当前蛋白身份:P32835 重新检索
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
2X19 Crystal structure of Importin13 - RanGTP complex 提交 2009-12-23 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 A 8–179(172 aa) 片段:RESIDUES 8-179
突变:YES GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6;100MM BIS-TRIS PH 6 23% 9W/V) PEG 3350 100MM NA-THIIOCYANATE RT
分辨率 2.80 Å R-free 0.268
3ICQ Karyopherin nuclear state 提交 2009-07-18 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:trimeric(3) 与全部聚合物一致
链 B 9–179(171 aa) 片段:Ran, UNP residues 9-179
突变:Q71L GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;100mM Bis-Tris, pH5.5, 20% PEG3350, 180mM sodium acetate at 18 degrees, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.20 Å R-free 0.294
3ICQ Karyopherin nuclear state 提交 2009-07-18 Assembly 2 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:trimeric(3) 与全部聚合物一致
链 C 9–179(171 aa) 片段:Ran, UNP residues 9-179
突变:Q71L GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;100mM Bis-Tris, pH5.5, 20% PEG3350, 180mM sodium acetate at 18 degrees, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.20 Å R-free 0.294
3M1I Crystal structure of yeast CRM1 (Xpo1p) in complex with yeast RanBP1 (Yrb1p) and yeast RanGTP (Gsp1pGTP) 提交 2010-03-05 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 1–219(219 aa)
突变:Q71L GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.6;293 K;0.1M Bis-Tris, 0.2M ammonium nitrate, 18% PEG3350, pH 6.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 2.00 Å R-free 0.220
8DYO Cryo-EM structure of Importin-4 bound to RanGTP 提交 2022-08-04 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 1–219(219 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.10 Å
8F19 Cryo-EM structure of Kap114 bound to Gsp1 (RanGTP) 提交 2022-11-04 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 1–179(179 aa)
突变:Q71L GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5;20 mM Tris pH 7.5, 300 mM NaCl, 2 mM MgCl2, 1 mM TCEP, and 0.1% NP-40
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.49 Å
8F1E Cryo-EM structure of Kap114 bound to Gsp1 (RanGTP) and H2A-H2B 提交 2022-11-04 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致
链 D 1–179(179 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.28 Å
8F7A Cryo-EM structure of Importin-9 bound to RanGTP 提交 2022-11-18 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 1–219(219 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.78 Å
8QYZ Crystal structure of hiNES2 in complex with Xpo1 and RanGTP 提交 2023-10-26 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 A 1–182(182 aa)
突变:1-182, Q71L GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.4;293 K;Tris, PEG 20K, magnesium acetate
分辨率 3.00 Å R-free 0.247
8QYZ Crystal structure of hiNES2 in complex with Xpo1 and RanGTP 提交 2023-10-26 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 B 1–182(182 aa)
突变:1-182, Q71L GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.4;293 K;Tris, PEG 20K, magnesium acetate
分辨率 3.00 Å R-free 0.247
8QYZ Crystal structure of hiNES2 in complex with Xpo1 and RanGTP 提交 2023-10-26 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 E 1–182(182 aa)
突变:1-182, Q71L GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.4;293 K;Tris, PEG 20K, magnesium acetate
分辨率 3.00 Å R-free 0.247
8QYZ Crystal structure of hiNES2 in complex with Xpo1 and RanGTP 提交 2023-10-26 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 G 1–182(182 aa)
突变:1-182, Q71L GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.4;293 K;Tris, PEG 20K, magnesium acetate
分辨率 3.00 Å R-free 0.247
9D45 Cryo-EM structure of yeast Exportin Msn5 bound to cargo Pho4 and RanGTP 提交 2024-08-12 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 3 PDB 声明:trimeric(3) 与蛋白数一致
链 B 2–179(178 aa)
突变:Q71L GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9DXM Cryo-EM structure of yeast Exportin Msn5 bound to RanGTP and Pho4 (not modeled) (State 2-1) 提交 2024-10-11 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 2–179(178 aa)
突变:Q71L GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9DZ6 Cryo-EM structure of yeast Exportin Msn5 bound to RanGTP and Pho4 (not modeled) (State 3-1) 提交 2024-10-15 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致
链 B 2–179(178 aa)
突变:Q71L GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9OGB Cryo-EM structure of human exportin-1 conjugated with selinexor and bound to yeast RAN-GTP and human ASB8-ELOB/C 提交 2025-04-30 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric(5) 与蛋白数一致
链 B 1–179(179 aa) 片段:residues 1-179
突变:Q71L V6A selinexor, bound form × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4;20 mM HEPES pH 7.4, 110 mM KOAc, 2 mM Mg(OAc)2, 2 mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.25 Å