当前蛋白身份：P55735
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| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3BG0 Architecture of a Coat for the Nuclear Pore Membrane 提交 2007-11-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–316（316 aa）
链 D
1–316（316 aa）
链 E
1–316（316 aa）
链 H
1–316（316 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.7；294 K；16 % (w/v) PEG 3,350, 400 mM NaCl, 100 mM Na-K tartrate, and 100 mM BIS-TRIS, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 3.15 Å R-free 0.294 |
| 3BG0 Architecture of a Coat for the Nuclear Pore Membrane 提交 2007-11-23 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–316（316 aa）
链 D
1–316（316 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.7；294 K；16 % (w/v) PEG 3,350, 400 mM NaCl, 100 mM Na-K tartrate, and 100 mM BIS-TRIS, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 3.15 Å R-free 0.294 |
| 3BG0 Architecture of a Coat for the Nuclear Pore Membrane 提交 2007-11-23 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 E
1–316（316 aa）
链 H
1–316（316 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.7；294 K；16 % (w/v) PEG 3,350, 400 mM NaCl, 100 mM Na-K tartrate, and 100 mM BIS-TRIS, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 3.15 Å R-free 0.294 |
| 3BG0 Architecture of a Coat for the Nuclear Pore Membrane 提交 2007-11-23 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–316（316 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.7；294 K；16 % (w/v) PEG 3,350, 400 mM NaCl, 100 mM Na-K tartrate, and 100 mM BIS-TRIS, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 3.15 Å R-free 0.294 |
| 3BG0 Architecture of a Coat for the Nuclear Pore Membrane 提交 2007-11-23 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
1–316（316 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.7；294 K；16 % (w/v) PEG 3,350, 400 mM NaCl, 100 mM Na-K tartrate, and 100 mM BIS-TRIS, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 3.15 Å R-free 0.294 |
| 3BG0 Architecture of a Coat for the Nuclear Pore Membrane 提交 2007-11-23 | Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
1–316（316 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.7；294 K；16 % (w/v) PEG 3,350, 400 mM NaCl, 100 mM Na-K tartrate, and 100 mM BIS-TRIS, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 3.15 Å R-free 0.294 |
| 3BG0 Architecture of a Coat for the Nuclear Pore Membrane 提交 2007-11-23 | Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 H
1–316（316 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.7；294 K；16 % (w/v) PEG 3,350, 400 mM NaCl, 100 mM Na-K tartrate, and 100 mM BIS-TRIS, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 3.15 Å R-free 0.294 |
| 3BG1 Architecture of a Coat for the Nuclear Pore Membrane 提交 2007-11-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–316（316 aa）
链 D
1–316（316 aa）
链 E
1–316（316 aa）
链 H
1–316（316 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.7；294 K；16 % (w/v) PEG 3,350, 400 mM NaCl, 100 mM Na-K tartrate, and 100 mM BIS-TRIS, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.294 |
| 3BG1 Architecture of a Coat for the Nuclear Pore Membrane 提交 2007-11-23 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–316（316 aa）
链 D
1–316（316 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.7；294 K；16 % (w/v) PEG 3,350, 400 mM NaCl, 100 mM Na-K tartrate, and 100 mM BIS-TRIS, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.294 |
| 3BG1 Architecture of a Coat for the Nuclear Pore Membrane 提交 2007-11-23 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 E
1–316（316 aa）
链 H
1–316（316 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.7；294 K；16 % (w/v) PEG 3,350, 400 mM NaCl, 100 mM Na-K tartrate, and 100 mM BIS-TRIS, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.294 |
| 3BG1 Architecture of a Coat for the Nuclear Pore Membrane 提交 2007-11-23 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–316（316 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.7；294 K；16 % (w/v) PEG 3,350, 400 mM NaCl, 100 mM Na-K tartrate, and 100 mM BIS-TRIS, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.294 |
| 3BG1 Architecture of a Coat for the Nuclear Pore Membrane 提交 2007-11-23 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
1–316（316 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.7；294 K；16 % (w/v) PEG 3,350, 400 mM NaCl, 100 mM Na-K tartrate, and 100 mM BIS-TRIS, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.294 |
| 3BG1 Architecture of a Coat for the Nuclear Pore Membrane 提交 2007-11-23 | Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
1–316（316 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.7；294 K；16 % (w/v) PEG 3,350, 400 mM NaCl, 100 mM Na-K tartrate, and 100 mM BIS-TRIS, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.294 |
| 3BG1 Architecture of a Coat for the Nuclear Pore Membrane 提交 2007-11-23 | Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 H
1–316（316 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.7；294 K；16 % (w/v) PEG 3,350, 400 mM NaCl, 100 mM Na-K tartrate, and 100 mM BIS-TRIS, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.294 |
| 5A9Q Human nuclear pore complex 提交 2015-07-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 304 PDB 声明：304-meric（304） 与蛋白数一致 |
链 6
1–322（322 aa）
链 F
1–322（322 aa）
链 O
1–322（322 aa）
链 X
1–322（322 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
20MM TRIS, 0.2-0.4% TREHALOSE；pH 7.5；20MM TRIS, 0.2-0.4% TREHALOSE
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE-PROPANE MIXTURE, INSTRUMENT- HOMEMADE PLUNGER,
|
分辨率 23.00 Å |
| 7PEQ Model of the outer rings of the human nuclear pore complex 提交 2021-08-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 288 PDB 声明：288-meric（288） 与蛋白数一致 |
链 AF
1–322（322 aa）
链 BF
1–322（322 aa）
链 CF
1–322（322 aa）
链 DF
1–322（322 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Cells were grown on holey carbon, Au-mesh supports. Grids were rinsed briefly with PBS and manually blotted before plunging into liquid ethane.
|
分辨率 35.00 Å |
| 7R5J Human nuclear pore complex (dilated) 提交 2022-02-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 808 PDB 声明：808-meric（808） 与蛋白数一致 |
链 N0
1–322（322 aa）
链 N1
1–322（322 aa）
链 N2
1–322（322 aa）
链 N3
1–322（322 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 50.00 Å |
| 7R5K Human nuclear pore complex (constricted) 提交 2022-02-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 808 PDB 声明：808-meric（808） 与蛋白数一致 |
链 N0
1–322（322 aa）
链 N1
1–322（322 aa）
链 N2
1–322（322 aa）
链 N3
1–322（322 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 12.00 Å |
| 7UHY Human GATOR2 complex 提交 2022-03-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric（20） 与蛋白数一致 |
链 H
1–322（322 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 32 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.66 Å |
| 7UHY Human GATOR2 complex 提交 2022-03-27 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 H
1–322（322 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 16 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.66 Å |
| 7UHY Human GATOR2 complex 提交 2022-03-27 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 H
1–322（322 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 16 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.66 Å |
| 9LVJ Cryo-EM structure of Sestrin2 bound human GATOR2 complex 提交 2025-02-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric（18） 与蛋白数一致 |
链 H
1–368（368 aa）
链 R
1–368（368 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 32 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.82 Å |
| 9LVK Cryo-EM structure of CASTOR1 bound human GATOR2 complex 提交 2025-02-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric（18） 与蛋白数一致 |
链 H
1–368（368 aa）
链 R
1–368（368 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 31 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.59 Å |
| 9LWF Cryo-EM structure of dual sensor bound GATOR2 complex 提交 2025-02-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric（20） 与蛋白数一致 |
链 H
1–368（368 aa）
链 R
1–368（368 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 32 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.41 Å |
| 9OTI GATOR2 complex bound to arginine sensor CASTOR1 提交 2025-05-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric（18） 与蛋白数一致 |
链 H
1–322（322 aa）
链 R
1–322（322 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 29 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |