SAXSdb — Protein Structure Search

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Main Difference Dimensions in This Set

Different construct Different assembly state Different ligand/ion Different experimental conditions Different structure-quality metrics

Difference tags compare only the current result set; every original PDB and assembly record remains separate.

Related-Structure Differences

Each row represents one biological assembly in one PDB entry; multiple monomers of the same protein are listed separately.

PDB Entry	Assembly / Oligomeric State	Construct	Mutations and Modifications	Ligands, Ions and Non-polymers	Experimental Method	Experimental Conditions	Structure Quality
7BGL Salmonella LP ring 26 mer refined in C26 map Deposited 2021-01-07	Assembly 1 Protein heterocomplex Heteromer；Protein × 78 PDB declaration: 78-meric（78） Consistent with protein count	Chain a 1–365（365 aa） Chain b 1–365（365 aa） Chain c 1–365（365 aa） Chain d 1–365（365 aa） Chain e 1–365（365 aa） Chain f 1–365（365 aa） Chain g 1–365（365 aa） Chain h 1–365（365 aa） Chain i 1–365（365 aa） Chain j 1–365（365 aa） Chain k 1–365（365 aa） Chain l 1–365（365 aa） Chain m 1–365（365 aa） Chain n 1–365（365 aa） Chain o 1–365（365 aa） Chain p 1–365（365 aa） Chain q 1–365（365 aa） Chain r 1–365（365 aa） Chain s 1–365（365 aa） Chain t 1–365（365 aa） Chain u 1–365（365 aa） Chain v 1–365（365 aa） Chain w 1–365（365 aa） Chain x 1–365（365 aa） Chain y 1–365（365 aa） Chain z 1–365（365 aa）	Not recorded	TLW (2~{R},4~{R},5~{R},6~{R})-6-[(1~{R})-1,2-bis(oxidanyl)ethyl]-4,5-bis(oxidanyl)oxane-2-carboxylic acid × 26 TQN [(3~{R})-1-[[(2~{R},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-6-[[(2~{R},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-[[(3~{R})-3-dodecanoyloxytetradecanoyl]amino]-6-(hydroxymethyl)-5-phosphonooxy-4-[(3~{R})-3-tetradecanoyloxytetradecanoyl]oxy-oxan-2-yl]oxymethyl]-5-oxidanyl-4-[(3~{R})-3-oxidanyltetradecanoyl]oxy-2-phosphonooxy-oxan-3-yl]amino]-1-oxidanylidene-tetradecan-3-yl] hexadecanoate × 26	ELECTRON MICROSCOPY	cryo-EM buffer pH 8 cryo-EM vitrification conditions Cryogen ETHANE	Resolution 2.20 Å
7BJ2 Salmonella flagellar basal body assembly intermediate - P ring alone structure Deposited 2021-01-13	Assembly 1 Protein homooligomer Homooligomer；Protein × 26 PDB declaration: 26-meric（26） Consistent with protein count	Chain a 1–365（365 aa） Chain b 1–365（365 aa） Chain c 1–365（365 aa） Chain d 1–365（365 aa） Chain e 1–365（365 aa） Chain f 1–365（365 aa） Chain g 1–365（365 aa） Chain h 1–365（365 aa） Chain i 1–365（365 aa） Chain j 1–365（365 aa） Chain k 1–365（365 aa） Chain l 1–365（365 aa） Chain m 1–365（365 aa） Chain n 1–365（365 aa） Chain o 1–365（365 aa） Chain p 1–365（365 aa） Chain q 1–365（365 aa） Chain r 1–365（365 aa） Chain s 1–365（365 aa） Chain t 1–365（365 aa） Chain u 1–365（365 aa） Chain v 1–365（365 aa） Chain w 1–365（365 aa） Chain x 1–365（365 aa） Chain y 1–365（365 aa） Chain z 1–365（365 aa）	Not recorded	No recorded non-water small molecule	ELECTRON MICROSCOPY	cryo-EM buffer pH 8 cryo-EM vitrification conditions Cryogen ETHANE	Resolution 3.00 Å
7CBL Cryo-EM structure of the flagellar LP ring from Salmonella Deposited 2020-06-12	Assembly 1 Protein heterocomplex Heteromer；Protein × 52 PDB declaration: 52-meric（52） Consistent with protein count	Chain a 1–365（365 aa） Chain b 1–365（365 aa） Chain c 1–365（365 aa） Chain d 1–365（365 aa） Chain e 1–365（365 aa） Chain f 1–365（365 aa） Chain g 1–365（365 aa） Chain h 1–365（365 aa） Chain i 1–365（365 aa） Chain j 1–365（365 aa） Chain k 1–365（365 aa） Chain l 1–365（365 aa） Chain m 1–365（365 aa） Chain n 1–365（365 aa） Chain o 1–365（365 aa） Chain p 1–365（365 aa） Chain q 1–365（365 aa） Chain r 1–365（365 aa） Chain s 1–365（365 aa） Chain t 1–365（365 aa） Chain u 1–365（365 aa） Chain v 1–365（365 aa） Chain w 1–365（365 aa） Chain x 1–365（365 aa） Chain y 1–365（365 aa） Chain z 1–365（365 aa）	Not recorded	OCA OCTANOIC ACID (CAPRYLIC ACID) × 26	ELECTRON MICROSCOPY	cryo-EM buffer pH 8 cryo-EM vitrification conditions Cryogen ETHANE；blot for 6 seconds before plunging	Resolution 2.80 Å
7CGO Cryo-EM structure of the flagellar motor-hook complex from Salmonella Deposited 2020-07-01	Assembly 1 Protein heterocomplex Heteromer；Protein × 219 PDB declaration: 219-meric（219） Consistent with protein count	Chain BA 1–365（365 aa） Chain BB 1–365（365 aa） Chain BC 1–365（365 aa） Chain BD 1–365（365 aa） Chain BE 1–365（365 aa） Chain BF 1–365（365 aa） Chain BG 1–365（365 aa） Chain BH 1–365（365 aa） Chain BI 1–365（365 aa） Chain BJ 1–365（365 aa） Chain BK 1–365（365 aa） Chain BL 1–365（365 aa） Chain BM 1–365（365 aa） Chain BN 1–365（365 aa） Chain BO 1–365（365 aa） Chain BP 1–365（365 aa） Chain BQ 1–365（365 aa） Chain BR 1–365（365 aa） Chain BS 1–365（365 aa） Chain BT 1–365（365 aa） Chain BU 1–365（365 aa） Chain BV 1–365（365 aa） Chain BW 1–365（365 aa） Chain BX 1–365（365 aa） Chain BY 1–365（365 aa） Chain BZ 1–365（365 aa）	Not recorded	No recorded non-water small molecule	ELECTRON MICROSCOPY	cryo-EM buffer pH 8 cryo-EM vitrification conditions Cryogen ETHANE；blot for 6 seconds before plunging	Resolution 3.90 Å
8WHT Cryo-EM structure of the LP ring within the flagellar motor-hook complex in the CW state Deposited 2023-09-23	Assembly 1 Protein heterocomplex Heteromer；Protein × 52 PDB declaration: 52-meric（52） Consistent with protein count	Chain a 1–365（365 aa） Chain b 1–365（365 aa） Chain c 1–365（365 aa） Chain d 1–365（365 aa） Chain e 1–365（365 aa） Chain f 1–365（365 aa） Chain g 1–365（365 aa） Chain h 1–365（365 aa） Chain i 1–365（365 aa） Chain j 1–365（365 aa） Chain k 1–365（365 aa） Chain l 1–365（365 aa） Chain m 1–365（365 aa） Chain n 1–365（365 aa） Chain o 1–365（365 aa） Chain p 1–365（365 aa） Chain q 1–365（365 aa） Chain r 1–365（365 aa） Chain s 1–365（365 aa） Chain t 1–365（365 aa） Chain u 1–365（365 aa） Chain v 1–365（365 aa） Chain w 1–365（365 aa） Chain x 1–365（365 aa） Chain y 1–365（365 aa） Chain z 1–365（365 aa）	Not recorded	No recorded non-water small molecule	ELECTRON MICROSCOPY	cryo-EM buffer pH 8 cryo-EM vitrification conditions Cryogen ETHANE；Blot time: 4 Blot force: 10 Wait time: 30 Blot total: 1 Drain time: 2	Resolution 2.75 Å
