当前蛋白身份:P09493 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
3MUD Structure of the Tropomyosin Overlap Complex from Chicken Smooth Muscle 提交 2010-05-02 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 C 1–29(29 aa)
链 D 1–29(29 aa)
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;18% MePEG 2000, 100 mM Bis-Tris, 120 mM MgSO4 , pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.20 Å R-free 0.250
5KHT Crystal structure of the N-terminal fragment of tropomyosin isoform Tpm1.1 at 1.5 A resolution 提交 2016-06-15 Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 1–28(28 aa)
链 C 1–28(28 aa)
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;PEG 8000, Hepes/sodium hydroxide
分辨率 1.50 Å R-free 0.249
5KHT Crystal structure of the N-terminal fragment of tropomyosin isoform Tpm1.1 at 1.5 A resolution 提交 2016-06-15 Assembly 2 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 1–28(28 aa)
链 D 1–28(28 aa)
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;PEG 8000, Hepes/sodium hydroxide
分辨率 1.50 Å R-free 0.249
6KN7 Structure of human cardiac thin filament in the calcium free state 提交 2019-08-03 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 29 PDB 声明:29-meric(29) 与蛋白数一致
链 P 11–284(274 aa)
链 Q 11–284(274 aa)
链 R 1–29(29 aa)
链 S 1–29(29 aa)
链 W 11–284(274 aa)
链 X 11–284(274 aa)
链 Y 1–29(29 aa)
链 Z 1–29(29 aa)
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 15 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.60 Å
6KN8 Structure of human cardiac thin filament in the calcium bound state 提交 2019-08-03 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 29 PDB 声明:29-meric(29) 与蛋白数一致
链 P 11–284(274 aa)
链 Q 11–284(274 aa)
链 R 1–29(29 aa)
链 S 1–29(29 aa)
链 W 11–284(274 aa)
链 X 11–284(274 aa)
链 Y 1–29(29 aa)
链 Z 1–29(29 aa)
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 15 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
6UT2 3D structure of the leiomodin/tropomyosin binding interface 提交 2019-10-29 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 B 1–14(14 aa)
链 C 1–14(14 aa)
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5;298 K;离子强度(mmCIF原始值)0.081;压力 1
NMR样品组成 0.5 mM [U-13C; U-15N] leiomodin peptide, 1 mM tropomyosin peptide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.5 mM [U-13C; U-15N] tropomyosin peptide, 1 mM leiomodin peptide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.3 mM [U-15N] leiomodin peptide, 0.6 mM tropomyosin peptide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.3 mM [U-15N] tropomyosin peptide, 0.6 mM leiomodin peptide, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
6X5Z Bovine Cardiac Myosin in Complex with Chicken Skeletal Actin and Human Cardiac Tropomyosin in the Rigor State 提交 2020-05-27 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 O 1–284(284 aa)
链 P 1–284(284 aa)
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Thin filaments were reconstituted by first mixing F-actin and tropomyosin to final concentrations of 10 uM actin and 7 uM tropomyosin. Just before applying 1.5 uL actin-tropomyosin to a freshly glow discharged holey-carbon grid, the surfactant octyl B-D-glucopyranoside was added to the protein solution to a concentration of 12 nM. The grid sample was manually blotted for 1 second and a 1.5 uL drop of 7.5 uM myosin-S1 sub-fragment was then applied to the blotted grid sample. The sample was immediately blotted for 4 seconds and plunge-frozen in liquid ethane.
分辨率 4.24 Å
7UTI ALTERNATIVE MODELING OF TROPOMYOSIN IN HUMAN CARDIAC THIN FILAMENT IN THE CALCIUM BOUND STATE 提交 2022-04-27 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 32 PDB 声明:32-meric(32) 与蛋白数一致
链 W 1–284(284 aa)
链 b 1–284(284 aa)
链 e 1–284(284 aa)
链 f 1–284(284 aa)
链 g 1–284(284 aa)
链 h 1–284(284 aa)
链 i 1–284(284 aa)
链 j 1–284(284 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 16 MG MAGNESIUM ION × 16 CA CALCIUM ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
7UTL ALTERNATIVE MODELING OF TROPOMYOSIN IN HUMAN CARDIAC THIN FILAMENT IN THE CALCIUM FREE STATE 提交 2022-04-27 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 34 PDB 声明:34-meric(34) 与蛋白数一致
链 W 1–284(284 aa)
链 Z 1–284(284 aa)
链 a 1–284(284 aa)
链 b 1–284(284 aa)
链 g 1–284(284 aa)
链 h 1–284(284 aa)
链 i 1–284(284 aa)
链 j 1–284(284 aa)
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 18 MG MAGNESIUM ION × 18 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.60 Å
8EFH Helical reconstruction of the human cardiac actin-tropomyosin-myosin complex in complex with ADP-Mg2+ 提交 2022-09-08 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 O 1–284(284 aa)
链 P 1–284(284 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 6 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8EFI Helical reconstruction of the human cardiac actin-tropomyosin-myosin complex in the rigor form 提交 2022-09-08 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 O 1–284(284 aa)
链 P 1–284(284 aa)
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8ENC Helical reconstruction of the human cardiac actin-tropomyosin-myosin loop 4 7G mutant complex 提交 2022-09-29 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 O 1–284(284 aa)
链 P 1–284(284 aa)
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8ZB7 Human left ventricle ATM complex 提交 2024-04-26 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 16 PDB 声明:hexadecameric(16) 与蛋白数一致
链 L 45–210(166 aa)
链 N 45–210(166 aa)
链 O 45–210(166 aa)
链 P 45–210(166 aa)
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.19 Å
9ZBL Helical Reconstruction of the Human Cardiac F-Actin-Tropomyosin Complex 提交 2025-11-20 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 M 1–284(284 aa)
链 N 1–284(284 aa)
链 O 1–284(284 aa)
链 P 1–284(284 aa)
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Blotting was performed with a blot force of 3 and a blot time of 3 s.
分辨率 2.79 Å
9ZBP Helical Reconstruction of the Complex of Pseudo-Acetylated Human Cardiac Actin (K326/328Q) and Tropomyosin 提交 2025-11-21 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致
链 M 1–284(284 aa)
链 N 1–284(284 aa)
链 O 1–284(284 aa)
链 P 1–284(284 aa)
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;Blotting was performed with a blot force of 3 and a blot time of 3 s.
分辨率 3.12 Å