当前蛋白身份：P13423
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1ACC ANTHRAX PROTECTIVE ANTIGEN 提交 1997-02-05 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
30–764（735 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6；277 K；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 12-18% PEG 8K AND 50 MM CITRATE, PH 6.0 AT 4 DEGREES C. CRYSTAL FORM ""2"" (NEEDLE-LIKE CRYSTALS)., temperature 277K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.296 |
| 1T6B Crystal structure of B. anthracis Protective Antigen complexed with human Anthrax toxin receptor 提交 2004-05-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 X
30–764（735 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 NA SODIUM ION × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 MN MANGANESE (II) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；300 K；CHES buffer, PEG400, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 300K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.266 |
| 1TZN Crystal Structure of the Anthrax Toxin Protective Antigen Heptameric Prepore bound to the VWA domain of CMG2, an anthrax toxin receptor 提交 2004-07-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric（14） 与蛋白数一致 |
链 A
203–764（562 aa）
片段：63-kDa domain
链 B
203–764（562 aa）
片段：63-kDa domain
链 C
203–764（562 aa）
片段：63-kDa domain
链 D
203–764（562 aa）
片段：63-kDa domain
链 E
203–764（562 aa）
片段：63-kDa domain
链 F
203–764（562 aa）
片段：63-kDa domain
链 O
203–764（562 aa）
片段：63-kDa domain
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 14 MG MAGNESIUM ION × 7 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；PEG 8000, sodium chloride, Tris, magnesium chloride, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 4.30 Å R-free 0.330 |
| 1TZN Crystal Structure of the Anthrax Toxin Protective Antigen Heptameric Prepore bound to the VWA domain of CMG2, an anthrax toxin receptor 提交 2004-07-10 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric（14） 与蛋白数一致 |
链 G
203–764（562 aa）
片段：63-kDa domain
链 H
203–764（562 aa）
片段：63-kDa domain
链 I
203–764（562 aa）
片段：63-kDa domain
链 J
203–764（562 aa）
片段：63-kDa domain
链 K
203–764（562 aa）
片段：63-kDa domain
链 L
203–764（562 aa）
片段：63-kDa domain
链 M
203–764（562 aa）
片段：63-kDa domain
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 14 MG MAGNESIUM ION × 7 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；PEG 8000, sodium chloride, Tris, magnesium chloride, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 4.30 Å R-free 0.330 |
| 1TZN Crystal Structure of the Anthrax Toxin Protective Antigen Heptameric Prepore bound to the VWA domain of CMG2, an anthrax toxin receptor 提交 2004-07-10 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：28-meric（28） 与蛋白数一致 |
链 A
203–764（562 aa）
片段：63-kDa domain
链 B
203–764（562 aa）
片段：63-kDa domain
链 C
203–764（562 aa）
片段：63-kDa domain
链 D
203–764（562 aa）
片段：63-kDa domain
链 E
203–764（562 aa）
片段：63-kDa domain
链 F
203–764（562 aa）
片段：63-kDa domain
链 G
203–764（562 aa）
片段：63-kDa domain
链 H
203–764（562 aa）
片段：63-kDa domain
链 I
203–764（562 aa）
片段：63-kDa domain
链 J
203–764（562 aa）
片段：63-kDa domain
链 K
203–764（562 aa）
片段：63-kDa domain
链 L
203–764（562 aa）
片段：63-kDa domain
链 M
203–764（562 aa）
片段：63-kDa domain
链 O
203–764（562 aa）
片段：63-kDa domain
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 28 MG MAGNESIUM ION × 14 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；PEG 8000, sodium chloride, Tris, magnesium chloride, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 4.30 Å R-free 0.330 |
| 1TZN Crystal Structure of the Anthrax Toxin Protective Antigen Heptameric Prepore bound to the VWA domain of CMG2, an anthrax toxin receptor 提交 2004-07-10 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：28-meric（28） 与蛋白数一致 |
链 A
203–764（562 aa）
片段：63-kDa domain
链 B
203–764（562 aa）
片段：63-kDa domain
链 C
203–764（562 aa）
片段：63-kDa domain
链 D
