当前蛋白身份:P19235
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1CN4 ERYTHROPOIETIN COMPLEXED WITH EXTRACELLULAR DOMAINS OF ERYTHROPOIETIN RECEPTOR 提交 1999-05-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 A
25–249(225 aa)
片段:EXTRACELLULAR LIGAND BINDING DOMAINS
链 B
25–249(225 aa)
片段:EXTRACELLULAR LIGAND BINDING DOMAINS
|
突变:N52Q, N164Q, A211E 突变:N52Q, N164Q, A211E | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5;pH 6.50
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.336 |
| 1EBA COMPLEX BETWEEN THE EXTRACELLULAR DOMAIN OF ERYTHROPOIETIN (EPO) RECEPTOR [EBP] AND AN INACTIVE PEPTIDE [EMP33] CONTAINS 3,5-DIBROMOTYROSINE IN POSITION 4 (DENOTED DBY) 提交 1998-10-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 A
34–248(215 aa)
片段:EXTRACELLULAR DOMAIN
链 B
34–248(215 aa)
片段:EXTRACELLULAR DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6;pH 6.0
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.299 |
| 1EBA COMPLEX BETWEEN THE EXTRACELLULAR DOMAIN OF ERYTHROPOIETIN (EPO) RECEPTOR [EBP] AND AN INACTIVE PEPTIDE [EMP33] CONTAINS 3,5-DIBROMOTYROSINE IN POSITION 4 (DENOTED DBY) 提交 1998-10-02 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 A
34–248(215 aa)
片段:EXTRACELLULAR DOMAIN
链 B
34–248(215 aa)
片段:EXTRACELLULAR DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6;pH 6.0
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.299 |
| 1EBA COMPLEX BETWEEN THE EXTRACELLULAR DOMAIN OF ERYTHROPOIETIN (EPO) RECEPTOR [EBP] AND AN INACTIVE PEPTIDE [EMP33] CONTAINS 3,5-DIBROMOTYROSINE IN POSITION 4 (DENOTED DBY) 提交 1998-10-02 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 A
34–248(215 aa)
片段:EXTRACELLULAR DOMAIN
链 B
34–248(215 aa)
片段:EXTRACELLULAR DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6;pH 6.0
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.299 |
| 1EBP COMPLEX BETWEEN THE EXTRACELLULAR DOMAIN OF ERYTHROPOIETIN (EPO) RECEPTOR [EBP] AND AN AGONIST PEPTIDE [EMP1] 提交 1996-05-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 A
34–244(211 aa)
片段:EXTRACELLULAR DOMAIN
链 B
34–244(211 aa)
片段:EXTRACELLULAR DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.80 Å R-free 0.334 |
| 1EER CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN ERYTHROPOIETIN COMPLEXED TO ITS RECEPTOR AT 1.9 ANGSTROMS 提交 1998-07-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 B
31–250(220 aa)
片段:EXTRACELLULAR DOMAIN
链 C
31–250(220 aa)
片段:EXTRACELLULAR DOMAIN
|
突变:N52Q, N164Q, A211E 突变:N52Q, N164Q, A211E | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5;pH 6.50
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.318 |
| 1ERN NATIVE STRUCTURE OF THE EXTRACELLULAR DOMAIN OF ERYTHROPOIETIN (EPO) RECEPTOR [EBP] 提交 1999-01-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
34–246(213 aa)
片段:EXTRACELLULAR DOMAIN
链 B
34–246(213 aa)
片段:EXTRACELLULAR DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.7;pH 7.7
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.295 |
| 2JIX Crystal structure of ABT-007 FAB fragment with the soluble domain of EPO receptor 提交 2007-07-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 C
25–249(225 aa)
片段:EPO RECEPTOR SOLUBLE DOMAIN, RESIDUES 25-249
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.20 Å R-free 0.323 |
| 2JIX Crystal structure of ABT-007 FAB fragment with the soluble domain of EPO receptor 提交 2007-07-02 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 B
25–249(225 aa)
片段:EPO RECEPTOR SOLUBLE DOMAIN, RESIDUES 25-249
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.20 Å R-free 0.323 |
| 2JIX Crystal structure of ABT-007 FAB fragment with the soluble domain of EPO receptor 提交 2007-07-02 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 E
25–249(225 aa)
片段:EPO RECEPTOR SOLUBLE DOMAIN, RESIDUES 25-249
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.20 Å R-free 0.323 |