8WL2 Cryo-EM structure of the membrane-anchored part of the flagellar motor-hook complex in the CW state. Deposited 2023-09-29	Assembly 1 Protein heterocomplex Heteromer；Protein × 213 PDB declaration: 213-meric（213） Consistent with protein count	Chain a 1–365（365 aa） Chain b 1–365（365 aa） Chain c 1–365（365 aa） Chain d 1–365（365 aa） Chain e 1–365（365 aa） Chain f 1–365（365 aa） Chain g 1–365（365 aa） Chain h 1–365（365 aa） Chain i 1–365（365 aa） Chain j 1–365（365 aa） Chain k 1–365（365 aa） Chain l 1–365（365 aa） Chain m 1–365（365 aa） Chain n 1–365（365 aa） Chain o 1–365（365 aa） Chain p 1–365（365 aa） Chain q 1–365（365 aa） Chain r 1–365（365 aa） Chain s 1–365（365 aa） Chain t 1–365（365 aa） Chain u 1–365（365 aa） Chain v 1–365（365 aa） Chain w 1–365（365 aa） Chain x 1–365（365 aa） Chain y 1–365（365 aa） Chain z 1–365（365 aa）	Not recorded	No recorded non-water small molecule	ELECTRON MICROSCOPY	cryo-EM buffer pH 8 cryo-EM vitrification conditions Cryogen ETHANE；Blot time: 4 Blot force: 10 Wait time: 30 Blot total: 1 Drain time: 2	Resolution 3.40 Å
8WLE Cryo-EM structure of the LP ring within the flagellar motor-hook complex in the CCW state. Deposited 2023-09-29	Assembly 1 Protein heterocomplex Heteromer；Protein × 52 PDB declaration: 52-meric（52） Consistent with protein count	Chain a 1–365（365 aa） Chain b 1–365（365 aa） Chain c 1–365（365 aa） Chain d 1–365（365 aa） Chain e 1–365（365 aa） Chain f 1–365（365 aa） Chain g 1–365（365 aa） Chain h 1–365（365 aa） Chain i 1–365（365 aa） Chain j 1–365（365 aa） Chain k 1–365（365 aa） Chain l 1–365（365 aa） Chain m 1–365（365 aa） Chain n 1–365（365 aa） Chain o 1–365（365 aa） Chain p 1–365（365 aa） Chain q 1–365（365 aa） Chain r 1–365（365 aa） Chain s 1–365（365 aa） Chain t 1–365（365 aa） Chain u 1–365（365 aa） Chain v 1–365（365 aa） Chain w 1–365（365 aa） Chain x 1–365（365 aa） Chain y 1–365（365 aa） Chain z 1–365（365 aa）	Not recorded	No recorded non-water small molecule	ELECTRON MICROSCOPY	cryo-EM buffer pH 8 cryo-EM vitrification conditions Cryogen ETHANE；Blot time: 2 Blot force: -15 Wait time: 60 Blot total: 1	Resolution 3.00 Å
8WLT Cryo-EM structure of the membrane-anchored part of the flagellar motor-hook complex in the CCW state Deposited 2023-10-01	Assembly 1 Protein heterocomplex Heteromer；Protein × 213 PDB declaration: 213-meric（213） Consistent with protein count	Chain a 1–365（365 aa） Chain b 1–365（365 aa） Chain c 1–365（365 aa） Chain d 1–365（365 aa） Chain e 1–365（365 aa） Chain f 1–365（365 aa） Chain g 1–365（365 aa） Chain h 1–365（365 aa） Chain i 1–365（365 aa） Chain j 1–365（365 aa） Chain k 1–365（365 aa） Chain l 1–365（365 aa） Chain m 1–365（365 aa） Chain n 1–365（365 aa） Chain o 1–365（365 aa） Chain p 1–365（365 aa） Chain q 1–365（365 aa） Chain r 1–365（365 aa） Chain s 1–365（365 aa） Chain t 1–365（365 aa） Chain u 1–365（365 aa） Chain v 1–365（365 aa） Chain w 1–365（365 aa） Chain x 1–365（365 aa） Chain y 1–365（365 aa） Chain z 1–365（365 aa）	Not recorded	No recorded non-water small molecule	ELECTRON MICROSCOPY	cryo-EM buffer pH 8 cryo-EM vitrification conditions Cryogen ETHANE；Blot time: 2 Blot force: -15 Wait time: 60 Blot total: 1	Resolution 4.10 Å
