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蛋白结构与聚集状态

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当前蛋白身份：P75957 重新检索
22PDB条目
22Biological assembly
43链与assembly记录
本组结构的主要差异维度
构建体不同 突变/修饰不同 组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

差异标签只比较当前检索结果；所有PDB和assembly原始记录仍分别保留。

相关结构差异明细

一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。

PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
7ARH LolCDE in complex with lipoprotein 提交 2020-10-25 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致
链 D 1–233（233 aa）
链 F 1–233（233 aa）
未记录 Z41 (2S)-3-hydroxypropane-1,2-diyl dihexadecanoate × 1 PLM PALMITIC ACID × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8；20 mM Tris-HCl, pH 7.8, 150 mM NaCl and 0.05% LMNG
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7ARI LolCDE apo structure 提交 2020-10-25 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致
链 D 1–233（233 aa）
链 F 1–233（233 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8；20 mM Tris-HCl, pH 7.8, 150 mM NaCl and 0.05% LMNG
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7ARJ LolCDE in complex with lipoprotein and AMPPNP complex undimerized form 提交 2020-10-25 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致
链 D 1–233（233 aa）
链 F 1–233（233 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 Z41 (2S)-3-hydroxypropane-1,2-diyl dihexadecanoate × 1 PLM PALMITIC ACID × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8；20 mM Tris-HCl, pH 7.8, 150 mM NaCl and 0.05% LMNG
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7ARK LolCDE in complex with AMP-PNP in the closed NBD state 提交 2020-10-25 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致
链 D 1–233（233 aa）
链 F 1–233（233 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8；20 mM Tris-HCl, pH 7.8, 150 mM NaCl and 0.05% LMNG
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
7ARL LolCDE in complex with lipoprotein and ADP 提交 2020-10-25 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致
链 D 1–233（233 aa）
链 F 1–233（233 aa）
未记录 Z41 (2S)-3-hydroxypropane-1,2-diyl dihexadecanoate × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 PLM PALMITIC ACID × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8；20 mM Tris-HCl, pH 7.8, 150 mM NaCl and 0.05% LMNG
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7ARM LolCDE in complex with lipoprotein and LolA 提交 2020-10-25 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致
链 D 1–233（233 aa）
链 F 1–233（233 aa）
未记录 Z41 (2S)-3-hydroxypropane-1,2-diyl dihexadecanoate × 1 PLM PALMITIC ACID × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8；20 mM Tris-HCl, pH 7.8, 150 mM NaCl and 0.05% LMNG
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7MDX LolCDE nucleotide-free 提交 2021-04-06 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致
链 C 4–221（218 aa）
链 D 4–221（218 aa）
未记录 F15 PENTADECANOIC ACID × 1 ZM5 (2R)-2-(tridecanoyloxy)propyl hexadecanoate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
7V8I LolCD(E171Q)E with bound AMPPNP in nanodiscs 提交 2021-08-23 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致
链 D 1–233（233 aa）
链 F 1–233（233 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN
分辨率 3.60 Å
7V8L LolCDE with bound RcsF in nanodiscs 提交 2021-08-23 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致
链 D 1–233（233 aa）
链 F 1–233（233 aa）
未记录 PCJ (2R)-3-{[(2S)-3-HYDROXY-2-(PALMITOYLAMINO)PROPYL]THIO}PROPANE-1,2-DIYL DIHEXADECANOATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN
分辨率 3.50 Å
7V8M LolCDE-apo in nanodiscs 提交 2021-08-23 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致
链 D 1–233（233 aa）
链 F 1–233（233 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 NITROGEN
分辨率 4.20 Å
9GRC Cryo-EM structure of lipoprotein-bound LolCDE in nanodiscs 提交 2024-09-11 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致