| 2MV6 Solution structure of the transmembrane domain and the juxta-membrane domain of the Erythropoietin Receptor in micelles 提交 2014-09-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白数一致 |
链 A
237–284(48 aa)
片段:UNP residues 237-284
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5;313 K;离子强度(mmCIF原始值)20;压力 ambient
NMR样品组成
20 mM sodium phosphate, 10 v/v D2O, 250 mM DPC, 0.5 mM [U-99% 15N] protein, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.5-1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] protein, 10 % D2O, 20 mM sodium phosphate, 200-400 mM DPC, 1 mM DTT, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 4Y5V Diabody 305 complex with EpoR 提交 2015-02-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致 |
链 C
32–249(218 aa)
链 F
32–249(218 aa)
|
突变:N52Q, N164Q 突变:N52Q, N164Q | GOL GLYCEROL × 10 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;293 K;HEPES, PEG 4000
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.229 |
| 4Y5V Diabody 305 complex with EpoR 提交 2015-02-12 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致 |
链 I
32–249(218 aa)
|
突变:N52Q, N164Q | GOL GLYCEROL × 10 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;293 K;HEPES, PEG 4000
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.229 |
| 4Y5X Diabody 305 complex with EpoR 提交 2015-02-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致 |
链 C
32–249(218 aa)
链 L
32–249(218 aa)
|
未记录 | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 12 FLC CITRATE ANION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7;293 K;sodium citrate, PEG 8000
|
分辨率 3.15 Å R-free 0.241 |
| 4Y5X Diabody 305 complex with EpoR 提交 2015-02-12 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致 |
链 F
32–249(218 aa)
链 I
32–249(218 aa)
|
未记录 | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7;293 K;sodium citrate, PEG 8000
|
分辨率 3.15 Å R-free 0.241 |
| 4Y5Y Diabody 330 complex with EpoR 提交 2015-02-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致 |
链 C
32–249(218 aa)
链 F
32–249(218 aa)
|
突变:N76Q, N188Q, D247L, and L248D 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 突变:N76Q, N188Q, D247L, and L248D 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7;293 K;Magnesium chloride, Tris, PEG 8000
|
分辨率 2.85 Å R-free 0.241 |
| 6E2Q Structure of human JAK2 FERM/SH2 in complex with Erythropoietin Receptor 提交 2018-07-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 N
273–338(66 aa)
片段:UNP residues 273-338
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.6;277.15 K;100 mM Tris, pH 7.6, 2-4% PEG8000
|
分辨率 2.65 Å R-free 0.263 |
| 6E2Q Structure of human JAK2 FERM/SH2 in complex with Erythropoietin Receptor 提交 2018-07-11 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 O
273–338(66 aa)
片段:UNP residues 273-338
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.6;277.15 K;100 mM Tris, pH 7.6, 2-4% PEG8000
|
分辨率 2.65 Å R-free 0.263 |
| 6E2Q Structure of human JAK2 FERM/SH2 in complex with Erythropoietin Receptor 提交 2018-07-11 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 M
273–338(66 aa)
片段:UNP residues 273-338
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.6;277.15 K;100 mM Tris, pH 7.6, 2-4% PEG8000
|
分辨率 2.65 Å R-free 0.263 |
| 6E2Q Structure of human JAK2 FERM/SH2 in complex with Erythropoietin Receptor 提交 2018-07-11 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 P
273–338(66 aa)
片段:UNP residues 273-338
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.6;277.15 K;100 mM Tris, pH 7.6, 2-4% PEG8000
|
分辨率 2.65 Å R-free 0.263 |
| 6MOE Monomeric DARPin E2 complex with EpoR 提交 2018-10-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 D
32–249(218 aa)
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 5 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 5.6;295 K;1 M sodium potassium phosphate pH 5.6
