当前蛋白身份：P40969
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2QUQ Crystal Structure of the Essential Inner Kinetochore Protein Cep3p 提交 2007-08-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
47–608（562 aa）
片段：residues 47-608
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；100 mM HEPES, 5% PEG 4000, 500 mM NaCl, pH 7.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.285 |
| 2VEQ Insights into kinetochore-DNA interactions from the structure of Cep3p 提交 2007-10-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
48–608（561 aa）
片段：RESIDUES 48-608
|
未记录 | BME BETA-MERCAPTOETHANOL × 2 CAC CACODYLATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；100MM SODIUM CACODYLATE PH 6.5, 0.2M POTASSIUM THIOCYANATE, 12% PEG 4000
|
分辨率 2.49 Å R-free 0.246 |
| 6F07 CBF3 Core Complex 提交 2017-11-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–608（608 aa）
链 B
1–608（608 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 6FE8 Cryo-EM structure of the core Centromere Binding Factor 3 complex 提交 2017-12-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
47–608（562 aa）
链 B
47–608（562 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.10 Å |
| 6GSA Core Centromere Binding Factor 3 (CBF3) with monomeric Ndc10 提交 2018-06-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：tetrameric（4） 待复核 |
链 A
47–608（562 aa）
链 B
47–608（562 aa）
|
突变：Truncation of the N-terminal domain, UNP residues 1-46 突变：Truncation of the N-terminal domain, UNP residues 1-46 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.20 Å |
| 6GYP Cryo-EM structure of the CBF3-core-Ndc10-DBD complex of the budding yeast kinetochore 提交 2018-07-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 B
1–608（608 aa）
链 C
49–608（560 aa）
|
未记录 | MET METHIONINE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ASN ASPARAGINE × 1 ARG ARGININE × 1 THR THREONINE × 2 GLN GLUTAMINE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 6GYS Cryo-EM structure of the CBF3-CEN3 complex of the budding yeast kinetochore 提交 2018-07-01 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric（12） 与全部聚合物一致 |
链 B
1–608（608 aa）
链 C
1–608（608 aa）
链 I
1–608（608 aa）
链 J
1–608（608 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.40 Å |
| 6GYU Cryo-EM structure of the CBF3-msk complex of the budding yeast kinetochore 提交 2018-07-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 B
1–608（608 aa）
链 C
49–608（560 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 7K79 CBF3 提交 2020-09-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 L
1–608（608 aa）
链 O
1–608（608 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.00 Å |
| 7K7G nucleosome and Gal4 complex 提交 2020-09-22 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric（11） 与全部聚合物一致 |
链 M
1–48（48 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.20 Å |
| 8OW1 Cryo-EM structure of the yeast Inner kinetochore bound to a CENP-A nucleosome. 提交 2023-04-26 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：42-meric（42） 与全部聚合物一致 |
链 CE
1–608（608 aa）
链 ce
1–608（608 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |