当前蛋白身份：P30305
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1CWR HUMAN CDC25B CATALYTIC DOMAIN WITHOUT ION IN CATALYTIC SITE 提交 1999-08-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
356–566（211 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 BME BETA-MERCAPTOETHANOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 9；4 MICROLITERS PROTEIN (10 MG/ ML IN 50 MM TRISHCL, 1% BME AT PH 9.0) MIXED
WITH 4 MICROLITERS WELL BUFFER (1.8 (NH4)2SO4, 0.5 M NACL, 0.1 M TRISHCL, 0.25
BME) AT 4 DEG. C
|
分辨率 2.10 Å |
| 1CWS HUMAN CDC25B CATALYTIC DOMAIN WITH TUNGSTATE 提交 1999-08-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
329–539（211 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN
|
未记录 | WO4 TUNGSTATE(VI)ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 BME BETA-MERCAPTOETHANOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 9；4 MICROLITERS PROTEIN (10 MG/ ML IN 50 MM TRISHCL, WO4=,1% BME AT PH 9.0)
MIXED WITH 4 MICROLITERS WELL BUFFER (1.8 (NH4)2SO4, 0.5 M NACL, 0.1 M TRISHCL,
0.25 BME) AT 4 DEG. C
|
分辨率 2.00 Å |
| 1CWT HUMAN CDC25B CATALYTIC DOMAIN WITH METHYL MERCURY 提交 1999-08-26 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
347–524（178 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN
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未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 MMC METHYL MERCURY ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 9；4 MICROLITERS PROTEIN (10 MG/ ML IN 50 MM TRISHCL, CH(3)HGCL,1% BME AT PH 9.0) MIXED WITH 4 MICROLITERS WELL BUFFER (1.8 (NH4)2SO4, 0.5 M NACL, 0.1 M TRISHCL, 0.25 BME) AT 4 DEG. C
|
分辨率 2.30 Å |
| 1QB0 HUMAN CDC25B CATALYTIC DOMAIN 提交 1999-04-29 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
356–566（211 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 BME BETA-MERCAPTOETHANOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；277 K；4 MICROLITERS PROTEIN (10 MG/ML IN 50 MM TRISHCL, 1% BME AT PH 9.0) MIXED WITH 4 MICROLITERS WELL BUFFER (1.8
(NH4)2SO4, 0.5 M NACL, 0.1 M TRISHCL, 0.25 BME) AT 4 DEG. C, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 4.0K
|
分辨率 1.91 Å |
| 1YM9 Crystal structure of the CDC25B phosphatase catalytic domain with the active site cysteine in the sulfinic form 提交 2005-01-20 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
391–564（174 aa）
片段：catalytic domain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.25；DTT, Tris, Ammonium Sulfate, pH 7.25, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 100.0K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.237 |
| 1YMD Crystal Structure of the CDC25B phosphatase catalytic domain with the active site cysteine in the sulfonic form 提交 2005-01-20 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
391–564（174 aa）
片段：catalytic domain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.25；DTT, Tris, Ammonium Sulfate, pH 7.25, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 100.0K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.209 |
| 1YMK Crystal Structure of the CDC25B phosphatase catalytic domain in the apo form 提交 2005-01-21 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
391–564（174 aa）
片段：catalytic domain
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.25；DTT,Tris, Ammonium Sulfate, pH 7.25, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 100.0K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.196 |
| 1YML Crystal Structure of the CDC25B phosphatase catalytic domain with the active site cysteine in the sulfenic form 提交 2005-01-21 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
391–564（174 aa）
片段：catalytic domain
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.25；DTT,Tris, Ammonium Sulfate, pH 7.25, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 100.0K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.208 |
| 1YS0 Crystal Structure of the CDC25B phosphatase catalytic domain with the active site cysteine in the disulfide form 提交 2005-02-05 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
391–564（174 aa）
片段：catalytic domain
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.25；DTT, Tris, Ammonium Sulfate, pH 7.25, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 100.0K
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分辨率 2.00 Å R-free 0.244 |
| 2A2K Crystal Structure of an active site mutant, C473S, of Cdc25B Phosphatase Catalytic Domain 提交 2005-06-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
377–550（174 aa）
片段：Catalytic Domain
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突变：C473S | CL CHLORIDE ION × 2 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；DTT, Ammonium Sulfate, Tris, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.52 Å R-free 0.191 |
| 2IFD Crystal structure of a remote binding site mutant, R492L, of CDC25B Phosphatase catalytic domain 提交 2006-09-20 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
391–564（174 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, residues 391-564
|
突变：R492L | SO4 SULFATE ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；DTT, AMMONIUM SULFATE, TRIS, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.212 |
| 2IFV Crystal structure of an active site mutant, C473D, of CDC25B phosphatase catalytic domain 提交 2006-09-21 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
391–564（174 aa）
片段：Catalytic domain, residues 391-564
|
突变：C473D | CL CHLORIDE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；DTT, AMMONIUM SULFATE, TRIS, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.192 |
| 2UZQ Protein Phosphatase, New Crystal Form 提交 2007-05-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
377–566（190 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 377-566
链 B
377–566（190 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 377-566
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7；PEG 8000, HEPES PH 7.0, GUANIDINIUM CHLORIDE
|
分辨率 2.38 Å R-free 0.249 |
| 2UZQ Protein Phosphatase, New Crystal Form 提交 2007-05-01 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
377–566（190 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 377-566
链 D
377–566（190 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 377-566
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7；PEG 8000, HEPES PH 7.0, GUANIDINIUM CHLORIDE
|
分辨率 2.38 Å R-free 0.249 |
| 2UZQ Protein Phosphatase, New Crystal Form 提交 2007-05-01 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
377–566（190 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 377-566
链 F
377–566（190 aa）
片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 377-566
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7；PEG 8000, HEPES PH 7.0, GUANIDINIUM CHLORIDE
|
分辨率 2.38 Å R-free 0.249 |
| 4WH7 Structure of the CDC25B Phosphatase Catalytic Domain with Bound Ligand 提交 2014-09-20 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
386–565（180 aa）
片段：catalytic domain (UNP residues 386-565)
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突变：C473S | SO4 SULFATE ION × 6 8H8 2-fluoro-4-hydroxybenzonitrile × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；(NH4)2SO4, Tris, TCEP
|
分辨率 1.62 Å R-free 0.198 |
| 4WH9 Structure of the CDC25B Phosphatase Catalytic Domain with Bound Inhibitor 提交 2014-09-20 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
386–565（180 aa）
片段：catalytic domain (UNP residues 386-565)
|
突变：C473S | 3M8 2-[(2-cyano-3-fluoro-5-hydroxyphenyl)sulfanyl]ethanesulfonic acid × 1 SO4 SULFATE ION × 4 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；(NH4)2SO4, Tris, TCEP
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.152 |
| 9T09 X-ray structure of the catalytic domain of CDC25B C473S at 1.34 angstrom resolution 提交 2025-10-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
391–564（174 aa）
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突变：C473S | SO4 SULFATE ION × 4 CL CHLORIDE ION × 1 ZN ZINC ION × 1 GOL GLYCEROL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；2.0 M ammonium sulphate, 0.5 M NaCl, 0.1 M Tris-HCl pH 7.5, and 0.5 mM TCEP
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分辨率 1.34 Å R-free 0.175 |
| 9T0A X-ray structure of the complex between the catalytic domain of CDC25B C473S and 3-O-methylfluorescein phosphate (3-OMFP) 提交 2025-10-16 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
391–564（174 aa）
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突变：C473S | A1JSQ [(1~{R})-6'-methoxy-3-oxidanylidene-spiro[2-benzofuran-1,9'-xanthene]-3'-yl] dihydrogen phosphate × 1 A1JSP [(1~{S})-6'-methoxy-3-oxidanylidene-spiro[2-benzofuran-1,9'-xanthene]-3'-yl] dihydrogen phosphate × 1 CL CHLORIDE ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；3.8 M NaCl, 0.1 M HEPES pH 7.5, and 1.2% v/v 2-propanol
|
分辨率 2.04 Å R-free 0.214 |