当前蛋白身份：P33120
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1BI0 STRUCTURE OF APO-AND HOLO-DIPHTHERIA TOXIN REPRESSOR 提交 1998-06-21 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–226（226 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；pH 8.5
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.296 |
| 1BI1 STRUCTURE OF APO-AND HOLO-DIPHTHERIA TOXIN REPRESSOR 提交 1998-06-21 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–226（226 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；pH 8.5
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.311 |
| 1BI2 STRUCTURE OF APO-AND HOLO-DIPHTHERIA TOXIN REPRESSOR 提交 1998-06-21 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–226（226 aa）
链 B
1–226（226 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；pH 8.5
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.352 |
| 1BI3 STRUCTURE OF APO-AND HOLO-DIPHTHERIA TOXIN REPRESSOR 提交 1998-06-21 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–226（226 aa）
链 B
1–226（226 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ZN ZINC ION × 2 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；pH 8.5
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.333 |
| 1BYM SOLUTION STRUCTURES OF THE C-TERMINAL DOMAIN OF DIPHTHERIA TOXIN REPRESSOR 提交 1998-10-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
130–226（97 aa）
片段：RESIDUES 130-226
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；303 K
|
分辨率未提供 |
| 1C0W CRYSTAL STRUCTURE OF THE COBALT-ACTIVATED DIPHTHERIA TOXIN REPRESSOR-DNA COMPLEX REVEALS A METAL BINDING SH-LIKE DOMAIN 提交 1999-07-22 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
2–226（225 aa）
链 B
2–226（225 aa）
链 C
2–226（225 aa）
链 D
2–226（225 aa）
|
未记录 | CO COBALT (II) ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.279 |
| 1DDN DIPHTHERIA TOX REPRESSOR (C102D MUTANT)/TOX DNA OPERATOR COMPLEX 提交 1998-06-23 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–226（226 aa）
链 B
1–226（226 aa）
链 C
1–226（226 aa）
链 D
1–226（226 aa）
|
突变：C102D 突变：C102D 突变：C102D 突变：C102D | NI NICKEL (II) ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.00 Å R-free 0.280 |
| 1DPR STRUCTURES OF THE APO-AND METAL ION ACTIVATED FORMS OF THE DIPHTHERIA TOX REPRESSOR FROM CORYNEBACTERIUM DIPHTHERIAE 提交 1995-02-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–226（226 aa）
链 B
1–226（226 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.00 Å R-free 0.417 |
| 1F5T DIPHTHERIA TOX REPRESSOR (C102D MUTANT) COMPLEXED WITH NICKEL AND DTXR CONSENSUS BINDING SEQUENCE 提交 2000-06-15 | Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric（6） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–121（121 aa）
链 B
1–121（121 aa）
链 C
1–121（121 aa）
链 D
1–121（121 aa）
|
突变：C102D 突变：C102D 突变：C102D 突变：C102D | NI NICKEL (II) ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；100 mM sodium cacodylate pH7.3, 10 mM MgCl2, 2 mM spermine, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.273 |
| 1FWZ GLU20ALA DTXR 提交 2000-09-25 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–226（226 aa）
|
突变：E20A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 2 ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；1.6-2.0 ammonium sulfate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.285 |
| 1G3S CYS102SER DTXR 提交 2000-10-25 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–226（226 aa）
|
突变：C102S | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；298 K；Ammonium sulfate, EDTA, glycerol, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.271 |
| 1G3T CYS102SER DTXR 提交 2000-10-25 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–226（226 aa）
链 B
1–226（226 aa）
|
突变：C102S 突变：C102S | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；Ammonium sulfate, glycerol, EDTA, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.318 |
| 1G3W CD-CYS102SER DTXR 提交 2000-10-25 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–226（226 aa）
|
突变：C102 | CD CADMIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；Ammonium sulfate, glycerol, CdCl2, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.259 |
| 1G3Y ARG80ALA DTXR 提交 2000-10-25 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–226（226 aa）
|
突变：R80A | ZN ZINC ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；Ammonium sulfate, Zn2+, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.328 |
| 1P92 Crystal Structure of (H79A)DtxR 提交 2003-05-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–226（226 aa）
|
突变：H79A | BME BETA-MERCAPTOETHANOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；PEG 400, ammonium sulfate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.280 |
| 1P92 Crystal Structure of (H79A)DtxR 提交 2003-05-08 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–226（226 aa）
|
突变：H79A | BME BETA-MERCAPTOETHANOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；PEG 400, ammonium sulfate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.280 |
| 1QVP C terminal SH3-like domain from Diphtheria toxin Repressor residues 144-226. 提交 2003-08-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
144–226（83 aa）
片段：Residues 144-226
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；303 K；压力 ambient
NMR样品组成
1-2 mM DtxR144-226 U-15N; 10mM Potassium Phosphate buffer pH6.5 | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1-2 mM DtxR144-226 U-15N and U-13C; 10mM Potassium Phosphate buffer pH6.5 | 90% H2O, 10% D2O; 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 1QW1 Solution Structure of the C-Terminal Domain of DtxR residues 110-226 提交 2003-08-29 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
110–226（117 aa）
片段：RESIDUES 110-226
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；303 K；压力 ambient
NMR样品组成
1-2 mM DtxR110-226 U-15N, 50 mM Potassium Phosphate, pH 6.5 | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1-2 mM DtxR110-226 U-15N U-13C, 50 mM Potassium Phosphate, pH 6.5 | 100% D2O
NMR样品组成
1-2 mM DtxR110-226 U-15N U-13C, 50 mM Potassium Phosphate, pH 6.5 | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 1XCV Crystal Structure Of (H79AC102D)Dtxr complexed with Nickel(II) 提交 2004-09-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–139（139 aa）
|
突变：H79A, C102D | NI NICKEL (II) ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；ammonium sulfate, PEG 400, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.300 |
| 2DTR STRUCTURE OF DIPHTHERIA TOXIN REPRESSOR 提交 1996-07-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–226（226 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 CO COBALT (II) ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.90 Å |
| 2QQ9 Crystal Structure of DtxR(D6A C102D) Complexed with Nickel(II) 提交 2007-07-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–226（226 aa）
|
突变：D6A, C102D | NI NICKEL (II) ION × 4 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；0.2 M Sodium Phosphate, 20% PEG 3350, 5 mM Nickel Chloride, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.71 Å R-free 0.291 |
| 2QQA Crystal Structure of DtxR(E9A C102D) Complexed with Nickel(II) 提交 2007-07-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–226（226 aa）
|
突变：E9A, C102D | NI NICKEL (II) ION × 4 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；0.2 M Sodium Phosphate, 20% PEG 3350, 5 mM Nickel Chloride, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.256 |
| 2QQB Crystal Structure of DtxR(M10A C102D) Complexed with Nickel(II) 提交 2007-07-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–226（226 aa）
|
突变：M10A, C102D | NI NICKEL (II) ION × 4 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；0.2 M Sodium Phosphate, 20% PEG 3350, 5 mM Nickel Chloride, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.92 Å R-free 0.311 |
| 2TDX DIPHTHERIA TOX REPRESSOR (C102D MUTANT) COMPLEXED WITH NICKEL 提交 1998-06-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–226（226 aa）
|
突变：C102D | NI NICKEL (II) ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.40 Å R-free 0.321 |
| 3GLX Crystal Structure Analysis of the DtxR(E175K) complexed with Ni(II) 提交 2009-03-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–226（226 aa）
|
突变：E175K | NI NICKEL (II) ION × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；0.95 M Sodium/Potasium Phosphate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
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分辨率 1.85 Å R-free 0.271 |