当前蛋白身份：P28366
重新检索
差异标签只比较当前检索结果；所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。
相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1M6N Crystal structure of the SecA translocation ATPase from Bacillus subtilis 提交 2002-07-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–802（802 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 14 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；299 K；2 M ammonium sulfate, 30% glycerol, 1 mM DTT, 100 mM BES, pH 7.0,
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 299K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.301 |
| 1M74 Crystal structure of Mg-ADP-bound SecA from Bacillus subtilis 提交 2002-07-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–802（802 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；299 K；5 mM ADP, 5 mM MgCl, 2 M ammonium sulfate, 30% glycerol, 1 mM DTT, 100 mM BES,
pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP at 299K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.291 |
| 1TF2 Crystal structure of SecA:ADP in an open conformation from Bacillus Subtilis 提交 2004-05-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–841（841 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；0.1M HEPES, 250mM Magnesium Acetate, 7-12% PEG 8000, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.292 |
| 1TF5 Crystal structure of SecA in an open conformation from Bacillus Subtilis 提交 2004-05-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–841（841 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；0.1M HEPES, 250mM Magnesium Acetate, 7-12% PEG 8000, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.18 Å R-free 0.273 |
| 2IBM A novel dimer interface and conformational changes revealed by an X-ray structure of B. subtilis SecA 提交 2006-09-11 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–780（780 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；301 K；1.8 M malonate, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 301K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.323 |
| 2IBM A novel dimer interface and conformational changes revealed by an X-ray structure of B. subtilis SecA 提交 2006-09-11 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–780（780 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；301 K；1.8 M malonate, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 301K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.323 |
| 2IBM A novel dimer interface and conformational changes revealed by an X-ray structure of B. subtilis SecA 提交 2006-09-11 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–780（780 aa）
链 B
1–780（780 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；301 K；1.8 M malonate, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 301K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.323 |
| 2IBM A novel dimer interface and conformational changes revealed by an X-ray structure of B. subtilis SecA 提交 2006-09-11 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–780（780 aa）
链 B
1–780（780 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；301 K；1.8 M malonate, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 301K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.323 |
| 3DL8 Structure of the complex of aquifex aeolicus SecYEG and bacillus subtilis SecA 提交 2008-06-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–779（779 aa）
片段：UNP residues 1-779
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；26-28% (w/v) PEG 3350 and 250mM lithium sulfate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 7.50 Å R-free 0.390 |
| 3DL8 Structure of the complex of aquifex aeolicus SecYEG and bacillus subtilis SecA 提交 2008-06-26 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
1–779（779 aa）
片段：UNP residues 1-779
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；26-28% (w/v) PEG 3350 and 250mM lithium sulfate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 7.50 Å R-free 0.390 |
| 3IQM Active site mutants of B. subtilis SecA 提交 2009-08-20 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–802（802 aa）
片段：UNP residues 1-802
|
突变：E208Q | SO4 SULFATE ION × 22 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；299 K；20 mM BES pH 7.0, 2.12 M Ammonium sulfate, 31% Glycerol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 299K
|
分辨率 3.40 Å R-free 0.267 |
| 3IQY Active site mutants of B. subtilis SecA 提交 2009-08-21 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–841（841 aa）
|
突变：E208Q, R489K | SO4 SULFATE ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；299 K；20 mM BES pH 7.0, 2.1 M Ammonium sulfate, 32 % Glycerol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 299K
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.269 |
| 5EUL Structure of the SecA-SecY complex with a translocating polypeptide substrate 提交 2015-11-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–742（742 aa）
链 A
744–780（37 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 TBR HEXATANTALUM DODECABROMIDE × 18 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；295 K；21-24% polyethylene glycol 1500, 100mM Tris-HCl pH8.5, 50-100 mM MgAc2, 2% 2-methyl-2,4-pentandiol
|
分辨率 3.70 Å R-free 0.315 |
| 6ITC Structure of a substrate engaged SecA-SecY protein translocation machine 提交 2018-11-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 A
1–780（780 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PGV (1R)-2-{[{[(2S)-2,3-DIHYDROXYPROPYL]OXY}(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL (11E)-OCTADEC-11-ENOATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.45 Å |
| 7XHA Structure of the SecA/SecYE/proOmpA(4Y)-sfGFP complex with ADP.BeF3-. 提交 2022-04-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–778（778 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.35 Å |
| 7XHB Structure of the SecA/SecYE/proOmpA(4Y)-sfGFP complex with ADP 提交 2022-04-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–778（778 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.33 Å |
| 8Y9Y Structure of the SecA-SecY complex with the substrate FtsQ-LacY(+1C) 提交 2024-02-07 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–778（778 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.29 Å |
| 8Y9Z Structure of the SecA-SecY complex with the substrate HmBRI-3TM 提交 2024-02-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
1–778（778 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.41 Å |
| 8YA0 Structure of the SecA-SecY complex with the substrate FtsQ-LacY(+7C) 提交 2024-02-07 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 A
14–778（765 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.97 Å |
| 8YA2 Structure of the SecA-SecY complex with the substrate FtsQ-LacY(+20C) 提交 2024-02-07 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
1–778（778 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.84 Å |
| 8YAS Structure of the SecA-SecY complex with the substrate HmBRI-7TM 提交 2024-02-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–778（778 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.97 Å |