当前蛋白身份：P39748
重新检索
差异标签只比较当前检索结果；所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。
相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1U7B Crystal structure of hPCNA bound to residues 331-350 of the flap endonuclease-1 (FEN1) 提交 2004-08-03 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 B
331–350（20 aa）
片段：PIP-box region of FEN-1 (residues 331-350)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；298 K；ammonium sulfate, sodium acetate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.88 Å R-free 0.265 |
| 1UL1 Crystal structure of the human FEN1-PCNA complex 提交 2003-09-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 X
2–380（379 aa）
链 Y
2–380（379 aa）
链 Z
2–380（379 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；283 K；6% PEG1000, 50mM MES, 50mM Sodium chloride, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 283K
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.284 |
| 3Q8K Crystal Structure of Human Flap Endonuclease FEN1 (WT) in complex with product 5'-flap DNA, SM3+, and K+ 提交 2011-01-06 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
2–336（335 aa）
|
未记录 | SM SAMARIUM (III) ION × 4 K POTASSIUM ION × 1 OH HYDROXIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7；288 K；16% mPEG 2k, 20% saturated KCl, 0.5 mM Sm2(SO4)3, 10 mM Mg(NO3)2, 100 mM Hepes pH 7.0, 5% ethylene glycol, VAPOR DIFFUSION, temperature 288K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.213 |
| 3Q8L Crystal Structure of Human Flap Endonuclease FEN1 (WT) in complex with substrate 5'-flap DNA, SM3+, and K+ 提交 2011-01-06 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
2–336（335 aa）
|
未记录 | SM SAMARIUM (III) ION × 4 K POTASSIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7；288 K；17% mPEG 2k, 20% KCl, 0.5 mM Sm2(SO4)3, 50 mM Bis-Tris pH 7.0 and 5% Ethylene Glycol, vapor diffusion, temperature 288K
|
分辨率 2.32 Å R-free 0.202 |
| 3Q8M Crystal Structure of Human Flap Endonuclease FEN1 (D181A) in complex with substrate 5'-flap DNA and K+ 提交 2011-01-06 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
2–336（335 aa）
片段：D181A
|
未记录 | K POTASSIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；288 K；20% mPEG 2k, 20% KCl, 10 mM CaCl2, 50 mM Bis-Tris pH 7.5, 5% ethylene glycol, vapor diffusion, temperature 288K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.272 |
| 3Q8M Crystal Structure of Human Flap Endonuclease FEN1 (D181A) in complex with substrate 5'-flap DNA and K+ 提交 2011-01-06 | Assembly 2 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 B
2–336（335 aa）
片段：D181A
|
未记录 | K POTASSIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；288 K；20% mPEG 2k, 20% KCl, 10 mM CaCl2, 50 mM Bis-Tris pH 7.5, 5% ethylene glycol, vapor diffusion, temperature 288K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.272 |
| 3UVU Structural basis of nuclear import of Flap endonuclease 1 (FEN1) 提交 2011-11-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
352–370（19 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.8；293 K；Sodium citrate, DTT, pH 5.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.38 Å R-free 0.215 |
| 5FV7 Human Fen1 in complex with an N-hydroxyurea compound 提交 2016-02-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–336（336 aa）
片段：RESIDUES 1-336
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 R3Z 1-[(2S)-2,3-dihydro-1,4-benzodioxin-2-ylmethyl]-3-hydroxythieno[3,2-d]pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；25% PEG3350, 0.1M MOPS 7.0, 5% 2-PROPANOL, 2% GLYCEROL, pH 7.5
|
分辨率 2.84 Å R-free 0.300 |
| 5FV7 Human Fen1 in complex with an N-hydroxyurea compound 提交 2016-02-03 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–336（336 aa）
片段：RESIDUES 1-336
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 R3Z 1-[(2S)-2,3-dihydro-1,4-benzodioxin-2-ylmethyl]-3-hydroxythieno[3,2-d]pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；25% PEG3350, 0.1M MOPS 7.0, 5% 2-PROPANOL, 2% GLYCEROL, pH 7.5
|
分辨率 2.84 Å R-free 0.300 |
| 5K97 Flap endonuclease 1 (FEN1) D233N with cleaved product fragment and Sm3+ 提交 2016-05-31 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：pentameric（5） 与全部聚合物一致 |
链 A
2–336（335 aa）
|
突变：D233N | SM SAMARIUM (III) ION × 8 K POTASSIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；283 K；24% MPEG 2K, 20% KCl, 5% ethylene glycol, 100 mM HEPES pH 7.5
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.219 |
| 5KSE Flap endonuclease 1 (FEN1) R100A with 5'-flap substrate DNA and Sm3+ 提交 2016-07-08 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
2–336（335 aa）
|
突变：R100A | SM SAMARIUM (III) ION × 5 K POTASSIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；288 K；22% mPEG 2000, 20% saturated KCl, 5% ethylene glycol, 100 mM HEPES pH 7.5
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.245 |
| 5UM9 Flap endonuclease 1 (FEN1) D86N with 5'-flap substrate DNA and Sm3+ 提交 2017-01-26 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
2–336（335 aa）
|
突变：D86N | K POTASSIUM ION × 1 SM SAMARIUM (III) ION × 5 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；283 K；6% MPEG 2K, 10% KCl, 50 mM HEPES pH 7.5, 2.5% Ethylene glycol, 1.06 mM SmSO4
|
分辨率 2.81 Å R-free 0.266 |
| 5ZOD Crystal Structure of hFen1 in apo form 提交 2018-04-13 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–333（333 aa）
片段：nuclease core
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 K POTASSIUM ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；298 K；PEG 3350, MgCl2, Tris, KCl
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.226 |
