当前蛋白身份：P17427
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1B9K ALPHA-ADAPTIN APPENDAGE DOMAIN, FROM CLATHRIN ADAPTOR AP2 提交 1999-02-11 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
701–938（238 aa）
片段：APPENDAGE DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6；20% PEG 4000, 10% ISOPROPANOL, 100MM NA CITRATE PH 6.0, 10MM DTT, 6MG/ML PROTEIN
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.221 |
| 1KY6 AP-2 CLATHRIN ADAPTOR ALPHA-APPENDAGE IN COMPLEX WITH EPSIN DPW PEPTIDE 提交 2002-02-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
701–938（238 aa）
片段：C-TERMINAL APPENDAGE (EAR) RESIDUES 701-938
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.00 Å R-free 0.245 |
| 1KY7 THE AP-2 CLATHRIN ADAPTOR ALPHA-APPENDAGE IN COMPLEX WITH AMPHIPHYSIN FXDXF 提交 2002-02-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
701–938（238 aa）
片段：C-TERMINAL APPENDAGE (EAR) RESIDUES 701-938
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.15 Å R-free 0.252 |
| 1KYD AP-2 CLATHRIN ADAPTOR ALPHA-APPENDAGE IN COMPLEX WITH EPSIN DPW PEPTIDE 提交 2002-02-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
701–938（238 aa）
片段：C-TERMINAL APPENDAGE (EAR), RESIDUES 701-938
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.00 Å R-free 0.228 |
| 1KYF AP-2 CLATHRIN ADAPTOR ALPHA-APPENDAGE IN COMPLEX WITH EPS15 DPF PEPTIDE 提交 2002-02-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
701–938（238 aa）
片段：C-TERMINAL APPENDAGE (EAR) RESIDUES 701-938
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.22 Å R-free 0.211 |
| 1KYU AP-2 CLATHRIN ADAPTOR ALPHA-APPENDAGE IN COMPLEX WITH EPS15 DPF PEPTIDE 提交 2002-02-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
701–938（238 aa）
片段：C-TERMINAL APPENDAGE (EAR) RESIDUES 701-938
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.80 Å R-free 0.223 |
| 1QTP CRYSTAL STRUCTURE OF THE AP-2 CLATHRIN ADAPTOR ALPHA-APPENDAGE 提交 1999-06-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
692–938（247 aa）
片段：C-TERMINAL APPENDAGE (EAR) RESIDUES 701-938
|
突变：SELENOMETHIONINE SUBSTITUTED PROTEIN 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；293 K；1.5 M MAGNESIUM SULFATE, 100 MM MES, 10MM SPERMINE TETRA-HCL, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.211 |
| 1QTS CRYSTAL STRUCTURE OF THE AP-2 CLATHRIN ADAPTOR ALPHA-APPENDAGE 提交 1999-06-29 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
692–938（247 aa）
片段：C-TERMINAL APPENDAGE (EAR) RESIDUES 701-938
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；293 K；1.3 M AMMONIUM SULFATE, 80 MM HEPES, 8% DIOXANE, pH 6.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.209 |
| 1W80 Crystal structure of the alpha-adaptin appendage domain, from the AP2 adaptor complex, bound to 2 peptides from Synaptojanin170 提交 2004-09-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
695–938（244 aa）
片段：APPENDAGE DOMAIN, RESIDUES 695-938
|
未记录 | BEN BENZAMIDINE × 1 CO3 CARBONATE ION × 3 DTD DITHIANE DIOL × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；1.2M AMMONIUM SULFATE, 3% ISOPROPANOL, 0.05M SODIUM CITRATE, pH 6.50
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.224 |
| 2JKR AP2 CLATHRIN ADAPTOR CORE with Dileucine peptide RM(phosphoS)QIKRLLSE 提交 2008-08-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
1–271（271 aa）
片段：ALPHA CHAIN, RESIDUES 1-620
链 A
272–620（349 aa）
片段：ALPHA CHAIN, RESIDUES 1-620
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 14 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；1.7-2.2M AMMONIUM SULPHATE, 100MM SODIUM CITRATE PH6 .5 AND 5MM DTT FROM A MIXTURE OF 10MG/ML AP2 CORE AND 7MG/ML PEPTIDE. CRYOPROTECTED WITH 1.8-2.3M AMMONIUM SULPHATE, 100MM SODIUM CITRATE PH 6.5, 17% GLYCEROL AND 7MG/ ML CD4 DILEUCINE PEPTIDE
|
分辨率 2.98 Å R-free 0.260 |
| 2JKR AP2 CLATHRIN ADAPTOR CORE with Dileucine peptide RM(phosphoS)QIKRLLSE 提交 2008-08-29 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 L
1–271（271 aa）
片段：ALPHA CHAIN, RESIDUES 1-620
链 L
272–620（349 aa）
片段：ALPHA CHAIN, RESIDUES 1-620
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 17 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；1.7-2.2M AMMONIUM SULPHATE, 100MM SODIUM CITRATE PH6 .5 AND 5MM DTT FROM A MIXTURE OF 10MG/ML AP2 CORE AND 7MG/ML PEPTIDE. CRYOPROTECTED WITH 1.8-2.3M AMMONIUM SULPHATE, 100MM SODIUM CITRATE PH 6.5, 17% GLYCEROL AND 7MG/ ML CD4 DILEUCINE PEPTIDE
|
分辨率 2.98 Å R-free 0.260 |
| 2JKT AP2 CLATHRIN ADAPTOR CORE with CD4 Dileucine peptide RM(phosphoS) EIKRLLSE Q to E mutant 提交 2008-08-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
1–271（271 aa）
片段：ALPHA CHAIN, RESIDUES 1-620
链 A
272–620（349 aa）
片段：ALPHA CHAIN, RESIDUES 1-620
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 15 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；1.7-2.2M AMMONIUM SULPHATE, 100MM SODIUM CITRATE PH6 .5 AND 5MM DTT FROM A MIXTURE OF 10MG/ML AP2 CORE AND 7MG/ML PEPTIDE. CRYOPROTECTED WITH 1.8-2.3M AMMONIUM SULPHATE, 100MM SODIUM CITRATE PH 6.5, 17% GLYCEROL AND 7MG/ ML CD4 DILEUCINE PEPTIDE
|