203–764（562 aa）
片段：63-kDa domain
链 E
203–764（562 aa）
片段：63-kDa domain
链 F
203–764（562 aa）
片段：63-kDa domain
链 G
203–764（562 aa）
片段：63-kDa domain
链 H
203–764（562 aa）
片段：63-kDa domain
链 I
203–764（562 aa）
片段：63-kDa domain
链 J
203–764（562 aa）
片段：63-kDa domain
链 K
203–764（562 aa）
片段：63-kDa domain
链 L
203–764（562 aa）
片段：63-kDa domain
链 M
203–764（562 aa）
片段：63-kDa domain
链 O
203–764（562 aa）
片段：63-kDa domain
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 28 MG MAGNESIUM ION × 14 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；PEG 8000, sodium chloride, Tris, magnesium chloride, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 4.30 Å R-free 0.330 |
| 1TZN Crystal Structure of the Anthrax Toxin Protective Antigen Heptameric Prepore bound to the VWA domain of CMG2, an anthrax toxin receptor 提交 2004-07-10 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 28 PDB 声明：28-meric（28） 与蛋白数一致 |
链 A
203–764（562 aa）
片段：63-kDa domain
链 B
203–764（562 aa）
片段：63-kDa domain
链 C
203–764（562 aa）
片段：63-kDa domain
链 D
203–764（562 aa）
片段：63-kDa domain
链 E
203–764（562 aa）
片段：63-kDa domain
链 F
203–764（562 aa）
片段：63-kDa domain
链 G
203–764（562 aa）
片段：63-kDa domain
链 H
203–764（562 aa）
片段：63-kDa domain
链 I
203–764（562 aa）
片段：63-kDa domain
链 J
203–764（562 aa）
片段：63-kDa domain
链 K
203–764（562 aa）
片段：63-kDa domain
链 L
203–764（562 aa）
片段：63-kDa domain
链 M
203–764（562 aa）
片段：63-kDa domain
链 O
203–764（562 aa）
片段：63-kDa domain
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 28 MG MAGNESIUM ION × 14 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；PEG 8000, sodium chloride, Tris, magnesium chloride, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 4.30 Å R-free 0.330 |
| 1TZO Crystal Structure of the Anthrax Toxin Protective Antigen Heptameric Prepore 提交 2004-07-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 A
203–764（562 aa）
片段：63-kDa domain
链 B
203–764（562 aa）
片段：63-kDa domain
链 C
203–764（562 aa）
片段：63-kDa domain
链 D
203–764（562 aa）
片段：63-kDa domain
链 E
203–764（562 aa）
片段：63-kDa domain
链 F
203–764（562 aa）
片段：63-kDa domain
链 O
203–764（562 aa）
片段：63-kDa domain
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 14 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.25；298 K；HEPES, sodium chloride, b-octylglucoside, spermine, pH 8.25, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.60 Å R-free 0.317 |
| 1TZO Crystal Structure of the Anthrax Toxin Protective Antigen Heptameric Prepore 提交 2004-07-10 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 G
203–764（562 aa）
片段：63-kDa domain
链 H
203–764（562 aa）
片段：63-kDa domain
链 I
203–764（562 aa）
片段：63-kDa domain
链 J
203–764（562 aa）
片段：63-kDa domain
链 K
203–764（562 aa）
片段：63-kDa domain
链 L
203–764（562 aa）
片段：63-kDa domain
链 M
203–764（562 aa）
片段：63-kDa domain
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 14 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.25；298 K；HEPES, sodium chloride, b-octylglucoside, spermine, pH 8.25, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.60 Å R-free 0.317 |
| 25PV Structure of the anthrax protective antigen in complex with a potent neutralizing antibody 提交 2026-04-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
200–626（427 aa）
|
突变：F231S | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.03 Å |
| 3ETB Crystal structure of the engineered neutralizing antibody M18 complexed with anthrax protective antigen domain 4 提交 2008-10-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 J
621–764（144 aa）
片段：Domain 4 of protective antigen PA-63: UNP residues 621-764
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；10% PEG 20000, 0.05 M Tris-HCl, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 3.80 Å R-free 0.276 |
| 3ETB Crystal structure of the engineered neutralizing antibody M18 complexed with anthrax protective antigen domain 4 提交 2008-10-07 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 K