链 D 1–233（233 aa）
链 F 1–233（233 aa）
未记录 Z41 (2S)-3-hydroxypropane-1,2-diyl dihexadecanoate × 1 PLM PALMITIC ACID × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
9GVK Cryo-EM structure of endogenous ATP-bound LolCDE with LolD-E171Q mutations in nanodiscs 提交 2024-09-25 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致
链 D 1–233（233 aa）
链 F 1–233（233 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
9RLC LolCDE complex with Lpp lipoprotein 提交 2025-06-16 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致
链 D 1–233（233 aa）
链 F 1–233（233 aa）
未记录 PLM PALMITIC ACID × 1 Z41 (2S)-3-hydroxypropane-1,2-diyl dihexadecanoate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9RLD LolCDE complex with Lpp lipoprotein 提交 2025-06-16 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致
链 D 1–233（233 aa）
链 F 1–233（233 aa）
突变：C-terminal His tag (GSHHHHHH) 突变：C-terminal His tag (GSHHHHHH) PLM PALMITIC ACID × 1 Z41 (2S)-3-hydroxypropane-1,2-diyl dihexadecanoate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9RLE LolCDE complex with Pal lipoprotein 提交 2025-06-16 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致
链 D 1–233（233 aa）
链 F 1–233（233 aa）
突变：C-terminal His tag (GSHHHHHH) 突变：C-terminal His tag (GSHHHHHH) PLM PALMITIC ACID × 1 Z41 (2S)-3-hydroxypropane-1,2-diyl dihexadecanoate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.18 Å
9RLF LolCDE complex with Pal lipoprotein 提交 2025-06-16 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致
链 D 1–233（233 aa）
链 F 1–233（233 aa）
突变：C-terminal His tag (GSHHHHHH) 突变：C-terminal His tag (GSHHHHHH) PLM PALMITIC ACID × 1 Z41 (2S)-3-hydroxypropane-1,2-diyl dihexadecanoate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.17 Å
9RLG LolCDE complex with LolB lipoprotein 提交 2025-06-16 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致
链 D 1–233（233 aa）
链 F 1–233（233 aa）
突变：C-terminal His tag (GSHHHHHH) 突变：C-terminal His tag (GSHHHHHH) PLM PALMITIC ACID × 1 Z41 (2S)-3-hydroxypropane-1,2-diyl dihexadecanoate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.09 Å
9RLH LolCDE complex with del 9-15 LolB lipoprotein 提交 2025-06-16 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致
链 D 1–233（233 aa）
链 F 1–233（233 aa）
突变：C-terminal His tag (GSHHHHHH) 突变：C-terminal His tag (GSHHHHHH) PLM PALMITIC ACID × 1 Z41 (2S)-3-hydroxypropane-1,2-diyl dihexadecanoate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.19 Å
9RLI LolCDEdelta(235-252) complex with Pal lipoprotein 提交 2025-06-16 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致
链 D 1–233（233 aa）
链 F 1–233（233 aa）
突变：C-terminal His tag (GSHHHHHH) 突变：C-terminal His tag (GSHHHHHH) PLM PALMITIC ACID × 1 Z41 (2S)-3-hydroxypropane-1,2-diyl dihexadecanoate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.63 Å
9RLJ LolCDE with bound ATPgammaS 提交 2025-06-16 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致
链 D 1–233（233 aa）
链 F 1–233（233 aa）
突变：C-terminal His tag (GSHHHHHH) 突变：C-terminal His tag (GSHHHHHH) AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9RLK LolCDE(delta 235-252) complex with Pal lipoprotein 提交 2025-06-16 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致
链 D 1–233（233 aa）
链 F 1–233（233 aa）
突变：C-terminal His tag (GSHHHHHH) 突变：C-terminal His tag (GSHHHHHH) PLM PALMITIC ACID × 1 Z41 (2S)-3-hydroxypropane-1,2-diyl dihexadecanoate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.29 Å
9XRO LolCDE in complex with SMT-738_3 提交 2025-11-19 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致
链 F 1–233（233 aa）
未记录 A1ER4 2-azanyl-1-[6-[2-azanyl-5-(3-methylpyridin-4-yl)-1H-imidazol-4-yl]-2,3-dihydro-1,4-benzoxazin-4-yl]-2-methyl-propan-1-one × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.88 Å

页面展示的是PDB/mmCIF中的结构证据。“未记录非水小分子”不等于实验样品绝对无配体； 实验环境属于整个PDB实验记录，配体与拷贝数按具体biological assembly展示。