当前蛋白身份:P19235 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
1CN4 ERYTHROPOIETIN COMPLEXED WITH EXTRACELLULAR DOMAINS OF ERYTHROPOIETIN RECEPTOR 提交 1999-05-25 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 25–249(225 aa) 片段:EXTRACELLULAR LIGAND BINDING DOMAINS
链 B 25–249(225 aa) 片段:EXTRACELLULAR LIGAND BINDING DOMAINS
突变:N52Q, N164Q, A211E 突变:N52Q, N164Q, A211E 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5;pH 6.50
分辨率 2.80 Å R-free 0.336
1EBA COMPLEX BETWEEN THE EXTRACELLULAR DOMAIN OF ERYTHROPOIETIN (EPO) RECEPTOR [EBP] AND AN INACTIVE PEPTIDE [EMP33] CONTAINS 3,5-DIBROMOTYROSINE IN POSITION 4 (DENOTED DBY) 提交 1998-10-02 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 34–248(215 aa) 片段:EXTRACELLULAR DOMAIN
链 B 34–248(215 aa) 片段:EXTRACELLULAR DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6;pH 6.0
分辨率 2.70 Å R-free 0.299
1EBA COMPLEX BETWEEN THE EXTRACELLULAR DOMAIN OF ERYTHROPOIETIN (EPO) RECEPTOR [EBP] AND AN INACTIVE PEPTIDE [EMP33] CONTAINS 3,5-DIBROMOTYROSINE IN POSITION 4 (DENOTED DBY) 提交 1998-10-02 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 34–248(215 aa) 片段:EXTRACELLULAR DOMAIN
链 B 34–248(215 aa) 片段:EXTRACELLULAR DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6;pH 6.0
分辨率 2.70 Å R-free 0.299
1EBA COMPLEX BETWEEN THE EXTRACELLULAR DOMAIN OF ERYTHROPOIETIN (EPO) RECEPTOR [EBP] AND AN INACTIVE PEPTIDE [EMP33] CONTAINS 3,5-DIBROMOTYROSINE IN POSITION 4 (DENOTED DBY) 提交 1998-10-02 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 34–248(215 aa) 片段:EXTRACELLULAR DOMAIN
链 B 34–248(215 aa) 片段:EXTRACELLULAR DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6;pH 6.0
分辨率 2.70 Å R-free 0.299
1EBP COMPLEX BETWEEN THE EXTRACELLULAR DOMAIN OF ERYTHROPOIETIN (EPO) RECEPTOR [EBP] AND AN AGONIST PEPTIDE [EMP1] 提交 1996-05-07 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 A 34–244(211 aa) 片段:EXTRACELLULAR DOMAIN
链 B 34–244(211 aa) 片段:EXTRACELLULAR DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.80 Å R-free 0.334
1EER CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN ERYTHROPOIETIN COMPLEXED TO ITS RECEPTOR AT 1.9 ANGSTROMS 提交 1998-07-24 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 B 31–250(220 aa) 片段:EXTRACELLULAR DOMAIN
链 C 31–250(220 aa) 片段:EXTRACELLULAR DOMAIN
突变:N52Q, N164Q, A211E 突变:N52Q, N164Q, A211E 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5;pH 6.50
分辨率 1.90 Å R-free 0.318
1ERN NATIVE STRUCTURE OF THE EXTRACELLULAR DOMAIN OF ERYTHROPOIETIN (EPO) RECEPTOR [EBP] 提交 1999-01-11 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 34–246(213 aa) 片段:EXTRACELLULAR DOMAIN
链 B 34–246(213 aa) 片段:EXTRACELLULAR DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.7;pH 7.7
分辨率 2.40 Å R-free 0.295
2JIX Crystal structure of ABT-007 FAB fragment with the soluble domain of EPO receptor 提交 2007-07-02 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 C 25–249(225 aa) 片段:EPO RECEPTOR SOLUBLE DOMAIN, RESIDUES 25-249
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.20 Å R-free 0.323
2JIX Crystal structure of ABT-007 FAB fragment with the soluble domain of EPO receptor 提交 2007-07-02 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 B 25–249(225 aa) 片段:EPO RECEPTOR SOLUBLE DOMAIN, RESIDUES 25-249
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.20 Å R-free 0.323
2JIX Crystal structure of ABT-007 FAB fragment with the soluble domain of EPO receptor 提交 2007-07-02 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 E 25–249(225 aa) 片段:EPO RECEPTOR SOLUBLE DOMAIN, RESIDUES 25-249
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.20 Å R-free 0.323
2MV6 Solution structure of the transmembrane domain and the juxta-membrane domain of the Erythropoietin Receptor in micelles 提交 2014-09-23 Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致
链 A 237–284(48 aa) 片段:UNP residues 237-284
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5;313 K;离子强度(mmCIF原始值)20;压力 ambient
NMR样品组成 20 mM sodium phosphate, 10 v/v D2O, 250 mM DPC, 0.5 mM [U-99% 15N] protein, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.5-1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] protein, 10 % D2O, 20 mM sodium phosphate, 200-400 mM DPC, 1 mM DTT, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
4Y5V Diabody 305 complex with EpoR 提交 2015-02-12 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 C 32–249(218 aa)
链 F 32–249(218 aa)
突变:N52Q, N164Q 突变:N52Q, N164Q GOL GLYCEROL × 10 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;293 K;HEPES, PEG 4000
分辨率 2.60 Å R-free 0.229
4Y5V Diabody 305 complex with EpoR 提交 2015-02-12 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 I 32–249(218 aa)
突变:N52Q, N164Q GOL GLYCEROL × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;293 K;HEPES, PEG 4000
分辨率 2.60 Å R-free 0.229
4Y5X Diabody 305 complex with EpoR 提交 2015-02-12 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 C 32–249(218 aa)
链 L 32–249(218 aa)
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 12 FLC CITRATE ANION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 7;293 K;sodium citrate, PEG 8000
分辨率 3.15 Å R-free 0.241
4Y5X Diabody 305 complex with EpoR 提交 2015-02-12 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 F 32–249(218 aa)
链 I 32–249(218 aa)
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 7;293 K;sodium citrate, PEG 8000
分辨率 3.15 Å R-free 0.241
4Y5Y Diabody 330 complex with EpoR 提交 2015-02-12 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致
链 C 32–249(218 aa)
链 F 32–249(218 aa)
突变:N76Q, N188Q, D247L, and L248D 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 突变:N76Q, N188Q, D247L, and L248D 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 7;293 K;Magnesium chloride, Tris, PEG 8000
分辨率 2.85 Å R-free 0.241
6E2Q Structure of human JAK2 FERM/SH2 in complex with Erythropoietin Receptor 提交 2018-07-11 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 N 273–338(66 aa) 片段:UNP residues 273-338
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.6;277.15 K;100 mM Tris, pH 7.6, 2-4% PEG8000
分辨率 2.65 Å R-free 0.263
6E2Q Structure of human JAK2 FERM/SH2 in complex with Erythropoietin Receptor 提交 2018-07-11 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 O 273–338(66 aa) 片段:UNP residues 273-338
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.6;277.15 K;100 mM Tris, pH 7.6, 2-4% PEG8000
分辨率 2.65 Å R-free 0.263
6E2Q Structure of human JAK2 FERM/SH2 in complex with Erythropoietin Receptor 提交 2018-07-11 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 M 273–338(66 aa) 片段:UNP residues 273-338
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.6;277.15 K;100 mM Tris, pH 7.6, 2-4% PEG8000
分辨率 2.65 Å R-free 0.263
6E2Q Structure of human JAK2 FERM/SH2 in complex with Erythropoietin Receptor 提交 2018-07-11 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 P 273–338(66 aa) 片段:UNP residues 273-338
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.6;277.15 K;100 mM Tris, pH 7.6, 2-4% PEG8000
分辨率 2.65 Å R-free 0.263
6MOE Monomeric DARPin E2 complex with EpoR 提交 2018-10-04 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 D 32–249(218 aa)
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 5 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 5.6;295 K;1 M sodium potassium phosphate pH 5.6 Cryoprotected in 25% ethylene glycol