621–764（144 aa）
片段：Domain 4 of protective antigen PA-63: UNP residues 621-764
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；10% PEG 20000, 0.05 M Tris-HCl, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 3.80 Å R-free 0.276 |
| 3ETB Crystal structure of the engineered neutralizing antibody M18 complexed with anthrax protective antigen domain 4 提交 2008-10-07 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 L
621–764（144 aa）
片段：Domain 4 of protective antigen PA-63: UNP residues 621-764
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；10% PEG 20000, 0.05 M Tris-HCl, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 3.80 Å R-free 0.276 |
| 3ETB Crystal structure of the engineered neutralizing antibody M18 complexed with anthrax protective antigen domain 4 提交 2008-10-07 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 M
621–764（144 aa）
片段：Domain 4 of protective antigen PA-63: UNP residues 621-764
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；10% PEG 20000, 0.05 M Tris-HCl, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 3.80 Å R-free 0.276 |
| 3INO 1.95A Resolution Structure of Protective Antigen Domain 4 提交 2009-08-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
624–764（141 aa）
片段：Domain 4
链 B
624–764（141 aa）
片段：Domain 4
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；277 K；20% PEG 8000, 100mM imidazole, 3% MPD, pH 6.5, vapor diffusion, temperature 277K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.258 |
| 3INO 1.95A Resolution Structure of Protective Antigen Domain 4 提交 2009-08-12 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
624–764（141 aa）
片段：Domain 4
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；277 K；20% PEG 8000, 100mM imidazole, 3% MPD, pH 6.5, vapor diffusion, temperature 277K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.258 |
| 3INO 1.95A Resolution Structure of Protective Antigen Domain 4 提交 2009-08-12 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
624–764（141 aa）
片段：Domain 4
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；277 K；20% PEG 8000, 100mM imidazole, 3% MPD, pH 6.5, vapor diffusion, temperature 277K
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.258 |
| 3J9C CryoEM single particle reconstruction of anthrax toxin protective antigen pore at 2.9 Angstrom resolution 提交 2014-12-25 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 7 PDB 声明：7-MERIC（7） 与蛋白数一致 |
链 A
203–764（562 aa）
片段：C-terminal 63-kDa fragment (UNP residues 203-764)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 14 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
50 mM NaOAc, pH 5.0, 0.05% Igepal CA-630；pH 5；50 mM NaOAc, pH 5.0, 0.05% Igepal CA-630
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Plunged into liguid nitrogen (FEI VITROBOT MARK IV).
|
分辨率 2.90 Å |
| 3J9C CryoEM single particle reconstruction of anthrax toxin protective antigen pore at 2.9 Angstrom resolution 提交 2014-12-25 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
203–764（562 aa）
片段：C-terminal 63-kDa fragment (UNP residues 203-764)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
50 mM NaOAc, pH 5.0, 0.05% Igepal CA-630；pH 5；50 mM NaOAc, pH 5.0, 0.05% Igepal CA-630
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Plunged into liguid nitrogen (FEI VITROBOT MARK IV).
|
分辨率 2.90 Å |
| 3J9C CryoEM single particle reconstruction of anthrax toxin protective antigen pore at 2.9 Angstrom resolution 提交 2014-12-25 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
203–764（562 aa）
片段：C-terminal 63-kDa fragment (UNP residues 203-764)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
50 mM NaOAc, pH 5.0, 0.05% Igepal CA-630；pH 5；50 mM NaOAc, pH 5.0, 0.05% Igepal CA-630
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Plunged into liguid nitrogen (FEI VITROBOT MARK IV).