分辨率 3.40 Å R-free 0.256 |
| 2JKT AP2 CLATHRIN ADAPTOR CORE with CD4 Dileucine peptide RM(phosphoS) EIKRLLSE Q to E mutant 提交 2008-08-29 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 L
1–271（271 aa）
片段：ALPHA CHAIN, RESIDUES 1-620
链 L
272–620（349 aa）
片段：ALPHA CHAIN, RESIDUES 1-620
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 16 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；1.7-2.2M AMMONIUM SULPHATE, 100MM SODIUM CITRATE PH6 .5 AND 5MM DTT FROM A MIXTURE OF 10MG/ML AP2 CORE AND 7MG/ML PEPTIDE. CRYOPROTECTED WITH 1.8-2.3M AMMONIUM SULPHATE, 100MM SODIUM CITRATE PH 6.5, 17% GLYCEROL AND 7MG/ ML CD4 DILEUCINE PEPTIDE
|
分辨率 3.40 Å R-free 0.256 |
| 2VJ0 Crystal structure of the alpha-adaptin appendage domain, from the AP2 adaptor complex, in complex with an FXDNF peptide from amphiphysin1 and a WVXF peptide from synaptojanin P170 提交 2007-12-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
693–938（246 aa）
片段：APPENDAGE DOMAIN, RESIDUES 693-938
|
未记录 | BEN BENZAMIDINE × 1 DTD DITHIANE DIOL × 1 SO4 SULFATE ION × 3 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；1.2M AMMONIUM SULPHATE, 3% ISOPROPANOL AND 0.05M SODIUM CITRATE PH 6.5
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.208 |
| 7OHI FCHO1-peptide-AP2 alpha ear complex 提交 2021-05-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
695–938（244 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 5 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；289 K；1.6M Magnesium sulfate
heptahydrate 0.1M MES pH 6.5. The crystal were subsequently cryo-protected with ~20% glycerol final.
|
分辨率 1.41 Å R-free 0.215 |
| 7RW8 AP2 bound to heparin in the closed conformation 提交 2021-08-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–620（620 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE；Blot force -10, 4 second blot, 4 uL sample
|
分辨率 3.50 Å |
| 7RW9 AP2 bound to heparin in the bowl conformation 提交 2021-08-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–620（620 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE；Blot force -10, 4 second blot, 4 uL sample
|
分辨率 3.90 Å |
| 7RWA AP2 bound to heparin and Tgn38 tyrosine cargo peptide 提交 2021-08-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 A
1–620（620 aa）
链 a
1–620（620 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE；Blot force -10, 4 second blot, 4 uL sample
|
分辨率 4.70 Å |
| 7RWB AP2 bound to the APA domain of SGIP in the presence of heparin 提交 2021-08-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–620（620 aa）
链 a
1–620（620 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE；Blot force -10, 4 second blot, 4 uL sample
|
分辨率 3.90 Å |
| 7RWC AP2 bound to the APA domain of SGIP and heparin; partial signal subtraction and symmetry expansion 提交 2021-08-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
1–620（620 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE；Blot force -10, 4 second blot, 4 uL sample
|
分辨率 3.80 Å |
| 8T1O AP2 bound to MSP2N2 nanodisc with Tgn38 cargo peptide; composite map 提交 2023-06-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
1–620（620 aa）
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未记录 | PIO [(2R)-2-octanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phosphoryl]oxy-propyl] octanoate × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；20 mM HEPES pH 7.4, 100 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE；Two applications of sample.
|
分辨率 3.30 Å |
| 9PPP Structure of Alpha Appendage of AP2 bound to the extended FxDxF motif derived of CCDC32 提交 2025-07-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
695–938（244 aa）
|
未记录 | 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM SPG pH 8.0, 25% PEG 1500
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.205 |
| 9PPP Structure of Alpha Appendage of AP2 bound to the extended FxDxF motif derived of CCDC32 提交 2025-07-21 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
695–938（244 aa）
|
未记录 | 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM SPG pH 8.0, 25% PEG 1500
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.205 |
| 9PUE Structure of Alpha Appendage of AP2 bound to the FxDxF motif derived of CCDC32 提交 2025-07-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
695–938（244 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；40% isopropanol, 100 mM imidazole pH 6.5, 15% PEG 8000
|
分辨率 1.91 Å R-free 0.230 |
| 9PWA Closed AP-2 clathrin adaptor complex in solution 提交 2025-08-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–620（620 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 2.55 Å |
| 9PWB Structure of AP-2 bound to the dileucine motif of CCDC32; combined map 提交 2025-08-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
9–620（612 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 2.64 Å |
| 9PWC Composite structure of AP-2 bound to the dileucine motif and WxxPhi motif of CCDC32 提交 2025-08-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
1–620（620 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.00 Å |