8WO5 Cryo-EM structure of the intact flagellar motor-hook complex in the CCW state Deposited 2023-10-06	Assembly 1 Protein heterocomplex Heteromer；Protein × 417 PDB declaration: 417-meric（417） Consistent with protein count	Chain a 1–365（365 aa） Chain b 1–365（365 aa） Chain c 1–365（365 aa） Chain d 1–365（365 aa） Chain e 1–365（365 aa） Chain f 1–365（365 aa） Chain g 1–365（365 aa） Chain h 1–365（365 aa） Chain i 1–365（365 aa） Chain j 1–365（365 aa） Chain k 1–365（365 aa） Chain l 1–365（365 aa） Chain m 1–365（365 aa） Chain n 1–365（365 aa） Chain o 1–365（365 aa） Chain p 1–365（365 aa） Chain q 1–365（365 aa） Chain r 1–365（365 aa） Chain s 1–365（365 aa） Chain t 1–365（365 aa） Chain u 1–365（365 aa） Chain v 1–365（365 aa） Chain w 1–365（365 aa） Chain x 1–365（365 aa） Chain y 1–365（365 aa） Chain z 1–365（365 aa）	Not recorded	No recorded non-water small molecule	ELECTRON MICROSCOPY	cryo-EM buffer pH 8 cryo-EM vitrification conditions Cryogen ETHANE；Blot time: 2 Blot force: -5 Wait time: 5 Blot total: 1 Drain time: 2	Resolution 7.40 Å
8WOE Cryo-EM structure of the intact flagellar motor-hook complex in the CW state Deposited 2023-10-07	Assembly 1 Protein heterocomplex Heteromer；Protein × 451 PDB declaration: 451-meric（451） Consistent with protein count	Chain a 1–365（365 aa） Chain b 1–365（365 aa） Chain c 1–365（365 aa） Chain d 1–365（365 aa） Chain e 1–365（365 aa） Chain f 1–365（365 aa） Chain g 1–365（365 aa） Chain h 1–365（365 aa） Chain i 1–365（365 aa） Chain j 1–365（365 aa） Chain k 1–365（365 aa） Chain l 1–365（365 aa） Chain m 1–365（365 aa） Chain n 1–365（365 aa） Chain o 1–365（365 aa） Chain p 1–365（365 aa） Chain q 1–365（365 aa） Chain r 1–365（365 aa） Chain s 1–365（365 aa） Chain t 1–365（365 aa） Chain u 1–365（365 aa） Chain v 1–365（365 aa） Chain w 1–365（365 aa） Chain x 1–365（365 aa） Chain y 1–365（365 aa） Chain z 1–365（365 aa）	Not recorded	No recorded non-water small molecule	ELECTRON MICROSCOPY	cryo-EM buffer pH 8 cryo-EM vitrification conditions Cryogen ETHANE；Blot time: 4 Blot force: 10 Wait time: 30 Blot total: 1 Drain time: 2	Resolution 4.30 Å
9IYC P ring on polyrod-P ring complex from Salmonella TH26292 strain Deposited 2024-07-30	Assembly 1 Protein homooligomer Homooligomer；Protein × 26 PDB declaration: 26-meric（26） Consistent with protein count	Chain A 20–365（346 aa） Chain B 20–365（346 aa） Chain C 20–365（346 aa） Chain D 20–365（346 aa） Chain E 20–365（346 aa） Chain F 20–365（346 aa） Chain G 20–365（346 aa） Chain H 20–365（346 aa） Chain I 20–365（346 aa） Chain J 20–365（346 aa） Chain K 20–365（346 aa） Chain L 20–365（346 aa） Chain M 20–365（346 aa） Chain N 20–365（346 aa） Chain O 20–365（346 aa） Chain P 20–365（346 aa） Chain Q 20–365（346 aa） Chain R 20–365（346 aa） Chain S 20–365（346 aa） Chain T 20–365（346 aa） Chain U 20–365（346 aa） Chain V 20–365（346 aa） Chain W 20–365（346 aa） Chain X 20–365（346 aa） Chain Y 20–365（346 aa） Chain Z 20–365（346 aa）	Not recorded	No recorded non-water small molecule	ELECTRON MICROSCOPY	cryo-EM buffer pH 8 cryo-EM vitrification conditions Cryogen ETHANE；BLOTTING TIME OF 4 SECONDS, 1 SECONDS DRAIN TIME, FORCE 0	Resolution 2.33 Å

Protein Structures and Oligomeric States

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