|
分辨率 2.90 Å |
| 3KWV Structural basis for the unfolding of anthrax lethal factor by protective antigen oligomers 提交 2009-12-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
197–764（568 aa）
片段：UNP residues 197-764
链 B
197–764（568 aa）
片段：UNP residues 197-764
|
突变：V303P, H304G 突变：V303P, H304G | CA CALCIUM ION × 16 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；291 K；16% PEG 3000, 0.1M cacodylic acid, 0.2M magnesium chloride, 10 mM Tris-Cl, 75 mM sodium chloride, 10 mM adenosine-5'-triphosphate, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.281 |
| 3KWV Structural basis for the unfolding of anthrax lethal factor by protective antigen oligomers 提交 2009-12-01 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 D
197–764（568 aa）
片段：UNP residues 197-764
链 E
197–764（568 aa）
片段：UNP residues 197-764
|
突变：V303P, H304G 突变：V303P, H304G | CA CALCIUM ION × 16 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；291 K；16% PEG 3000, 0.1M cacodylic acid, 0.2M magnesium chloride, 10 mM Tris-Cl, 75 mM sodium chloride, 10 mM adenosine-5'-triphosphate, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 3.10 Å R-free 0.281 |
| 3MHZ 1.7A structure of 2-fluorohistidine labeled Protective Antigen 提交 2010-04-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
30–764（735 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8.2；293 K；30% PEG 400, 0.1M Tris, pH 8.2, vapor diffusion, temperature 293K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.222 |
| 3Q8A Crystal structure of WT Protective Antigen (pH 5.5) 提交 2011-01-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
30–764（735 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；293 K；25 %(w/v) PEG 1500, 100 mM SPG Buffer, pH 5.5, vapor diffusion, temperature 293K
|
分辨率 3.13 Å R-free 0.279 |
| 3Q8B Crystal structure of WT Protective Antigen (pH 9.0) 提交 2011-01-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
30–764（735 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 9；293 K；25 %(w/v) PEG 1500, 100 mM MMT Buffer, pH 9.0, vapor diffusion, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.258 |
| 3Q8C Crystal structure of Protective Antigen W346F (pH 5.5) 提交 2011-01-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
30–764（735 aa）
|
突变：W346F | CA CALCIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；293 K；25%(w/v) PEG 1500, 100mM SPG Buffer, pH 5.5, vapor diffusion, temperature 293K
|
分辨率 2.85 Å R-free 0.271 |
| 3Q8E Crystal structure of Protective Antigen W346F (pH 8.5) 提交 2011-01-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
30–764（735 aa）
|
突变：W346F | CA CALCIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；293 K；25%(w/v) PEG 1500, 100mM SPG Buffer, pH 8.5, vapor diffusion, temperature 293K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.248 |
| 3Q8F Crystal structure of 2-Fluorohistine labeled Protective Antigen (pH 5.8) 提交 2011-01-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
30–764（735 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7；293 K；30% PEG 400, 100mM MES, pH 7.0, vapor diffusion, temperature 293K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.267 |
| 3TEZ Crystal Structure of Anthrax Protective Antigen Mutant S337C N664C and dithiolacetone modified to 1.8-A resolution 提交 2011-08-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
30–764（735 aa）
|
突变：S337C,N664C | CA CALCIUM ION × 2 MXE 2-METHOXYETHANOL × 2 ACN ACETONE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；292 K；20% PEG-ME 2000, 0.1M Tris-Cl, 0.2M Trimethylamine-N-oxide, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
|
分辨率 1.83 Å R-free 0.226 |
| 4EE2 Crystal Structure of Anthrax Protective Antigen K446M Mutant to 1.91-A Resolution 提交 2012-03-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
30–764（735 aa）
片段：Protective antigen
|
突变：K446M | CA CALCIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；292 K；0.1M tris, 20% peg2k-MME, 0.2M TMAO, pH 8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K
|
分辨率 1.91 Å R-free 0.265 |
| 4H2A Crystal structure of wild type protective antigen to 1.62 A (pH 7.5) 提交 2012-09-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
30–764（735 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 CA CALCIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；280 K；protein crystallised from 0.1 M HEPES pH 7.5, 10 % PEG 8000, 8 % ethylene glycol by sitting drop vapour diffusion at temperature 280 K., VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
|
分辨率 1.62 Å R-free 0.219 |
| 4NAM 1.7A structure of 5-Fluoro Tryptophan Labeled Protective Antigen (W206Y) 提交 2013-10-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
30–764（735 aa）
|
突变：W206Y 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CA CALCIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；293 K；35% (v/v) Pentaerythritol propoxylate (5/4 PO/OH), 0.05 M HEPES, 0.2 M Potassium chloride, pH 7.5, vapor diffusion, temperature 293K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.208 |