| 5ZOE Crystal Structure of D181A hFen1 in complex with DNA 提交 2018-04-13 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–333（333 aa）
片段：nuclease core (1-333)
|
突变：D181A | K POTASSIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；298 K；PEG 3350, MgCl2, Tris, KCl
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.227 |
| 5ZOF Crystal Structure of D181A/R192F hFen1 in complex with DNA 提交 2018-04-13 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–333（333 aa）
片段：nuclease core (1-333)
|
突变：D181A, R192F | K POTASSIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；298 K；PEG 3350, MgCl2, Tris, KCl
|
分辨率 2.25 Å R-free 0.269 |
| 5ZOG Crystal Structure of R192F hFen1 in complex with DNA 提交 2018-04-13 | Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：tetrameric（4） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–333（333 aa）
片段：nuclease core (1-333)
|
突变：R192F | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；298 K；PEG 3350, MgCl2, Tris, KCl
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.231 |
| 6TNZ Human polymerase delta-FEN1-PCNA toolbelt 提交 2019-12-10 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric（10） 与全部聚合物一致 |
链 H
1–380（380 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 TTP THYMIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.05 Å |
| 7QO1 complex of DNA ligase I and FEN1 on PCNA and DNA 提交 2021-12-23 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric（8） 与全部聚合物一致 |
链 Y
1–380（380 aa）
|
突变：D181A | AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.40 Å |
| 8YJH Structure of the human endogenous PCNA-FEN1 complex - State A 提交 2024-03-01 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：octameric（8） 与全部聚合物一致 |
链 D
1–380（380 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.68 Å |
| 8YJL Structure of the human endogenous PCNA-FEN1 complex - State B 提交 2024-03-02 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：octameric（8） 与全部聚合物一致 |
链 D
1–380（380 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.51 Å |
| 8YJQ Structure of the human endogenous PCNA-FEN1 complex - State C 提交 2024-03-02 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：octameric（8） 与全部聚合物一致 |
链 D
1–380（380 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.51 Å |
| 8YJR Structure of the human endogenous PCNA-FEN1 complex - State D 提交 2024-03-02 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：octameric（8） 与全部聚合物一致 |
链 D
1–380（380 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.51 Å |
| 8YJS Structure of the human endogenous PCNA-FEN1 complex - State E 提交 2024-03-02 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：octameric（8） 与全部聚合物一致 |
链 D
1–380（380 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.55 Å |
| 8YJU Structure of the human endogenous PCNA-FEN1 complex - State F 提交 2024-03-02 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：octameric（8） 与全部聚合物一致 |
链 D
1–380（380 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.78 Å |
| 8YJV Structure of the human endogenous PCNA-FEN1 complex - State G 提交 2024-03-03 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：octameric（8） 与全部聚合物一致 |
链 D
1–380（380 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.51 Å |
| 8YJW Structure of the human endogenous PCNA-FEN1 complex - State H 提交 2024-03-03 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：octameric（8） 与全部聚合物一致 |
链 D
1–380（380 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.55 Å |
| 8YJZ Structure of the human endogenous PCNA-FEN1-RNase H2 complex - State D 提交 2024-03-03 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：decameric（10） 与全部聚合物一致 |
链 D
1–380（380 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.15 Å |
| 9RCI Crystal Structure of Flap Endonuclease FEN1 with Compound 28 提交 2025-05-29 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–336（336 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 A1JD4 (3~{S})-13-[(1~{S})-1-(2-methylquinolin-7-yl)ethoxy]-11-oxidanyl-5-oxa-1,8-diazatricyclo[8.4.0.0^{3,8}]tetradeca-10,13-diene-9,12-dione × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；277 K；21 % PEG MME 5000, 0.1 M MES pH 6.5, 10 mM ammonium sulphate
|
分辨率 1.66 Å R-free 0.283 |
| 9RCI Crystal Structure of Flap Endonuclease FEN1 with Compound 28 提交 2025-05-29 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–336（336 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 A1JD4 (3~{S})-13-[(1~{S})-1-(2-methylquinolin-7-yl)ethoxy]-11-oxidanyl-5-oxa-1,8-diazatricyclo[8.4.0.0^{3,8}]tetradeca-10,13-diene-9,12-dione × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；277 K；21 % PEG MME 5000, 0.1 M MES pH 6.5, 10 mM ammonium sulphate
|
分辨率 1.66 Å R-free 0.283 |
| 9RDI Crystal Structure of Flap Endonuclease FEN1 with Compound 5 提交 2025-06-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–336（336 aa）
|
未记录 | A1JED 2-methyl-9-oxidanyl-6-(phenylmethyl)-3,4-dihydropyrazino[1,2-c]pyrimidine-1,8-dione × 1 TEW 6-tungstotellurate(VI) × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；277 K；21 % PEG MME 5000, 0.1 M MES pH 6.5, 10 mM ammonium sulphate
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.232 |
| 9RDI Crystal Structure of Flap Endonuclease FEN1 with Compound 5 提交 2025-06-02 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–336（336 aa）
|
未记录 | A1JED 2-methyl-9-oxidanyl-6-(phenylmethyl)-3,4-dihydropyrazino[1,2-c]pyrimidine-1,8-dione × 1 TEW 6-tungstotellurate(VI) × 5 MG MAGNESIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；277 K；21 % PEG MME 5000, 0.1 M MES pH 6.5, 10 mM ammonium sulphate
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.232 |