Cryoprotected in 25% ethylene glycol
|
分辨率 2.09 Å R-free 0.230 |
| 6MOE Monomeric DARPin E2 complex with EpoR 提交 2018-10-04 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 C
32–249(218 aa)
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 5.6;295 K;1 M sodium potassium phosphate pH 5.6
Cryoprotected in 25% ethylene glycol
|
分辨率 2.09 Å R-free 0.230 |
| 6MOF Monomeric DARPin G2 complex with EpoR 提交 2018-10-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 B
32–249(218 aa)
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 7;295 K;0.2 M Magnesium chloride, 0.1 M Tris pH 7.0, 10% PEG 8000, 25% ethylene glycol as cryoprotectant
|
分辨率 2.89 Å R-free 0.266 |
| 6MOH Dimeric DARPin C_R3 complex with EpoR 提交 2018-10-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 C
32–249(218 aa)
链 D
32–249(218 aa)
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 7 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.3;295 K;0.1 M HEPES pH 7.3, 1.4 M sodium potassium phosphate, 24% glycerol cryoprotectant
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.277 |
| 6MOI Dimeric DARPin C_angle_R5 complex with EpoR 提交 2018-10-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 B
32–249(218 aa)
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 20 MG MAGNESIUM ION × 4 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;295 K;0.3 M magnesium sulfate, 0.1 M bis-tris propane pH 7, 22.5% PurePEGs cocktail (Anatrace), 30% ethylene glycol cryoprotectant
|
分辨率 2.06 Å R-free 0.251 |
| 6MOJ Dimeric DARPin A_angle_R5 complex with EpoR 提交 2018-10-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 B
32–249(218 aa)
|
未记录 | TAR D(-)-TARTARIC ACID × 6 GOL GLYCEROL × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;295 K;0.2 M sodium potassium tartrate, 0.1 M bis-tris propane pH 8.5, 20% PEG 3350, 30% glycerol as cryoprotectant
|
分辨率 2.43 Å R-free 0.250 |
| 6MOK Dimeric DARPin A_distance_R7 complex with EpoR 提交 2018-10-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 B
32–249(218 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;295 K;0.2 M NaCl, 0.1 M Tris pH 8.5, 25% PEG 3350
|
分辨率 5.10 Å R-free 0.299 |
| 6MOL Monoextended DARPin M_R12 complex with EpoR 提交 2018-10-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 B
32–249(218 aa)
链 C
32–249(218 aa)
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;295 K;Seeded from 0.2 M NaCl, 0.1 M CAPS pH 10.5, 20% PEG 8000 into 0.2 M ammonium tartrate and 20% PEG 3350, with 10% glycerol, 10% ethylene glycol as cryoprotectant
|
分辨率 3.16 Å R-free 0.260 |
| 8VUI Structure of FabS1CE-EPR-1, an elbow-locked Fab, in complex with the erythropoeitin receptor 提交 2024-01-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 D
25–250(226 aa)
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 NA SODIUM ION × 4 CL CHLORIDE ION × 5 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CIT CITRIC ACID × 1 NH4 AMMONIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.2;298 K;0.2 M Ammonium Citrate dibasic, 20% PEG2000 monomethyl ether, pH 5.2
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.240 |
| 8VVM Structure of FabS1CE1-EPR1-1 in complex with the erythropoietin receptor 提交 2024-01-31 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 I
25–250(226 aa)
|
突变:residues 22-250 | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 NA SODIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5;298 K;0.1 M MMT buffer pH 5.0, 25% PEG1500
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.273 |
| 8VVO Structure of FabS1CE2-EPR1-1 in complex with the erythropoietin receptor 提交 2024-01-31 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致 |
链 I
25–250(226 aa)
|
突变:residues 22-250 | NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;298 K;0.1 M MMT buffer pH 6.0, 25% PEG1500
|
分辨率 3.09 Å R-free 0.289 |