| 5FR3 X-ray crystal structure of aggregation-resistant protective antigen of Bacillus anthracis (mutant S559L T576E) 提交 2015-12-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
43–764（722 aa）
|
突变：YES | CA CALCIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
20 MM MGCL2, 100 MM HEPES PH 7.5, 22% POLY(ACRYLIC ACID SODIUM SALT) 5100
|
分辨率 1.94 Å R-free 0.227 |
| 6PSN Anthrax toxin protective antigen channels bound to lethal factor 提交 2019-07-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
197–764（568 aa）
链 B
197–764（568 aa）
链 C
197–764（568 aa）
链 D
197–764（568 aa）
链 E
197–764（568 aa）
链 F
197–764（568 aa）
链 G
197–764（568 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 14 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.60 Å |
| 6UJI Low resolution crystal structure (5.5 A) of the anthrax toxin protective antigen heptamer prepore D425A mutant 提交 2019-10-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 A
197–764（568 aa）
链 B
197–764（568 aa）
链 C
197–764（568 aa）
链 D
197–764（568 aa）
链 E
197–764（568 aa）
链 F
197–764（568 aa）
链 G
197–764（568 aa）
|
突变：D425A 突变：D425A 突变：D425A 突变：D425A 突变：D425A 突变：D425A 突变：D425A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；10% (v/v) ethanol, 0.1 M Tris
|
分辨率 5.50 Å R-free 0.278 |
| 6UJI Low resolution crystal structure (5.5 A) of the anthrax toxin protective antigen heptamer prepore D425A mutant 提交 2019-10-03 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 H
197–764（568 aa）
链 I
197–764（568 aa）
链 J
197–764（568 aa）
链 K
197–764（568 aa）
链 L
197–764（568 aa）
链 M
197–764（568 aa）
链 N
197–764（568 aa）
|
突变：D425A 突变：D425A 突变：D425A 突变：D425A 突变：D425A 突变：D425A 突变：D425A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；291 K；10% (v/v) ethanol, 0.1 M Tris
|
分辨率 5.50 Å R-free 0.278 |
| 6UZB Anthrax toxin protective antigen channels bound to edema factor 提交 2019-11-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
30–764（735 aa）
链 B
30–764（735 aa）
链 C
30–764（735 aa）
链 D
30–764（735 aa）
链 E
30–764（735 aa）
链 F
30–764（735 aa）
链 G
30–764（735 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 14 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 6UZD Anthrax toxin protective antigen channels bound to edema factor 提交 2019-11-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 A
30–764（735 aa）
链 B
30–764（735 aa）
链 C
30–764（735 aa）
链 D
30–764（735 aa）
链 E
30–764（735 aa）
链 F
30–764（735 aa）
链 G
30–764（735 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 14 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 6UZE Anthrax toxin protective antigen channels bound to edema factor 提交 2019-11-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 A
30–764（735 aa）
链 B
30–764（735 aa）
链 C
30–764（735 aa）
链 D
30–764（735 aa）
链 E
30–764（735 aa）
链 F
30–764（735 aa）
链 G
30–764（735 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 14 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 6VRA Anthrax octamer prechannel bound to full-length edema factor 提交 2020-02-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
33–764（732 aa）
链 B
33–764（732 aa）
链 C
33–764（732 aa）
链 D
33–764（732 aa）
链 E
33–764（732 aa）
链 F
33–764（732 aa）
链 G
33–764（732 aa）
链 H
33–764（732 aa）
|
突变：K245G, R252N 突变：D512K 突变：K245G, R252N 突变：D512K 突变：K245G, R252N 突变：D512K 突变：K245G, R252N 突变：D512K | CA CALCIUM ION × 16 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 6WJJ Anthrax octamer prechannel bound to full-length lethal factor 提交 2020-04-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
33–764（732 aa）
链 B
33–764（732 aa）
链 C
33–764（732 aa）
链 D
33–764（732 aa）
链 E
33–764（732 aa）
链 F
33–764（732 aa）
链 G
33–764（732 aa）
链 H
33–764（732 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 16 SO4 SULFATE ION × 4 ZN ZINC ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 7KXR Protective antigen pore translocating lethal factor N-terminal domain 提交 2020-12-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
203–764（562 aa）
片段：UNP Residues 203-764
链 B
203–764（562 aa）
片段：UNP Residues 203-764
链 C
203–764（562 aa）
片段：UNP Residues 203-764
链 D
203–764（562 aa）
片段：UNP Residues 203-764
链 E
203–764（562 aa）
片段：UNP Residues 203-764
链 F
203–764（562 aa）
片段：UNP Residues 203-764
链 G
203–764（562 aa）
片段：UNP Residues 203-764
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 14 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 5.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 7O85 Anthrax toxin prepore in complex with the neutralizing Fab cAb29 提交 2021-04-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric（21） 与蛋白数一致 |
链 A
203–643（441 aa）
链 D
203–643（441 aa）
链 G
203–643（441 aa）
链 J
203–643（441 aa）
链 M
203–643（441 aa）
链 P
203–643（441 aa）
链 S
203–643（441 aa）
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 14 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |