当前蛋白身份:P0AC02 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
2YHC Structure of BamD from E. coli 提交 2011-04-28 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 29–245(217 aa) 片段:RESIDUES 29-245
未记录 URE UREA × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7;30% PEG 4000, 10% I-PROH, 0.1 M HEPES PH 7.5 .
分辨率 1.80 Å R-free 0.233
3Q5M Crystal structure of Escherichia coli BamD 提交 2010-12-28 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 23–245(223 aa)
未记录 IOD IODIDE ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;277 K;0.14M KI, 26%-27% PEG3350, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.60 Å R-free 0.261
3Q5M Crystal structure of Escherichia coli BamD 提交 2010-12-28 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 23–245(223 aa)
未记录 IOD IODIDE ION × 14 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;277 K;0.14M KI, 26%-27% PEG3350, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.60 Å R-free 0.261
3TGO Crystal structure of the E. coli BamCD complex 提交 2011-08-17 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 21–245(225 aa) 片段:UNP residues 21-245
未记录 K POTASSIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 9.2;295 K;0.2 M K2HPO4 and 20% PEG3350, pH 9.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 2.90 Å R-free 0.243
3TGO Crystal structure of the E. coli BamCD complex 提交 2011-08-17 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 21–245(225 aa) 片段:UNP residues 21-245
未记录 GOL GLYCEROL × 3 CL CHLORIDE ION × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 9.2;295 K;0.2 M K2HPO4 and 20% PEG3350, pH 9.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 2.90 Å R-free 0.243
3TGO Crystal structure of the E. coli BamCD complex 提交 2011-08-17 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 21–245(225 aa) 片段:UNP residues 21-245
链 B 21–245(225 aa) 片段:UNP residues 21-245
未记录 K POTASSIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 4 CL CHLORIDE ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 9.2;295 K;0.2 M K2HPO4 and 20% PEG3350, pH 9.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 2.90 Å R-free 0.243
3TGO Crystal structure of the E. coli BamCD complex 提交 2011-08-17 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白数一致
链 A 21–245(225 aa) 片段:UNP residues 21-245
链 B 21–245(225 aa) 片段:UNP residues 21-245
未记录 K POTASSIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 8 CL CHLORIDE ION × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 2 NA SODIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 9.2;295 K;0.2 M K2HPO4 and 20% PEG3350, pH 9.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 2.90 Å R-free 0.243
5AYW Structure of a membrane complex 提交 2015-09-14 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 D 20–245(226 aa) 片段:UNP residues 20-245
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;289 K;Tris-HCl, NaCl, PEG 400
分辨率 3.56 Å R-free 0.314
5D0O BamABCDE complex, outer membrane beta barrel assembly machinery entire complex 提交 2015-08-03 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 D 1–245(245 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1 M HEPES, pH7.5, 30% PEG600, CYMAL-4
分辨率 2.90 Å R-free 0.304
5D0Q BamACDE complex, outer membrane beta-barrel assembly machinery (BAM) complex 提交 2015-08-03 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 D 2–245(244 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;297 K;0.1 M Tris, pH8.0, 0.1 M MgCl2, 24% PEG500 MME.
分辨率 3.50 Å R-free 0.340
5D0Q BamACDE complex, outer membrane beta-barrel assembly machinery (BAM) complex 提交 2015-08-03 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 H 2–245(244 aa)
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;297 K;0.1 M Tris, pH8.0, 0.1 M MgCl2, 24% PEG500 MME.
分辨率 3.50 Å R-free 0.340
5EKQ The structure of the BamACDE subcomplex from E. coli 提交 2015-11-04 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 D 20–245(226 aa) 片段:UNP residues 20-245
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8.5;294 K;100 mM Tris-HCl, pH 8.5, 200 mM MgCl2, 10 mM MnCl2, and 8% PEG 4000
分辨率 3.39 Å R-free 0.281
6LYQ Structure of the BAM complex 提交 2020-02-15 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 D 1–245(245 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;27-30% PEG 400, 100mM NaCl
分辨率 3.19 Å R-free 0.293
6LYR Structure of the BAM complex 提交 2020-02-15 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 D 1–245(245 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;27-30% PEG 400, 100mM NaCl
分辨率 3.28 Å R-free 0.280
6LYS Structure of the BAM complex 提交 2020-02-15 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 D 1–245(245 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;289 K;27-30% PEG 400, 100mM NaCl
分辨率 3.05 Å R-free 0.284
6LYU Structure of the BAM complex 提交 2020-02-15 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 D 1–245(245 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7BNQ Lateral-closed conformation of the lid-locked BAM complex (BamA E435C S665C, BamBDCE) by cryoEM 提交 2021-01-22 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 D 1–245(245 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
7NBX Lateral-open conformation of the lid-locked BAM complex (BamA E435C S665C, BamBDCE) by cryoEM 提交 2021-01-28 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 D 1–245(245 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
7NCS Lateral-open conformation of the lid-locked BAM complex (BamA E435C S665C, BamBDCE) bound by a bactericidal Fab fragment 提交 2021-01-29 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric(7) 与蛋白数一致
链 D 1–245(245 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.10 Å
7ND0 lateral-open conformation of the wild-type BAM complex (BamABCDE) bound to a bactericidal Fab fragment 提交 2021-01-29 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric(7) 与蛋白数一致
链 D 1–245(245 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.20 Å
7NRI Structure of the darobactin-bound E. coli BAM complex (BamABCDE) 提交 2021-03-03 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 D 20–245(226 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;4microL of sample applied
分辨率 3.03 Å
7R1W E. coli BAM complex (BamABCDE) bound to dynobactin A 提交 2022-02-03 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 D 1–245(245 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8;20 mM Tris pH 8.0, 150 mM NaCl, 0.05% (w/v) n-dodecyl Beta-D-maltopyranoside (DDM)
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7YE4 BAM-EspP complex structure with BamA-G431C and G781C/EspP-N1293C and A1043C mutations in nanodisc 提交 2022-07-05 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 D 1–245(245 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8;20 mM Tris-HCl, pH 7.8, 150 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7YE6 BAM-EspP complex structure with BamA-N427C/EspP-R1297C mutations in nanodisc 提交 2022-07-05 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 D 1–245(245 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8;20 mM Tris-HCl, pH 7.8, 150 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8ADG Cryo-EM structure of Darobactin 22 bound BAM complex 提交 2022-07-08 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 D 1–245(245 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.00 Å
8ADI Cryo-EM structure of Darobactin 9 bound BAM complex 提交 2022-07-08 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 D 1–245(245 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
8BNZ BAM-EspP complex structure with BamA-G431C/EspP-N1293C mutations in nanodisc 提交 2022-11-14 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 D 1–245(245 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8BO2 BAM-EspP complex structure with BamA-S425C/EspP-S1299C mutations in nanodisc 提交 2022-11-14 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 D 1–245(245 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8BVQ E. coli BAM complex (BamABCDE) bound to darobactin B 提交 2022-12-05 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 D 20–245(226 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8PZ1 Wait Complex: Lateral open BAM bound Compact SurA 提交 2023-07-26 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 D 20–245(226 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
8PZ2 Wait Complex: Lateral open BAM bound Extended SurA 提交 2023-07-26 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 D 20–245(226 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
8PZU Wait Complex: BAM bound Darobactin-B and Compact SurA 提交 2023-07-27 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric(7) 与蛋白数一致
链 D 20–245(226 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8PZV Wait Complex: BAM bound Darobactin-B and Extended SurA 提交 2023-07-27 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric(7) 与蛋白数一致
链 D 20–245(226 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8Q0G Release Complex: BAM bound EspP and Compact SurA 提交 2023-07-28 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric(7) 与蛋白数一致
链 D 20–245(226 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
8QN4 Structure of the BAM-EspP complex in an open EspP intermediate state 提交 2023-09-25 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 D 1–245(245 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.36 Å
8QP5 Release Complex: BAM bound EspP (SurA released) 提交 2023-09-29 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 D 20–245(226 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
8QPU Release Complex: BAM bound EspP and Extended SurA 提交 2023-10-03 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric(7) 与蛋白数一致
链 D 20–245(226 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.20 Å
8QPV Handover Complex: BAM bound OmpX and extended SurA 提交 2023-10-03 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:heptameric(7) 待复核
链 D 20–245(226 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8QPW Arrival Complex: Lateral open BAM bound extended SurA plus OmpX 提交 2023-10-03 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric(7) 与蛋白数一致
链 D 20–245(226 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.30 Å
9H85 BAM-hinge (GSGS) 提交 2024-10-28 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 D 20–245(226 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
9H89 BAM-hinge (LVPR) suppressor (T434A) 提交 2024-10-28 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 D 20–245(226 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
9HE1 Structure of the Xenorceptide A2-bound E. coli BAM complex (BamABCDE) 提交 2024-11-13 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 D 1–245(245 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7;25 mM NaPi, 100 mM NaCl, pH 7.0
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE;3.5uL sample, blot time 3sec, Blotforce 1, Blot total 1,
分辨率 3.00 Å
9HG5 BAM-SurA complex in the swing-in state with full length BamC resolved 提交 2024-11-19 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 D 20–245(226 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8;20mM Tris-HCl, 150mM NaCl, 0.05% DDM
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
9HG6 BAM-SurA complex in the swing-in state 提交 2024-11-19 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 D 20–245(226 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8;20mM Tris-HCl, 150mM NaCl, 0.05% DDM
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.73 Å
9HG7 BAM-SurA complex in the swing-out state 提交 2024-11-19 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 D 20–245(226 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8;20mM Tris-HCl, 150mM NaCl, 0.05% DDM
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.83 Å
9HG8 BAM-SurA complex in the swing-out state with BamC resolved 提交 2024-11-19 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 D 20–245(226 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8;20mM Tris-HCl, 150mM NaCl, 0.05% DDM
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9HG9 BAM-SurA-darobactin complex in the swing-in state 提交 2024-11-19 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric(7) 与蛋白数一致
链 D 20–245(226 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8;20mM Tris-HCl, 150mM NaCl, 0.05% DDM
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.88 Å
9HGA BAM-SurA-darobactin complex in the swing-out state 提交 2024-11-19 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric(7) 与蛋白数一致
链 D 20–245(226 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8;20mM Tris-HCl, 150mM NaCl, 0.05% DDM
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.62 Å
9MGE beta-barrel assembly machine from Escherichia coli in an early state of substrate assembly 提交 2024-12-10 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric(7) 与蛋白数一致
链 D 20–245(226 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
9MGF beta-barrel assembly machine from Escherichia coli in a middle state of substrate assembly 提交 2024-12-10 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:heptameric(7) 与全部聚合物一致
链 D 20–245(226 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9MGG beta-barrel assembly machine from Escherichia coli in a late state of substrate assembly 提交 2024-12-10 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 D 1–245(245 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
9P1U beta-barrel assembly machine from Escherichia coli in an late state of LptD assembly 提交 2025-06-10 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 7 PDB 声明:heptameric(7) 与蛋白数一致
链 D 1–245(245 aa)
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å