分辨率 2.09 Å R-free 0.230
6MOE Monomeric DARPin E2 complex with EpoR 提交 2018-10-04 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 C 32–249(218 aa)
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 5.6;295 K;1 M sodium potassium phosphate pH 5.6 Cryoprotected in 25% ethylene glycol
分辨率 2.09 Å R-free 0.230
6MOF Monomeric DARPin G2 complex with EpoR 提交 2018-10-04 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 32–249(218 aa)
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION;pH 7;295 K;0.2 M Magnesium chloride, 0.1 M Tris pH 7.0, 10% PEG 8000, 25% ethylene glycol as cryoprotectant
分辨率 2.89 Å R-free 0.266
6MOH Dimeric DARPin C_R3 complex with EpoR 提交 2018-10-04 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 C 32–249(218 aa)
链 D 32–249(218 aa)
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 7 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.3;295 K;0.1 M HEPES pH 7.3, 1.4 M sodium potassium phosphate, 24% glycerol cryoprotectant
分辨率 3.20 Å R-free 0.277
6MOI Dimeric DARPin C_angle_R5 complex with EpoR 提交 2018-10-04 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 B 32–249(218 aa)
未记录 SO4 SULFATE ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 20 MG MAGNESIUM ION × 4 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;295 K;0.3 M magnesium sulfate, 0.1 M bis-tris propane pH 7, 22.5% PurePEGs cocktail (Anatrace), 30% ethylene glycol cryoprotectant
分辨率 2.06 Å R-free 0.251
6MOJ Dimeric DARPin A_angle_R5 complex with EpoR 提交 2018-10-04 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 B 32–249(218 aa)
未记录 TAR D(-)-TARTARIC ACID × 6 GOL GLYCEROL × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;295 K;0.2 M sodium potassium tartrate, 0.1 M bis-tris propane pH 8.5, 20% PEG 3350, 30% glycerol as cryoprotectant
分辨率 2.43 Å R-free 0.250
6MOK Dimeric DARPin A_distance_R7 complex with EpoR 提交 2018-10-04 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 B 32–249(218 aa)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;295 K;0.2 M NaCl, 0.1 M Tris pH 8.5, 25% PEG 3350
分辨率 5.10 Å R-free 0.299
6MOL Monoextended DARPin M_R12 complex with EpoR 提交 2018-10-04 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 B 32–249(218 aa)
链 C 32–249(218 aa)
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;295 K;Seeded from 0.2 M NaCl, 0.1 M CAPS pH 10.5, 20% PEG 8000 into 0.2 M ammonium tartrate and 20% PEG 3350, with 10% glycerol, 10% ethylene glycol as cryoprotectant
分辨率 3.16 Å R-free 0.260
8VUI Structure of FabS1CE-EPR-1, an elbow-locked Fab, in complex with the erythropoeitin receptor 提交 2024-01-29 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 D 25–250(226 aa)
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 NA SODIUM ION × 4 CL CHLORIDE ION × 5 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CIT CITRIC ACID × 1 NH4 AMMONIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.2;298 K;0.2 M Ammonium Citrate dibasic, 20% PEG2000 monomethyl ether, pH 5.2
分辨率 2.10 Å R-free 0.240
8VVM Structure of FabS1CE1-EPR1-1 in complex with the erythropoietin receptor 提交 2024-01-31 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 I 25–250(226 aa)
突变:residues 22-250 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 NA SODIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5;298 K;0.1 M MMT buffer pH 5.0, 25% PEG1500
分辨率 2.90 Å R-free 0.273
8VVO Structure of FabS1CE2-EPR1-1 in complex with the erythropoietin receptor 提交 2024-01-31 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 I 25–250(226 aa)
突变:residues 22-250 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;298 K;0.1 M MMT buffer pH 6.0, 25% PEG1500
分辨率 3.09 Å R-free 0.289