Alk4 fusion reveal insight into activin receptor interactions 提交 2021-05-20 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 A
311–426（116 aa）
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未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；17.7 mg/ml complex in 20 mM HEPES, 200 mM NaCl pH 7.5. 100 + 100 nl sitting drop in a MRC 3-well plate with reservoir 0.1 M Na cacodylate pH 6.5 and 17 % (w/v) PEG 4000).
|
分辨率 3.27 Å R-free 0.269 |
| 7U5P CRYSTAL STRUCTURE OF THE ACTIVIN RECEPTOR TYPE-2A LIGAND BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH ACTIVIN-A 提交 2022-03-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
311–426（116 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.8；294 K；100mM Sodium Citrate, 17%PEG 3000
|
分辨率 3.14 Å R-free 0.276 |
| 7U5P CRYSTAL STRUCTURE OF THE ACTIVIN RECEPTOR TYPE-2A LIGAND BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH ACTIVIN-A 提交 2022-03-02 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
311–426（116 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.8；294 K；100mM Sodium Citrate, 17%PEG 3000
|
分辨率 3.14 Å R-free 0.276 |
| 7U5P CRYSTAL STRUCTURE OF THE ACTIVIN RECEPTOR TYPE-2A LIGAND BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH ACTIVIN-A 提交 2022-03-02 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
311–426（116 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.8；294 K；100mM Sodium Citrate, 17%PEG 3000
|
分辨率 3.14 Å R-free 0.276 |
| 7U5P CRYSTAL STRUCTURE OF THE ACTIVIN RECEPTOR TYPE-2A LIGAND BINDING DOMAIN IN COMPLEX WITH ACTIVIN-A 提交 2022-03-02 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 H
311–426（116 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.8；294 K；100mM Sodium Citrate, 17%PEG 3000
|
分辨率 3.14 Å R-free 0.276 |
| 9I5W Structure of mature Activin A from DMSO solvent optimisation of XChem fragment screen 提交 2025-01-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
311–426（116 aa）
链 B
311–426（116 aa）
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 6 SO4 SULFATE ION × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；294 K；1.55 M (NH4)2SO4, 100 mM Hepes pH 7.4, 8 % DMSO, 40 mM NaSO4
|
分辨率 1.77 Å R-free 0.235 |